目的运用网络药理学研究左金丸治疗原发性肝癌的作用机制。方法通过中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP)获取左金丸的化合物及靶点,以口服生物利用度(OB)≥30%和类药性(DL)≥0.18为阈值进行化合物筛选,将靶点输入Uniprot获取靶点对...目的运用网络药理学研究左金丸治疗原发性肝癌的作用机制。方法通过中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP)获取左金丸的化合物及靶点,以口服生物利用度(OB)≥30%和类药性(DL)≥0.18为阈值进行化合物筛选,将靶点输入Uniprot获取靶点对应的基因Symbol;从人类基因数据库(GeneCards:The Human Gene Database)获取原发性肝癌的疾病基因,并筛选出与左金丸靶点基因的交集基因;运用Cytoscape3.7.1软件绘制活性成分-靶点、疾病-中药-化合物-交集靶点(基因)网络图;运用String构建蛋白相互作用网络,运用g:Profiler数据分析平台进行GO富集及KEGG通路富集分析;联合主要化合物、交集基因与通路分析结果,绘制成分-靶点-通路网络图。结果筛选得到左金丸化合物41种、交集基因111个,剔除不含交集基因(靶点)的化学成分后得到化合物31种,槲皮素、黄连素、吴茱萸碱等为左金丸的主要活性成分,AKT1、TP53、HSP90AA1等为主要作用靶点。GO富集分析共获得条目136条,涉及细胞因子受体结合、核受体结合、调控序列特异性DNA结合等多个生物过程,KEGG富集分析得到165条通路。结论左金丸通过多靶点调控PI3K-Akt信号通路、乙型肝炎通路、IL-17信号通路等治疗原发性肝癌。经生物信息学的基因芯片验证,结果基本相符。展开更多
文摘目的运用网络药理学研究左金丸治疗原发性肝癌的作用机制。方法通过中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP)获取左金丸的化合物及靶点,以口服生物利用度(OB)≥30%和类药性(DL)≥0.18为阈值进行化合物筛选,将靶点输入Uniprot获取靶点对应的基因Symbol;从人类基因数据库(GeneCards:The Human Gene Database)获取原发性肝癌的疾病基因,并筛选出与左金丸靶点基因的交集基因;运用Cytoscape3.7.1软件绘制活性成分-靶点、疾病-中药-化合物-交集靶点(基因)网络图;运用String构建蛋白相互作用网络,运用g:Profiler数据分析平台进行GO富集及KEGG通路富集分析;联合主要化合物、交集基因与通路分析结果,绘制成分-靶点-通路网络图。结果筛选得到左金丸化合物41种、交集基因111个,剔除不含交集基因(靶点)的化学成分后得到化合物31种,槲皮素、黄连素、吴茱萸碱等为左金丸的主要活性成分,AKT1、TP53、HSP90AA1等为主要作用靶点。GO富集分析共获得条目136条,涉及细胞因子受体结合、核受体结合、调控序列特异性DNA结合等多个生物过程,KEGG富集分析得到165条通路。结论左金丸通过多靶点调控PI3K-Akt信号通路、乙型肝炎通路、IL-17信号通路等治疗原发性肝癌。经生物信息学的基因芯片验证,结果基本相符。
