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反刍动物瘤胃氮素高效利用微生物及酶学研究进展
1
作者 杨斯涵 张振斌 +1 位作者 王林枫 王梦芝 《饲料工业》 北大核心 2025年第20期11-18,共8页
反刍动物摄入的饲粮在瘤胃中经历一系列复杂的生物化学过程,逐步转化为小分子物质。这些物质部分作为瘤胃微生物的氮源,包括氨、肽和氨基酸等;而另一部分则通过发酵作用转化为挥发性脂肪酸,为瘤胃微生物的蛋白合成提供必需的碳骨架和能... 反刍动物摄入的饲粮在瘤胃中经历一系列复杂的生物化学过程,逐步转化为小分子物质。这些物质部分作为瘤胃微生物的氮源,包括氨、肽和氨基酸等;而另一部分则通过发酵作用转化为挥发性脂肪酸,为瘤胃微生物的蛋白合成提供必需的碳骨架和能量。在反刍动物瘤胃生态系统中,特定细菌类群通过分泌胞外蛋白酶驱动饲粮蛋白的水解过程。基于宏蛋白质组学研究,已鉴定出4种核心功能菌株:嗜淀粉瘤胃杆菌(Ruminobacter amylophilus)、溶纤维丁酸弧菌(Butyrivibrio fibri-solvens)、瘤胃普雷沃氏菌(Prevotella ruminicola)及牛链球菌(Streptococcus bovis),其分泌的丝氨酸/金属蛋白酶可高效催化粗蛋白的脱氨基与肽链裂解反应。文章综述了这些菌种的形态学特征、生理功能,以及它们所分泌蛋白酶的生物化学特性,旨在为反刍动物营养调控和饲粮配方的精细化设计提供科学依据。 展开更多
关键词 瘤胃微生物 瘤胃蛋白降解菌 蛋白酶 挥发性脂肪酸 营养调控
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牦牛瘤胃纤维素降解菌的筛选鉴定及产酶条件优化
2
作者 王永奔 卢博雨 +5 位作者 张朋 姚有莉 吴国芳 张剑搏 罗璇 王磊 《动物营养学报》 北大核心 2025年第8期5667-5680,共14页
本试验旨在从牦牛瘤胃中筛选鉴定高纤维素酶活性益生菌,为其后续作为饲料添加剂在动物养殖中应用提供参考。试验采用LB-羧甲基纤维素固体培养基和刚果红染色法分离初筛产纤维素酶细菌,然后采用二硝基水杨酸(DNS)法复筛获得高纤维素酶活... 本试验旨在从牦牛瘤胃中筛选鉴定高纤维素酶活性益生菌,为其后续作为饲料添加剂在动物养殖中应用提供参考。试验采用LB-羧甲基纤维素固体培养基和刚果红染色法分离初筛产纤维素酶细菌,然后采用二硝基水杨酸(DNS)法复筛获得高纤维素酶活性细菌,并对其进行形态学、生理生化、分子生物学和益生性鉴定以及产酶条件优化。结果表明:1)试验共筛选获得10株具有降解纤维素能力的菌,其中5株为解淀粉芽孢杆菌(Bacillus amyloliquefaciens),3株为地衣芽孢杆菌(Bacillus licheniformis),2株属于芽孢杆菌属(Bacillus)。2)菌株YR3.2(为解淀粉芽孢杆菌)外切葡聚糖酶和内切葡聚糖酶活性均显著高于其他菌株(P<0.05),分别为78.09和54.69 U/mL。3)除了少数菌株耐受四环素和红霉素外,多数菌株对8种抗生素均敏感,并对大肠杆菌和金黄色葡萄球菌具有良好的抑制效果;10株菌均不含ace、gelE和cylA毒力因子基因;菌株YR3.2的表面疏水率和自凝集率最高,分别为97.55%和80.84%。4)菌株YR3.2产酶条件最佳组合为初始pH 7.0、时间36 h、温度35℃,此条件下羧甲基纤维素酶活性为72.78 U/mL;液态发酵7 d,油菜秸秆和燕麦秸秆损失率分别为18.52%和23.34%。综上所述,菌株YR3.2具有较高的纤维素酶活性和益生特性,可作为候选菌株在饲草料加工和动物养殖中应用。 展开更多
关键词 牦牛 瘤胃 纤维素降解菌 纤维素酶 益生特性 产酶条件优化
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妊娠120 d与临产湖羊瘤胃细菌群落组成及功能研究
3
作者 赵岩岩 李胜利 《饲料研究》 北大核心 2025年第17期10-16,共7页
试验旨在探究妊娠120 d与临产湖羊瘤胃细菌群落组成及功能。选取12只初次妊娠的健康湖羊(妊娠90 d)随机分为两组:妊娠120 d组(T120组)和临产组(T150组),每组6只羊。两组饲喂的饲粮以及管理条件相同,分别在妊娠第120和150天采集瘤胃液,... 试验旨在探究妊娠120 d与临产湖羊瘤胃细菌群落组成及功能。选取12只初次妊娠的健康湖羊(妊娠90 d)随机分为两组:妊娠120 d组(T120组)和临产组(T150组),每组6只羊。两组饲喂的饲粮以及管理条件相同,分别在妊娠第120和150天采集瘤胃液,用宏基因组测序技术检测细菌。结果显示,T120组和T150组在门和种水平上的细菌组成相似,均以拟杆菌门和厚壁菌门为优势菌门,以栖瘤胃普雷沃氏菌、布氏密螺旋体和黄色瘤胃球菌为优势菌种。T150组变形菌门的相对丰度显著高于T120组(P<0.05)。反刍月形单胞菌富集于T120组,瘤胃假丁酸弧菌富集于T150组。显著富集于T150组的代谢通路有35条,其中2条属于碳水化合物代谢,10条属于氨基酸代谢,4条属于辅因子和维生素代谢;显著富集于T120组的代谢通路有9条,包括催乳素信号通路、胰高血糖素信号通路、抗原处理与呈递通路等。研究表明,妊娠120 d和临产湖羊瘤胃细菌群落组成相似,优势菌群无差异,低丰度菌群的相对丰度存在差异;临产湖羊瘤胃细菌在氨基酸和碳水化合物代谢功能通路上的丰度高于妊娠120 d。可在湖羊妊娠后期逐步提高饲粮中优质蛋白及易发酵碳水化合物供给,以满足瘤胃细菌对氨基酸代谢和碳水化合物代谢功能增强的需求;还可以在饲粮中添加栖瘤胃普雷沃氏菌和黄色瘤胃球菌等有益菌,改善母羊及其后代的整体健康状况。 展开更多
关键词 湖羊 妊娠后期 宏基因组 瘤胃细菌 功能差异分析
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不同产奶量遗传潜力后备牛瘤胃微生物区系的比较
4
作者 何丽丽 刘乐 +2 位作者 马楠 樊希雅 王玲 《农业科学研究》 2025年第1期59-65,共7页
为研究不同产奶量遗传潜力后备牛瘤胃发酵参数和瘤胃细菌群落的差异,选择14头体况相近、发育状况良好的7月龄后备牛在同一牛舍进行散栏饲养,喂食相同日粮。根据试验牛基因组综合育种值及其母亲上一胎次产奶量,将试验牛分为高产奶量遗传... 为研究不同产奶量遗传潜力后备牛瘤胃发酵参数和瘤胃细菌群落的差异,选择14头体况相近、发育状况良好的7月龄后备牛在同一牛舍进行散栏饲养,喂食相同日粮。根据试验牛基因组综合育种值及其母亲上一胎次产奶量,将试验牛分为高产奶量遗传潜力组(H)和低产奶量遗传潜力组(L),晨饲前采集瘤胃液,对瘤胃发酵参数和瘤胃细菌群结构进行分析比较。结果表明:L组瘤胃乙酸、丙酸、丁酸和总挥发性脂肪酸的浓度显著高于H组(P<0.05);L组瘤胃细菌丰富度显著高于H组(P<0.05),细菌群落多样性无显著差异。在细菌门水平上,拟杆菌门和厚壁菌门是7月龄不同产奶量遗传潜力后备牛瘤胃的优势菌门,L组变形菌门的相对丰度显著高于H组(P<0.01);在属水平上,不同产奶量遗传潜力后备牛瘤胃细菌相对丰度差异不显著(P>0.05)。可见,在采食相同日粮条件下,不同产奶量遗传潜力后备牛瘤胃细菌群落结构的差异小。 展开更多
关键词 遗传潜力 7月龄后备牛 发酵参数 瘤胃细菌
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复合菌剂发酵玉米秸秆对绵羊瘤胃液细菌多样性的影响 被引量：26
5
作者 郭威 郭晓军 +2 位作者 周贤 李术娜 朱宝成 《畜牧兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2018年第4期736-745,共10页
旨在通过16SrDNA高通量测序技术研究发酵玉米秸秆对绵羊瘤胃液细菌多样性的影响。本研究选用装有瘤胃瘘管的南非肉用美利奴♂×东北细毛羊♀的F1代成年公羊12只,随机平均分为两组,分别饲喂青贮玉米秸秆和发酵玉米秸秆。分别在饲喂前... 旨在通过16SrDNA高通量测序技术研究发酵玉米秸秆对绵羊瘤胃液细菌多样性的影响。本研究选用装有瘤胃瘘管的南非肉用美利奴♂×东北细毛羊♀的F1代成年公羊12只,随机平均分为两组,分别饲喂青贮玉米秸秆和发酵玉米秸秆。分别在饲喂前1天、饲喂第7、21天晨饲后6h取瘤胃液。同一时间所采取的同一处理的样品混合均匀,分别命名为青贮组(CS:YD0、YD7、YD21)和发酵组(FCS:YS0、YS7、YS21),之后通过高通量测序进行分析。结果显示:1)绵羊瘤胃内细菌群落包括29个门,74个纲,135个目,215个科和428个属。2)青贮组以拟杆菌门(Bacteroidetes)为优势菌群,其次为黏胶球形菌门(Lentisphaerae)、厚壁菌门(Firmicutes)和纤维杆菌门(Fibrobacteres),发酵组优势菌亦为拟杆菌门,其次为厚壁菌门、黏胶球形菌门和纤维杆菌门。通过21d的饲喂试验可知,青贮组拟杆菌门和厚壁菌门所占比例较发酵组降低,两组黏胶球形菌门和纤维杆菌门菌群数量都有所增加,但青贮组增加幅度更大。3)拟杆菌门的普雷沃氏菌属(Prevotella)在发酵组饲喂7d后成为最优势菌属(丰度达15.56%),而在青贮组明显降低(丰度从10.48%降至3.17%);纤维杆菌属(Fibrobacter)相对丰度在饲喂21d后青贮组增加量大于发酵组。4)在97%相似性水平下,饲喂21d后发酵组的Shannon和Simpson指数更高,表明它拥有更高的瘤胃细菌多样性。复合菌剂发酵玉米秸秆提高了绵羊瘤胃细菌多样性。饲喂发酵玉米秸秆的绵羊瘤胃内拟杆菌门和厚壁菌门菌群的比例降低,而黏胶球形菌门和纤维杆菌门菌群的数量增加。 展开更多
关键词 发酵玉米秸秆 绵羊 瘤胃细菌 多样性
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饲粮精粗比对泌乳水牛瘤胃细菌和甲烷菌区系的影响 被引量：25
6
作者 林波 梁辛 +3 位作者 李丽莉 韦升菊 李萍 邹彩霞 《动物营养学报》 CAS CSCD 北大核心 2016年第10期3101-3109,共9页
本试验旨在研究饲粮精粗比对泌乳水牛瘤胃细菌和甲烷菌区系的影响。选取15头健康杂交后备泌乳水牛,按体重、采食量等相近原则随机分为3组,每组5头,分别饲喂精粗比为0∶100（全粗料组）、35∶65（低精料组）、50∶50（中等精料组）的混... 本试验旨在研究饲粮精粗比对泌乳水牛瘤胃细菌和甲烷菌区系的影响。选取15头健康杂交后备泌乳水牛,按体重、采食量等相近原则随机分为3组,每组5头,分别饲喂精粗比为0∶100（全粗料组）、35∶65（低精料组）、50∶50（中等精料组）的混合饲粮。试验为期40 d,其中前10 d为预试期。在试验结束后第1天,经口腔抽取瘤胃液抽提微生物DNA,采用Illumina Miseq PE250平台研究瘤胃细菌和甲烷菌区系组成。结果表明：1）在门水平上,水牛瘤胃内拟杆菌门（45%-65%）、厚壁菌门（13%-27%）和变形菌门（13%-18%）为主要细菌类别,与低精料组和中等精料组相比,全粗料组提高了拟杆菌门、黄杆菌门和SR1细菌的比例,降低了厚壁菌门、疣微菌门、放线菌门和绿弯菌门细菌的比例;在科水平上,普雷沃氏科（15%-32%）和黄杆菌科（8%-21%）为主要细菌类别,与中等精料组相比,全粗料组、低精料组提高了普雷沃氏科细菌的比例,降低了黄杆菌科、毛螺菌科、瘤胃球菌科、红蝽杆菌科和双歧杆菌科细菌的比例;中等精料组瘤胃细菌相比全粗料组有更高的多样性。2）水牛瘤胃内,90%以上的甲烷菌为甲烷短杆菌属,其次为热原体属,饲粮精粗比的改变并未影响甲烷短杆菌属在瘤胃内的优势地位。综合得出,全粗料饲粮有提高水牛瘤胃内纤维降解相关细菌比例的趋势,却降低了瘤胃细菌的多样性;饲粮精粗比的差异对水牛瘤胃甲烷菌在属水平上的组成并无显著影响。 展开更多
关键词 水牛 精粗比 瘤胃 细菌区系 甲烷菌区系
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基于MiSeq分析川中黑山羊瘤胃细菌的多样性及群落结构 被引量：13
7
作者 陈芸 刘旗 +3 位作者 邓俊良 任志华 杨颜铱 高爽 《湖南农业大学学报（自然科学版）》 CAS CSCD 北大核心 2017年第3期286-291,共6页
采用MiSeq高通量测序技术分析川中黑山羊瘤胃细菌的多样性及菌群结构。选用3只140日龄健康公羊,其平均体质量为(15.53±0.21)kg,饲喂10 d后,于150日龄时采集瘤胃液(样品A),40 d后再次采集瘤胃液(样品F),提取瘤胃液细菌基因组DNA,对... 采用MiSeq高通量测序技术分析川中黑山羊瘤胃细菌的多样性及菌群结构。选用3只140日龄健康公羊,其平均体质量为(15.53±0.21)kg,饲喂10 d后,于150日龄时采集瘤胃液(样品A),40 d后再次采集瘤胃液(样品F),提取瘤胃液细菌基因组DNA,对细菌16S rDNA序列V4区进行MiSeq测序。结果显示:1)从样品A与样品F中共获得高质量序列338 830条,聚类后得3 400个运算分类单位(OTU);2)样品A的α多样性指数高于样品F的,但其差异无统计学意义;3)门水平上,样品A最高相对丰度为拟杆菌门的(占总序列数的40.87%),其次为厚壁菌门的(27.19%),样品F最高相对丰度为拟杆菌门的(47.12%),其次为变形菌门的(19.99%),再次为厚壁菌门的(18.05%),样品A厚壁菌门的相对丰度极显著高于样品F的(P<0.01);4)在属水平上,样品A与样品F的最高相对丰度均为普雷沃氏菌属的(样品A的为25.54%,样品F的为27.67%),样品A中月形单胞菌属、丁酸弧菌属、瘤胃球菌属、琥珀酸弧菌属、琥珀酸菌属等的相对丰度显著高于样品F的(P<0.05)。试验结果表明,川中黑山羊瘤胃中相对丰度最高的菌门为拟杆菌门,相对丰度最高的菌属为普雷沃氏菌属,且两瘤胃样品中部分细菌相对丰度间的差异显著。 展开更多
关键词 川中黑山羊 瘤胃细菌 多样性 群落结构 MiSeq测序 拟杆菌门 普雷沃氏菌属
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体外试验中不同粗精比对山羊瘤胃细菌氨态氮利用效率的影响 被引量：6
8
作者 赵国琦 丁健 +4 位作者 孙龙生 张艳云 刘大林 贾亚红 陈小连 《畜牧兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2004年第6期640-645,共6页
利用体外发酵法研究了4种粗精比(10∶0、8∶2、6∶4和4∶6)底物对山羊瘤胃细菌产量、15NH3-N利用效率的影响。结果表明:混合培养液的pH值与氨态氮浓度在8h内急剧下降,而后至24h呈缓慢下降;经24h培养的细菌产量在8∶2、6∶4和4∶6组中差... 利用体外发酵法研究了4种粗精比(10∶0、8∶2、6∶4和4∶6)底物对山羊瘤胃细菌产量、15NH3-N利用效率的影响。结果表明:混合培养液的pH值与氨态氮浓度在8h内急剧下降,而后至24h呈缓慢下降;经24h培养的细菌产量在8∶2、6∶4和4∶6组中差异不显著(P>0.05),但都极显著地高于10∶0组(P<0.01);细菌体15N丰度以8∶2及4∶6组较高,显著高于10∶0和6∶4组(P<0.05);细菌体15N富集量以8∶2组最高,底物547.43μg15N中有120.44μg被细菌体富集,显著高于10∶0组(P<0.05),但6∶4、4∶6组与10∶0组间差异均不显著(P>0.05)。细菌赖氨酸的相对百分组成随精饲料比例的增加而显著增加,胱氨酸在粗饲料组(10∶0)显著高于其它组,但各精饲料添加组间差异不显著,组氨酸以8∶2组为最高,显著高于10∶0组,但与其它精饲料添加组间差异不显著(P>0.05)。 展开更多
关键词 ^15N 精饲料 瘤胃 山羊 氨态氮 氮利用效率 细菌 体外试验 影响 比对
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奶牛瘤胃需氧及兼性厌氧菌的PCR-16S rDNA鉴定及日粮的影响 被引量：9
9
作者 巩庆亮 王振勇 +4 位作者 柴同杰 侯志高 贾玉东 王允田 马健 《畜牧兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2008年第10期1367-1372,共6页
设计9个精料梯度的日粮饲喂干乳期成年荷斯坦奶牛,并对其瘤胃液中的部分细菌进行了分离,PCR-16SrDNA鉴定和动态检测。结果显示,以瘤胃液为原料,采用人工培养基共分离到56株细菌,并对7株具代表性的细菌进行了PCR扩增,经序列同源性比较,... 设计9个精料梯度的日粮饲喂干乳期成年荷斯坦奶牛,并对其瘤胃液中的部分细菌进行了分离,PCR-16SrDNA鉴定和动态检测。结果显示,以瘤胃液为原料,采用人工培养基共分离到56株细菌,并对7株具代表性的细菌进行了PCR扩增,经序列同源性比较,最终把细菌鉴定为牛链球菌(A0625、A1212、0131)、蜡样芽孢杆菌(0113)、地衣芽孢杆菌(0091)、短小芽孢杆菌(0083)和嗜热链球菌(0123)。同时还发现随精料浓度的增加,牛链球菌、芽孢杆菌及嗜热链球菌的数量均呈不同程度的上升趋势。结果表明不同精料浓度的日粮对奶牛瘤胃需氧及兼性厌氧菌有着不同程度的影响,其中对牛链球菌影响最大,从系统发育分析可知所分离细菌虽未形成新的细菌进化枝,但牛链球菌和嗜热链球菌的核苷酸序列仍发生了多处碱基突变。 展开更多
关键词 奶牛 瘤胃细菌 PCR-16S rDNA鉴定 日粮影响
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甘露寡糖、果寡糖和大豆寡糖组合对锦江黄牛瘤胃液细菌多样性的影响 被引量：12
10
作者 刘立恒 闵力 +2 位作者 瞿明仁 戈婷婷 钟志勇 《动物营养学报》 CAS CSCD 北大核心 2012年第8期1583-1588,共6页
本试验旨在研究功能性寡糖(甘露寡糖、果寡糖和大豆寡糖)组合对锦江黄牛的瘤胃液细菌多样性的影响。选择3头健康且体重相近的安装有永久性瘤胃瘘管的锦江黄牛,采用自身对照方法,试验分2期进行,第1期:对照期,饲喂基础饲粮,不添加任何寡糖... 本试验旨在研究功能性寡糖(甘露寡糖、果寡糖和大豆寡糖)组合对锦江黄牛的瘤胃液细菌多样性的影响。选择3头健康且体重相近的安装有永久性瘤胃瘘管的锦江黄牛,采用自身对照方法,试验分2期进行,第1期:对照期,饲喂基础饲粮,不添加任何寡糖;第2期:添加期,饲喂基础饲粮+功能性寡糖(0.8%甘露寡糖+1.0%果寡糖+0.8%大豆寡糖),每期持续14 d。利用PCR-变性梯度凝胶电泳(DGGE)方法研究分析牛瘤胃液细菌多样性。结果表明:添加功能性寡糖组合后,牛瘤胃液细菌PCR-DGGE图谱条带数明显增加,3头牛增加了5个共同条带。经测序,其中2个是产琥珀酸丝状杆菌属,3个是未鉴定细菌。饲粮中添加功能性寡糖组合可使瘤胃液细菌菌群种类明显增加。结果提示,饲粮添加功能性寡糖组合能够影响瘤胃菌群区系,增强其稳定性。 展开更多
关键词 功能性寡糖 变性梯度凝胶电泳 瘤胃 细菌 多样性
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饲粮不同NFC/NDF对奶山羊瘤胃溶纤维丁酸弧菌、牛链球菌及埃氏巨型球菌含量变化的影响 被引量：13
11
作者 赵培厅 刘大程 +5 位作者 高民 胡红莲 韩昊奇 周向丽 邓维康 王鹏飞 《动物营养学报》 CAS CSCD 北大核心 2011年第10期1716-1724,共9页
本试验旨在探讨在饲粮不同非纤维性碳水化合物/中性洗涤纤维(NFC/NDF)条件下,奶山羊发生亚急性瘤胃酸中毒(subacute rumen acidosis,SARA)过程中瘤胃溶纤维丁酸弧菌、牛链球菌及埃氏巨型球菌数量的变化。选用6只安装有永久性瘤胃瘘管的... 本试验旨在探讨在饲粮不同非纤维性碳水化合物/中性洗涤纤维(NFC/NDF)条件下,奶山羊发生亚急性瘤胃酸中毒(subacute rumen acidosis,SARA)过程中瘤胃溶纤维丁酸弧菌、牛链球菌及埃氏巨型球菌数量的变化。选用6只安装有永久性瘤胃瘘管的泌乳期关中奶山羊为试验动物,采用动物自身前后对照法,试验分4期进行,每期10 d,依次饲喂NFC/NDF比分别为1.02(Ⅰ期)、1.24(Ⅱ期)、1.63(Ⅲ期)、2.58(Ⅳ期)的4种饲粮,以逐渐增加饲粮精料含量的方式诱导奶山羊发生SARA,并采用实时定量PCR技术对瘤胃内溶纤维丁酸弧菌、牛链球菌及埃氏巨型球菌的数量变化进行定量分析。结果表明:1)随着饲粮NFC/NDF比的逐步升高,溶纤维丁酸弧菌和埃氏巨型球菌的数量均增加,但当饲粮NFC/NDF比升至2.58时,与其他试验期相比,埃氏巨型球菌的数量极显著增加(P<0.01),而溶纤维丁酸弧菌的数量却菜显著降低(P<0.01)。2)牛链球菌的数量随着饲粮NFC/NDF比的逐步增加呈显著下降(P<0.05),但到Ⅳ期又恢复到Ⅰ期数量。结果提示,当奶山羊发生SARA时,瘤胃牛链球菌的数量无明显变化,对低pH敏感的溶纤维丁酸弧菌数量急剧下降,而耐酸性的埃氏巨型球菌数量表现为大幅增加。 展开更多
关键词 饲粮NFC/NDF比 亚急性瘤胃酸中毒 实时定量PCR 瘤胃细菌
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藏系绵羊瘤胃细菌区系的季节动态分析 被引量：13
12
作者 淡瑞芳 龙瑞军 +2 位作者 张海涛 张欣 丁学智 《动物营养学报》 CAS CSCD 北大核心 2009年第5期798-802,共5页
本文旨在研究不同季节牧草营养成分变化及藏系绵羊瘤胃细菌区系的季节动态变化。试验在不同季节分别随机选取3只藏系绵羊,采用PCR-DGGE技术对12只藏系绵羊瘤胃内容物中的细菌区系进行分子生态学的分析,对细菌16S rDNA的V6～V8可变区的... 本文旨在研究不同季节牧草营养成分变化及藏系绵羊瘤胃细菌区系的季节动态变化。试验在不同季节分别随机选取3只藏系绵羊,采用PCR-DGGE技术对12只藏系绵羊瘤胃内容物中的细菌区系进行分子生态学的分析,对细菌16S rDNA的V6～V8可变区的扩增产物进行DGGE图谱分析、相似性分析和Shannon多样指数分析。结果表明:(1)秋季瘤胃细菌种群丰富度极显著(P<0.01)高于冬、春季节,显著(P<0.05)高于夏季,而其他3个季节之间差异不显著(P>0.05);(2)瘤胃细菌区系组成结构在春季和夏季相似性高于90%,在秋、冬季相似性低于70%,而春、夏季与秋、冬季之间的相似性低于60%;(3)夏季牧草中DE和CP含量极显著(P<0.01)高于其他季节,其瘤胃液pH极显著(P<0.01)低于其他季节,瘤胃细菌区系丰富度也相应降低;秋季牧草的DE和CP含量显著(P<0.05)高于春、冬季节,其瘤胃液pH范围为7.1～7.3,瘤胃细菌区系丰富度高于其他3个季节。由以上结果可以看出,不同季节瘤胃内优势菌群发生了改变,瘤胃细菌区系的季节变化与瘤胃pH、瘤胃内容物的物理特性、营养成分及其比例等有关。 展开更多
关键词 变性梯度凝胶电泳(DGGE) 藏系绵羊 瘤胃细菌 季节动态分析
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藏系绵羊瘤胃细菌数量及其放牧地牧草养分随季节变化的研究 被引量：17
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作者 淡瑞芳 张海涛 +2 位作者 龙瑞军 丁学智 张欣5 《草业学报》 CSCD 北大核心 2009年第1期100-104,共5页
试验分别于春、夏、秋和冬季,随机选择3只同群常年放牧健康的藏系绵羯羊(2岁),屠宰后采集瘤胃内容物。采用瘤胃细菌通用引物和实时定量PCR技术,研究瘤胃细菌数量随季节的动态变化。结果表明,1)夏季瘤胃细菌数量显著(P<0.05)高于其他... 试验分别于春、夏、秋和冬季,随机选择3只同群常年放牧健康的藏系绵羯羊(2岁),屠宰后采集瘤胃内容物。采用瘤胃细菌通用引物和实时定量PCR技术,研究瘤胃细菌数量随季节的动态变化。结果表明,1)夏季瘤胃细菌数量显著(P<0.05)高于其他3个季节,分别是春季、秋季、冬季细菌数量的5.56,2.35和2.49倍;秋、冬季是春季细菌数量的2.38和2.23倍;而秋和冬季瘤胃细菌的数量差异不显著(P>0.05)。2)夏季藏系绵羊采食量分别为春季、冬季和秋季的1.98,1.61和1.80倍,饲料中的纤维性物质含量增高,采食量也随着降低,瘤胃细菌的数量也相应降低;3)实时定量PCR技术能准确的反映出放牧藏系绵羊瘤胃细菌数量随季节的动态变化。 展开更多
关键词 实时定量PCR 藏系绵羊 季节 瘤胃细菌数量
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复合抗菌肽对山羊瘤胃菌群结构的影响 被引量：12
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作者 陈芸 刘旗 +4 位作者 邓俊良 杨颜铱 高爽 陈憧 姚淑华 《浙江农业学报》 CSCD 北大核心 2017年第11期1800-1808,共9页
试验旨在探讨复合抗菌肽对山羊瘤胃菌群结构的影响,以期为抗菌肽应用于反刍动物提供理论依据。选取24只4月龄川中黑山羊,分为4组,每组6只,正常精料组(A),正常精料+抗菌肽组(C),双倍精料组(D),双倍精料+抗菌肽组(E)分别饲喂精料300、300... 试验旨在探讨复合抗菌肽对山羊瘤胃菌群结构的影响,以期为抗菌肽应用于反刍动物提供理论依据。选取24只4月龄川中黑山羊,分为4组,每组6只,正常精料组(A),正常精料+抗菌肽组(C),双倍精料组(D),双倍精料+抗菌肽组(E)分别饲喂精料300、300、600和600 g·d^(-1)·只^(-1),C与E组饲喂3 g·d^(-1)·只^(-1)复合抗菌肽。于21 d晨饲前每组随机选取3只采集瘤胃液,提取样品总DNA,扩增16S rRNA V4区,扩增产物采用Miseq平台测序。结果表明:1)共获得高质量序列629 634条,97%相似度下聚类后共获得13227个OTU。2)所得OTU经物种注释后,门水平上,除D组最优势菌门为厚壁菌门(Firmicutes)(34.30%)外,其余各组最优势菌门均为拟杆菌门(Bacteroidetes)(38.52%~43.68%),且添加复合抗菌肽显著降低变形菌门(Proteobacteria)与螺旋菌门(Spirochaetes)含量(P<0.05);增加精料量显著增加厚壁菌门与螺旋菌门含量(P<0.05),显著降低拟杆菌门与变形菌门含量(P<0.05)。3)属水平上,普雷沃菌属(Prevotella)为所有样品中最优势菌属(25.54%~33.88%),添加抗菌肽后,琥珀酸菌属(Succiniclasticum)、瘤胃球菌属(Ruminococcus)、假丁酸弧菌属(Pseudobutyrivibrio)、脱硫弧菌属(Desulfovibrio)显著或极显著增加(P<0.05或P<0.01),琥珀酸弧菌属(Succinivibrio)极显著降低(P<0.01),且不受精料量影响,但月形单胞菌属(Selenomonas)与密螺旋体(Treponema)的变化趋势与精料量相关,正常精料组显著降低(P<0.05),而双倍精料组无显著变化(P>0.05);增加精料量显著增加普雷沃菌属、密螺旋体等含量(P<0.05),降低琥珀酸弧菌属等含量(P<0.05)。4)各样品在alpha多样性Chao、ACE、Shannon和Simpson指数上,差异不显著(P>0.05)。表明添加复合抗菌肽降低变形菌门和螺旋菌门的相对含量,提高部分降解纤维菌属的含量;增加精料量可增加厚壁菌门和螺旋菌门相对含量,降低拟杆菌门和变形菌门的相对含量,增加普雷沃菌属相对含量,降低琥珀酸弧菌属相对含量;瘤胃细菌多样性并不受复合抗菌肽及精料量的影响。 展开更多
关键词 山羊 瘤胃细菌 菌群结构 高通量测序 复合抗菌肽 精料
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添加不同酵母培养物对瘤胃纤维分解菌群和纤维素酶活的影响 被引量：42
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作者 黄庆生 王加启 《畜牧兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2005年第2期144-148,共5页
用3种酵母培养物(YC- 1、YC 2和YC- 3)分别饲喂4头带有永久性瘤胃瘘管的肉牛,研究培养物对瘤胃发酵、纤维分解酶活性和3种纤维分解菌数量的影响,结果表明:YC 2处理的乙酸、丙酸、丁酸和总 VFA浓度显著高于对照组(P<0 .05),YC 1和YC ... 用3种酵母培养物(YC- 1、YC 2和YC- 3)分别饲喂4头带有永久性瘤胃瘘管的肉牛,研究培养物对瘤胃发酵、纤维分解酶活性和3种纤维分解菌数量的影响,结果表明:YC 2处理的乙酸、丙酸、丁酸和总 VFA浓度显著高于对照组(P<0 .05),YC 1和YC 3处理的乙酸/丙酸比例显著降低(P<0 .01);各处理均能显著提高瘤胃内羧甲基纤维素酶、水杨苷酶和木聚糖酶的活性(P<0 .01);各处理都显著提高黄化瘤胃球菌的相对比例(P<0 .01),16SrRNA特异性寡聚核苷酸探针杂交法分析测定结果表明 3 种纤维分解菌在瘤胃细菌中所占比例为 3. 80%±0 .2%。 展开更多
关键词 瘤胃发酵 酵母培养物 饲喂 羧甲基纤维素酶 黄化 比例 添加 处理 菌群 胃瘘
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不同品种羔羊胃肠道微生物发育规律的比较研究 被引量：9
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作者 刘洁 李伟 +5 位作者 李鑫 任二军 刘进军 王朋然 韩学良 张英杰 《动物营养学报》 CAS CSCD 北大核心 2023年第10期6475-6496,共22页
本试验旨在探究相同饲养条件下不同品种(道赛特羊、湖羊和小尾寒羊)羔羊瘤胃和直肠的细菌和真菌差异,为阐明不同品种羔羊胃肠道微生物发育规律和精准饲养管理提供基础数据。选取同一产房、胎次和性别相同的1日龄不同品种羔羊30只,其中... 本试验旨在探究相同饲养条件下不同品种(道赛特羊、湖羊和小尾寒羊)羔羊瘤胃和直肠的细菌和真菌差异,为阐明不同品种羔羊胃肠道微生物发育规律和精准饲养管理提供基础数据。选取同一产房、胎次和性别相同的1日龄不同品种羔羊30只,其中道赛特羊、湖羊和小尾寒羊公羔各10只,相同饲养管理模式下进行120 d饲养试验。采集瘤胃液和粪便样品,测定细菌和真菌区系。结果表明:1)小尾寒羊瘤胃细菌的PD whole tree指数显著高于湖羊(P<0.05),湖羊直肠真菌的辛普森指数显著高于道赛特羊(P<0.05)。2)主坐标分析(PCoA)和相似性分析(ANOSIM)表明,不同品种羔羊在20、90日龄瘤胃细菌,70日龄直肠细菌,20、70、90日龄瘤胃真菌,90、120日龄直肠真菌中的群落均存在显著差异(P<0.05)。3)道赛特羊直肠细菌中螺旋体门和密螺旋体属相对丰度表现出升高的趋势(P=0.086)。小尾寒羊瘤胃细菌中理研菌科RC-9肠道群和克里斯滕森菌科R-7群相对丰度显著高于道赛特羊和湖羊(P<0.05),瘤胃真菌中子囊菌门相对丰度显著低于道赛特羊和湖羊(P<0.05),瘤胃细菌中普雷沃氏菌属相对丰度表现出降低的趋势(P=0.063)。综上所述,在相同饲养条件下,3个品种羔羊的胃肠道菌群的多样性和组成均存在差异,小尾寒羊具有较高的瘤胃细菌多样性,湖羊具有较高的直肠真菌多样性,道赛特羊直肠细菌中螺旋体门和密螺旋体属相对丰度较高,小尾寒羊瘤胃细菌中普雷沃氏菌属相对丰度较低以及理研菌科RC-9肠道群和克里斯滕森菌科R-7群相对丰度较高,胃肠道微生物区系结构差异可能是导致不同品种羔羊生产性能差异的原因之一。 展开更多
关键词 品种 羔羊 瘤胃 直肠 细菌 真菌
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运用Real-time PCR方法研究日粮添加豆油与胡麻油对肉牛瘤胃纤维分解菌数量的影响 被引量：13
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作者 李旦 王加启 +3 位作者 卜登攀 杨舒黎 魏宏阳 周凌云 《动物营养学报》 CAS CSCD 北大核心 2008年第3期256-260,共5页
本研究分别以产琥珀酸丝状杆菌(Fibrobacter succinogenes)、黄色瘤胃球菌(Ruminococcus flavefaciens)、白色瘤胃球菌(Ruminobacter albus)和溶纤维丁酸弧菌(Butyrivibrio fibrisolvens)16S rDNA序列设计引物,运用Real-ti me PCR技术... 本研究分别以产琥珀酸丝状杆菌(Fibrobacter succinogenes)、黄色瘤胃球菌(Ruminococcus flavefaciens)、白色瘤胃球菌(Ruminobacter albus)和溶纤维丁酸弧菌(Butyrivibrio fibrisolvens)16S rDNA序列设计引物,运用Real-ti me PCR技术研究日粮中添加豆油与胡麻油对肉牛上述4种瘤胃纤维分解菌数量的影响。结果表明,与对照组(CK)相比,添加豆油组(LOC1)和胡麻油(LOC2)组,产琥珀酸丝状杆菌(Fibrobacter succinogenes)、黄色瘤胃球菌(Ruminococcus flavefaciens)、白色瘤胃球菌(Ruminobacter albus)和溶纤维丁酸弧菌(Butyrivibrio fibrisol-vens)数量显著减少(P<0.05),分别降低了78%和31%、30%和36%、27%和23%、6%和13%。通过该方法的结果表明日粮中添加4%的豆油和胡麻油显著减少了瘤胃中纤维分解菌,对产琥珀酸丝状杆菌的影响明显。而且采用Real-ti me PCR方法对瘤胃纤维分解菌进行定量,可以快速有效反映出在日粮改变的情况下菌的数量变化趋势,相对于传统计数方法更直观、快捷与准确。 展开更多
关键词 Real-time PCR 瘤胃纤维菌 定量 肉牛
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不同代乳条件下1～35日龄羔羊瘤胃及其微生物群落的发育 被引量：6
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作者 李凤鸣 雒秋江 +2 位作者 牛越峰 潘榕 李维东 《动物营养学报》 CAS CSCD 北大核心 2015年第5期1567-1576,共10页
本试验旨在研究不同代乳条件下1~35日龄羔羊瘤胃及其微生物群落的发育。选取56只初生重（3 380±328）g的小尾寒羊公羊,从1日龄起分别饲喂牛奶粉代乳（milk powder substitute,MS,28只）或鱼粉代乳（fish meal substitute,FS,28只）... 本试验旨在研究不同代乳条件下1~35日龄羔羊瘤胃及其微生物群落的发育。选取56只初生重（3 380±328）g的小尾寒羊公羊,从1日龄起分别饲喂牛奶粉代乳（milk powder substitute,MS,28只）或鱼粉代乳（fish meal substitute,FS,28只）,并在21日龄将饲喂2种代乳的羔羊各8只转喂开食料。在7、14、21、28和35日龄分别宰杀4只,进行瘤胃液细菌和原虫分类计数,测定瘤胃液真菌数量、挥发性脂肪酸和氨态氮（NH3-N）浓度,瘤网胃重量和结构形态指标。结果表明：1）饲喂MS羔羊瘤胃在7日龄即有细菌（85.47×109个/m L,97.4%为瘤胃球菌）和原虫（1.10×105个/m L）,且总数均随日龄增加而增加。7日龄羔羊瘤胃液真菌数量较少,直到35日龄时才较多。羔羊瘤胃在7日龄即有总挥发性脂肪酸（TVFA,乙酸为主）,但浓度在21日龄后才随日龄增加大幅上升。7日龄羔羊瘤胃液NH3-N浓度为33.2 mg/d L。饲喂MS的羔羊瘤网胃重量、瘤胃乳头长度和宽度随日龄增加而增加。2）与饲喂MS相比,饲喂FS的羔羊7日龄瘤胃液细菌和原虫总数分别减少30.8%（P〈0.01）和27.3%（P〉0.05）,瘤胃液TVFA和NH3-N浓度随日龄增加波动变化,35日龄瘤网胃重减少17.1%（P〉0.05）,瘤胃乳头长度和宽度分别减少16.0%（P〈0.05）和增加39.4%（P〉0.05）。3）21日龄给羔羊转喂开食料,原先饲喂MS羔羊28日龄瘤胃液细菌总数增加49.7%（P0.01）,原虫总数减少50.3%（P〈0.01）,TVFA浓度升高158.8%（P〈0.01）,瘤网胃重增加14.0%（P〉0.05）、瘤胃乳头长度变短43.3%（P〈0.01）,宽度增加61.8%（P〈0.01）;瘤胃液真菌数量在35日龄时显著增加。4）21日龄给羔羊转喂开食料,原先饲喂FS羔羊28日龄瘤胃液细菌总数增加21.1%（P〉0.05）,原虫总数减少60.4%（P〈0.01）,TVFA和NH3-N浓度各降低43.5%（P〉0.05）和49.1%（P〈0.05）,瘤胃乳头长度和宽度分别减少23.1%（P〈0.05）和11.2%（P〉0.05）;在35日龄时几乎没有真菌存在。由本试验得出结论,羔羊7日龄瘤胃消化发育即已开始,饲喂FS或21日龄转喂开食料都会影响瘤胃及其微生物群落的发育。 展开更多
关键词 羔羊 瘤胃 原虫 细菌 真菌
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牛瘤胃未培养细菌中一个β-葡萄糖苷酶基因umbgl3A的克隆及鉴定 被引量：18
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作者 赵广存 段承杰 +5 位作者 庞浩 封毅 许跃强 莫新春 唐纪良 冯家勋 《西南农业学报》 CSCD 2005年第4期472-476,共5页
通过构建牛瘤胃未培养细菌的宏基因组文库,共获得12000个克隆,文库外源DNA总容量为4.2×108bp,筛选得到九个表达β-葡萄糖苷酶活性的克隆,并对其中的一个表达β-葡萄糖苷酶活性的克隆pGXN1009进行亚克隆,将β-葡萄糖苷酶基因定位在4... 通过构建牛瘤胃未培养细菌的宏基因组文库,共获得12000个克隆,文库外源DNA总容量为4.2×108bp,筛选得到九个表达β-葡萄糖苷酶活性的克隆,并对其中的一个表达β-葡萄糖苷酶活性的克隆pGXN1009进行亚克隆,将β-葡萄糖苷酶基因定位在4.3kb的片段上。测序结果表明在4.3kb的片段上有一个全长为1956bp的ORF,编码一个可能的β-葡萄糖苷酶基因um-bgl3A,其编码产物与一个来源于小鼠大肠未培养细菌的β-葡萄糖苷酶(GenBankAcessionNO:AAX16378.1)一致性为63%、相似性为79%;与哈氏噬纤维菌(Cytophagahutchinsonii)的β-葡萄糖苷酶(GenBankAcessionNO:ZP-00308419)的一致性为50%、相似性为67%。利用SMART软件对Umbgl3A结构组件预测表明,Umbgl3A包含一个家族3糖基水解酶(glycosylhydrolase)功能域和一个家族3C糖基水解酶功能域。遗传进化分析表明umbgl3A基因可能是来自牛瘤胃微生物噬纤维菌属未培养的一个种。 展开更多
关键词 牛瘤胃 未培养细菌 宏基因组 β-葡萄耱苷酶
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不同功能性寡糖组合对锦江黄牛瘤胃固相微生物多样性的影响 被引量：7
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作者 闵力 瞿明仁 +2 位作者 戈婷婷 钟志勇 刘立恒 《江西农业大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2012年第4期769-774,共6页
研究功能性寡糖组合对锦江黄牛的瘤胃固相微生物多样性的影响。选择3头健康且体重相近的安装有永久性瘤胃瘘管的锦江黄牛,采用自身对照方法,试验分3期进行,第1期:对照期,饲喂基础日粮,不添加任何寡糖;第2期:GT1添加期,饲喂基础日粮+0.8... 研究功能性寡糖组合对锦江黄牛的瘤胃固相微生物多样性的影响。选择3头健康且体重相近的安装有永久性瘤胃瘘管的锦江黄牛,采用自身对照方法,试验分3期进行,第1期:对照期,饲喂基础日粮,不添加任何寡糖;第2期:GT1添加期,饲喂基础日粮+0.8%甘露寡糖+1.0%果寡糖+0.8%大豆寡糖,第3期:GT2添加期,饲喂基础日粮+0.8%甘露寡糖+1.20%果寡糖+1.0%大豆寡糖,每期持续14 d。利用PCR-DGGE方法进行分析牛瘤胃固相微生物PCR-DGGE图谱条带数及相似性。结果发现:添加功能性寡糖组合后,对锦江黄牛瘤胃固相微生物PCR-DGGE图谱条带数影响不明显。3头牛3个试验期DGGE图谱的相似度较高。对锦江黄牛瘤胃液相微生物多样性影响有待下一步研究。 展开更多
关键词 功能性寡糖组合 变性梯度凝胶电泳(DGGE) 锦江黄牛 瘤胃固相微生物 多样性
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