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一种基于iSRM策略的蛋白质组质谱数据分析工具
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作者 张伟 卫军营 +6 位作者 贾婷 徐长明 张纪阳 朱云平 钱小红 张养军 谢红卫 《质谱学报》 EI CAS CSCD 北大核心 2013年第1期15-22,共8页
由于重复性好、定量精度高,基于质谱的选择反应监测(SRM)技术在蛋白质定量分析中的应用越来越广泛。智能选择反应监测(iSRM)是一种新型的SRM实验策略。针对该策略产生的质谱数据,开发了一个肽段定量信息提取工具——iSQuant。该工具使用... 由于重复性好、定量精度高,基于质谱的选择反应监测(SRM)技术在蛋白质定量分析中的应用越来越广泛。智能选择反应监测(iSRM)是一种新型的SRM实验策略。针对该策略产生的质谱数据,开发了一个肽段定量信息提取工具——iSQuant。该工具使用MATLAB脚本语言编写,简便易用。利用重复实验数据和标准实验数据对iSQuant的性能评估表明,iSQuant具有优越的可重复性能,定量结果和理论丰度线性度很高。 展开更多
关键词 智能选择反应监测(isrm) 质谱分析 蛋白质组 分析工具 可重复性能 线性性能
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分散固相萃取-气相色谱-串联质谱法测定蔬菜中107种农药的残留量 被引量:79
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作者 沈伟健 余可垚 +5 位作者 桂茜雯 蒋原 赵增运 沈崇钰 吴斌 储晓刚 《色谱》 CAS CSCD 北大核心 2009年第4期391-400,共10页
采用分散固相萃取-气相色谱-串联质谱(QuEChERS-GC-MS/MS)建立了蔬菜中107种农药残留量的分析方法。样品由含1%冰醋酸的正己烷饱和乙腈提取、分散固相萃取法净化,采用气相色谱-串联质谱方法在分时段选择反应监测模式下进行测定,外标法... 采用分散固相萃取-气相色谱-串联质谱(QuEChERS-GC-MS/MS)建立了蔬菜中107种农药残留量的分析方法。样品由含1%冰醋酸的正己烷饱和乙腈提取、分散固相萃取法净化,采用气相色谱-串联质谱方法在分时段选择反应监测模式下进行测定,外标法定量。所有农药在0.05~1mg/L范围内线性关系均良好;所有农药的方法定量限(LOQ)均低于10μg/kg;在10μg/kg的添加水平下,大蒜、青刀豆、萝卜和菠菜4种基质中绝大多数农药的平均回收率处于60%~130%之间,相对标准偏差(RSD)不大于15.3%。该方法不仅能用于多种蔬菜基质中107种农药残留的检测,而且还能较好地解决本底成分相当复杂的大蒜基质极易出现的干扰问题。 展开更多
关键词 气相色谱-串联质谱 选择反应监测 分散固相萃取 多农药残留 蔬菜
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气相色谱-三重四极质谱对复杂基质蔬菜(洋葱、茴香)中12种农药残留量的同时测定 被引量:7
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作者 王建 贾斌 张伟国 《分析测试学报》 CAS CSCD 北大核心 2008年第S1期177-179,共3页
A new method was developed for the simultaneous analysis of 12 pesticide residues in onion and fennel by gas chromatography(GC)-triple quadrupole mass spectrometry(MS/MS)-electron impact ion source(EI)-select reaction... A new method was developed for the simultaneous analysis of 12 pesticide residues in onion and fennel by gas chromatography(GC)-triple quadrupole mass spectrometry(MS/MS)-electron impact ion source(EI)-select reaction monitoring mode(SRM).The 12 pesticide includes fungicide,acaricide,carbamate and plant growth regulator pesticide.The complicated matrix samples of onion and fennel were extracted by acetonitrile,cleaned up by solid phase extraction of Carb/PSA.By optimizing the GC-MS/MS-SRM parameters,the interference from clean-up procedure was further removed and 12 pesticide residues were determined accurately.The average recoveries for most pesticides(at the spiked level of 0.05-0.20 mg/kg) were between 114%-156%,the relative standard deviation(RSD) of the method was less than 20%,and the limit of detection were 0.5-5 μg/kg. 展开更多
关键词 VEGETABLE PESTICIDE RESIDUES gas chromatography-triple QUADRUPOLE mass SPECTROMETRY select reaction monitoring
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分散型固相萃取-气相色谱串联质谱法测定食品中8种芳氧苯氧丙酸酯类除草剂的残留量 被引量:8
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作者 赵增运 徐星 +7 位作者 沈伟健 余可垚 柳菡 桂茜雯 龚玉霞 沈崇钰 吴斌 蒋原 《质谱学报》 EI CAS CSCD 2010年第5期306-312,共7页
建立了大豆、绿茶、大米、胡萝卜、菠菜、豌豆、大蒜、草莓、蜂蜜、猪肉、鱼肉、鸡蛋等12种食品中8种芳氧苯氧丙酸酯类除草剂残留量的分散型固相萃取-气相色谱串联质谱(DSPE-GC-MS/MS)分析方法。样品由含1%冰醋酸的正己烷的饱和乙腈... 建立了大豆、绿茶、大米、胡萝卜、菠菜、豌豆、大蒜、草莓、蜂蜜、猪肉、鱼肉、鸡蛋等12种食品中8种芳氧苯氧丙酸酯类除草剂残留量的分散型固相萃取-气相色谱串联质谱(DSPE-GC-MS/MS)分析方法。样品由含1%冰醋酸的正己烷的饱和乙腈溶液提取,分散型固相萃取法净化,采用气相色谱-串联质谱分时段反应离子监测技术进行测定,外标法定量。所有农药在10~1 000μg.L-1范围内线性良好;方法定量限(LOQ)均低于10μg.kg-1;在10、20、40μg.kg-1三个添加水平下,大豆等12种代表性基质中所有农药的平均回收率均处于70%~120%之间,RSD≤13%;该方法选择性较好,不仅能够用于多种食品基质的残留检测,而且还能较好地解决本底成分相当复杂的大蒜基质极易出现的干扰问题。 展开更多
关键词 气相色谱-串联质谱(GC/MS) 反应离子监测(srm) 分散型固相萃取(DSPE) 芳氧苯氧丙酸酯类除草剂 食品
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选择性反应监测技术在蛋白质组学研究中的进展及应用 被引量:2
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作者 单亦初 张丽华 张玉奎 《色谱》 CAS CSCD 北大核心 2014年第4期330-335,共6页
选择性反应监测(SRM)技术作为一种重要的定向蛋白质分析技术,通过选择性检测特定母离子和子离子来排除非目标组分的干扰,增强了检测灵敏度和定量准确度,具有选择性高、重复性好、灵敏度高、动态范围宽等优点,已被广泛应用于定量蛋白质... 选择性反应监测(SRM)技术作为一种重要的定向蛋白质分析技术,通过选择性检测特定母离子和子离子来排除非目标组分的干扰,增强了检测灵敏度和定量准确度,具有选择性高、重复性好、灵敏度高、动态范围宽等优点,已被广泛应用于定量蛋白质组学研究,在生命科学领域发挥着至关重要的作用。本文从分析通量、检测灵敏度、定量方法以及相关软件资源4个方面,对近期SRM技术的研究进展进行了综述。然后,对SRM技术在蛋白质组学研究包括生物标志物验证、蛋白质翻译后修饰研究、生物工程以及信号通路分析等领域中的应用进行了概述。最后,本文对SRM技术的应用以及发展前景进行了展望。 展开更多
关键词 选择性反应监测 蛋白质组 定量 综述
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基于质谱的选择反应监测技术相关策略和方法的研究进展 被引量:9
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作者 常乘 吴松锋 +2 位作者 马洁 张伟 朱云平 《生物化学与生物物理进展》 SCIE CAS CSCD 北大核心 2012年第11期1118-1127,共10页
随着蛋白质组学研究的不断深入,基于质谱的选择反应监测技术(SRM)已经成为以发现生物标志物为代表的定向蛋白质组学研究的重要手段.SRM技术根据假设信息,特异性地获取符合假设条件的质谱信号,去除不符合条件的离子信号干扰,从而得到特... 随着蛋白质组学研究的不断深入,基于质谱的选择反应监测技术(SRM)已经成为以发现生物标志物为代表的定向蛋白质组学研究的重要手段.SRM技术根据假设信息,特异性地获取符合假设条件的质谱信号,去除不符合条件的离子信号干扰,从而得到特定蛋白质的定量信息.SRM技术具有更高的灵敏度和精确性、更大的动态范围等优势.该技术可分为实验设计、数据获取和数据分析三个步骤.在这几个步骤中,最重要的是利用生物信息学手段总结当前实验数据的结果,并用机器学习方法和总结的经验规则进行SRM实验的母离子和子离子对的预测.针对数据质控和定量的生物信息学方法研究在提高SRM数据可靠性方面具有重要作用.此外,为方便SRM的研究,本文还收集、汇总了SRM技术相关的软件、工具和数据库资源.随着质谱仪器的不断发展,新的SRM实验策略以及分析方法、计算工具也应运而生.结合更优化的实验策略、方法,采用更精准的生物信息学算法和工具,SRM在未来蛋白质组学的发展中将发挥更加重要的作用. 展开更多
关键词 定向蛋白质组学 生物质谱 选择反应监测技术 蛋白质特异性肽段 母离子-子离子对
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色谱-三重四级杆质谱定量分析深度加氢脱硫柴油中的二苯并噻吩类化合物 被引量:3
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作者 刘明星 李颖 刘泽龙 《石油学报(石油加工)》 EI CAS CSCD 北大核心 2015年第5期1103-1109,共7页
利用选择反应监测模式(SRM),建立了一种快速、灵敏的深度加氢脱硫柴油中二苯并噻吩类化合物(DBTs)的气相色谱-三重四级杆质谱(GC-QQQ-MS/MS)测定方法。以5种DBTs混合标样绘制标准曲线,对深度加氢柴油中的C0~C4烷基取代二苯并噻... 利用选择反应监测模式(SRM),建立了一种快速、灵敏的深度加氢脱硫柴油中二苯并噻吩类化合物(DBTs)的气相色谱-三重四级杆质谱(GC-QQQ-MS/MS)测定方法。以5种DBTs混合标样绘制标准曲线,对深度加氢柴油中的C0~C4烷基取代二苯并噻吩((C0~C4)DBTs)进行定量。实验结果表明,采用该方法可以避免柴油中其他化合物的干扰,快速准确测定深度加氢脱硫柴油中(C0~C4)DBTs的含量,而且重现性好,相对标准偏差低于10%,方法的线性相关系数R2〉0.9996,检出限和定量限分别在0.0006~0.0017mg/L和0.002~0.006mg/L范围,回收率在98.23%~114.59%范围。该方法适用于深度加氢脱硫柴油中DBTs的测定。 展开更多
关键词 二苯并噻吩类化合物 气相色谱-三重四级杆质谱 柴油 选择反应监测 深度加氢脱硫
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液相色谱-质谱法测定墨水中蓖麻油硫酸钠
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作者 杨成对 宋莉晖 张焱 《理化检验(化学分册)》 CAS CSCD 北大核心 2008年第4期326-327,329,共3页
建立了用液相色谱串联质谱对蓖麻油硫酸钠进行定性定量的分析方法。采用SR-CN型色谱柱(100 mm×4.6 mm,3.5μm),以甲醇-水(1+1)为流动相,流速500μL·min^-1。质谱测定中采用电喷雾电离源,负离子采集模式,定量离子对m/z377... 建立了用液相色谱串联质谱对蓖麻油硫酸钠进行定性定量的分析方法。采用SR-CN型色谱柱(100 mm×4.6 mm,3.5μm),以甲醇-水(1+1)为流动相,流速500μL·min^-1。质谱测定中采用电喷雾电离源,负离子采集模式,定量离子对m/z377/297。该方法检出限为0.1 mg·L^-1,线性范围0.4-400 mg·L^-1。方法用于墨水中蓖麻油硫酸钠的定性定量分析。 展开更多
关键词 液相色谱-质谱 选择反应监测 蓖麻油硫酸钠
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依赖色谱保留时间的智能化选择反应监测质谱方法的建立及其初步应用 被引量:2
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作者 毛心丽 卫军营 +6 位作者 牛明 周廉淇 王雪颖 佟巍 秦伟捷 张养军 钱小红 《色谱》 CAS CSCD 北大核心 2012年第2期170-177,共8页
建立了依赖色谱保留时间的智能化选择反应监测质谱方法,并与非依赖色谱保留时间的智能化选择反应监测质谱分析方法对不同体系(牛血清白蛋白酶切物、6种标准蛋白质混合物酶切物、腾冲嗜热菌蛋白提取液酶切物)的分析结果进行了系统比较。... 建立了依赖色谱保留时间的智能化选择反应监测质谱方法,并与非依赖色谱保留时间的智能化选择反应监测质谱分析方法对不同体系(牛血清白蛋白酶切物、6种标准蛋白质混合物酶切物、腾冲嗜热菌蛋白提取液酶切物)的分析结果进行了系统比较。结果表明,引入色谱保留时间后的智能化选择反应监测质谱方法能够显著提高肽段及蛋白质的鉴定量,并且在复杂体系(如腾冲嗜热菌蛋白提取液酶切物)中效果尤为明显,鉴定到的肽段及蛋白质的覆盖率可分别达到目标肽段和蛋白质数量的89.62%和92.41%,并且灵敏度高、重复性好,能够实现对质荷比相同但保留时间有差异的肽段的准确鉴定。该方法将在复杂生物样本目标蛋白质组高通量、高灵敏度的鉴定、验证和确认中发挥独特作用。 展开更多
关键词 液相色谱 保留时间 智能化选择反应监测 质谱 目标蛋白质组学 腾冲嗜热菌
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超高效液相色谱-串联质谱法测定食用油中的叔丁基对苯二酚 被引量:14
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作者 张朋杰 张宪臣 +1 位作者 张静 王勇 《食品科学》 EI CAS CSCD 北大核心 2009年第6期143-145,共3页
目的:建立一套稳定可靠的使用超高效液相色谱-串联质谱(UPLC-MS/MS)测定食用油中的抗氧化剂叔丁基对苯二酚(TBHQ)的方法。方法:用乙腈振荡萃取样品中的TBHQ,以乙腈-水为流动相洗脱,以反相C18柱作为分离柱,以电喷雾离子源为接口,负离子... 目的:建立一套稳定可靠的使用超高效液相色谱-串联质谱(UPLC-MS/MS)测定食用油中的抗氧化剂叔丁基对苯二酚(TBHQ)的方法。方法:用乙腈振荡萃取样品中的TBHQ,以乙腈-水为流动相洗脱,以反相C18柱作为分离柱,以电喷雾离子源为接口,负离子模式扫描,选择监测(SRM)模式检测,外标法定量。结果:本方法的检出限为0.10mg/kg,在0.05~2.5μg/ml浓度范围内呈良好线性,相关系数大于0.999,回收率83%~115%。结论:实验结果表明该方法灵敏度高,检出限低,确证能力强,分析时间短,能够准确的测定食用油中的抗氧化剂TBHQ的含量。 展开更多
关键词 超高效液相色谱-串联质谱法 选择监测(srm)模式 叔丁基对苯二酚 食用油
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浅谈定向质谱法验证蛋白质生物标记物
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作者 张展 杨建新 郭育培 《现代畜牧兽医》 2012年第5期62-67,共6页
特异性生物标记物的发现有益于疾病的早期诊断,促进靶向治疗的发展,并提供精确的治疗反应监控方法。血浆中候选生物标记物的验证过程中的一个主要问题是血浆中蛋白质浓度的动态范围非常广。本文回顾了当前能够在所预期的血浆浓度范围内(... 特异性生物标记物的发现有益于疾病的早期诊断,促进靶向治疗的发展,并提供精确的治疗反应监控方法。血浆中候选生物标记物的验证过程中的一个主要问题是血浆中蛋白质浓度的动态范围非常广。本文回顾了当前能够在所预期的血浆浓度范围内(如ng/ml浓度水平)量化候选生物标记物的定向蛋白质组学策略。另外,提供了基于定向质谱法,可对大部分候选生物标记蛋白进行快速验证的技术流程。这些公开数据库中的技术对生物标记的验证研究中的处理量具有极大影响潜力。 展开更多
关键词 生物标记物 srm 定向质谱法
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