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Application of PCR-SSCP in detecting rpoB drug resistant gene polymorphism of M. tuberculosis L-form from pneumoconiosis patients with tuberculosis
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作者 陆军 江姗 郑昭 《Journal of Medical Colleges of PLA(China)》 CAS 2006年第5期330-332,共3页
Objective: To study the relationship between the polymorphism of drug resistant gene rpoB and drug resistance against rifampicin(RFP) of M. tuberculosis L-forms, and to evaluate its clinical application. Methods: A to... Objective: To study the relationship between the polymorphism of drug resistant gene rpoB and drug resistance against rifampicin(RFP) of M. tuberculosis L-forms, and to evaluate its clinical application. Methods: A total of 52 clinical isolated strains of M. tuberculosis L-forms were collected. rpoB gene polymorphism was analyzed by polymerase chain reaction and single-strand conformation polymorphism (PCR-SSCP) and conventional antimicrobial susceptibility test (AST). Their results were compared. Results: AST results showed that 38 of 52 clinical isolated strains were drug resistance (73.08%),while PCR-SSCP indicated 65.38% (32/52) rpoB gene polymorphism. There was no statistic significance(χ2= 2.4914) between the 2 methods. Conclusion:Combined the application of PCR-SSCP with AST in detecting rpoB drug resistant gene polymorphism of M. tuberculosis L-form from pneumoconiosis patients with tuberculosis may have advantages at earlier diagnosis and guidance of clinical medications. 展开更多
关键词 PNEUMOCONIOSIS TUBERCULOSIS M. TUBERCULOSIS L-FORM drug-resistance RPOB polymerase chain reaction and SINGLE-strand conformation polymorphism antimicrobial susceptibility test
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原发性肝癌拓扑异构酶Ⅱα的表达及其与P53基因突变之间的关系 被引量:2
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作者 丁磊 陈孝平 +1 位作者 张志伟 靖凯 《肝胆外科杂志》 2006年第3期222-225,共4页
目的研究原发性肝癌拓扑异构酶Ⅱα(Topoisom eraseⅡ,αToPoⅡα)的表达及临床意义,并探讨其与p53基因突变之间的关系。方法免疫组织化学法和W estern B lotting方法检测57例未经化疗过的原发性肝癌肿瘤组织和32例肝硬化组织ToPoⅡα... 目的研究原发性肝癌拓扑异构酶Ⅱα(Topoisom eraseⅡ,αToPoⅡα)的表达及临床意义,并探讨其与p53基因突变之间的关系。方法免疫组织化学法和W estern B lotting方法检测57例未经化疗过的原发性肝癌肿瘤组织和32例肝硬化组织ToPoⅡα蛋白的表达,并用聚合酶链反应-单链构象多态性(PCR-SSCP)分析p53基因7、8外显子的突变。结果To-PoⅡα蛋白在肝癌组织中阳性率为87.7%(50/57),在肝硬化组织中阳性率为50%(16/32),两者有显著差异(P<0.05)。蛋白印迹结果显示肝癌组织中ToPoⅡα蛋白表达显著高于肝硬化组织(P<0.05),高分化肿瘤与中、低分化的肿瘤组织之间有显著差异(P<0.05),有转移的病人高于无转移者(P<0.05).等级相关分析显示ToPoⅡα蛋白的表达与p53基因突变呈正相关(r=0.914,P=0.001)。p53基因突变组ToPoⅡ蛋白的表达显著高于野生型组(P<0.01)。结论ToPoⅡα的检测可作为肝癌分化程度的特异指标,同时p53基因突变可能诱导ToPoⅡα蛋白的表达。 展开更多
关键词 拓扑异构酶Ⅱα 原发性肝癌 P53 基因 PCR-SSCP
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PCR-SSCP法检测结核分枝杆菌L型rpsL耐药基因 被引量:1
3
作者 陆军 叶松 金强 《临床检验杂志》 CAS CSCD 北大核心 2007年第2期107-108,共2页
目的探索尘肺结核患者感染的结核分枝杆菌(MT)L型的耐药基因rpsL突变与耐受链霉素(SM)的关系。方法用PCR-SSCP方法检测rpsL基因,与采用常规SM药敏试验(AST法)的结果进行对比分析。结果采用AST法检测,52株结核分枝杆菌L型临床分离株中共... 目的探索尘肺结核患者感染的结核分枝杆菌(MT)L型的耐药基因rpsL突变与耐受链霉素(SM)的关系。方法用PCR-SSCP方法检测rpsL基因,与采用常规SM药敏试验(AST法)的结果进行对比分析。结果采用AST法检测,52株结核分枝杆菌L型临床分离株中共有26株(50.0%)耐SM;PCR-SSCP法检出rpsL基因突变率为40.4%(21/52),2种方法检测耐药株的符合率为80.8%。结论结核杆菌L型对SM的耐药与rpsL基因突变有关。 展开更多
关键词 尘肺 结核分枝杆菌L型 耐药 RPSL基因 聚合酶链反应-单链构象多态性分析
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慢性乙型肝炎HBV前C区基因突变的临床研究 被引量:2
4
作者 赵龙凤 贾因棠 《山西医科大学学报》 CAS 2002年第5期409-410,共2页
采用聚合酶链反应 (PCR)及单链构象多态分析 (SSCP)银染技术检测了 32例HBVDNA阳性慢性乙型肝炎患者及乙肝病毒携带者的前C区基因变异。结果表明有前C区基因突变株感染者 8例 ,突变株感染者检出率为 2 5 .0 % ;突变株的检出率以慢性乙... 采用聚合酶链反应 (PCR)及单链构象多态分析 (SSCP)银染技术检测了 32例HBVDNA阳性慢性乙型肝炎患者及乙肝病毒携带者的前C区基因变异。结果表明有前C区基因突变株感染者 8例 ,突变株感染者检出率为 2 5 .0 % ;突变株的检出率以慢性乙肝重度最高 ,其次是慢性乙肝中度、轻度患者 ,乙肝病毒携带者最低 ;抗 -HBe阳性患者前C区突变株检出率高于HBeAg阳性患者。提示HBV前C区突变与病情轻重及e系统血清标志有关。 展开更多
关键词 慢性乙型肝炎 HBV 前C区基因突变 临床研究
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甲状腺乳头状癌患者血液p53基因表达及与淋巴结转移、临床分期的关系 被引量:4
5
作者 尹凤媛 焦淑贤 迟晓云 《山东医药》 CAS 北大核心 2011年第27期25-26,共2页
目的探讨p53基因突变在甲状腺乳头状癌(PTC)发生、发展中的作用。方法选择118例PTC患者(PTC组)、38例淋巴结转移甲状腺癌患者(转移组)及122例健康体检者(对照组),均抽取空腹静脉血,采用PCR-单链构象多态方法检测p53基因(第5-8外显因子)... 目的探讨p53基因突变在甲状腺乳头状癌(PTC)发生、发展中的作用。方法选择118例PTC患者(PTC组)、38例淋巴结转移甲状腺癌患者(转移组)及122例健康体检者(对照组),均抽取空腹静脉血,采用PCR-单链构象多态方法检测p53基因(第5-8外显因子)表达情况。结果 PTC组和转移组血液p53基因表达阳性率均显著高于对照组,其中转移组显著高于PTC组,PTC组Ⅲ~Ⅳ期者显著高于Ⅰ~Ⅱ期者(P均<0.05)。结论 p53基因突变可促进PTC的发生和转移;可为PTC的诊治及预后判定提供依据。 展开更多
关键词 甲状腺乳头状癌 P53基因 聚合酶链式反应-单链构象多态
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肺癌K-ras基因点突变的研究 被引量:1
6
作者 杨丽萍 张舒林 +3 位作者 何苡 张进忠 胡天勇 李淑娟 《河南医学研究》 CAS 2000年第2期134-135,共2页
目的 :探讨肺癌发生的分子遗传学机理 ,了解肺癌中K ras基因的突变情况。方法 :采用聚合酶链式反应一单链构象多态性 (PCR SSCP)结合银染技术 ,对 3 2例肺癌组织及其相应的癌旁组织中K ras基因第 12、13、61位密码子的突变情况进行检测... 目的 :探讨肺癌发生的分子遗传学机理 ,了解肺癌中K ras基因的突变情况。方法 :采用聚合酶链式反应一单链构象多态性 (PCR SSCP)结合银染技术 ,对 3 2例肺癌组织及其相应的癌旁组织中K ras基因第 12、13、61位密码子的突变情况进行检测。结果 :肺癌组织中K ras基因总突变率为 2 5 % ( 8/3 2 ) ,其中腺癌突变率为 40 % ( 4 /10 ) ,鳞癌突变率为 2 3 % ( 3 /13 ) ,大细胞肺癌突变率为 3 3 % ( 1/3 )。小细胞癌突变率为 0 ( 0 /6) ,相应的癌旁组织突变率为 3 1% ( 1/3 2 )。结论 :K ras基因突变与肺癌发生发展有关。 展开更多
关键词 肺癌 基因 K-RAS PCR-SSCP
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单链构象多态性技术在胰岛素受体基因突变检测中的应用
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作者 牛文彦 刘德敏 +2 位作者 石建党 王家驰 汤新之 《临床检验杂志》 CAS CSCD 北大核心 1998年第5期259-261,共3页
建立聚合酶链反应-单链构象多态性和银染技术筛查胰岛素受体基因突变方法。选择89例非胰岛素依赖性糖尿病(NIDDM)患者,扩增胰岛素受体基因的外显子17-21,SSCP电泳,银染色后,对突变样品进行序列分析。结果发现8... 建立聚合酶链反应-单链构象多态性和银染技术筛查胰岛素受体基因突变方法。选择89例非胰岛素依赖性糖尿病(NIDDM)患者,扩增胰岛素受体基因的外显子17-21,SSCP电泳,银染色后,对突变样品进行序列分析。结果发现8例外显子17和1例外显子20的异常电泳条带,外显子17的突变经顺序分析为codon1058(CAC→CAT)的纯合和杂合无意义突变。 展开更多
关键词 单链构象多态性 糖尿病 胰岛素受体 突变 PCR
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快速检测结核分枝杆菌γpoB基因突变的研究
8
作者 刘国华 闫国蕊 +4 位作者 刘传玉 祖燕 贾振 王子玲 李英 《河南医学研究》 CAS 2001年第4期316-318,共3页
目的 :应用PCR SSCP技术直接快速检测痰标本中结核分枝杆菌γpoB基因突变 ,评价此方法用于结核分枝杆菌利福平 (RFP)耐药性的意义。方法 :以结核分枝杆菌H37Rv为对照、5 0例耐RFP(单耐和多耐 )结核分枝杆菌临床分离株、12例RFP敏感菌株... 目的 :应用PCR SSCP技术直接快速检测痰标本中结核分枝杆菌γpoB基因突变 ,评价此方法用于结核分枝杆菌利福平 (RFP)耐药性的意义。方法 :以结核分枝杆菌H37Rv为对照、5 0例耐RFP(单耐和多耐 )结核分枝杆菌临床分离株、12例RFP敏感菌株、35例耐RFP肺结核患者痰标本 ,采用PCR SSCP检测痰标本和菌株中结核杆菌γpoB基因突变。结果 :5 0例耐RFP菌株中有 45例PCR SSCP条带与结核分枝杆菌H37Rv条带有明显差别 ,与药敏试验结果做对比 ,PCR SSCP检测敏感性为 90 % ,特异性为 10 0 % ;12例敏感菌株与H37Rv条带一致 ,35份肺结核病人痰标本 ,2 1份痰PCR扩增阳性 ,15份SSCP图谱与H37Rv图谱有差别 ,而用PCR SSCP 2 8份图谱与H37Rv有差别 ,阳性率为 80 %。结论 :PCR SSCP检测结核分枝杆菌γpoB基因突变快速、简便、易行 ,有望用于结核分枝杆菌RFP耐药性的快速测定 。 展开更多
关键词 结核分枝杆菌 γpoB基因 聚合酶链反应 多态现象 单链构象
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p53基因第7、8外显子突变与广西肝癌家族聚集遗传易感性的关系 被引量:5
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作者 于冰雪 吴健林 +3 位作者 吴继周 龚婷婷 王尊付 钟彬 《山东医药》 CAS 北大核心 2016年第38期23-25,共3页
目的探讨p53基因第7、8外显子突变(exon7/exon8)与广西肝癌高发区肝癌家族聚集遗传易感性的关系。方法依配对方法选择广西肝癌高发区肝癌高发家族、肝癌单发家族和无癌家族中未发生肝癌的家族成员各123例为家族组,同时选择广西肝癌高发... 目的探讨p53基因第7、8外显子突变(exon7/exon8)与广西肝癌高发区肝癌家族聚集遗传易感性的关系。方法依配对方法选择广西肝癌高发区肝癌高发家族、肝癌单发家族和无癌家族中未发生肝癌的家族成员各123例为家族组,同时选择广西肝癌高发区内30例肝癌患者作为肝癌组。控制HBV、HCV感染及环境因素后,应用聚合酶链式反应-单链构象多态性分析结合基因测序的方法筛查p53基因exon7/exon8突变情况。结果肝癌组p53基因exon7/exon8总突变率为13.3%(4/30),家族组exon7/exon8总突变率为0,P<0.05。结果 p53基因exon7/exon8突变可能不是广西肝癌高发区肝癌家族聚集的遗传易感因素。 展开更多
关键词 原发性肝癌 家族聚集性 P53基因 基因突变 聚合酶链式反应-单链构象多态性分析 广西
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结核分枝杆菌利福平耐药基因的检测 被引量:3
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作者 牛占丛 张广宇 +3 位作者 王孟山 翟秉祥 刘延龙 李冀文 《临床检验杂志》 CAS CSCD 北大核心 1999年第2期74-76,共3页
以药物敏感试验为标准,应用聚合酶链反应-单链构象多态性(PCR-SSCP)分析方法对68例利福平耐药菌株(单耐利福平或多药耐药)和20例利福平敏感菌株进行测定。结果88例结核分枝杆菌均扩增出目标DNA条带,10例非结... 以药物敏感试验为标准,应用聚合酶链反应-单链构象多态性(PCR-SSCP)分析方法对68例利福平耐药菌株(单耐利福平或多药耐药)和20例利福平敏感菌株进行测定。结果88例结核分枝杆菌均扩增出目标DNA条带,10例非结核分枝杆菌和8例非分枝杆菌未出现目标DNA条带,所用引物扩增rpoB基因215bp片段为结核分枝杆菌复合群特异性的。68例耐药菌株中60例PCR-SSCP条带与结核分枝杆菌标准菌株H37Rv的条带有明显差别,20例敏感菌株条带与H37Rv条带一致。与药物敏感试验结果做对比,PCR-SSCP发现结核分枝杆菌利福平耐药的敏感性为88%,特异性为100%。 展开更多
关键词 结核分枝杆菌 利福平 耐药性 单链构象多态性
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PCR-SSCP灵敏度的影响因素 被引量:1
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作者 梅平 刘双信 吕灿群 《皖南医学院学报》 CAS 2000年第4期270-272,共3页
为了探讨 PCR- SSCP方法最佳实验条件 ,笔者分析了影响 PCR- SSCP图像的因素 ,结果发现 :PCR产物的特异性、中性聚丙烯酰胺凝胶组成、电泳温度及显色系统等均影响 PCR- SSCP的结果。
关键词 狼疮性肾炎 糖皮质激素受体 PCR-SSCP 灵敏度
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单链构象多态性分析检测Leber遗传性视神经病变
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作者 胡宏阁 陈辉 +2 位作者 金学民 李晓文 徐国英 《眼科新进展》 CAS 2006年第5期361-363,368,共4页
目的筛查Leber遗传性视神经病变(Leberhereditaryopticneuropathy,LHON)患者的线粒体DNA碱基突变,研究LHON的临床发病特点及分子生物学改变。方法对3个疑似LHON家系进行调查,知情同意后,抽取了30个母系成员的血样,对照组32个血样均来自... 目的筛查Leber遗传性视神经病变(Leberhereditaryopticneuropathy,LHON)患者的线粒体DNA碱基突变,研究LHON的临床发病特点及分子生物学改变。方法对3个疑似LHON家系进行调查,知情同意后,抽取了30个母系成员的血样,对照组32个血样均来自无视力障碍的正常人。采用聚合酶链反应扩增结合单链构象多态性分析对3个家系的30个母系成员的线粒体DNA(mtDNA)进行了11个位点的突变筛查。结果3个家系的母系成员共41人(男23人,女19人),发病20例,发病率48·78%,男女比例3∶1,平均发病年龄28.73岁。3个家系患者发病年龄随传代数的增加而减小,呈现遗传早发现象。含11778、11696两个位点的片段1,实验组30例检测结果全部为异常,对照组32例单链构象多态性检测结果全部正常。含14459、14482、14484、14498位点的片段2实验组30例中仅有1例检测结果为异常,对照组32例SSCP检测结果全部正常。含3394、3460两个位点的片段3和含4136、4160、4216三个位点的片段4,实验组和对照组的所有样本均未发现异常。结论LHON患者发病年龄随传代数的增加而提前,具有遗传早发现象;综合国内的文献资料和我们的研究结果,我国LHON患者以携带11778点突变占绝大多数;所检测3个家系母系成员有共同的突变位点,但只有部分发病,其中已发病者可确诊为LHON患者,未发病的母系成员为该病的携带者。 展开更多
关键词 线粒体DNA LEBER遗传性视神经病变 聚合酶链反应 单链构象多态性
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应用PCR-SSCP检测β地中海贫血基因突变
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作者 朱益军 刘敬忠 吴冠芸 《高技术通讯》 EI CAS CSCD 1993年第6期25-27,共3页
关键词 β 地中海贫血 检测 基因
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Study on mitochondrial DNA diversity among 7 inbred strains of mice
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作者 戴纪刚 肖颖彬 +2 位作者 张国强 闵家新 魏泓 《Journal of Medical Colleges of PLA(China)》 CAS 2006年第3期164-168,共5页
Objective:To study the genetic variation of mitochondrial DNA (mtDNA) among common laboratory strains of inbred mice. Methods: The genetic polymorphism of mtDNA among 4 classical laboratory strains of inbred mice ... Objective:To study the genetic variation of mitochondrial DNA (mtDNA) among common laboratory strains of inbred mice. Methods: The genetic polymorphism of mtDNA among 4 classical laboratory strains of inbred mice and 3 inbred strains of mice established in China was analyzed by polymerase chain reaction coupled with restriction fragment length polymorphism(PCR-RFLP) and PCR coupled with single-stranded conformation polymorphism(PCR-SSCP). Results: With regard to the D-loop (Displacement loop, D-loop), tRNA^ Met+Glu+Ile, and ND3 (NADH dehydrogenase subunit 3, ND3) gene fragments of mtDNA from these mice,no variation was revealed by PCR-RFLP at 46 restriction enzyme sites. Further analyzed by PCR-SSCP,the D-loop 5'fragment and 3'end fragment of mtDNA from these mice also showed no genetic variation. Conclusion: Owing to maternal mode of inheritance of mtDNA,the results indicate that these common inbred strains of mice share the same maternal lineage. 展开更多
关键词 inbred strains mtDNA polymerase chain reaction coupled with restriction fragment length polymorphism PCR coupled with single-stranded conformation polymorphism polymorphism
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