侵染贵州甘蓝的芜菁花叶病毒CP基因序列分析 被引量：2

1

作者 刘学辉 李淳 +2 位作者 陈小均 何海永 王莉爽 《广东农业科学》 CAS 2020年第4期99-105,共7页

【目的】明确贵州省甘蓝芜菁花叶病毒(Turnip mosaic virus,TuMV)的发生分布,为科学防控提供指导。【方法】在贵州省安顺市、威宁县和修文县采集甘蓝病毒病样品,采用酶联免疫吸附试验法(enzyme-linked immunosorbent assay,ELISA)和RT-... 【目的】明确贵州省甘蓝芜菁花叶病毒(Turnip mosaic virus,TuMV)的发生分布,为科学防控提供指导。【方法】在贵州省安顺市、威宁县和修文县采集甘蓝病毒病样品,采用酶联免疫吸附试验法(enzyme-linked immunosorbent assay,ELISA)和RT-PCR对病样进行TuMV检测,利用相关生物学软件分析TuMV CP基因序列的一致性,并构建系统进化树。【结果】152份甘蓝样品中66份检测出阳性,检出率为43.42%;测序的15个TuMV CP基因核苷酸同源性为88.70%~100%,与已报道TuMV 6个组的分离物构建系统进化树发现,14个分离物属于basal-BR,1个分离物属于world-B组。【结论】TuMV在贵州省甘蓝不同种植区普遍发生,且basal-BR为感染甘蓝的优势毒源。 展开更多

关键词 甘蓝 芜菁花叶病毒 外壳蛋白(cp) 分子变异

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三七Y病毒部分ci基因和cp基因的克隆及序列分析 被引量：2

2

作者 李梅蓉 李晓静 +5 位作者 包改丽 朱静 杨馨 谭冠林 兰平秀 李凡 《云南农业大学学报（自然科学版）》 CSCD 北大核心 2016年第1期35-42,共8页

对云南文山地区三七上获得的三七Y病毒（Panax virus Y,PnVY）不同分离物进行了部分ci基因和cp基因的克隆及序列分析,获得的部分ci基因长657 nt,编码219个氨基酸;获得的部分cp基因长834 nt,编码278个氨基酸。所获得的11个PnVY分离物的c... 对云南文山地区三七上获得的三七Y病毒（Panax virus Y,PnVY）不同分离物进行了部分ci基因和cp基因的克隆及序列分析,获得的部分ci基因长657 nt,编码219个氨基酸;获得的部分cp基因长834 nt,编码278个氨基酸。所获得的11个PnVY分离物的ci基因之间核苷酸和氨基酸的同源性分别为80.8%～99.8%和91.3%～100%,与其他PnVY分离物的同源性分别为80.8%～98.8%和92.7%～99.5%。所获得的18个PnVY分离物的cp基因核苷酸和氨基酸序列同源性分别为91.8%～99.9%和93.9%～100%,与其他PnVY分离物的同源性分别为92.0%～100%和95.7%～100%。系统进化树分析表明,基于ci基因可以将PnVY分为2个大组,第Ⅱ组分离物之间的差异相比第Ⅰ组的复杂;基于cp基因可以将PnVY分为3个大组,第Ⅲ组分离物之间差异最大。基于ci基因和cp基因的分析结果均表明,PnVY不同种群间存在较为丰富的遗传多样性,但尚不清楚PnVY的分子变异是否与PnVY引起的多种症状类型有关。 展开更多

关键词 三七Y病毒 ci基因 cp基因 序列分析 分子变异

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黄瓜绿斑驳花叶病毒广东分离物的分子鉴定 被引量：10

3

作者 张卫东 权永兵 +3 位作者 廖力 徐淼锋 迟远丽 陈其文 《广东农业科学》 CAS CSCD 北大核心 2011年第20期73-76,共4页

采用RT-PCR方法,扩增并测定了黄瓜绿斑驳花叶病毒广东分离物(CGMMV-GD-GZ,CGMMV-GD-LZ,CGMMV-GD-LF)的外壳蛋白(coat protein,CP)和运动蛋白(movement protein,MP)基因序列。结果显示,CP基因序列全长486 bp,编码161个氨基酸;MP基因全长7... 采用RT-PCR方法,扩增并测定了黄瓜绿斑驳花叶病毒广东分离物(CGMMV-GD-GZ,CGMMV-GD-LZ,CGMMV-GD-LF)的外壳蛋白(coat protein,CP)和运动蛋白(movement protein,MP)基因序列。结果显示,CP基因序列全长486 bp,编码161个氨基酸;MP基因全长795 bp,编码264个氨基酸。CGMMV广东分离物与其他15个CGMMV分离物之间外壳蛋白基因核苷酸的同源性在90.9%～100%之间,运动蛋白核苷酸同源性为92.7%～100%;与同属其他13种病毒基因组核苷酸序列同源性分别仅为29.5%～56.2%和38.8%～61.8%。基于外壳蛋白和运动蛋白基因序列构建系统发育树显示,CGMMV不同分离物进化为亚洲和欧洲两大群体,3种CGMMV广东分离物与韩国、日本等亚洲分离物同源性极高,可能具有共同的侵染源。 展开更多

关键词 黄瓜绿斑驳花叶病毒 外壳蛋白基因 运动蛋白基因 分子鉴定

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马铃薯卷叶病毒分离株外壳蛋白基因和17k蛋白基因的克隆及序列分析 被引量：7

4

作者 吴志明 朱水芳 +1 位作者 田文会 张成良 《河北农业大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2002年第4期62-66,72,共6页

从典型的马铃薯卷叶病毒病株中直接提取出植物总RNA ,根据PLRV外壳蛋白基因序列 ,设计合成了一对寡核苷酸引物 ,经RT -PCR法扩增出全长的cDNA片段 ,将其克隆到质粒pGEM - 3Zf (+)上 ,并进行了序列分析。结果表明 ,克隆的cDNA片段由 6 2 ... 从典型的马铃薯卷叶病毒病株中直接提取出植物总RNA ,根据PLRV外壳蛋白基因序列 ,设计合成了一对寡核苷酸引物 ,经RT -PCR法扩增出全长的cDNA片段 ,将其克隆到质粒pGEM - 3Zf (+)上 ,并进行了序列分析。结果表明 ,克隆的cDNA片段由 6 2 7个核苷酸组成 ,编码 2 0 8个氨基酸组成的理论分子量为2 3k的蛋白 ,与PLRV外壳蛋白的大小一致 ;此外克隆片段还含有一个不同于外壳蛋白基因的阅读框架 ,该框架由 46 5个核苷酸组成 ,编码 15 5个氨基酸组成的理论分子量为 17k的蛋白 ,与PLRV的 17k蛋白大小一致。与国外报道的几个株系相比 ,PLRV分离物的外壳蛋白基因及 17k蛋白基因的核苷酸同源率分别高达97 5 %～ 99 7%和 96 5 %～ 99 6 % ,由此推测的氨基酸同源率高达 97 6 %～ 99 5 %和 96 1%～ 99 4% ,说明所克隆的PLRV外壳蛋白基因和 17k蛋白基因具有高度的保守性 ,本研究克隆了PLRV分离物外壳蛋白和17k蛋白基因的序列 。 展开更多

关键词 序列分析 马铃薯卷叶病毒 外壳蛋白基因 基因克隆 基因表达

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甘薯羽状斑驳病毒外壳蛋白基因的分子变异 被引量：6

5

作者 王晓华 张振臣 +3 位作者 乔奇 秦艳红 张德胜 田雨婷 《植物保护》 CAS CSCD 北大核心 2012年第2期114-116,123,共4页

应用单链构象多态性(single-strand conformation polymorphism,SSCP)技术结合核苷酸序列测定的方法,对我国甘薯主产区11个省份的甘薯羽状斑驳病毒(Sweet potato feathery mottle virus,SPFMV)外壳蛋白(CP)基因的分子变异情况进行了研... 应用单链构象多态性(single-strand conformation polymorphism,SSCP)技术结合核苷酸序列测定的方法,对我国甘薯主产区11个省份的甘薯羽状斑驳病毒(Sweet potato feathery mottle virus,SPFMV)外壳蛋白(CP)基因的分子变异情况进行了研究。结果表明,SPFMV CP基因的RT-PCR产物表现了较丰富的图谱类型,50个分离物共产生9种主要的SSCP带型;对显示不同带型的20个样品的CP基因进行了序列测定和进化树分析,CP基因核苷酸序列一致性为77.2%～99.9%。说明这些样品的SPFMV的CP基因存在较大的分子变异,可划分为EA、RC、O和C 4个株系。 展开更多

关键词 甘薯羽状斑驳病毒 外壳蛋白基因 分子变异 SScp分析

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河北省马铃薯Y病毒株系分子鉴定及其RT-PCR检测 被引量：12

6

作者 吴志明 时星 +2 位作者 谢晓亮 温春秀 张庆良 《河北农业大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2005年第3期54-59,共6页

根据马铃薯Y病毒(PotatovirusY,PVY)的外壳蛋白基因序列,设计合成了一对寡核苷酸引物,从感染PVY的马铃薯田间病叶组织中提取出病毒的RNA,进行cDNA合成及PCR扩增,得到一条长度约800bp的特异PCR扩增产物,与理论设计的基因片段大小一致,本... 根据马铃薯Y病毒(PotatovirusY,PVY)的外壳蛋白基因序列,设计合成了一对寡核苷酸引物,从感染PVY的马铃薯田间病叶组织中提取出病毒的RNA,进行cDNA合成及PCR扩增,得到一条长度约800bp的特异PCR扩增产物,与理论设计的基因片段大小一致,本试验建立了快速、灵敏、简便的PVY检测的方法。将RT-PCR扩增产物克隆到质粒pGEM-T上,并进行了序列分析。结果表明,克隆的cDNA片段由801个核苷酸组成,编码267个氨基酸组成的理论分子量为29kD蛋白,与PVY外壳蛋白的大小一致,与基因库登记的代表性株系相比,它们之间的核苷酸序列同源性为89 6%～98 8%,氨基酸序列的同源性为93 3%～98 5%,说明PVYCP基因具有高度的保守性(记为PVY-HBEI),与国内报道的PVY-CHU、PVY-ZHJ和PVY-ZHOU株系的氨基酸序列同源性分别为96 6%、98 5%和97 8%,与PVYN和PVYO株系的氨基酸序列同源性分别为93 6%和97 8%,从分子水平上确定PVY-HBEI归属于普通株系(PVYO株系)。 展开更多

关键词 马铃薯Y病毒 反转录-聚合酶链式反应 病毒检测 外壳蛋白基因(cp) 序列分析 株系鉴定

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甜菜坏死黄脉病毒不同分离物外壳蛋白的研究 被引量：5

7

作者 刘升学 向本春 +3 位作者 蔡瑜 黄家风 席德慧 杨震 《石河子大学学报（自然科学版）》 CAS 2003年第2期91-94,共4页

应用SDS PAGE和PCR SSCP分析技术,对新疆不同地区的BNYVV分离物进行分析,结果表明:12个分离物蛋白质外壳的蛋白亚基分子量均为20kD;来自库尔勒的K4和K5分离物编码外壳蛋白质的基因不同于其他地区和本地区的分离物,二者彼此间也不相同。

关键词 甜菜丛根病 甜菜坏死黄脉病毒 分离物 外壳蛋白 外壳蛋白基因 SDS-PAGE PCR-SScp

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新疆加工番茄上番茄花叶病毒的分子鉴定 被引量：15

8

作者 姜玉霞 向本春 +2 位作者 安仙丽 黄家风 汪铖华 《新疆农业科学》 CAS CSCD 2008年第3期484-489,共6页

从表现花叶、畸形的加工番茄病株上获得分离物xj124，用1对ToMVCP基因引物进行RT-PCR，扩增得到了689bp的特异性核苷酸片段。将PCR产物插入到克隆载体pMD18-T中再转化到大肠杆菌TOP10。经限制酶酶切鉴定，重组克隆中含有与PCR产物大小... 从表现花叶、畸形的加工番茄病株上获得分离物xj124，用1对ToMVCP基因引物进行RT-PCR，扩增得到了689bp的特异性核苷酸片段。将PCR产物插入到克隆载体pMD18-T中再转化到大肠杆菌TOP10。经限制酶酶切鉴定，重组克隆中含有与PCR产物大小相同的689bp的插入片段。cDNA全序列分析表明，所扩增出的689bpToMVCP基因，含1个480bp开放阅读框架（ORV），编码160氨基酸组成的蛋白，所克隆的基因包含完整的ToMVCP基因。所测得的xj124分离物与国内外已报道的部分ToMV CP基因序列比较。核苷酸同源性高达84．4％-99．8％，氨基酸同源性高达98．7％-100％。因此将该分离物鉴定为番茄病毒病花叶病毒。 展开更多

关键词 番茄花叶病毒 分子鉴定 克隆外壳蛋白基因 序列分析

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河北省马铃薯S病毒株系的分子鉴定研究 被引量：7

9

作者 周巧梅 谢晓亮 +3 位作者 温春秀 马恢 尹江 吴志明 《华北农学报》 CSCD 北大核心 2007年第3期39-42,共4页

对张家口分离的马铃薯S病毒（Potato virus S,PVS-Hebei）的CP基因进行了克隆和序列分析。以提纯的马铃薯植物总RNA为模板,应用RT-PCR技术扩增目的基因,PCR扩增产物克隆到质粒pMD18-T上,并进行了序列分析。结果表明,克隆的cDNA片段由88... 对张家口分离的马铃薯S病毒（Potato virus S,PVS-Hebei）的CP基因进行了克隆和序列分析。以提纯的马铃薯植物总RNA为模板,应用RT-PCR技术扩增目的基因,PCR扩增产物克隆到质粒pMD18-T上,并进行了序列分析。结果表明,克隆的cDNA片段由885个核苷酸组成,编码294个氨基酸组成的33 kD蛋白,与PVS外壳蛋白的大小一致,与国际基因库登记的几个株系相比,结果表明,PVS-Hebei与它们之间的核苷酸序列同源性为82.4%-95.6%,氨基酸序列的同源性为93.9%-98.0%,进化树分析表明,PVS明显存在2个组（组Ⅰ和组Ⅱ）,PVS-Hebei归类为Ⅰ组,与来自组Ⅰ的欧洲普通株系（PVS-Uk）的亲缘性要比来自组Ⅱ北美的Andean株系（PVS-A）株系的亲缘性要近。 展开更多

关键词 马铃薯S病毒 外壳蛋白基因(cp) 序列分析 株系鉴定

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中国甘薯双生病毒外壳蛋白基因分子变异及遗传多样性分析 被引量：2

10

作者 张成玲 孙厚俊 +3 位作者 杨冬静 徐振 赵永强 谢逸萍 《浙江农业学报》 CSCD 北大核心 2017年第4期611-617,共7页

甘薯双生病毒是中国甘薯上一类重要病毒,其外壳蛋白(coat protein,CP)基因具有介体传毒、基因包被等多功能。揭示其分子变异,可以为病毒防治及育种工作提供理论依据。利用PCR方法扩增获得了24个甘薯双生病毒分离物的cp基因,采用SDT、Dna... 甘薯双生病毒是中国甘薯上一类重要病毒,其外壳蛋白(coat protein,CP)基因具有介体传毒、基因包被等多功能。揭示其分子变异,可以为病毒防治及育种工作提供理论依据。利用PCR方法扩增获得了24个甘薯双生病毒分离物的cp基因,采用SDT、Dna SP、RDP3、MEGA等软件对其进行分子变异分析。结果表明:24个分离物核苷酸序列均为765个碱基,一致率为88.3%~100%,编码254个氨基酸,一致率为94.5%~100%。中国甘薯双生病毒分离物系统进化树分为2个组,组I包括大部分分离物及本研究获得的22个分离物,又分为了2个亚组;组Ⅱ含有29个分离物,包括本研究中的XU8_2和XU8_3,这2个分离物与其他分离物可能为不同的种。非同义突变与同义突变比值大于1,说明cp基因处于正向选择即多样化选择。错配分布图除亚组1相对比较平滑外,其余组或亚组分离物均为多峰锯齿状,表明除亚组1种群呈突然暴发的状态外,其他组或亚种群已经存在很长时间,处于动态平衡状态。 展开更多

关键词 甘薯双生病毒 外壳蛋白基因 分子变异 遗传多样性

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水稻条纹病毒云南分离物病害特异性蛋白基因的分子变异 被引量：4

11

作者 李凡 杨金广 +1 位作者 龙亚芹 陈海如 《华南农业大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2007年第3期28-31,共4页

对采自云南大理、陆良、禄劝、石林、玉溪、保山和宜良等地的水稻条纹叶枯病病样,提取病叶总RNA,经RT-PCR、cDNA克隆和序列测定,获得了水稻条纹病毒(Rice stripvirus,RSV)7个云南分离物的SP基因序列,核苷酸长为537 nts,并与GenBank中已... 对采自云南大理、陆良、禄劝、石林、玉溪、保山和宜良等地的水稻条纹叶枯病病样,提取病叶总RNA,经RT-PCR、cDNA克隆和序列测定,获得了水稻条纹病毒(Rice stripvirus,RSV)7个云南分离物的SP基因序列,核苷酸长为537 nts,并与GenBank中已报道的RSVSP基因进行同源性比较,综合分析了云南RSV不同分离物SP基因的分子变异.对纤细病毒属6种病毒的SP蛋白氨基酸序列进行进化分析,结果表明RSV与MStV亲缘关系最近,与RGSV亲缘关系最远. 展开更多

关键词 水稻条纹病毒 病害特异性蛋白基因 分子变异 纤细病毒属

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分子靶标烟草花叶病毒外壳蛋白的结构生物学研究进展 被引量：2

12

作者 李向阳 陈卓 +1 位作者 杨松 宋宝安 《农药学学报》 CAS CSCD 北大核心 2010年第4期391-401,共11页

病毒外壳蛋白(CP)是烟草花叶病毒(TMV)基因结构的重要组成部分,其主要功能除保护核酸物质不被降解外,还与TMV的远距离移动及寄主症状有关。目前研究较多的是CP基因介导的抗性、药剂干扰CP的聚合等,而有关靶标CP与药剂的作用机理尚未有... 病毒外壳蛋白(CP)是烟草花叶病毒(TMV)基因结构的重要组成部分,其主要功能除保护核酸物质不被降解外,还与TMV的远距离移动及寄主症状有关。目前研究较多的是CP基因介导的抗性、药剂干扰CP的聚合等,而有关靶标CP与药剂的作用机理尚未有系统全面的报道。从结构生物学的角度出发,详细介绍了TMVCP在电镜及单晶衍射技术下的三维结构;比较了国内已报道的CP的基因序列;综述了CP在基因工程领域的应用及其受药剂分子的干扰作用等方面的研究进展。以毒氟磷药剂为例,分析了其可能作用于TMVCP的分子机理,预测了毒氟磷小分子与TMVCP大分子可能的作用位点。有助于进一步研究和发现新型抗TMV药剂。 展开更多

关键词 烟草花叶病毒 外壳蛋白 分子靶标 结构生物学 综述

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五种啮齿类动物mtDNA蛋白编码基因序列变化的比较 被引量：4

13

作者 宋国华 陈朝阳 +1 位作者 庞文彪 岳文斌 《中国实验动物学报》 CAS CSCD 2013年第1期70-74,共5页

目的利用本实验室测定的中国地鼠、金黄地鼠和GenBank中田鼠、小鼠、大鼠的线粒体全基因组序列,比较分析五种啮齿类动物的mtDNA蛋白编码基因序列的变异,探讨其分子进化关系。方法将五种动物各自的13个蛋白编码基因分别连接成一个序列,用... 目的利用本实验室测定的中国地鼠、金黄地鼠和GenBank中田鼠、小鼠、大鼠的线粒体全基因组序列,比较分析五种啮齿类动物的mtDNA蛋白编码基因序列的变异,探讨其分子进化关系。方法将五种动物各自的13个蛋白编码基因分别连接成一个序列,用DNAstar-EditSeq分析软件计算每个序列的碱基长度和组成,计算蛋白编码基因的碱基和氨基酸的差异。以人为外群,基于连接在一起的13个蛋白编码基因的氨基酸序列,用MEGA4.0软件通过最大简约性法(MP)和非加权成对平均数法(UPGMA)构建进化树。结果在五种啮齿动物的13个蛋白基因序列中,A、T、C、G碱基的平均含量为32.4%、29.6%、26.2%和11.9%,中国地鼠mtDNA各蛋白编码序列以及其编码的氨基酸序列与其他物种相比,与金黄地鼠的相应序列差异最小,与大鼠mtDNA各蛋白编码序列以及其编码的氨基酸序列差异较大。分子进化树也显示中国地鼠和金黄地鼠的亲缘关系最近,与小鼠、大鼠存在的差异相对大。结论五种动物的碱基组成的百分比中显示G的相对缺乏,相互之间的进化关系与传统的分类地位基本吻合。 展开更多

关键词 啮齿类 线粒体DNA 蛋白编码基因 变异 分子进化

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马铃薯X病毒外壳蛋白基因的克隆与系统进化分析 被引量：2

14

作者 黄永会 朱英 刘永翔 《安徽农业科学》 CAS 2014年第27期9283-9285,9420,共4页

从贵州威宁等地采集马铃薯病叶样本,采用试管捕捉反转录PCR(tube-capture-RT-PCR,TC-RT-PCR)的方法克隆出714 bp的PVX CP基因,编码237个氨基酸残基。系统进化分析表明,PVX CP基因可分为两大类群,推测分离物属于X3株系,并建议重型花叶也... 从贵州威宁等地采集马铃薯病叶样本,采用试管捕捉反转录PCR(tube-capture-RT-PCR,TC-RT-PCR)的方法克隆出714 bp的PVX CP基因,编码237个氨基酸残基。系统进化分析表明,PVX CP基因可分为两大类群,推测分离物属于X3株系,并建议重型花叶也可作为PVX病叶样本。 展开更多

关键词 马铃薯X病毒 外壳蛋白 基因克隆 进化分析

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建兰花叶病毒外壳蛋白基因和3＇UTR序列测定与分析 被引量：1

15

作者 郑国华 苏勇波 +2 位作者 郑志忠 彭德伟 明艳林 《植物保护》 CAS CSCD 北大核心 2013年第2期13-19,共7页

采用单链构象多态性分析从建兰花叶病毒(Cymbidium mosaic virus,CyMV)的8个分离物筛选得到5个存在遗传变异的分离物,并测定了外壳蛋白(coat protein,CP)基因和3′非编码区(3′UTR)序列,经序列分析表明5个分离物与其他分离物间的CP核苷... 采用单链构象多态性分析从建兰花叶病毒(Cymbidium mosaic virus,CyMV)的8个分离物筛选得到5个存在遗传变异的分离物,并测定了外壳蛋白(coat protein,CP)基因和3′非编码区(3′UTR)序列,经序列分析表明5个分离物与其他分离物间的CP核苷酸和氨基酸序列相似性分别为87.1%～99.9%和91.1%～99.6%,属于亚组A成员。CP基因不同片段受到正选择压力的作用不一样,C端受到负选择压力的作用不易发生变异,而N端受到正选择压力的作用容易发生变异。通过RNAsharpes软件分析3′UTR序列发现各分离物均形成带有Potexvirus属保守核苷酸序列"AC(C/T)TAA"的三叶草茎环结构,这种结构的功能可能与病毒RNA复制有关。 展开更多

关键词 建兰花叶病毒 外壳蛋白基因 3'非编码区 分子变异

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水稻条纹病毒云南分离物NS2蛋白基因的分子变异 被引量：1

16

作者 陈爱香 吴祖建 《河南农业科学》 CSCD 北大核心 2006年第7期54-58,共5页

通过核苷酸测序表明,我国云南的16个RSV分离物,依据NS2蛋白基因同源性,基本按采样年份(2002、2003)分为了2组。结合已报道的日本T、O分离物,构建系统发育树,分析我国云南分离物与日本分离物可能有共同的起源。

关键词 水稻条纹病毒 云南分离物 NS2蛋白基因 分子变异 同源性 分子进化

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分子克隆过程中基因组DNA的电镜观察技术的研究

17

作者 徐均焕 冯明光 《电子显微学报》 CAS CSCD 1998年第3期280-284,共5页

为了尝试用电子显微镜对病毒外壳蛋白基因克隆过程中基因组ＤＮＡ的检测，我们采用电镜大分子展层技术制备电镜样品并观察了病毒外壳蛋白基因组ＤＮＡ经ＰＣＲ扩增，克隆到ＰＢＳ质粒ＤＮＡ中的全过程，电镜观察表明：ＰＢＳ质粒基因组... 为了尝试用电子显微镜对病毒外壳蛋白基因克隆过程中基因组ＤＮＡ的检测，我们采用电镜大分子展层技术制备电镜样品并观察了病毒外壳蛋白基因组ＤＮＡ经ＰＣＲ扩增，克隆到ＰＢＳ质粒ＤＮＡ中的全过程，电镜观察表明：ＰＢＳ质粒基因组ＤＮＡ有超螺旋状、环状、或断裂成线状，长度约为１．００μｍ，外壳蛋白基因为线状，长度为０．２０μｍ，外壳蛋白基因克隆到ＰＢＳ质粒后，重组子质粒ＤＮＡ有成环状或线状，长度为１．２０μｍ。电镜观察结果与其它生化实验结果相符。 展开更多

关键词 电镜 大分子展层技术 DNA 分子克隆过程

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我国北方稻区水稻条纹病毒分子变异和水稻品种抗病性分析 被引量：5

18

作者 张世贤 李莉 +1 位作者 王锡锋 周广和 《植物保护》 CAS CSCD 北大核心 2007年第5期45-50,共6页

为了明确我国北方稻区水稻条纹病毒（Rice stripe virus，RSV）群体的分子变异和水稻品种的抗性情况，测定了2004年和2005年从我国6省9个地区采集的34个RSV分离物的外壳蛋白（coat protein，CP）基因的序列，并对其进行了分析，同时用... 为了明确我国北方稻区水稻条纹病毒（Rice stripe virus，RSV）群体的分子变异和水稻品种的抗性情况，测定了2004年和2005年从我国6省9个地区采集的34个RSV分离物的外壳蛋白（coat protein，CP）基因的序列，并对其进行了分析，同时用强致病性江苏分离物（RSV-JS）对河南、安徽、山东、河北等省的25个推广品种进行了抗性研究。结果表明，供试RSV分离物间的核苷酸序列一致性和氨基酸序列的一致性分别在93．9％～100％和96．3％～100．0％之间。根据CP基因核苷酸序列一致性，所有分离物可以分为2组。云南4个分离物为一组，其余为一组。在第2组中各分离物CP基因的核苷酸序列和氨基酸序列的一致性与地域无必然联系。且在2年之内，RSV CP基因变异不大。抗病性鉴定表明同一分离物在不同水稻品种上表现不同症状。表现高抗（HR）的品种占供试品种的24％；60％以上的品种表现为感病，且不同水稻品种上表现不同症状。因此，我国北方稻区RSV的CP基因非常保守，但同一分离物在不同水稻品种上可能表现不同症状，不同水稻品种对RSV抗性有显著差异。这些结果为我国北方稻区水稻条纹叶枯病防治和抗病毒基因工程提供了理论依据。 展开更多

关键词 水稻条纹病毒 cp基因 分子变异 抗性鉴定

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猪繁殖与呼吸综合征病毒的分子生物学

19

作者 周盛华 崔尚金 《畜禽业》 2008年第3期10-12,共3页

猪繁殖与呼吸综合征是由猪繁殖与呼吸综合征病毒引起的猪的一种传染病,目前在世界各地均有发生和流行,是危害养猪业最为严重的疾病之一。PRRSV也是造成2006年以来我国猪高热病的主要病原。本文对猪繁殖与呼吸综合征病毒的病毒形态和理... 猪繁殖与呼吸综合征是由猪繁殖与呼吸综合征病毒引起的猪的一种传染病,目前在世界各地均有发生和流行,是危害养猪业最为严重的疾病之一。PRRSV也是造成2006年以来我国猪高热病的主要病原。本文对猪繁殖与呼吸综合征病毒的病毒形态和理化特性、基因组结构、病毒蛋白及功能,基因组的变异,分子生物学诊断等五个方面的研究进展作了综述。 展开更多

关键词 猪繁殖与呼吸综合征病毒 基因组 编码蛋白 基因变异 分子生 物学诊断

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苹果茎沟病毒外壳蛋白抗体制备与应用 被引量：2

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作者 谭嘉琦 韩秀清 +2 位作者 成思琼 吴云锋 郝兴安 《西北农业学报》 CAS CSCD 北大核心 2020年第5期787-792,共6页

从苹果寄主上分离得到了苹果茎沟病毒(Apple stem grooving virus,ASGV)中国株系。经基因克隆,测序后发现苹果茎沟病毒中国株系外壳蛋白基因(coat protein,CP)含有714个核苷酸,编码表达由237氨基酸残基组成的27 ku蛋白。通过构建含有ASG... 从苹果寄主上分离得到了苹果茎沟病毒(Apple stem grooving virus,ASGV)中国株系。经基因克隆,测序后发现苹果茎沟病毒中国株系外壳蛋白基因(coat protein,CP)含有714个核苷酸,编码表达由237氨基酸残基组成的27 ku蛋白。通过构建含有ASGV-CP基因的重组表达载体pECASGV-CP,在大肠杆菌BL21(DE3)中成功表达ASGV-CP蛋白。SDS-PAGE显示其分子质量与预计大小一致。利用纯化的重组蛋白制备多克隆抗体。该抗体可用于Western blot和DAS-ELISA检测技术。基于血清学检测,发现陕西苹果主产区ASGV发生普遍。 展开更多

关键词 苹果茎沟病毒 外壳蛋白基因 多克隆抗体 蛋白检测

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