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降解纤维素的“超分子机器”研究进展
被引量:
10
1
作者
王金兰
王禄山
+2 位作者
刘巍峰
陈冠军
高培基
《生物化学与生物物理进展》
SCIE
CAS
CSCD
北大核心
2011年第1期28-35,共8页
综述了目前关于纤维小体组装模式、纤维小体结构多样性及人工设计纤维小体等方面的研究进展.纤维小体是某些厌氧菌产生的由多个亚基共同组装而成的大分子机器,是致力于组织、协调多种酶组分协同高效催化降解木质纤维素的胞外蛋白质复合...
综述了目前关于纤维小体组装模式、纤维小体结构多样性及人工设计纤维小体等方面的研究进展.纤维小体是某些厌氧菌产生的由多个亚基共同组装而成的大分子机器,是致力于组织、协调多种酶组分协同高效催化降解木质纤维素的胞外蛋白质复合体.纤维小体是厌氧微生物水解纤维素的主体,具有非常高效的打破结晶纤维素的结晶结构和降解纤维素链的作用.纤维小体对木质纤维素降解的高效性来自于其自发组装而成的复杂的高级结构,其结构的复杂性因不同的厌氧微生物而有所不同.
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关键词
纤维小体
粘连模块
对接模块
脚手架蛋白
超分子复合体
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职称材料
内切纤维素酶E4参与纤维小体组装的研究
2
作者
区镜深
葛洪
曹以诚
《华南理工大学学报(自然科学版)》
EI
CAS
CSCD
北大核心
2013年第12期90-94,100,共6页
褐色高温单胞菌编码内切纤维素酶E4的催化域(CAD)DNA片段与丙酮丁醇梭菌编码对接蛋白的基因片段通过装配PCR方法,在大肠杆菌BL21(DE3)重组表达形成融合蛋白E4SD,然后在钙离子介导下与在大肠杆菌BL21(DE3)表达的来源于丙酮丁醇梭菌的含...
褐色高温单胞菌编码内切纤维素酶E4的催化域(CAD)DNA片段与丙酮丁醇梭菌编码对接蛋白的基因片段通过装配PCR方法,在大肠杆菌BL21(DE3)重组表达形成融合蛋白E4SD,然后在钙离子介导下与在大肠杆菌BL21(DE3)表达的来源于丙酮丁醇梭菌的含有纤维素结合单元和2个粘连蛋白的脚手架蛋白CipA互相作用,在体外组装成微纤维小体.结果显示,E4SD通过C-端的对接蛋白成功地与脚手架蛋白上的粘连蛋白互相作用,结合到脚手架蛋白上,且E4SD在微纤维小体中的羧甲基纤维素和微晶纤维素酶活性分别提高到游离状态下的130%与300%,提示非纤维小体酶系的纤维素酶,特别是远缘物种的具有优良酶特性的纤维素酶可以通过将其与脚手架蛋白同样种属的对接蛋白添加至末端,从而参与到丙酮丁醇梭菌的纤维小体中来,并与其他纤维素酶在脚手架蛋白的参与下协调作用,高效降解纤维素.
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关键词
内切纤维素酶E4
纤维小体
脚手架蛋白
对接蛋白
粘连蛋白
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职称材料
解纤维梭菌纤维小体黏附域与锚定域相互作用的差异性
3
作者
刘娜
闫治华
+1 位作者
申哲伟
许成钢
《中国生物化学与分子生物学报》
CAS
CSCD
北大核心
2022年第12期1651-1660,共10页
黏附域(cohesin)与锚定域(dockerin)的相互作用是纤维素酶复合体-纤维小体(cellulosome)组装的基础,该作用是自然界已知最强的相互作用力之一。为解析纤维小体的装配机制,本研究以解纤维梭菌(Ruminiclostridium cellulolyticum)纤维小...
黏附域(cohesin)与锚定域(dockerin)的相互作用是纤维素酶复合体-纤维小体(cellulosome)组装的基础,该作用是自然界已知最强的相互作用力之一。为解析纤维小体的装配机制,本研究以解纤维梭菌(Ruminiclostridium cellulolyticum)纤维小体为研究对象,通过Pull-down和等温滴定量热(ITC)的方法,分析并比较不同簇的3个黏附域与7个锚定域之间的相互作用。结果表明,不同簇黏附域与锚定域的相互作用具有显著差异。其中,Coh1与Doc-0729的相互作用最强,Ka为108 M-1,Coh7与Doc-0729、0931作用力强,Ka为107 M-1,而Coh8与Doc-0931、1656、0752作用强,Ka也达到107 M-1。总之,Doc-0729、0931、1656与3个Coh的结合力均较高。本研究揭示了纤维小体黏附域与锚定域的组装具有偏爱性,这为人工纤维小体的设计和装配奠定了理论基础。
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关键词
纤维小体
黏附域
锚定域
相互作用
解纤维梭菌
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职称材料
题名
降解纤维素的“超分子机器”研究进展
被引量:
10
1
作者
王金兰
王禄山
刘巍峰
陈冠军
高培基
机构
山东大学微生物技术国家重点实验室
山东大学威海分校
出处
《生物化学与生物物理进展》
SCIE
CAS
CSCD
北大核心
2011年第1期28-35,共8页
基金
国家自然科学基金(30970092)
山东省自然科学基金(Y2008D10)资助项目~~
文摘
综述了目前关于纤维小体组装模式、纤维小体结构多样性及人工设计纤维小体等方面的研究进展.纤维小体是某些厌氧菌产生的由多个亚基共同组装而成的大分子机器,是致力于组织、协调多种酶组分协同高效催化降解木质纤维素的胞外蛋白质复合体.纤维小体是厌氧微生物水解纤维素的主体,具有非常高效的打破结晶纤维素的结晶结构和降解纤维素链的作用.纤维小体对木质纤维素降解的高效性来自于其自发组装而成的复杂的高级结构,其结构的复杂性因不同的厌氧微生物而有所不同.
关键词
纤维小体
粘连模块
对接模块
脚手架蛋白
超分子复合体
Keywords
cellulosome
cohesin
dockerin
scaffoldin
macromolecular complexes
分类号
Q936 [生物学—微生物学]
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职称材料
题名
内切纤维素酶E4参与纤维小体组装的研究
2
作者
区镜深
葛洪
曹以诚
机构
华南理工大学生物科学与工程学院
出处
《华南理工大学学报(自然科学版)》
EI
CAS
CSCD
北大核心
2013年第12期90-94,100,共6页
基金
教育部中国网格计划生物信息网格平台子项目(B12137040130)
文摘
褐色高温单胞菌编码内切纤维素酶E4的催化域(CAD)DNA片段与丙酮丁醇梭菌编码对接蛋白的基因片段通过装配PCR方法,在大肠杆菌BL21(DE3)重组表达形成融合蛋白E4SD,然后在钙离子介导下与在大肠杆菌BL21(DE3)表达的来源于丙酮丁醇梭菌的含有纤维素结合单元和2个粘连蛋白的脚手架蛋白CipA互相作用,在体外组装成微纤维小体.结果显示,E4SD通过C-端的对接蛋白成功地与脚手架蛋白上的粘连蛋白互相作用,结合到脚手架蛋白上,且E4SD在微纤维小体中的羧甲基纤维素和微晶纤维素酶活性分别提高到游离状态下的130%与300%,提示非纤维小体酶系的纤维素酶,特别是远缘物种的具有优良酶特性的纤维素酶可以通过将其与脚手架蛋白同样种属的对接蛋白添加至末端,从而参与到丙酮丁醇梭菌的纤维小体中来,并与其他纤维素酶在脚手架蛋白的参与下协调作用,高效降解纤维素.
关键词
内切纤维素酶E4
纤维小体
脚手架蛋白
对接蛋白
粘连蛋白
Keywords
endoglucanase E4
minicellulosome
scaffoldin
dockerin
cohesin
分类号
Q78 [生物学—分子生物学]
Q814 [生物学—生物工程]
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职称材料
题名
解纤维梭菌纤维小体黏附域与锚定域相互作用的差异性
3
作者
刘娜
闫治华
申哲伟
许成钢
机构
浙江农林大学动物科技学院动物医学院兽医系
化学生物学与分子工程教育部重点实验室
山西大学生命科学学院
出处
《中国生物化学与分子生物学报》
CAS
CSCD
北大核心
2022年第12期1651-1660,共10页
基金
国家自然科学基金项目(No.32170053)
山西省自然科学基金(No.201901D211195)
浙江农业大学发展基金(No.2022LFR065)资助。
文摘
黏附域(cohesin)与锚定域(dockerin)的相互作用是纤维素酶复合体-纤维小体(cellulosome)组装的基础,该作用是自然界已知最强的相互作用力之一。为解析纤维小体的装配机制,本研究以解纤维梭菌(Ruminiclostridium cellulolyticum)纤维小体为研究对象,通过Pull-down和等温滴定量热(ITC)的方法,分析并比较不同簇的3个黏附域与7个锚定域之间的相互作用。结果表明,不同簇黏附域与锚定域的相互作用具有显著差异。其中,Coh1与Doc-0729的相互作用最强,Ka为108 M-1,Coh7与Doc-0729、0931作用力强,Ka为107 M-1,而Coh8与Doc-0931、1656、0752作用强,Ka也达到107 M-1。总之,Doc-0729、0931、1656与3个Coh的结合力均较高。本研究揭示了纤维小体黏附域与锚定域的组装具有偏爱性,这为人工纤维小体的设计和装配奠定了理论基础。
关键词
纤维小体
黏附域
锚定域
相互作用
解纤维梭菌
Keywords
cellulosome
cohesin
dockerin
interaction
Ruminiclostridium cellulolyticum
分类号
Q71 [生物学—分子生物学]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
降解纤维素的“超分子机器”研究进展
王金兰
王禄山
刘巍峰
陈冠军
高培基
《生物化学与生物物理进展》
SCIE
CAS
CSCD
北大核心
2011
10
在线阅读
下载PDF
职称材料
2
内切纤维素酶E4参与纤维小体组装的研究
区镜深
葛洪
曹以诚
《华南理工大学学报(自然科学版)》
EI
CAS
CSCD
北大核心
2013
0
在线阅读
下载PDF
职称材料
3
解纤维梭菌纤维小体黏附域与锚定域相互作用的差异性
刘娜
闫治华
申哲伟
许成钢
《中国生物化学与分子生物学报》
CAS
CSCD
北大核心
2022
0
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职称材料
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