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植物Ⅲ型聚酮合酶基因家族的分子进化分析被引量：2: 1; 作者王波孙君社 +2 位作者翟玉盼孙立伟张秀清《生物技术通报》 CAS CSCD 北大核心 2011年第1期83-89,94,共8页; Ⅲ型聚酮合酶(type Ⅲ polyketide synthase,PKSⅢ)广泛存在于细菌、真菌和植物中,目前数据库中已积累了大量的序列资料。为了进一步了解植物Ⅲ型聚酮合酶基因家族的分子进化,以及其作为系统进化研究材料的可能性,选取了75条来自不同植... 展开更多; 关键词植物ⅲ型聚酮合酶序列比对分子进化; 在线阅读下载PDF 职称材料

地衣型真菌皮革肾岛衣中1个Ⅲ型聚酮合酶基因的克隆与鉴定: 2; 作者原晓龙华梅 +2 位作者陈剑王娟王毅《西北植物学报》 CAS CSCD 北大核心 2017年第11期2146-2152,共7页; 该研究通过对皮革肾岛衣地衣型真菌转录组数据的分析,利用RT-PCR技术,首次克隆得到1个Ⅲ型聚酮合酶基因(NpPKS3),并分析该基因在不同培养基上的表达,以选择皮革肾岛衣地衣型真菌的最佳培养基,为研究NpPKS3基因功能奠定基础,并为异源表... 展开更多; 关键词皮革肾岛衣 ⅲ型聚酮合酶分子系统进化分析一菌多产物; 在线阅读下载PDF 职称材料

利用同框敲除技术研究Ⅲ型聚酮合酶基因orf18的代谢产物: 3; 作者原海亮管仁艳何璟《华中农业大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2016年第1期74-80,共7页; 为了阐明Streptomyces sahachiroi ATCC 33158中Ⅲ型聚酮合酶基因orf18的功能,利用同源双交换的方法对该基因进行同框敲除,采用异位表达的方法进行了相应的回补实验。通过高效液相色谱及液相色谱-质谱联用分析发现基因orf18的敲除会明... 展开更多; 关键词链霉菌 ⅲ型聚酮合酶同源双交换同框敲除基因回补苯甲酸盐; 在线阅读下载PDF 职称材料

虎杖中一种新的2-吡喃酮合酶基因的克隆和功能研究（英文）被引量：1: 4; 作者陈默吴志军 +4 位作者王晓伟胡红艳曹杰柴团耀王红《生物化学与生物物理进展》 SCIE CAS CSCD 北大核心 2019年第7期699-710,共12页; 4-羟基-6-甲基-2-吡喃酮(2-吡喃酮)及其衍生物是一类重要的植物次生代谢产物,具有抗虫、抗真菌等功能,在工业上可用于生产可再生化学平台间苯三酚和1,3,5-三氨基-2,4,6-三硝基苯. 2-吡喃酮合酶(2PS),一种Ⅲ型聚酮合酶(PKSs),是合成2-吡... 展开更多; 关键词 ⅲ型聚酮合酶 2-吡喃酮合酶虎杖; 在线阅读下载PDF 职称材料

月季新型PKSⅢ基因的生物信息学分析及原核表达被引量：1: 5; 作者汪王吉乃喆 +2 位作者崔娇鹏赵世伟赵惠恩《西北农林科技大学学报（自然科学版）》 CSCD 北大核心 2022年第12期97-107,共11页; 【目的】对月季Ⅲ型聚酮合酶基因(RcPKSⅢ)进行生物信息学和原核表达分析,为进一步探究该基因的催化功能奠定基础。【方法】以‘月月粉’花瓣为研究材料,从其基因组中筛选月季PKS基因(RcPKSs)家族成员,并对其进行生物信息学分析;利用MEG... 展开更多; 关键词月季 ⅲ型聚酮合酶基因原核表达生物信息学; 在线阅读下载PDF 职称材料

内生放线菌A00122中germicidin生物合成基因的克隆: 6; 作者吴莹莹李瑶瑶 +2 位作者郑忠辉白林泉黄耀坚《厦门大学学报（自然科学版）》 CAS CSCD 北大核心 2011年第3期598-602,共5页; 在植物和细菌中,Ⅲ型聚酮合酶能够产生种类多样的次生代谢产物.在药用植物内生放线菌A00122的发酵产物中,分离到了一个已知的Ⅲ型聚酮类化合物germicidin.对A00122菌株建立了基因组文库,根据已知的同源基因Sco7221设计引物作为探针对文... 展开更多; 关键词 ⅲ型聚酮合酶 germicidin 基因克隆; 在线阅读下载PDF 职称材料

题名植物Ⅲ型聚酮合酶基因家族的分子进化分析被引量：2: 1; 作者王波孙君社翟玉盼孙立伟张秀清; 机构中国农业大学食品科学与营养工程学院; 出处《生物技术通报》 CAS CSCD 北大核心 2011年第1期83-89,94,共8页; 基金中央高校基本科研业务费专项资金项目(2010JS083); 文摘 Ⅲ型聚酮合酶(type Ⅲ polyketide synthase,PKSⅢ)广泛存在于细菌、真菌和植物中,目前数据库中已积累了大量的序列资料。为了进一步了解植物Ⅲ型聚酮合酶基因家族的分子进化,以及其作为系统进化研究材料的可能性,选取了75条来自不同植物物种包括苔藓类植物、蕨类植物、裸子植物、单子叶植物和双子叶植物的PKSⅢ蛋白序列,用CLUSTAL X软件对其氨基酸序列进行了比对,并用邻位相接法构建了系统进化树。结果表明,尽管不同来源的PKSⅢ序列表现了很大的差异,但保守结构域CHS-like所包含的主要功能位点半胱氨酸(Cys184)、苯丙氨酸残基(Phe236和Phe286)、组氨酸残基(His335)、天冬酰氨残基(Asn369)在各植物物种中具有很好的保守性;同时发现,在植物PKSⅢ序列中多数的Cys位点均具有较好的保守性,而且蕨类植物PKSⅢ和单子叶植物PKSⅢ在Cys保守位点有很好的相似性;进一步构建分子进化树表明,PKSⅢ基因基本上首先根据功能而聚类,明显地划分为CHSs和non-CHSs两类,其次按照不同的植物物种聚类。; 关键词植物ⅲ型聚酮合酶序列比对分子进化; Keywords Plant-specific type ⅲ PKS Sequence alignments Molecular evolution; 分类号 Q943 [生物学—植物学]; 在线阅读下载PDF 职称材料

题名地衣型真菌皮革肾岛衣中1个Ⅲ型聚酮合酶基因的克隆与鉴定: 2; 作者原晓龙华梅陈剑王娟王毅; 机构云南省林业科学院; 出处《西北植物学报》 CAS CSCD 北大核心 2017年第11期2146-2152,共7页; 基金国家自然科学青年科学基金(31400488) 云南省应用基础研究计划面上项目(2016FB055) 对外科技合作计划(2015IA004); 文摘该研究通过对皮革肾岛衣地衣型真菌转录组数据的分析,利用RT-PCR技术,首次克隆得到1个Ⅲ型聚酮合酶基因(NpPKS3),并分析该基因在不同培养基上的表达,以选择皮革肾岛衣地衣型真菌的最佳培养基,为研究NpPKS3基因功能奠定基础,并为异源表达皮革肾岛衣地衣型真菌的聚酮类化合物提供研究材料。结果表明:(1)NpPKS3基因(GenBank登录号MF351559)全长1 335bp,编码444个氨基酸,其产物为NpPKS3蛋白,在细胞质基质中发挥功能。(2)系统进化分析显示,NpPKS3基因编码的氨基酸序列与Ⅲ型聚酮合酶的csyB亚组聚为一支,推测该基因编码csyB类酶蛋白。(3)采用"一菌多产物"策略研究发现,NpPKS3基因在BMG培养基中表达能力最强,在BD培养基上表达能力最弱。; 关键词皮革肾岛衣 ⅲ型聚酮合酶分子系统进化分析一菌多产物; Keywords Nephrmopsis pallescens polyketide synthase ⅲ phylogentic analysis OSMAC; 分类号 Q785 [生物学—分子生物学] Q786 [生物学—分子生物学]; 在线阅读下载PDF 职称材料

题名利用同框敲除技术研究Ⅲ型聚酮合酶基因orf18的代谢产物: 3; 作者原海亮管仁艳何璟; 机构华中农业大学农业微生物学国家重点实验室华中农业大学理学院; 出处《华中农业大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2016年第1期74-80,共7页; 基金国家自然科学基金项目(31270136) 教育部留学回国人员科研启动基金项目([2009]1590) 教育部新世纪人才支持计划项目(NCET-08-0779); 文摘为了阐明Streptomyces sahachiroi ATCC 33158中Ⅲ型聚酮合酶基因orf18的功能,利用同源双交换的方法对该基因进行同框敲除,采用异位表达的方法进行了相应的回补实验。通过高效液相色谱及液相色谱-质谱联用分析发现基因orf18的敲除会明显降低发酵产物中苯甲酸盐的含量,回补该基因能够在一定程度上恢复苯甲酸盐的产量,表明orf18在原宿主中极有可能参与苯甲酸盐的生物合成。; 关键词链霉菌 ⅲ型聚酮合酶同源双交换同框敲除基因回补苯甲酸盐; Keywords Streptomyces sahachiroi type ⅲ polyketide synthase homologous double-crossover in-frame deletion gene complementation benzoate; 分类号 Q939.9 [生物学—微生物学]; 在线阅读下载PDF 职称材料

题名虎杖中一种新的2-吡喃酮合酶基因的克隆和功能研究（英文）被引量：1: 4; 作者陈默吴志军王晓伟胡红艳曹杰柴团耀王红; 机构中国科学院大学生命科学学院中国科学院遗传与发育生物学研究所; 出处《生物化学与生物物理进展》 SCIE CAS CSCD 北大核心 2019年第7期699-710,共12页; 基金 supported by grants from The National Natural Science Foundation of China(61672489,61379081) the Chinese Academy of Sciences(KJRH2016)~~; 文摘 4-羟基-6-甲基-2-吡喃酮(2-吡喃酮)及其衍生物是一类重要的植物次生代谢产物,具有抗虫、抗真菌等功能,在工业上可用于生产可再生化学平台间苯三酚和1,3,5-三氨基-2,4,6-三硝基苯. 2-吡喃酮合酶(2PS),一种Ⅲ型聚酮合酶(PKSs),是合成2-吡喃酮的关键酶.本研究以中药材虎杖(Polygonum cuspidatum Sieb. et Zucc)为材料,从中分离鉴定了一种新的2-吡喃酮合酶(Pc2PS). Pc2PS与已知的几种2PSs的氨基酸序列相似性为54%~56%.通过体外酶促反应鉴定功能发现,Pc2PS可以催化1分子乙酰-CoA与2分子丙二酰-CoA,缩合生成4-羟基-6-甲基-2-吡喃酮;也可以只利用3分子丙二酰-CoA,以相同的效率缩合生成2-吡喃酮.由此可以看出,乙酰-CoA存在与否并不影响该酶的催化效率.随后,我们测定了Pc2PS以丙二酰-CoA为单一底物时的酶动力学参数.虽然之前报道的2PSs也可以只利用丙二酰-CoA生成2-吡喃酮,但与Pc2PS不同的是,乙酰-CoA的缺失会大大降低催化效率.另外,对Pc2PS基因的组织表达特异性检测结果表明,该基因主要在虎杖根中表达,在叶中的表达量很低.本研究丰富了2PS的种类,并为2-吡喃酮的生物合成提供了基因资源.; 关键词 ⅲ型聚酮合酶 2-吡喃酮合酶虎杖; Keywords TypeⅲPKS 2-Pyrone synthase Polygonum cuspidatum; 分类号 Q943.2 [生物学—植物学] S567.239 [农业科学—中草药栽培]; 在线阅读下载PDF 职称材料

题名月季新型PKSⅢ基因的生物信息学分析及原核表达被引量：1: 5; 作者汪王吉乃喆崔娇鹏赵世伟赵惠恩; 机构北京林业大学园林学院北京市园林科学研究院北京市植物园; 出处《西北农林科技大学学报（自然科学版）》 CSCD 北大核心 2022年第12期97-107,共11页; 基金北京市科技计划项目(Z201100008020004)。; 文摘【目的】对月季Ⅲ型聚酮合酶基因(RcPKSⅢ)进行生物信息学和原核表达分析,为进一步探究该基因的催化功能奠定基础。【方法】以‘月月粉’花瓣为研究材料,从其基因组中筛选月季PKS基因(RcPKSs)家族成员,并对其进行生物信息学分析;利用MEGA软件对RcPKSs与其他植物PKS氨基酸序列进行系统发育分析;利用DNAMAN软件对RcPKSs和紫花苜蓿查尔酮合酶2(CHS2)基因进行序列比对分析;对RcPKSs和紫花苜蓿CHS2活性位点上的氨基酸残基进行比较,分析其催化特征;利用SWISS-MODEL对RcPKSs进行同源建模,并与紫花苜蓿CHS2蛋白三维结构进行比较。利用实时荧光定量PCR方法,分析RcPKSs和间苯三酚甲基化酶编码基因在‘月月粉’花蕾期、半开期和盛开期的表达模式;克隆RcPKSs基因全长,构建其原核表达载体pET-32a-RcPKSs,进行诱导表达,并对重组蛋白进行纯化。【结果】从‘月月粉’基因组中共鉴定出6个RcPKSs,生物信息学分析表明,RcPKS1、RcPKS2和RcPKS3为CHS基因,RcPKS4、RcPKS5和RcPKS6为新型PKSⅢ基因。系统发育分析表明,RcPKS1、RcPKS2和RcPKS3编码CHS蛋白,RcPKS4、RcPKS5和RcPKS6编码新型的非CHS蛋白。序列比对分析表明,RcPKS1、RcPKS2和RcPKS3蛋白与紫花苜蓿CHS2相似度均为72.16%,RcPKS4、RcPKS5和RcPKS6与紫花苜蓿CHS2相似度分别为67.52%,33.85%和32.73%。活性位点上氨基酸残基比较发现,RcPKS1、RcPKS2和RcPKS3活性位点上氨基酸残基均保守,RcPKS4氨基酸残基在起始口袋和延伸口袋处发生替换,RcPKS5和RcPKS6氨基酸残基均在延伸口袋处发生替换。对RcPKSs蛋白质结构的分析结果显示,RcPKS4、RcPKS5和RcPKS6蛋白质采用了几乎相同的αβαβα三维整体折叠形式。实时荧光定量分析表明,RcPKS4、RcPKS5和RcPKS6表达量在‘月月粉’花朵盛开期最高,间苯三酚O-甲基转移酶基因(POMT)、苔黑酚O-甲基转移酶基因1(OOMT1)和OOMT2表达量在盛开期最低。聚丙烯酰胺凝胶电泳(SDS-PAGE)结果表明,重组蛋白诱导并且纯化成功。【结论】鉴定了‘月月粉’新型RcPKSⅢ基因,该基因可能参与花发育调控过程。克隆了RcPKSs基因,并诱导表达获得了RcPKSs重组蛋白。; 关键词月季 ⅲ型聚酮合酶基因原核表达生物信息学; Keywords Rosa chinensis PKSⅲgene prokaryotic expression bioinformatics; 分类号 S685.12 [农业科学—观赏园艺]; 在线阅读下载PDF 职称材料

题名内生放线菌A00122中germicidin生物合成基因的克隆: 6; 作者吴莹莹李瑶瑶郑忠辉白林泉黄耀坚; 机构厦门大学生命科学学院上海交通大学生命科学与技术学院; 出处《厦门大学学报（自然科学版）》 CAS CSCD 北大核心 2011年第3期598-602,共5页; 基金国际合作项目(DFA30970) 教育部科学技术研究重大项目(306010); 文摘在植物和细菌中,Ⅲ型聚酮合酶能够产生种类多样的次生代谢产物.在药用植物内生放线菌A00122的发酵产物中,分离到了一个已知的Ⅲ型聚酮类化合物germicidin.对A00122菌株建立了基因组文库,根据已知的同源基因Sco7221设计引物作为探针对文库进行PCR筛选,并通过Southern杂交的方法从阳性克隆5-3-10中定位了包含germi-cidin基因的片段,经测序得到长度为1 185 bp的完整合成基因.该基因的获得为深入研究Ⅲ型聚酮合酶的底物选择性,通过定向改造的方法获得非天然Ⅲ型聚酮类化合物提供了重要基础.; 关键词 ⅲ型聚酮合酶 germicidin 基因克隆; Keywords type ⅲ polyketide synthases germicidin gene cloning; 分类号 Q935 [生物学—微生物学]; 在线阅读下载PDF 职称材料

	题名	作者	出处	发文年	被引量	操作
1	植物Ⅲ型聚酮合酶基因家族的分子进化分析	王波孙君社翟玉盼孙立伟张秀清	《生物技术通报》 CAS CSCD 北大核心	2011	2	在线阅读下载PDF 职称材料
2	地衣型真菌皮革肾岛衣中1个Ⅲ型聚酮合酶基因的克隆与鉴定	原晓龙华梅陈剑王娟王毅	《西北植物学报》 CAS CSCD 北大核心	2017	0	在线阅读下载PDF 职称材料
3	利用同框敲除技术研究Ⅲ型聚酮合酶基因orf18的代谢产物	原海亮管仁艳何璟	《华中农业大学学报》 CAS CSCD 北大核心	2016	0	在线阅读下载PDF 职称材料
4	虎杖中一种新的2-吡喃酮合酶基因的克隆和功能研究（英文）	陈默吴志军王晓伟胡红艳曹杰柴团耀王红	《生物化学与生物物理进展》 SCIE CAS CSCD 北大核心	2019	1	在线阅读下载PDF 职称材料
5	月季新型PKSⅢ基因的生物信息学分析及原核表达	汪王吉乃喆崔娇鹏赵世伟赵惠恩	《西北农林科技大学学报（自然科学版）》 CSCD 北大核心	2022	1	在线阅读下载PDF 职称材料
6	内生放线菌A00122中germicidin生物合成基因的克隆	吴莹莹李瑶瑶郑忠辉白林泉黄耀坚	《厦门大学学报（自然科学版）》 CAS CSCD 北大核心	2011	0	在线阅读下载PDF 职称材料