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外源性microRNAs的研究与应用
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作者 张思雨 《饲料工业》 北大核心 2025年第13期136-144,共9页
循环microRNAs(circulating miRNAs)是一类在细胞外自由稳定存在的小分子非编码RNA,主要包括内源性miRNAs和外源性miRNAs(膳食性或体外注射)。其中,来自外部获取的miRNAs能在动物体内稳定存在,并通过循环到达靶组织和受体细胞后调节基... 循环microRNAs(circulating miRNAs)是一类在细胞外自由稳定存在的小分子非编码RNA,主要包括内源性miRNAs和外源性miRNAs(膳食性或体外注射)。其中,来自外部获取的miRNAs能在动物体内稳定存在,并通过循环到达靶组织和受体细胞后调节基因的表达,影响机体的生长发育。因此,外源性miRNAs作为跨物种信使在调节靶基因或靶细胞的生物过程研究正逐步受到关注。文章针对多种外源性miRNAs研究以及其在农业中潜在的应用前景进行综述,重点讨论了外源性miRNAs吸收、循环以及作用于受体的相关研究,为更系统地了解并利用外源性miRNAs,如在动物上的营养调控或药物治疗等提供资料。 展开更多
关键词 循环micrornas 外源性micrornas 跨物种调节 基因表达调控 营养调控
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MicroRNA对肌肉再生功能调控研究进展 被引量:1
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作者 周泰增 陈秋阳 +3 位作者 杨祎挺 甘麦邻 朱砺 沈林園 《遗传》 北大核心 2025年第5期513-532,共20页
MicroRNA(miRNA)是一类大小在22 nt左右的单链非编码短RNA分子,已被证明参与了几乎所有细胞事件中基因表达的转录后调节,包括细胞增殖、迁移、分化和凋亡。因此,miRNA受到最为广泛的研究和关注。miRNA通过靶向骨骼肌再生不同阶段的关键... MicroRNA(miRNA)是一类大小在22 nt左右的单链非编码短RNA分子,已被证明参与了几乎所有细胞事件中基因表达的转录后调节,包括细胞增殖、迁移、分化和凋亡。因此,miRNA受到最为广泛的研究和关注。miRNA通过靶向骨骼肌再生不同阶段的关键因素,在肌肉再生过程中发挥着重要作用。本文探讨了miRNA在肌肉再生过程中通过影响卫星细胞静止、成肌细胞增殖、分化从而调控肌肉再生能力,并且更新了miRNA在肌肉再生过程中与PI3K/AKT、TGF-β/Smad信号通路互作的研究进展,有助于研究者更多地了解miRNA在肌肉再生生物学中的知识,为非编码RNA参与肌肉再生提供更深入的理解。 展开更多
关键词 microrna 肌肉再生 肌肉卫星细胞 成肌细胞 信号通路
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利用荧光素酶报告基因法研究转录因子USF1结合调控马鹿MicroRNA PC-5p-4811基因启动子机制 被引量:1
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作者 高仰 韩青 +4 位作者 吴玄烨 索婧媛 金庆梅 刘学东 郑冬 《野生动物学报》 北大核心 2025年第1期63-71,共9页
为了探究转录因子上游刺激因子1(USF1)调控马鹿(Cervus elaphus)microRNA PC-5p-4811(miR-4811)基因转录的机理,综合运用核心启动子和转录因子结合位点生物信息学预测分析、基因克隆、点突变和双荧光素酶报告基因法等技术研究USF1结合mi... 为了探究转录因子上游刺激因子1(USF1)调控马鹿(Cervus elaphus)microRNA PC-5p-4811(miR-4811)基因转录的机理,综合运用核心启动子和转录因子结合位点生物信息学预测分析、基因克隆、点突变和双荧光素酶报告基因法等技术研究USF1结合miR-4811启动子分子机制和功能。结果显示:(1)截切突变证实马鹿miR-4811基因的核心启动子位于上游-3174~-2966 bp;(2)转录因子USF1在-3378~+73 bp区域共有2个DNA结合位点(-3046~-3031 bp、-3045~-3018 bp),均位于miR-4811核心启动子内;(3)USF1作为激活因子可直接结合上述位点激活miR-4811核心启动子上调双荧光素酶报告基因转录表达。研究结果揭示了USF1参与调节microRNA基因转录表达的机理,并为后续USF1/miR-4811调节轴参与调控鹿茸再生发育机制提供了重要基础数据。 展开更多
关键词 USF1 马鹿 microrna PC-5p-4811 启动子 转录调控
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microRNA在模拟空间辐射环境诱导星形胶质细胞促增殖旁效应中的作用研究
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作者 秦昱汉 张子寅 +8 位作者 严立本 郜雅楠 王爱璐 尔天漪 刘梦瑾 李诺敏 王巧娟 隋丽 马宏 《原子能科学技术》 北大核心 2025年第1期247-256,共10页
星形胶质细胞是中枢神经系统中最常见的细胞类型,也是辐射敏感的细胞类型之一。辐射不仅会影响星形胶质细胞自身的生长,还会通过细胞旁效应影响周围的神经细胞,进而诱导中枢神经系统的损伤。本研究利用^(60)Co产生的γ射线和_(12)C^(6+... 星形胶质细胞是中枢神经系统中最常见的细胞类型,也是辐射敏感的细胞类型之一。辐射不仅会影响星形胶质细胞自身的生长,还会通过细胞旁效应影响周围的神经细胞,进而诱导中枢神经系统的损伤。本研究利用^(60)Co产生的γ射线和_(12)C^(6+)产生的重离子射线,分别以耐受剂量(2 Gy的γ射线和0.2 Gy的重离子射线)和半致死剂量(10 Gy的γ射线和2 Gy的重离子射线)辐照人脑星形胶质母细胞瘤细胞(U-87细胞),比较两种射线对细胞存活率和旁细胞的影响。结果表明,γ射线和重离子射线在两种剂量下对细胞存活率和旁细胞增殖的影响有显著差异,其中γ射线诱导星形胶质细胞促增殖的旁效应,而重离子射线诱导抑制增殖的旁效应。进一步使用RNA高通量测序技术和生物信息学分析辐照前后细胞外培养基中外泌体内microRNA的表达差异情况,发现3种与细胞增殖相关的microRNA,分别是miR-24-1-5p、miR-100-5p和miR-7704,它们能够通过不同的机制共同调节旁细胞的增殖。此外,还检测了γ射线和重离子射线对这3种microRNA在细胞内外分布的影响,发现γ射线和重离子射线在不同剂量下对3种microRNA的表达影响不同。本研究发现的这3种microRNA可能是辐射诱导的星形胶质细胞促增殖旁效应的一个重要靶点,能够为揭示辐射诱导的神经致炎性细胞损伤旁效应的分子作用机制提供新的线索和思路。 展开更多
关键词 星形胶质细胞 空间辐射 外泌体 microrna
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结直肠癌患者血清microRNA-497的表达及其诊断与预后价值
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作者 华梅 翟晓璐 +2 位作者 唐翀 陈颖 印滇 《实用医学杂志》 北大核心 2025年第22期3579-3584,共6页
目的研究血清microRNA-497(miR-497)在结直肠癌(CRC)患者的表达特征,分析其与临床病理参数、诊断价值及患者预后的相关性。方法对医院2020年3月至2022年3月期间收治的122例CRC患者(CRC组)进行资料整理,筛选出100例健康体检人群作为对照... 目的研究血清microRNA-497(miR-497)在结直肠癌(CRC)患者的表达特征,分析其与临床病理参数、诊断价值及患者预后的相关性。方法对医院2020年3月至2022年3月期间收治的122例CRC患者(CRC组)进行资料整理,筛选出100例健康体检人群作为对照组。所有受试者在术前采集血清样本,利用实时定量PCR技术检测血清中miR-497的表达水平,并同步测定CEA与CA199水平。进一步分析miR-497表达与临床病理变量之间的关系,通过受试者工作特征(ROC)曲线评估其诊断能力,并采用Kaplan-Meier生存分析与Cox回归模型探讨其对患者预后的影响。结果CRC组血清miR-497表达水平显著低于健康对照组(P<0.001)。miR-497表达与TNM分期及淋巴结转移密切相关(P<0.001),而与肿瘤位置、性别、年龄等无显著相关性。ROC曲线分析显示miR-497在CRC诊断中的AUC为0.845,优于CEA(0.748)和CA199(0.702),DeLong检验表明miR-497与CEA、CA199的AUC差异均有统计学意义(P<0.05)。Kaplan-Meier生存分析显示,miR-497高表达组患者的3年DFS率显著优于低表达组(84.06%vs.64.58%)。高表达组中位DFS未达到,而低表达组中位DFS为36个月,组间差异有统计学意义(P=0.015)。Cox回归分析显示,miR-497低表达(HR=1.923,95%CI:1.184~3.125)、TNM分期(HR=2.511,95%CI:1.421~4.437)及淋巴结转移(HR=1.753,95%CI:1.151~2.664)是影响CRC患者DFS的独立危险因素。结论血清miR-497在CRC患者中呈低表达状态,且与肿瘤进展及不良预后密切相关,具有较高的诊断价值和预后评估潜力,可望作为CRC的辅助诊断和预后判断的潜在生物标志物。 展开更多
关键词 microrna-497 结直肠癌 肿瘤标志物 诊断效能 预后
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反刍动物初乳microRNA组成和功能研究进展
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作者 孙同玉 马涛 《畜牧兽医学报》 北大核心 2025年第1期74-81,共8页
反刍动物初乳中含有丰富的生物活性成分,其中microRNA是一类非编码RNA,可在转录后水平调节基因的表达,对于母体乳腺以及幼龄反刍动物肠道发育具有重要的调控作用。近年来,反刍动物初乳microRNA组成和功能的研究开始受到关注,本文综述了... 反刍动物初乳中含有丰富的生物活性成分,其中microRNA是一类非编码RNA,可在转录后水平调节基因的表达,对于母体乳腺以及幼龄反刍动物肠道发育具有重要的调控作用。近年来,反刍动物初乳microRNA组成和功能的研究开始受到关注,本文综述了反刍动物初乳中microRNA的来源、组成及其影响因素、功能,以及目前研究的局限性和未来的研究方向,为生产高品质初乳,提高母仔一体化培育水平提供理论支撑。 展开更多
关键词 反刍动物 初乳 microrna 胞外囊泡
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转录因子与microRNA在木质部次生细胞壁发育中的调控作用
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作者 章健楠 夏国华 《浙江农林大学学报》 北大核心 2025年第4期853-863,共11页
植物的次生细胞壁对维持结构完整性、提供机械支撑以及促进水分和矿物运输具有关键作用。随着分子生物学和生物信息学的发展,次生细胞壁形成的分子调控机制被深入揭示。研究显示:转录因子(如NAC、MYB等)和微RNA(microRNA)构建起了多层... 植物的次生细胞壁对维持结构完整性、提供机械支撑以及促进水分和矿物运输具有关键作用。随着分子生物学和生物信息学的发展,次生细胞壁形成的分子调控机制被深入揭示。研究显示:转录因子(如NAC、MYB等)和微RNA(microRNA)构建起了多层次的调控网络,在次生细胞壁的形成过程中发挥了重要作用。其中,NAC和MYB家族转录因子能激活木质素、纤维素和木聚糖合成相关的基因,从而直接参与次生细胞壁的生物合成;microRNA则通过靶向这些转录因子及其下游基因,实现对次生细胞壁发育的精细调控。本研究综述了次生细胞壁形成的最新研究进展,重点探讨了转录因子和microRNA在该过程中的相互作用及调控机制。此外,还对该领域当前的研究挑战和未来方向进行了探讨,为加深对植物木质部发育分子基础的理解以及为木材改良和生物质能源开发提供理论支撑。 展开更多
关键词 次生细胞壁 转录因子 microrna 分子调控 木质部发育
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草地贪夜蛾Sf9细胞外泌体microRNA调控AcMNPV增殖的研究
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作者 田伟彬 张以农 +2 位作者 任菲菲 严寄铭 孙京臣 《华南农业大学学报》 北大核心 2025年第2期133-140,共8页
【目的】探究草地贪夜蛾Spodoptera frugiperda Sf9细胞外泌体microRNA(miRNA)对苜蓿银纹夜蛾核多角体病毒(Autographa californica multiple nucleopolyhedrovirus,AcMNPV)增殖的影响。【方法】通过不连续蔗糖质量分数梯度超速离心纯... 【目的】探究草地贪夜蛾Spodoptera frugiperda Sf9细胞外泌体microRNA(miRNA)对苜蓿银纹夜蛾核多角体病毒(Autographa californica multiple nucleopolyhedrovirus,AcMNPV)增殖的影响。【方法】通过不连续蔗糖质量分数梯度超速离心纯化外泌体,随后利用透射电镜观察和纳米颗粒跟踪分析技术对纯化产物进行颗粒直径分析。运用sRNA高通量测序技术筛选AcMNPV感染Sf9细胞后外泌体差异表达的miRNA并预测其潜在靶基因对应的生物学通路。通过转染模拟物(mimic)和病毒感染等细胞试验以及qPCR验证外泌体miRNA的差异表达,并检测差异表达miRNA——sfr-miR-1a-3p对AcMNPV增殖的影响。【结果】成功纯化Sf9细胞外泌体,且AcMNPV感染有效刺激Sf9细胞外泌体的分泌量增加。AcMNPV感染Sf9细胞72 h后,经与Rfam数据库比对,筛选出11个差异表达的外泌体miRNAs,其中,8个miRNAs的转录水平与测序结果趋势一致。通过预测miRNAs靶基因和KEGG富集分析,发现潜在的靶基因主要富集在cAMP信号通路、PI3K-Akt信号通路、癌症通路、人乳头瘤病毒信号通路等,这表明差异表达外泌体miRNA可能参与昆虫天然免疫反应。过表达sfrmiR-1a-3p能显著提高AcMNPV病毒vp39基因的表达。【结论】本研究通过sRNA测序筛选了AcMNPV感染后Sf9细胞外泌体的差异表达miRNA,证明了AcMNPV通过促进外泌体分泌,协助被感染细胞传递miRNA−sfr-miR-1a-3p来影响周围未感染细胞,以促进自身增殖。以上结果为昆虫外泌体传递miRNA以调控病毒增殖的机制研究提供了重要的理论依据。 展开更多
关键词 草地贪夜蛾 SF9细胞 苜蓿银纹夜蛾核多角体病毒 外泌体 microrna sfr-miR-1a-3p
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MicroRNA-486-3p调控小鼠巨噬细胞差异表达基因筛选及鉴定
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作者 刘鸿雁 吴双双 +6 位作者 陈书婕 岑玉威 马一瑄 岳佳颖 魏书宇 王北艳 马金柱 《黑龙江八一农垦大学学报》 2025年第5期90-96,共7页
为分析MicroRNA-486-3p在小鼠巨噬细胞抵抗金黄色葡萄球菌感染过程中的调控作用,使用金黄色葡萄球菌感染MicroRNA-486-3p基因敲除型和野生型小鼠原代腹腔巨噬细胞24 h后,通过mRNA-Seq方法分析mRNA表达水平,筛选MicroRNA-486-3p调控巨噬... 为分析MicroRNA-486-3p在小鼠巨噬细胞抵抗金黄色葡萄球菌感染过程中的调控作用,使用金黄色葡萄球菌感染MicroRNA-486-3p基因敲除型和野生型小鼠原代腹腔巨噬细胞24 h后,通过mRNA-Seq方法分析mRNA表达水平,筛选MicroRNA-486-3p调控巨噬细胞的差异表达基因,利用RT-qPCR对遴选的差异基因加以验证。测序结果分析显示,差异表达基因共有744个,其中385个上调差异基因,359个下调差异基因,GO分析表明差异基因参与细胞代谢、增殖和免疫反应等生物作用,KEGG富集分析显示差异基因主要与PI3K-Akt、MAPK、NF-κB等信号通路活化相关,RT-qPCR验证结果显示遴选的差异基因与m RNA-Seq分析的下调趋势相符。上述结果表明,MicroRNA-486-3p在小鼠巨噬细胞感染金黄色葡萄球菌过程中具有调控作用,为今后深入研究MicroRNA-486-3p调控巨噬细胞免疫功能机制提供了重要参考。 展开更多
关键词 microrna-486-3p MRNA-SEQ 巨噬细胞 差异表达基因 金黄色葡萄球菌
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循环microRNAs的外泌形成机制及其对乳腺癌侵袭和转移的影响 被引量:6
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作者 万晓庆 王学健 +5 位作者 王艺斐 姜雨 路中 史立宏 丁怡 王丽华 《生物化学与生物物理进展》 SCIE CAS CSCD 北大核心 2017年第4期269-278,共10页
目前乳腺癌的临床诊疗主要依赖影像学和相对较少的预后/预测指标(如雌激素受体、孕激素受体、HER2等).这些生物标志物主要是基于原发肿瘤病灶的生物学检测,可用于转移或复发的检测指标很少,尤其是在切除肿瘤原发灶后,复发监测很困难.循... 目前乳腺癌的临床诊疗主要依赖影像学和相对较少的预后/预测指标(如雌激素受体、孕激素受体、HER2等).这些生物标志物主要是基于原发肿瘤病灶的生物学检测,可用于转移或复发的检测指标很少,尤其是在切除肿瘤原发灶后,复发监测很困难.循环cell-free microRNAs(circulating cf-miRNAs,或简称circulating miRNAs)的发现为改变现有乳腺癌临床诊疗模式提供了可能.Cell-free miRNA通过外泌体、微囊或转运蛋白的主动外泌机制,可能在循环miRNA的形成中起着重要作用.Cell-free miRNA特别是circulating miRNA不仅自身可以作为信号分子影响肿瘤细胞和组织微环境,而且还可以与其他信号通路发生交互通讯来调控肿瘤部位新生血管的形成和肿瘤细胞表型的上皮-间质转换,影响乳腺癌的侵袭和转移.本文综述了循环miRNA的特征与分泌机制,特别是乳腺癌相关的循环miRNA参与作为一种液体活检生物标志物在乳腺癌诊断、预后评价和疗效评估的临床意义. 展开更多
关键词 microrna CELL-FREE micrornaS 循环microrna 主动外泌 乳腺癌 转移
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布鲁氏菌病诊断外泌体microRNA生物标志物的筛选和潜在miRNA-mRNA调控网络的构建
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作者 赵进 陈志强 +5 位作者 王冰丽 李书灵 朱晓玉 贾金彤 柳叶子 李智伟 《中国人兽共患病学报》 北大核心 2025年第3期269-277,共9页
目的 探索布鲁氏菌病新型辅助诊断生物标志物及其潜在的miRNA-mRNA调控网络。方法 通过高通量测序比较布鲁氏菌病患者和健康对照组血清外泌体中miRNA的表达差异。利用RT-qPCR验证显著上调的外泌体miRNA的表达。采用ROC曲线评估这些miRN... 目的 探索布鲁氏菌病新型辅助诊断生物标志物及其潜在的miRNA-mRNA调控网络。方法 通过高通量测序比较布鲁氏菌病患者和健康对照组血清外泌体中miRNA的表达差异。利用RT-qPCR验证显著上调的外泌体miRNA的表达。采用ROC曲线评估这些miRNA的诊断价值,并结合生物信息学分析miRNA在布鲁氏菌病感染中的潜在作用。结果 ROC曲线显示外泌体hsa-miR-11400(P<0.05)、hsa-miR-199a-5p(P<0.05)和hsa-miR-148a-5p(P<0.05)的曲线下面积分别为0.79、0.81和0.74。预测了465个差异表达基因,其中包括25个免疫相关靶基因,其中大多数与癌症蛋白多糖、NF-kappa B信号网络和IL-17信号通路密切相关。通过构建差异表达基因网络,PLXNA2、IL17RA、PRKCA、CD22、ACVR1B和CBL免疫基因可能分别受到hsa-miR-199a-5p和hsa-miR-148a-5p的调控。结论 表明外泌体miRNA可作为布鲁氏菌病的辅助诊断指标,且外泌体miRNA-mRNA调控网络为布鲁氏菌病的发病机制及治疗提供了新的见解。 展开更多
关键词 布鲁氏菌病 外泌体微小核糖核酸 生物标志物 miRNA-mRNA调控网络
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microRNA调控血吸虫生长发育的研究进展
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作者 孙成松 王毓洁 《中国人兽共患病学报》 北大核心 2025年第1期94-101,共8页
microRNA(miRNA)是一类大小约22 nt的内源性非编码RNA,其通过与靶基因mRNA序列3′端非翻译区(3′untranslated region,3′UTR)互补结合,促使mRNA降解或抑制翻译,进而调节众多的生理和病理过程。越来越多的证据表明,miRNA在血吸虫生长发... microRNA(miRNA)是一类大小约22 nt的内源性非编码RNA,其通过与靶基因mRNA序列3′端非翻译区(3′untranslated region,3′UTR)互补结合,促使mRNA降解或抑制翻译,进而调节众多的生理和病理过程。越来越多的证据表明,miRNA在血吸虫生长发育以及与宿主间相互作用过程中发挥重要的调控作用。本文着重阐述不同来源miRNA调控血吸虫生长发育的研究进展,为血吸虫生物学与血吸虫病防治研究提供新的思路。 展开更多
关键词 血吸虫 microrna 生长发育
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脑梗死和脑出血患者外周血中循环microRNA表达谱差异的初步分析 被引量:22
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作者 李武英 金俊 +3 位作者 陈健 郭阳 汤郡 谭盛 《实用医学杂志》 CAS 北大核心 2014年第11期1750-1753,共4页
目的:利用microRNA芯片研究急性脑梗死和脑出血患者循环血浆中是否存在相关的miRNAs及有表达差异的miRNAs。方法:分别收集急性脑梗死、脑出血患者和健康对照者全血各3例,运用Norgen血浆外泌体RNA提取试剂盒提取血浆总RNA并通过定量PCR... 目的:利用microRNA芯片研究急性脑梗死和脑出血患者循环血浆中是否存在相关的miRNAs及有表达差异的miRNAs。方法:分别收集急性脑梗死、脑出血患者和健康对照者全血各3例,运用Norgen血浆外泌体RNA提取试剂盒提取血浆总RNA并通过定量PCR进行质量和浓度检测。采用μParaflorTM microRNA芯片技术进行miRNAs表达谱研究。用相关软件和统计学方法进行数据分析。结果:在脑梗死和脑出血患者血浆中发现8个与脑卒中相关的miRNAs,且有显著差异性表达(P<0.05)。脑梗死和健康对照者、脑出血和健康对照者间分别有11、24个差异表达miRNAs,但两两比较上调或下调2倍以上的差异表达的miRNAs均无统计学意义(P>0.05)。结论:脑梗死和脑出血组间miRNA的表达差异可能与不同类型脑卒中的发生发展相关,可为进一步研究急性脑卒中发生的表观遗传学分子机制提供依据。 展开更多
关键词 脑梗死 脑出血 循环microrna microrna芯片
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p53直接调控microRNA及其靶基因的高通量筛选 被引量:8
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作者 郭志云 茆灿泉 +1 位作者 熊莉丽 辛洪波 《生物化学与生物物理进展》 SCIE CAS CSCD 北大核心 2009年第9期1154-1164,共11页
通过对676条人microRNA进行筛选,共得到了53条新的具有p53-DNA结合位点且调控p53上游转录因子和下游靶基因的microRNA.结合已有蛋白质互作关系与microRNA调控信息,构建了p53-microRNA相互作用网络图,其中FAS受多条microRNA调控,FAS是介... 通过对676条人microRNA进行筛选,共得到了53条新的具有p53-DNA结合位点且调控p53上游转录因子和下游靶基因的microRNA.结合已有蛋白质互作关系与microRNA调控信息,构建了p53-microRNA相互作用网络图,其中FAS受多条microRNA调控,FAS是介导细胞凋亡的关键因子,因此,FAS-microRNA的相互作用可能在细胞凋亡途径中起着关键的作用.随后,提出了microRNA参与p53调控的假设机制,认为p53调控靶基因与microRNA的同时也受上游转录因子与microRNA的调控,从而形成了以p53为中心的一种平衡,当这种调控平衡一旦被打破则会引起信号通路的紊乱,从而可能引发相应的疾病.对这53条microRNA进行靶基因预测,共得到15500个靶基因,对这些基因的出现频率进行聚类分析共得到27个簇,将出现频率大于10的基因进行功能注释分析,发现多数基因功能属于近来发现的p53靶基因新的功能分类——细胞粘连和细胞运动,目前研究认为,p53通过与这些具有细胞粘连和运动功能的靶基因结合来抑制肿瘤的迁移.通过对15500个基因进行功能注释分析,得到了30条感兴趣的参与细胞周期调控、细胞凋亡和细胞增殖的microRNA,其中有9条microRNA于3种生物学进程均有参与,这9条microRNA分别是:hsa-mir-181a-1、hsa-mir-181b-1、hsa-mir-181c、hsa-mir-181d、hsa-mir-195、hsa-mir-497、hsa-mir-495、hsa-mir-543和hsa-mir-548c.这暗示着这9条microRNA在p53信号通路的调节中可能起着关键的作用,它们互相作用共同调节着多个p53信号环路.最后在36个物种的基因组中对这30条microRNA进行了同源性搜索与保守性分析,结果发现有10条高度保守的且为目前数据库所未收录的microRNA.这10条microRNA分别是:hsa-mir-497、hsa-mir-495、hsa-mir-543、hsa-mir-19a、hsa-mir-19b-1、hsa-mir-200b、hsa-mir-448、hsa-mir-28、hsa-mir-455和hsa-mir-590. 展开更多
关键词 microrna P53 p53-DNA结合位点 microrna靶基因预测
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MicroRNA-21在缺血再灌注损伤早期大鼠心肌的表达及抗细胞凋亡作用 被引量:7
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作者 杨琼 杨侃 +1 位作者 李安莹 谭文鹏 《中南大学学报(医学版)》 CAS CSCD 北大核心 2013年第5期483-489,共7页
目的:观察microRNA-21(miR-21)在缺血再灌注损伤(I/R)早期大鼠心肌的表达及对细胞凋亡的影响。方法:SD大鼠随机分为对照组(冠状动脉注射转染空白对照病毒rAAV9-ZsGreen),miR-21组(冠状动脉注射转染rAAV9-ZsGreen-pre-miR-21),Sham组(仅... 目的:观察microRNA-21(miR-21)在缺血再灌注损伤(I/R)早期大鼠心肌的表达及对细胞凋亡的影响。方法:SD大鼠随机分为对照组(冠状动脉注射转染空白对照病毒rAAV9-ZsGreen),miR-21组(冠状动脉注射转染rAAV9-ZsGreen-pre-miR-21),Sham组(仅开胸挂线),I/R组(进行I/R处理),I/R+miR-21(转染rAAV9-ZsGreen-pre-miR-21后再进行I/R处理)。用Realtime-PCR检测大鼠miR-21水平,免疫组织化学及Western印迹方法检测Bcl-2,Bax,caspase-3水平并计算Bcl-2/Bax比值。结果:冠状动脉注射rAAV9-ZsGreen-pre-miR-21可使miR-21表达增加4.43倍(P<0.001);与Sham组比较,I/R组大鼠缺血区miR-21水平下调(P<0.05),而非缺血区miR-21升高(P<0.05);与Sham组比较,I/R组再灌注1,2,6 h miR-21水平进行性下降(P<0.05),在同一时间点I/R+miR-21组较I/R组miR-21表达升高(P<0.05);与Sham组比较,再灌注6h时I/R及I/R+miR-21组Bcl-2增高、caspase-3增高、Bcl-2/Bax降低(P<0.05),与I/R组比较,I/R+miR-21组Bcl-2下调、caspase-3下调、Bcl-2/Bax增高(P<0.05)。结论:I/R早期大鼠心肌缺血区miR-21表达下降,细胞凋亡增加,过表达miR-21可改善细胞凋亡。 展开更多
关键词 microrna microrna-21 缺血再灌注损伤 细胞凋亡
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子宫内膜癌干细胞分化过程中microRNA表达谱的鉴定及分析 被引量:7
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作者 王伟 王臻 +3 位作者 黄康榕 王月玲 柏海燕 杨新园 《西安交通大学学报(医学版)》 CAS CSCD 北大核心 2018年第2期221-226,共6页
目的筛选子宫内膜癌干细胞分化过程中差异表达的microRNAs(miRNAs)并进行初步鉴定。方法无血清悬浮培养法富集子宫内膜癌干细胞,贴壁培养获得其分化细胞。利用microRNA芯片比较肿瘤干细胞及其分化细胞之间miRNAs的表达差异,挑选出有显... 目的筛选子宫内膜癌干细胞分化过程中差异表达的microRNAs(miRNAs)并进行初步鉴定。方法无血清悬浮培养法富集子宫内膜癌干细胞,贴壁培养获得其分化细胞。利用microRNA芯片比较肿瘤干细胞及其分化细胞之间miRNAs的表达差异,挑选出有显著差异的miRNAs,通过RT-qPCR进行验证,应用TargetScan等数据库预测其靶基因;同时,芯片检测肿瘤干细胞及其分化细胞之间基因表达的差异,结合预测的miRNAs靶基因进行综合分析。结果 microRNA芯片筛选得到子宫内膜癌干细胞及其分化细胞之间差异表达(相差倍数2倍以上)的miRNAs有11个,其中在肿瘤干细胞中表达上调的miRNAs 10个,分别为miR-522、miR-139-3p、miR-520c-5p、miR-518d-5p、miR-146b-5p、miR-34a、miR-526a、miR-193a-3p、miR-221、miR-4674;在肿瘤干细胞中低表达的miRNA 1个,为miR-760。RT-qPCR检测结果显示,除miR-526a、miR-4674以外,其余9个miRNAs在肿瘤干细胞及分化细胞间的相对表达量均存在显著差异,与芯片检测结果一致。TargetScan、miRanda及miRTarBase在线数据库的交集中,筛选的miRNAs均可预测到靶基因。基因芯片检测肿瘤干细胞及其分化细胞,表达有显著性差异的基因共445个,其中207个在肿瘤干细胞中高表达,238个在肿瘤干细胞中低表达,与预测的miRNAs靶基因进行综合分析后发现,除miR-139-3p外,两者均有交集。结论子宫内膜癌干细胞分化过程中部分miRNAs的表达具有显著性变化,对此进行深入探索将为肿瘤干细胞的分化机制研究提供新的线索。 展开更多
关键词 子宫内膜癌 肿瘤干细胞 分化 micrornaS microrna芯片
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k-gram方法识别microRNA前体 被引量:4
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作者 杨良怀 吕丕明 +1 位作者 陈立军 邓明华 《生物化学与生物物理进展》 SCIE CAS CSCD 北大核心 2007年第2期154-161,共8页
MicroRNAs(miRNAs)是动植物中较短的参与调控基因表达的功能性非编码RNA序列.第一个miRNA是通过实验手段发现的,然而通过实验手段识别miRNA在技术上仍然具有很大的挑战性和不完整性.因此,miRNA基因识别需要寻求计算方法来弥补实验方法... MicroRNAs(miRNAs)是动植物中较短的参与调控基因表达的功能性非编码RNA序列.第一个miRNA是通过实验手段发现的,然而通过实验手段识别miRNA在技术上仍然具有很大的挑战性和不完整性.因此,miRNA基因识别需要寻求计算方法来弥补实验方法的不足.提出了一个全新的miRNA前体的识别方法.在构造识别模型中,把初级序列和序列二级结构相结合,采用k-gram方法把序列信息映射到高维特征空间中,然后通过特征选取方法提取特征,并用这些特征为miRNA前体的识别构造了基于SVM的识别模型.同时,采用隐马尔可夫模型(HMM)的学习方法进行了比较.实验结果表明,该方法是有效的,可以达到较高的敏感性和特异性. 展开更多
关键词 microrna 基因识别 支持向量机 隐马尔可夫模型 microrna前体
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MicroRNA-25对大鼠骨关节炎软骨细胞增殖和凋亡调节作用 被引量:7
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作者 吴寒松 黄世福 +4 位作者 黎腾 曾群群 陈彬祺 邹腾 廖琦 《科学技术与工程》 北大核心 2016年第33期160-164,170,共6页
探讨miR-25对白细胞介素1β(IL-1β)促进OA软骨细胞凋亡和增殖的影响。以木瓜蛋白酶膝关节腔注射诱导骨性关节炎动物模型和SD大鼠骨性关节炎软骨细胞原代培养。IL-1β体外刺激OA软骨细胞,模拟骨性关节炎体外环境。MiR-25mimic或inhibito... 探讨miR-25对白细胞介素1β(IL-1β)促进OA软骨细胞凋亡和增殖的影响。以木瓜蛋白酶膝关节腔注射诱导骨性关节炎动物模型和SD大鼠骨性关节炎软骨细胞原代培养。IL-1β体外刺激OA软骨细胞,模拟骨性关节炎体外环境。MiR-25mimic或inhibitor转染至OA软骨细胞。利用Annexin V-FITC/PI和CCK-8法检测软骨细胞细胞凋亡和细胞增殖。miR-25过表达明显抑制软骨细胞凋亡而miR-25低表达促进软骨细胞凋亡(P<0.05);miR-25 mimic促进软骨细胞增殖,而miR-25 inhibitor抑制软骨细胞增殖(P>0.05)。miR-25介导OA发病发生,进展中发挥着保护性调节作用,抑制OA软骨细胞凋亡和促进其增殖作用,可能对OA发病机制有新的认识和提示OA新治疗策略。 展开更多
关键词 骨性关节炎 microrna microrna-25 细胞凋亡 细胞增殖
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MicroRNA与肝癌诊治:新的机遇和挑战 被引量:10
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作者 侯晋 曹雪涛 《中国肿瘤生物治疗杂志》 CAS CSCD 北大核心 2015年第1期1-7,共7页
MicroRNA(miRNA)广泛参与机体各项生理和病理过程,近年来受到广泛关注且研究进展迅速。肝癌尤其是乙型肝炎相关肝癌是我国的重大疾病,miRNA在肝癌发生、发展过程中发挥着重要作用,在肝癌发生、肿瘤进展、预后判断和生物治疗等方面,miRN... MicroRNA(miRNA)广泛参与机体各项生理和病理过程,近年来受到广泛关注且研究进展迅速。肝癌尤其是乙型肝炎相关肝癌是我国的重大疾病,miRNA在肝癌发生、发展过程中发挥着重要作用,在肝癌发生、肿瘤进展、预后判断和生物治疗等方面,miRNA均能通过调控其靶基因的表达参与其中。由于大规模平行测序等miRNA组学研究的新技术进展迅速,肝脏与肝癌miRNA组的研究进一步加深了科研工作者对肝癌相关miRNA的理解。在肝脏中富集表达的miRNA在肝癌组织中均出现表达失调,这些表达失调的重要miRNA已被证明是肝癌基因治疗的潜在靶点。此外,肝癌患者血清中存在的游离miRNA被证实是肝癌诊断和个体化治疗的潜在生物标志物。笔者简要阐述肝癌相关miRNA的表达和作用机制及其在临床肝癌诊断和干预中的潜在意义与价值,并对miRNA给肝癌诊治带来新的机遇和挑战作一展望。 展开更多
关键词 肝细胞癌 microrna microrna 标志物 诊断 治疗
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螺旋CT灌注成像联合血清microRNA-20a、microRNA-210水平对非小细胞肺癌同步放化疗预后的预测价值 被引量:19
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作者 潘元威 董军强 +2 位作者 胡丽丽 王猛 周志刚 《郑州大学学报(医学版)》 CAS 北大核心 2020年第2期281-286,共6页
目的:探讨64层螺旋CT灌注(CTP)成像联合血清microRNA(miR)-20a、miR-210水平对非小细胞肺癌(NSCLC)同步放化疗预后的预测价值。方法:回顾性分析105例行同步放化疗的NSCLC患者的临床资料,同步放化疗结束2周后评估疗效,行CT检查并记录血流... 目的:探讨64层螺旋CT灌注(CTP)成像联合血清microRNA(miR)-20a、miR-210水平对非小细胞肺癌(NSCLC)同步放化疗预后的预测价值。方法:回顾性分析105例行同步放化疗的NSCLC患者的临床资料,同步放化疗结束2周后评估疗效,行CT检查并记录血流量(BF)、表面通透性(PMB)、对比剂平均通过时间(MTT),实时荧光定量PCR法检测血清miR-20a、miR-210水平。结果:同步放化疗结束2周后,缓解84例,未缓解21例。随访1 a,生存68例,死亡37例。缓解组BF、PMB及血清miR-20a、miR-210水平低于未缓解组,生存组低于死亡组(P<0.05);缓解组MTT长于未缓解组,生存组长于死亡组(P<0.05)。Logistic回归分析结果显示BF、PMB、MTT、血清miR-20a、miR-210水平是预后不良的预测因子,OR(95%CI)分别为2.599(1.856~3.341)、2.100(1.748~2.452)、1.831(1.236~2.427)、3.117(2.197~4.038)、2.892(2.004~3.380)。5个指标在诊断界点串联预测的灵敏度、准确度、约登指数分别为72.97%、94.12%、0.671。结论:CTP成像参数BF、PMB、MTT及血清miR-20a、miR-210水平与NSCLC同步放化疗预后关系密切,指标联合可提高预后预测的特异度。 展开更多
关键词 非小细胞肺癌 螺旋CT灌注成像 microrna-20a microrna-210
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