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基于键偶极模型的多肽-水体系多体极化作用强度高效计算新方法
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作者 祝佳怡 姜笑楠 +2 位作者 郑笑函 郝强 王长生 《高等学校化学学报》 北大核心 2025年第4期60-69,共10页
为解决传统非极化力场无法准确描述三体及更高阶多体作用的问题,并精确模拟液态水环境下蛋白质的结构和功能,提出了一种可以快速准确计算多肽-水体系中的多体极化作用强度的新方法.该方法将多肽分子中的N—H和C=O极性化学键及水分子的O... 为解决传统非极化力场无法准确描述三体及更高阶多体作用的问题,并精确模拟液态水环境下蛋白质的结构和功能,提出了一种可以快速准确计算多肽-水体系中的多体极化作用强度的新方法.该方法将多肽分子中的N—H和C=O极性化学键及水分子的O—H键视为键偶极,周围环境对化学键的极化作用使得该化学键上产生了诱导键偶极,使用键偶极之间的相互作用来描述体系中的多体极化作用.通过拟合模型体系中三体作用能随分子间距离变化的势能曲线确定所需参数.将该方法应用于多肽-水体系中的三体作用强度计算,并与高精度的MP2方法和AMOEBABIO18可极化力场方法进行了系统比较.结果表明,本文方法计算的6个多肽水团簇(共包含92290个三体作用)的总三体作用强度与MP2方法的计算结果具有极高的线性相关性(线性相关系数为0.9965,均方根误差为7.29 kJ/mol),准确度略优于AMOEBABIO18可极化力场方法(其与MP2方法的线性相关系数为0.9950,均方根误差为10.74 kJ/mol).此外,本文方法的计算效率与AMOEBABIO18可极化力场方法相比也有显著提高,在涉及超过20000次三体相互作用的模拟中,计算时间缩短了约50%.本文提出的高效方法为大规模蛋白质-水体系的多体作用模拟提供了新思路,在相关领域中具有重要应用潜力. 展开更多
关键词 极化作用 化学键偶极 诱导键偶极 多肽-水 三体作用能
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三体相互作用下Bessel型光晶格中物质波孤立子的稳定性研究
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作者 陈海军 张耀文 《原子与分子物理学报》 CAS CSCD 北大核心 2016年第1期147-152,共6页
研究了两体和三体相互作用空间调制情形下Bessel型光晶格中准二维玻色-爱因斯坦凝聚体系中物质波孤立子的稳定性.利用标准的变分法程序,得出体系有效势能的表达式,进而根据有效势能结构给出了体系的稳定性条件.结果表明,在有Bessel型光... 研究了两体和三体相互作用空间调制情形下Bessel型光晶格中准二维玻色-爱因斯坦凝聚体系中物质波孤立子的稳定性.利用标准的变分法程序,得出体系有效势能的表达式,进而根据有效势能结构给出了体系的稳定性条件.结果表明,在有Bessel型光晶格和没有Bessel型光晶格的情况下,体系均能形成稳定的孤立子解,但是有晶格参与时,体系有很大范围的稳定区间.另外,稳定性受两体相互作用和三体相互作用共同支配,其中两体相互作用对体系的稳定性起主导作用,三体相互作用和相互作用的空间调制只对稳定性起调节作用,但是在特定情况下,必须要有三体相互作用或者相互作用空间调制的参与才能形成稳定的孤立子解. 展开更多
关键词 相互作用 Bessel型光晶格 孤立子 稳定性
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两体和三体相互作用下的非线性Landau-Zener隧穿的圈结构研究
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作者 魏秀芳 刘子江 《原子与分子物理学报》 CAS CSCD 北大核心 2014年第5期816-820,共5页
在加速光晶格中玻色-爱因斯坦凝聚体(BEC),当同时考虑两体和三体相互作用时,其能级结构、隧穿率出现了独特的特性.在一维加速光晶格中的BEC,当两体和三体相互作用参数满足一定条件时,非线性两能级体系的能级结构中出现了圈结构,研究得... 在加速光晶格中玻色-爱因斯坦凝聚体(BEC),当同时考虑两体和三体相互作用时,其能级结构、隧穿率出现了独特的特性.在一维加速光晶格中的BEC,当两体和三体相互作用参数满足一定条件时,非线性两能级体系的能级结构中出现了圈结构,研究得出了圈的宽度随两体和三体相互作用参数变化的关系,并由此分析圈结构的出现及其大小对BEC隧穿率的影响. 展开更多
关键词 玻色-爱因斯坦凝聚(BEC) 圈结构 相互作用 隧穿率
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带有三体相互作用的XXX自旋链模型的隐形传态 被引量:3
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作者 郗玉兴 单传家 黄燕霞 《原子与分子物理学报》 CAS CSCD 北大核心 2014年第5期769-773,共5页
本文研究了基于一个带有多体相互作用(XZY-YZX型和XZX+YZY型)的三比特XXX海森堡自旋链模型的量子隐形传态.首先求出该模型的本征值和本征态,然后再以它在热平衡态下的纠缠为量子信道进行隐形传态并求出保真度的表达式.分别分析了不带三... 本文研究了基于一个带有多体相互作用(XZY-YZX型和XZX+YZY型)的三比特XXX海森堡自旋链模型的量子隐形传态.首先求出该模型的本征值和本征态,然后再以它在热平衡态下的纠缠为量子信道进行隐形传态并求出保真度的表达式.分别分析了不带三体相互作用和仅带一种三体相互作用及同时带两种三体相互作用的XXX模型的保真度与外磁场和温度的关系,得知仅带有XZX+YZY型三体相互作用的铁磁质海森堡XXX模型的隐形传态质量最好,并且工作时需要的外界磁场最小、温度相对较高,在实验上容易实现. 展开更多
关键词 隐形传态 保真度 相互作用
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醇及脱氧核糖与水分子间三体作用强度的快速准确计算 被引量:1
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作者 李晓蕾 孙云娇 +1 位作者 唐颖 王长生 《高等学校化学学报》 SCIE EI CAS CSCD 北大核心 2021年第12期3664-3671,共8页
快速准确预测醇及脱氧核糖分子与水形成的氢键复合物的三体作用强度,对准确模拟水环境下蛋白质和DNA的结构和功能至关重要.基于对多体极化作用的理解,在可极化偶极-偶极作用模型(PBFF)基础上,将体系中的极性化学键视为化学键偶极,通过... 快速准确预测醇及脱氧核糖分子与水形成的氢键复合物的三体作用强度,对准确模拟水环境下蛋白质和DNA的结构和功能至关重要.基于对多体极化作用的理解,在可极化偶极-偶极作用模型(PBFF)基础上,将体系中的极性化学键视为化学键偶极,通过模拟键偶极的极化计算了醇及脱氧核糖与水分子形成的氢键复合物的三体作用能.通过拟合甲醇与水氢键复合物的三体作用能随分子间距离变化的能量曲线确定了所需的参数.将模型和所确定的参数应用于计算更多的甲醇、乙醇及脱氧核糖与水氢键复合物的三体作用能,检验了模型的准确性和参数的可转移性.计算结果表明,可极化偶极-偶极作用模型及所确定的参数能够较好地预测具有不同结构的氢键复合物的三体作用强度,其精度可与MP2方法的计算精度相当. 展开更多
关键词 氢键复合物 作用 化学键偶极 极化作用 可极化偶极-偶极作用模型
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可快速计算水团簇三体作用强度的新方法 被引量:1
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作者 李晓蕾 王长生 《高等学校化学学报》 SCIE EI CAS CSCD 北大核心 2019年第5期950-958,共9页
将水分子视为由2个O—H键偶极构成,再将水分子间的三体作用视为长程诱导作用和短程校正之和,使用Thole模型计算长程诱导作用,通过同时考虑不同水分子间的置换和同一个水分子中2个键偶极间的置换计算短程校正,从而提出了一个可快速计算... 将水分子视为由2个O—H键偶极构成,再将水分子间的三体作用视为长程诱导作用和短程校正之和,使用Thole模型计算长程诱导作用,通过同时考虑不同水分子间的置换和同一个水分子中2个键偶极间的置换计算短程校正,从而提出了一个可快速计算水团簇三体作用强度的新方法.根据已报道的12347个水三聚体的结构和CCSD(T)三体作用能,确定了该方法所需参数.将该方法和所确定的参数应用于67个水团簇体系,计算这些体系的三体作用能,并与CCSD(T),MP2,M06-2X方法的计算结果进行比较.结果表明,相对于CCSD(T)方法的总三体作用能,本文方法的均方根偏差(RMSD)仅为3. 32 k J/mol,平均相对偏差(MRD)仅为2. 43%;对较大水团簇体系,该方法计算精度稍优于MP2方法,明显优于M06-2X方法,并且更快捷高效. 展开更多
关键词 水团簇 作用 键偶极
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含三体相互作用海森堡链的几何量子失谐
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作者 谢玉霞 刘晶 《西安邮电大学学报》 2016年第4期83-87,共5页
研究含三体相互作用和外加匀强磁场时海森堡XX自旋链的几何量子失谐特性,结果发现:对有限温度下的热平衡态,ZZZ型三体相互作用可用来有效增强系统边界量子比特之间的Bures距离量子失谐和Hellinger距离量子失谐,却不能用来增强对应的迹... 研究含三体相互作用和外加匀强磁场时海森堡XX自旋链的几何量子失谐特性,结果发现:对有限温度下的热平衡态,ZZZ型三体相互作用可用来有效增强系统边界量子比特之间的Bures距离量子失谐和Hellinger距离量子失谐,却不能用来增强对应的迹距离量子失谐;不同度量方式的几何量子失谐会给出不同的量子态态序。 展开更多
关键词 几何量子失谐 海森堡链 相互作用
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含三体相互作用XX模型的测量诱导非局域性
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作者 谢玉霞 刘晶 《西安邮电大学学报》 2016年第3期94-98,共5页
利用Bures距离测量诱导非局域性的概念研究含三体相互作用海森堡XX链的非局域性,讨论增强系统边界量子比特之间测量诱导非局域性的可调参数。对有限温度下的系统热平衡态,通过优化调节XZX+YZY或XZY-YZX型三体相互作用的强度和外加匀强... 利用Bures距离测量诱导非局域性的概念研究含三体相互作用海森堡XX链的非局域性,讨论增强系统边界量子比特之间测量诱导非局域性的可调参数。对有限温度下的系统热平衡态,通过优化调节XZX+YZY或XZY-YZX型三体相互作用的强度和外加匀强磁场的强度,对应边界量子比特之间的Bures距离测量诱导非局域性得到有效提高。该结论可用于实现量子自旋系统的非局域性调控。 展开更多
关键词 测量诱导非局域性 海森堡XX模型 相互作用
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水团簇(H_2O)_n中多体作用强度与水分子间距的关系 被引量:3
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作者 杨微 李晓蕾 王长生 《物理化学学报》 SCIE CAS CSCD 北大核心 2015年第12期2285-2293,共9页
使用高精度从头算方法(含基组重叠误差校正)计算了水团簇(H_2O)_n(n=8,10,16,20,22,24)中的所有二体、三体和四体作用能,分析了水团簇中的多体效应.研究表明,二体作用对体系总作用能的贡献高达70%以上,三体作用对总作用能的贡献可高达2... 使用高精度从头算方法(含基组重叠误差校正)计算了水团簇(H_2O)_n(n=8,10,16,20,22,24)中的所有二体、三体和四体作用能,分析了水团簇中的多体效应.研究表明,二体作用对体系总作用能的贡献高达70%以上,三体作用对总作用能的贡献可高达25%,四体作用在总作用能中所占比例不超过3%,五体及以上多体作用能在总作用能中所占比例更小,不超过0.5%.本文研究还表明,两个水分子间距小于0.68 nm的二体作用、三个和四个水分子中最近的两个水分子间距小于0.31 nm的三体和四体作用对体系总作用能的贡献高达99.4%.因此,以生物体系为对象的分子模拟方法应该具备准确地模拟两个水分子间距小于0.68 nm的二体作用、三个和四个水分子中最近的两个分子间距小于0.31 nm的三体和四体作用的能力. 展开更多
关键词 水团簇 作用 作用 作用
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He_2F^-体系的分子间相互作用势能面
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作者 孙晓颖 王钦 +3 位作者 李志儒 吴迪 孙家锺 唐敖庆 《高等学校化学学报》 SCIE EI CAS CSCD 北大核心 2007年第5期960-963,共4页
使用高水平的从头算CCSD(T)/aug-cc-pVTZ方法,经过Counterpoise校正,计算了He2F-体系的分子间相互作用势能面.在He2F-体系的相互作用势能面的最小值处,发现了一个等腰三角形的稳定结构.在这个结构中,He…F-距离是0.334nm,He…He的距离是... 使用高水平的从头算CCSD(T)/aug-cc-pVTZ方法,经过Counterpoise校正,计算了He2F-体系的分子间相互作用势能面.在He2F-体系的相互作用势能面的最小值处,发现了一个等腰三角形的稳定结构.在这个结构中,He…F-距离是0.334nm,He…He的距离是0.295nm,∠HeF-He为52.5°.计算了此稳定结构的频率、相互作用能、二体相互作用能和三体相互作用能.在CCSD(T)/d-aug-cc-pVTZ水平下,相互作用能为-1.727kJ/mol. 展开更多
关键词 相互作用势能面 从头算方法 相互作用能 He2F^-
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规则星形高分子之间的相互作用势的自洽场研究 被引量:2
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作者 徐嘉靖 邱枫 +1 位作者 张红东 杨玉良 《高等学校化学学报》 SCIE EI CAS CSCD 北大核心 2006年第1期174-177,共4页
用自洽场理论方法计算了星形高分子之间的相互作用势,并与标度理论的推测以及基于粒子的分子动力学模拟方法的结果进行了比较.自洽场理论计算得到的星形高分子之间的二体相互作用势与标度理论推测的结果基本一致:当两个星形高分子核心... 用自洽场理论方法计算了星形高分子之间的相互作用势,并与标度理论的推测以及基于粒子的分子动力学模拟方法的结果进行了比较.自洽场理论计算得到的星形高分子之间的二体相互作用势与标度理论推测的结果基本一致:当两个星形高分子核心之间的距离小于其对应的等效软球的半径R时,二体相互作用势U与星形高分子核心之间的距离d及官能度f之间的关系为U(d)∝-f3/2ln(d/R).当星形高分子核心间距离较小,相互作用势与星形高分子核心间距离的对数呈线性关系时,三体相互作用为吸引作用,但其强度约等于二体作用的10%.因此,以二体作用为基础的基于粒子的模拟方法是基本合理的. 展开更多
关键词 自洽场理论 星形高分子 相互作用 相互作用 相互作用
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锂原子与正负电子碰撞电离截面的计算
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作者 周雅君 葛自明 王治文 《原子与分子物理学报》 CAS CSCD 北大核心 1998年第S1期141-142,共2页
电离是正负电子同原子碰撞过程中非常重要的反应通道,应用等价局部光学势理论,计算了入射能量从电离阈值到1000eV的正负电子碰撞锂原子的总的电离截面,现在的计算结果同实验测量和其它的理论计算结果进行了比较。
关键词 碰撞电离截面 锂原子 正负电子 实验测量 相互作用 光学势模型 矩阵元 电离阈值 中等能量范围 束缚-自由跃
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[He_3H]^+分子基态势能面的从头计算研究(英文) 被引量:1
13
作者 李巍 屈军艳 赵新生 《物理化学学报》 SCIE CAS CSCD 北大核心 2003年第8期751-756,共6页
使用CCSD(T)/aug-cc-pVTZ从头计算方法,对犤He3H犦+分子的一些特殊构型的电子基态势能进行扫描,并以此为基础对三体相互作用势在惰性气体质子簇中的影响进行了讨论.结果表明即使在这样一个简单的体系中三体相互作用的影响都是不能忽略的... 使用CCSD(T)/aug-cc-pVTZ从头计算方法,对犤He3H犦+分子的一些特殊构型的电子基态势能进行扫描,并以此为基础对三体相互作用势在惰性气体质子簇中的影响进行了讨论.结果表明即使在这样一个简单的体系中三体相互作用的影响都是不能忽略的.另一方面,在犤He3H犦+分子稳定构型附近仅将势能展开至三体相互作用项便可提供较精确的相互作用信息,但在强排斥区域更高阶作用的影响变得越来越突出.本文同时讨论了犤He4H犦+的稳态结构.犤He3H犦+与犤He4H犦+的稳态结构表明,犤HenH犦+簇中存在着一个犤He2H犦+核. 展开更多
关键词 [He3H]+ 分子基态 势能面 从头计算 稳定构型 相互作用 [He4H]^+ 氦氢团簇
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CO_(2)/O_(2)环境对柴油着火及燃烧特性的影响 被引量:1
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作者 万源 刘永峰 +2 位作者 毕贵军 刘海峰 张璐 《内燃机工程》 CAS CSCD 北大核心 2023年第3期44-54,共11页
为研究CO_(2)/O_(2)环境对柴油着火和燃烧特性的影响,以正庚烷为柴油表征燃料,利用CONVERGE计算了不同CO_(2)/O_(2)环境下正庚烷的着火和燃烧过程,并搭建了可视化定容燃烧弹试验平台进行了验证。使用高速摄影机记录了初始温度850 K,初... 为研究CO_(2)/O_(2)环境对柴油着火和燃烧特性的影响,以正庚烷为柴油表征燃料,利用CONVERGE计算了不同CO_(2)/O_(2)环境下正庚烷的着火和燃烧过程,并搭建了可视化定容燃烧弹试验平台进行了验证。使用高速摄影机记录了初始温度850 K,初始压力3 MPa,CO_(2)体积分数分别为35%、40%、50%和60%时正庚烷燃烧的自发光强度,利用CHEMKIN中定容均质反应器分析了CO_(2)物理和化学作用对着火的影响。研究结果表明:在CO_(2)体积分数35%时存在爆燃的现象,随着CO_(2)体积分数增长,着火延迟时间增长,着火位置远离喷嘴,稳态燃烧阶段火焰的长度和宽度也增大,CO_(2)体积分数在50%~60%之间时火焰自发光强度峰值明显下降;CO_(2)的物理作用抑制了着火,第三体作用对着火的促进作用大于直接参与反应对着火的抑制作用,造成CO_(2)的化学作用缩短了着火延迟时间,并且随着CO_(2)体积分数增大,化学作用对着火的促进作用更加明显。 展开更多
关键词 CO_(2)/O_(2)环境 定容燃烧弹 着火过程 火焰自发光强度 作用
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