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基于SCoT、SRAP和SSR分子标记的220份辣椒种质资源遗传多样性分析
1
作者 裴红霞 汪露瑶 +1 位作者 李生梅 高晶霞 《生物技术通报》 北大核心 2025年第8期165-174,共10页
【目的】深入解析保存在宁夏农林科学院辣椒种质资源的遗传多样性和亲缘关系,为辣椒种质资源的引进、保护和应用提供重要的理论依据。【方法】采用SCoT、SRAP和SSR 3种分子标记技术,对收集于全国15个地区的220份辣椒种质资源进行遗传多... 【目的】深入解析保存在宁夏农林科学院辣椒种质资源的遗传多样性和亲缘关系,为辣椒种质资源的引进、保护和应用提供重要的理论依据。【方法】采用SCoT、SRAP和SSR 3种分子标记技术,对收集于全国15个地区的220份辣椒种质资源进行遗传多样性分析。【结果】6个SCoT标记分别扩增出1-4条条带,14个SRAP标记分别扩增出2-4条条带,3个SSR标记分别扩增出2-5条条带,且所有标记均表现出100%的多态性条带百分比。进一步分析发现,SSR标记的平均多态性信息指数(PIC)最高,达到0.77,显著高于SCoT(0.55)和SRAP(0.55),表明SSR标记在遗传多态性检测中更具优势,其中,HpmsE088为最优SSR标记。聚类分析、主坐标分析和群体遗传结构分析将15个地区的种质划分为两大类群(Group 1和Group 2),其中Group 1包含中国四川、中国辽宁、中国新疆、中国山东、中国宁夏和中国湖南的种质,Group 2则包括中国(云南、江苏、河南、甘肃、北京和安徽)、荷兰、日本和美国的种质。此外,83.2%的种质表现出较高的纯合性。果形特征与聚类分组存在一定的相关性,Group 1中线形果实的辣椒种质比例显著高于Group 2,而所有短牛角形果实的辣椒种质均被归入Group 2。【结论】保存在宁夏农林科学院的辣椒种质资源具有较高的遗传多样性,根据遗传信息主要可以被划分为2组。 展开更多
关键词 辣椒 遗传多样性 SCoT标记 srap标记 SSR标记
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基于SRAP和ISSR标记的花椒种质资源遗传多样性及群体结构分析
2
作者 李晋华 汪志燚 +4 位作者 王少铭 冷家归 侯颖辉 罗莉斯 李德文 《种子》 北大核心 2025年第1期10-18,30,共10页
为探究国内花椒种质资源遗传多样性及群体结构,本研究采用ISSR和SRAP分子标记技术对48份花椒资源进行遗传多样性、亲缘关系及群体结构分析。结果表明,利用筛选的6对SRAP、7条ISSR引物分别扩增出43条、56条多态性条带,多态性比率分别为87... 为探究国内花椒种质资源遗传多样性及群体结构,本研究采用ISSR和SRAP分子标记技术对48份花椒资源进行遗传多样性、亲缘关系及群体结构分析。结果表明,利用筛选的6对SRAP、7条ISSR引物分别扩增出43条、56条多态性条带,多态性比率分别为87.73%、88.89%;48份花椒种质材料的平均Nei's遗传多样性指数为0.4372,平均Shannon's信息指数为0.6217。根据不同来源地,对8个花椒群体进行遗传多样性分析,遗传多样性排序表现为贵州省遵义市群体>陕西省群体>四川省群体>贵州省黔西南州群体>江西省群体>贵州省铜仁市群体>贵州省黔东南州群体>贵州省贵阳市群体;分子遗传变异分析表明,在花椒种质资源总遗传变异中,92%的变异发生在种源内,只有8%的变异发生在种源间;Structure群体遗传结构和UPGMA聚类结果表明,种源间存在中等程度的基因交流现象。利用SRAP和ISSR标记可以对花椒种质资源进行较高效的多态性检出,花椒种质资源的种间遗传分化明显,而同一种类不同来源地资源的遗传分化较小。 展开更多
关键词 花椒 srap分子标记 ISSR分子标记 遗传多样性 群体结构分析
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基于SRAP分子标记的沙芥居群遗传多样性分析
3
作者 门岩 杨忠仁 +3 位作者 黄修梅 张晓辉 郝丽珍 张凤兰 《安徽农业科学》 2025年第19期89-92,共4页
[目的]探究不同地区沙芥居群的遗传多样性与亲缘关系。[方法]应用SRAP分子标记技术对沙芥7个居群84份植物叶片进行PCR扩增,并计算多态位点、Nei’s多样性指数等遗传参数。[结果]挑选出14对SRAP引物,它们的扩增多态性高,条带清晰。经过... [目的]探究不同地区沙芥居群的遗传多样性与亲缘关系。[方法]应用SRAP分子标记技术对沙芥7个居群84份植物叶片进行PCR扩增,并计算多态位点、Nei’s多样性指数等遗传参数。[结果]挑选出14对SRAP引物,它们的扩增多态性高,条带清晰。经过一系列检测后,结果显示共138个位点被检出,其中多态位点百分比达到92.70%;Nei’s基因多样性指数平均值、Shannon’s信息多样性指数平均值、总基因多样性指数、遗传分化系数和基因流值分别为0.2204、0.3315、0.3112、0.2917和1.2140。沙芥不同居群之间存在一定的遗传分化,大部分发生在居群内,约占70.83%,29.17%发生在居群间。[结论]该研究结果可为后续开展沙芥珍稀物种的保护和利用奠定基础。 展开更多
关键词 沙芥 遗传多样性 亲缘关系 srap标记
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杉木球果形态变异及与SRAP标记的关联分析
4
作者 林慧珠 曾韦珊 +2 位作者 黄荣 黄少伟 郑会全 《西南林业大学学报(自然科学)》 北大核心 2025年第2期50-57,共8页
为揭示杉木不同亲本球果的变异特征及其遗传基础,挖掘与杉木球果形态相关联的分子标记,对广东杉木第3代种子园中50个亲本的球果形态指标进行测定,在分析遗传多样性的基础上,将球果形态数据与SRAP分子标记进行关联分析。结果表明:球果形... 为揭示杉木不同亲本球果的变异特征及其遗传基础,挖掘与杉木球果形态相关联的分子标记,对广东杉木第3代种子园中50个亲本的球果形态指标进行测定,在分析遗传多样性的基础上,将球果形态数据与SRAP分子标记进行关联分析。结果表明:球果形态特征在亲本间存在极显著差异;各球果表型变异系数达到了11.01%~31.90%,遗传变异系数达到了8.13%~21.54%,所有球果性状的重复力均高于0.8,说明杉木球果形态特征变化受到强烈的遗传因素控制。关联分析共得到59个标记与8个性状显著关联,其中与球果纵径、球果横径、单个球果鲜质量、球果体积、苞鳞层数、苞鳞总数、苞鳞长和苞鳞宽显著关联的标记分别有9、10、6、3、6、9、8、8个。 展开更多
关键词 杉木 球果 多态性 亲本 srap 关联分析
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运用SRAP和SSR分子标记鉴定铁皮石斛与金钗石斛F1代杂种的真实性 被引量：1
5
作者 杜俊峰 袁瑗 +1 位作者 邓春莉 任羽 《现代园艺》 2025年第2期6-8,共3页
为了鉴定铁皮石斛和金钗石斛杂交F1代杂种的真实性,运用SRAP和SSR分子标记鉴定F1代。结果表明,从20对SR AP引物和10对SSR引物中各选出1对用于22株F1代鉴定,鉴定结果为21株是真杂交种,真杂交种率为95.4%。由此可知,用SSR和SRAP标记鉴定... 为了鉴定铁皮石斛和金钗石斛杂交F1代杂种的真实性,运用SRAP和SSR分子标记鉴定F1代。结果表明,从20对SR AP引物和10对SSR引物中各选出1对用于22株F1代鉴定,鉴定结果为21株是真杂交种,真杂交种率为95.4%。由此可知,用SSR和SRAP标记鉴定石斛杂交后代可行,对加快石斛育种的速度,缩短育种的时间年限和石斛的种质资源保护具有重要意义。 展开更多
关键词 SSR分子标记 srap分子标记 铁皮石斛 金钗石斛 杂种鉴定
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河南省牛至及其近缘种甘牛至SRAP遗传多样性分析与指纹图谱构建 被引量：2
6
作者 田慧鑫 于婵 +7 位作者 杨帆 苏亚楠 王晓东 周艳 李贺敏 黄勇 梁妍 夏至 《河南农业科学》 北大核心 2025年第1期55-65,共11页
探讨河南省不同区域分布的牛至(Origanum vulgare)及其近缘种甘牛至(Origanum majorana)遗传多样性和亲缘关系,为牛至及甘牛至种质资源保护、开发利用提供参考。采用相关序列扩增多态性(Sequence-related amplified polymorphism,SRAP)... 探讨河南省不同区域分布的牛至(Origanum vulgare)及其近缘种甘牛至(Origanum majorana)遗传多样性和亲缘关系,为牛至及甘牛至种质资源保护、开发利用提供参考。采用相关序列扩增多态性(Sequence-related amplified polymorphism,SRAP)分子标记方法,选取牛至野生居群(7个)、栽培居群(1个)及甘牛至栽培居群(1个)共9个居群77份牛至和甘牛至种质资源进行遗传多样性分析,构建DNA指纹图谱。结果表明,9对引物共扩增出98个条带,多态性条带94条,多态性条带比率为95.92%,平均每对引物扩增出10.89条。等位基因数(Na)为1.9592、有效等位基因数(Ne)为1.4195、Nei基因多样性指数(H)为0.2632、Shannon’s指数(I)为0.4119。基于SRAP分子标记数据建立的UPGMA亲缘关系聚类图,遗传相似系数介于0.66~0.95。当遗传相似系数为0.66时,将牛至和甘牛至分为2个单独分支。在遗传相似系数为0.75时,不同区域牛至分为5个分支。综上,SRAP分子标记可以有效鉴别牛至与甘牛至;河南省南阳牛至种群遗传多样性高于其他区域;筛选出了5对SRAP引物(Me1/em6、Me1/em11、Me3/em4、Me3/em11、Me5/em3)构建牛至和甘牛至种质DNA指纹图谱。 展开更多
关键词 牛至 甘牛至 相关序列扩增多态性 遗传多样性 DNA指纹图谱
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ISSR和SRAP分子标记在石斛属植物杂交育种上的应用效果
7
作者 黄佳维 陈小玲 +1 位作者 陈前程 余松金 《现代农业科技》 2025年第12期145-148,共4页
以6种石斛为试验材料,采用简单重复序列间扩增(ISSR)和序列相关扩增多态性(SRAP)2种分子标记技术对其进行遗传多样性分析。结果表明:ISSR引物共扩增出69条条带,多态性比例达100%,SRAP引物共扩增出78条条带,多态性比例达99%。2种分子标... 以6种石斛为试验材料,采用简单重复序列间扩增(ISSR)和序列相关扩增多态性(SRAP)2种分子标记技术对其进行遗传多样性分析。结果表明:ISSR引物共扩增出69条条带,多态性比例达100%,SRAP引物共扩增出78条条带,多态性比例达99%。2种分子标记的聚类分析结果均将杯鞘石斛、喇叭唇石斛和紫婉石斛聚为一组,与传统分类结果和杂交结果一致,而兜唇石斛自成一组。区别在于ISSR分子标记将重唇石斛和黄喉石斛分开各自为一组,而SRAP分子标记将两者归为一组,遗传相似系数为0.500,与杂交结果相符。综上所述,ISSR和SRAP 2种分子标记均能在一定程度上指导石斛属植物的分类,ISSR在多态性分析上效果更好,SRAP则更能准确地表达种间亲缘关系,对杂交育种亲本的选择具有指导意义。 展开更多
关键词 石斛 杂交育种 ISSR srap 遗传多样性 结实率
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19个苦荞种质资源的SRAP分析
8
作者 郑竹 解芬 文霞 《农技服务》 2025年第1期23-26,共4页
为提高苦荞种质资源利用效率和其杂交亲本的选配提供参考,利用琼脂糖凝胶电泳对野苦荞、黑丰1号的144对SRAP正反引物组合扩增产物进行筛选,筛选出14对多态性较好的引物组合,并对19份苦荞种质资源进行SRAP-PCR扩增。结果表明:PCR扩增共... 为提高苦荞种质资源利用效率和其杂交亲本的选配提供参考,利用琼脂糖凝胶电泳对野苦荞、黑丰1号的144对SRAP正反引物组合扩增产物进行筛选,筛选出14对多态性较好的引物组合,并对19份苦荞种质资源进行SRAP-PCR扩增。结果表明:PCR扩增共检测出69个等位变异,平均每对引物组合可检出4.643个等位变异。UPGMA聚类分析表明,19个苦荞供试材料遗传相似系数变幅为0.37~0.72,当遗传相似系数为0.39时,可将19份苦荞品种分为2类;当遗传相似系数为0.418时,可分为4类,说明19个苦荞品种在遗传组成上具有一定的差异,SRAP引物适用于苦荞多态性分析。 展开更多
关键词 苦荞 srap分子标记 聚类分析 遗传多样性
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美味扇菇SRAP-PCR反应体系优化及菌盖颜色特异性引物筛选
9
作者 张警丹 杨婷 +2 位作者 张慧敏 丁佳瑶 姜婉竹 《食药用菌》 2025年第5期350-356,共7页
以采自吉林省白山市的两个野生美味扇菇菌株(编号M3,M6)为试材,采用单因素试验法,对SRAP-PCR反应的Taq DNA聚合酶用量、Mg^(2+)浓度、dNTPs浓度、引物浓度和模板DNA用量等关键因素进行优化,并对SRAP引物进行特异性条带筛选。结果表明:... 以采自吉林省白山市的两个野生美味扇菇菌株(编号M3,M6)为试材,采用单因素试验法,对SRAP-PCR反应的Taq DNA聚合酶用量、Mg^(2+)浓度、dNTPs浓度、引物浓度和模板DNA用量等关键因素进行优化,并对SRAP引物进行特异性条带筛选。结果表明:美味扇菇SRAP-PCR的最优反应体系为Taq DNA聚合酶1.0 U、Mg^(2+)3.0 mmol/L、dNTPs 0.5 mmol/L、引物0.2μmol/L、模板DNA 40 ng/μL、ddH_(2)O补足至20μL。采用优化后的体系对153对SRAP引物进行筛选,有124对引物可以扩增出目的条带(引物有效性81.05%),其中105对引物组合能扩增出清晰且多态性较高的条带。研究结果可为美味扇菇分子标记开发及遗传多样性分析提供理论依据。 展开更多
关键词 美味扇菇 srap-PCR 体系优化 引物筛选
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白及SRAP-PCR反应体系正交设计优化及引物筛选
10
作者 桂腾琴 李春艳 +2 位作者 韦燕 武忠亮 张思平 《福建农业科技》 2025年第3期18-24,共7页
建立白及Bletilla striata Rchb.f.最佳SRAP-PCR(sequence-related amplified polymorphism polymerase chain reaction,SRAP-PCR)反应体系,为从分子水平开展白及不同地理群体的分子遗传学评价研究提供相关的技术支持。以采自于贵州省... 建立白及Bletilla striata Rchb.f.最佳SRAP-PCR(sequence-related amplified polymorphism polymerase chain reaction,SRAP-PCR)反应体系,为从分子水平开展白及不同地理群体的分子遗传学评价研究提供相关的技术支持。以采自于贵州省安龙县白及嫩叶为材料,应用正交设计L_(9)(3^(4))对反应体系中4个因素(引物、Taq DNA聚合酶、Mg2+和dNTPs)的用量进行优化,正交设计引物组合为(Me1/Em1),探索建立白及最佳SRAP-PCR反应体系并对引物进行筛选,筛选稳定性高、多态性好的引物组合。结果表明:白及的最佳SRAP-PCR反应体系(25μL)为:2.50μL10×Buffer、2.50 mmol·L^(−1)Mg^(2+)、0.30 mmol·L^(−1)dNTPs、0.25μmol·L^(−1)引物、1.50 U Taq DNA聚合酶以及20~80 ng模板DNA。利用21份白及对最佳SRAP-PCR反应体系稳定性检测,该体系稳定性高、重复性好。以白及基因组DNA为模板,选用最佳的SRAP-PCR反应体系对80对引物组合进行筛选,最终获得多态性引物13对,共扩增出182个位点,其中多态性位点152个,多态性位点百分比为83.52%。该体系稳定性高、重复性好,为后续遗传多样性研究提供相关的技术支持。 展开更多
关键词 白及 正交设计 srap-PCR 体系优化 引物筛选
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基于SRAP分子标记构建云南旱冬瓜核心种质 被引量：1
11
作者 邹广权 王晓丽 +3 位作者 曹现富 李艳 张新洛 曹子林 《西南农业学报》 CSCD 北大核心 2024年第1期49-55,共7页
【目的】通过对比不同抽样比例构建的旱冬瓜种质子集的有效性和代表性,筛选出旱冬瓜核心种质适宜的构建策略。【方法】以旱冬瓜优树同胞子代为试材,设10%、15%、25%、35%、45%和55%共6个抽样比例,采用Nei’s遗传距离和改进的最小距离逐... 【目的】通过对比不同抽样比例构建的旱冬瓜种质子集的有效性和代表性,筛选出旱冬瓜核心种质适宜的构建策略。【方法】以旱冬瓜优树同胞子代为试材,设10%、15%、25%、35%、45%和55%共6个抽样比例,采用Nei’s遗传距离和改进的最小距离逐步取样法取样,采用4个遗传多样性指数分析种质子集对原种质的代表性,通过均值t检验和方差F检验分析种质子集与原种质集变异是否同质,利用相关系数分析种质子集与原种质集的相关性,通过遗传距离比较和聚类分析确认核心种质。【结果】25%抽样比例构建的种质子集的多态位点数、多态位点百分率、观测等位基因数和等位基因保留率与原种质集一致,其余4个评价指数皆显著大于原种质集,均值和方差与原种质的相关系数均接近或者等于1,平均遗传距离较原种质提高16.82%,因此认为在25%抽样比例构建的种质子集能很好地代表原种质。【结论】综合考虑核心种质的有效性、实用性、费用和工作量等,认为25%抽样比例构建的旱冬瓜核心种质能充分代表原种质的遗传多样性。 展开更多
关键词 旱冬瓜 srap标记数据 核心种质
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基于SRAP分子标记和农艺性状的大球盖菇种质资源遗传多样性分析 被引量：1
12
作者 詹美蓉 严胜泽 +5 位作者 罗情情 王圣铕 谢婷 王爱琴 陆欢 王瑞娟 《南方农业学报》 CSCD 北大核心 2024年第12期3563-3573,共11页
【目的】综合评价大球盖菇菌株的农艺性状及遗传多样性,筛选出适宜在福建三明地区栽培的优质菌株,为大球盖菇育种及其开发利用提供参考依据。【方法】通过ITS序列分析、拮抗试验及SRAP分子标记对收集的17株大球盖菇菌株进行遗传多样性分... 【目的】综合评价大球盖菇菌株的农艺性状及遗传多样性,筛选出适宜在福建三明地区栽培的优质菌株,为大球盖菇育种及其开发利用提供参考依据。【方法】通过ITS序列分析、拮抗试验及SRAP分子标记对收集的17株大球盖菇菌株进行遗传多样性分析,分别测定子实体长度、菌盖直径、菌盖厚度、菌柄上端直径、菌柄下端直径及单朵重等农艺性状后,采用相关分析和主成分分析对大球盖菇的农艺性状进行分析。【结果】ITS序列分析证实,17株供试菌株均为大球盖菇,在进化关系上分属于三大分支;拮抗试验结果表明,具有拮抗反应的培养组合共有87组,无拮抗反应的培养组合有49组,即大球盖菇菌株间存在较大差异性;17株大球盖菇菌株的遗传相似系数为0.66~0.92,遗传背景较丰富;当遗传相似系数为0.79时,17株大球盖菇菌株可分为六大类(I~VI)。不同农艺性状的遗传多样性指数(H')均大于1.50,变异系数为14.29%~47.82%。其中,单朵重的变异系数最大(47.82%),产量的变异系数较小(14.29%),说明大球盖菇农艺性状存在丰富的变异,具有高的遗传多样性。相关分析发现,培养皿菌丝形态与培养皿菌丝生长速率呈显著负相关(r=-0.565)(P<0.05,下同),与栽培袋菌丝形态、产量呈极显著正相关(r=0.772和r=0.664)(P<0.01,下同);培养皿菌丝生长速率与产量呈显著负相关(r=-0.524);栽培袋菌丝形态与产量呈极显著正相关(r=0.721)。主成分分析结果表明,第一主成分(PC1)的贡献率为50.768%,其特征向量较高的农艺性状是子实体长度和产量;第二主成分(PC2)的贡献率为38.729%,其特征向量较高的农艺性状是菌盖直径和菌柄上端直径。【结论】大球盖菇D-3菌株的菌丝生长均匀、浓密,生长速率较快,产量高且稳定,子实体菌柄粗壮,整体商品性好,可作为大球盖菇品种选育亲本,适宜在福建三明地区推广种植。 展开更多
关键词 大球盖菇 种质资源 srap分子标记 农艺性状 遗传多样性
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燕麦倒伏相关性状的SRAP关联分析 被引量：2
13
作者 隋白婧 孙艳楠 +3 位作者 纪明雪 王永聪 杨超 齐冰洁 《西北农林科技大学学报（自然科学版）》 CSCD 北大核心 2024年第12期73-81,104,共10页
【目的】挖掘与燕麦倒伏性状相关的SRAP分子标记,为燕麦倒伏相关性状的研究及分子标记辅助育种提供遗传基础。【方法】以62份燕麦种质为试材,测定其表型性状、茎秆力学特性以及茎秆生理生化指标,并进行描述性和相关性分析;利用筛选的10... 【目的】挖掘与燕麦倒伏性状相关的SRAP分子标记,为燕麦倒伏相关性状的研究及分子标记辅助育种提供遗传基础。【方法】以62份燕麦种质为试材,测定其表型性状、茎秆力学特性以及茎秆生理生化指标,并进行描述性和相关性分析;利用筛选的10对SRAP引物组合对其进行多态性和关联分析。【结果】供试燕麦种质的茎壁厚度、茎秆弯曲强度、茎秆穿刺强度、茎秆压碎强度、倒伏指数、产量,以及茎秆第2节间的可溶性糖含量、纤维素含量、氮含量、磷含量和钾含量等11个性状差异较大;燕麦的株高、重心高度、穗位高和茎秆第2节间氮含量与倒伏指数呈极显著正相关,而茎秆第2节间的可溶性糖、纤维素、木质素和钾含量及茎秆穿刺强度与倒伏指数呈显著负相关。SRAP多样性分析显示,多态信息含量均值为0.4076,遗传多样性较高。关联分析分别检测到46个和25个标记位点与倒伏相关性状关联,其中位点A17B2和T4G4与多个倒伏性状关联。【结论】供试燕麦种质遗传差异大,多样性指数较高。关联分析找到与燕麦倒伏相关性状显著关联的SRAP分子标记,可用于燕麦分子标记辅助育种。 展开更多
关键词 燕麦育种 倒伏性状 srap分子标记
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基于SRAP分子标记的郁金香遗传多样性分析 被引量：1
14
作者 秦斗文 刘伟强 +2 位作者 田吉婷 唐楠 巨秀婷 《植物研究》 CAS CSCD 北大核心 2024年第5期783-792,共10页
为探究郁金香(Tulipa gesneriana)种质资源的遗传背景,精准评价和筛选优异种质用于郁金香遗传改良,该研究采用SRAP分子标记分析40个郁金香品种的遗传背景,明晰遗传多样性和亲缘关系。结果表明:在43对SRAP引物中可用于郁金香遗传多样性... 为探究郁金香(Tulipa gesneriana)种质资源的遗传背景,精准评价和筛选优异种质用于郁金香遗传改良,该研究采用SRAP分子标记分析40个郁金香品种的遗传背景,明晰遗传多样性和亲缘关系。结果表明:在43对SRAP引物中可用于郁金香遗传多样性研究的多态性引物共21对,在40个品种中共扩增出249条清晰稳定的条带,其中多态性条带245条,多态性比率为98.39%。供试的40个品种遗传相似性指数为0.5020~0.8675,遗传多样性参数等位基因数(N*a)、有效等位基因数(N*e)、Nei’s基因多样性指数(H*)、Shannon’s信息指数(I*)和多态性信息含量分别为1.9810、1.5149、0.3042、0.4603和0.3212,供试材料遗传多样性丰富。聚类结果和主坐标分析将40个郁金香品种分为两大类,其中‘Christmas Magical’‘Banja Luka’‘Madame Lefeber’与其他品种亲缘关系较远,在遗传背景上具有一定差异。 展开更多
关键词 郁金香 srap 遗传多样性 聚类分析
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番石榴杂交F_(1)代基于SRAP标记的鉴定及果实性状的遗传倾向分析 被引量：3
15
作者 黄婉莉 张冬敏 +2 位作者 符喜喜 陈心怡 张朝坤 《果树学报》 CAS CSCD 北大核心 2024年第9期1731-1745,共15页
【目的】通过鉴定番石榴杂交F_(1)代真实性以及探究其果实主要性状的遗传倾向,丰富番石榴遗传规律研究,以期为番石榴杂交育种亲本选配提供参考依据。【方法】以母本红香1号番石榴、父本帝王番石榴及其104个杂交F_(1)代单株为研究材料,应... 【目的】通过鉴定番石榴杂交F_(1)代真实性以及探究其果实主要性状的遗传倾向,丰富番石榴遗传规律研究,以期为番石榴杂交育种亲本选配提供参考依据。【方法】以母本红香1号番石榴、父本帝王番石榴及其104个杂交F_(1)代单株为研究材料,应用SRAP分子标记鉴定杂种的真实性,并对亲本与F_(1)代群体遗传多样性、遗传关系和果实品质的遗传倾向进行分析。【结果】利用SRAP标记对杂交F_(1)代群体进行鉴定,真杂种率为98.08%。聚类分析图谱显示,在0.90阈值处可将父母本及杂交F_(1)代群体分为6类;杂交F_(1)代单果质量、果实纵径、横径、果形指数、果心直径、果肉厚度、果实可滴定酸(TA)含量和可溶性固形物(TSS)含量等8个性状都表现为较典型的正态分布,属于由多个基因控制的数量性状;杂交F_(1)代单果质量、果实纵径、横径、果形指数和TSS含量呈增大变异的遗传趋势,果实TA含量呈现趋小变异的遗传趋势;杂交F_(1)代果实6个质量性状果实形状、果面质地、果皮颜色、果肉颜色、果肉质地以及果实香气离散幅度较大,多样性指数较高。6种质量性状受不同的基因控制,其中果实形状、果面质地、果皮颜色、果肉颜色受父本影响较大,果肉质地和果实香气主要受母本影响。【结论】番石榴8个数量性状中,单果质量、果实纵径、横径和果形指数超亲优势明显,表明番石榴果实大小的遗传受加性效应的影响;番石榴6个质量性状中,果实形状、果面质地、果皮颜色、果肉颜色受父本影响较大,果肉质地和果实香气主要受母本影响。 展开更多
关键词 番石榴 杂交后代 srap分子标记 果实品质 遗传规律
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89份香蕉种质资源SRAP分子标记亲缘关系分析 被引量：2
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作者 周海琪 夏玲 +7 位作者 吕顺 曾莉莎 王芳 黄晓彦 陈东仪 刘文清 梁少丽 刘丽琴 《热带作物学报》 CSCD 北大核心 2024年第4期703-711,共9页
香蕉分类是一个难题,利用形态学特征进行分类已无法满足需要。分子标记技术逐渐被应用到香蕉品种(系)的种群鉴定与分类、亲缘关系分析和遗传多样性研究等方面。本研究采用SRAP分子标记技术对89份香蕉种质资源的亲缘关系进行分析。利用1... 香蕉分类是一个难题,利用形态学特征进行分类已无法满足需要。分子标记技术逐渐被应用到香蕉品种(系)的种群鉴定与分类、亲缘关系分析和遗传多样性研究等方面。本研究采用SRAP分子标记技术对89份香蕉种质资源的亲缘关系进行分析。利用10对正反引物两两组合成100对引物组合,从中筛选出扩增条带易于识别、带型清晰、多态性高的13对SRAP引物,共扩增出170条可辨认条带,平均每对引物扩增13.08条,其中表现出多态性的条带有140条,多态性比率为79.00%。89份香蕉种质资源的相似系数的变化范围在0.241~1.000之间,遗传多样性非常丰富,来源于同一个地方或者来源不同地方的同一类型的野生蕉的相似性系数较高。当相似性系数为0.49时可以将这89份香蕉资源分成六大类,包括香牙蕉、贡蕉和龙牙蕉为主的第一大类(AAA、AA、AAB基因型),粉大蕉、粉蕉和BB类野蕉为主的第二大类(ABB、BB基因型),大蕉、阿宽蕉类野蕉为主的第三大类,以及红花蕉、地涌金莲、蝎尾蕉分别所属的第四、五、六类群。其结果与现行的经典分类结论基本一致,只有部分香蕉种质分类地位有差异,说明用SRAP标记对香蕉种质资源进行分类是可行的。同时,栽培类香牙蕉、贡蕉和龙牙蕉具有相同的祖先,与AA基因型野蕉亲缘关系近,粉蕉、粉大蕉与BB基因型的野蕉亲缘关系较近,不同基因组的香蕉种质资源聚到一起,说明香蕉种质资源的起源影响后代的亲缘关系,单一的分类方法无法将香蕉种质资源完全区分。此外,大蕉与阿宽蕉亲缘关系较近,但是无法分辨大蕉是否含有A和B基因组,因此大蕉基因型和遗传背景有待进一步研究。 展开更多
关键词 香蕉 srap 聚类分析 亲缘关系
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木姜叶柯SRAP-PCR反应体系优化、引物筛选及验证
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作者 罗超颖 严武平 +4 位作者 汪玉玲 王梦醒 彭莎 廖红 程建峰 《南方农业学报》 CSCD 北大核心 2024年第11期3231-3241,共11页
【目的】建立一套适用于木姜叶柯SRAP-PCR的最佳反应体系,筛选出应用于木姜叶柯种质资源遗传多样性分析的多态性引物,为后续木姜叶柯保护遗传学研究及其开发利用提供科学依据。【方法】采用单因素试验和正交试验相结合的方法,对SRAP-PC... 【目的】建立一套适用于木姜叶柯SRAP-PCR的最佳反应体系,筛选出应用于木姜叶柯种质资源遗传多样性分析的多态性引物,为后续木姜叶柯保护遗传学研究及其开发利用提供科学依据。【方法】采用单因素试验和正交试验相结合的方法,对SRAP-PCR扩增效果的主要影响因素(模板DNA用量、dNTPs浓度、Taq DNA聚合酶用量和引物浓度)进行优化。利用最佳反应体系筛选出适用于木姜叶柯的SRAP多态性引物。【结果】优化获得木姜叶柯SRAPPCR最佳反应体系(20.00μL):10×PCRBuffer2.00μL,TaqDNA聚合酶1.50U,dNTPs0.25mmol/L,引物浓度0.600μmol/L和模板DNA 30.00 ng。各因素对木姜叶柯PCR扩增效果影响程度排序:引物浓度>dNTPs浓度>Taq DNA聚合酶用量>模板DNA用量。应用优化后的SRAP-PCR最佳反应体系和筛选到的20对多态性引物对3个居群的24个木姜叶柯样本进行SRAP-PCR扩增,结果发现4对SRAP引物从3个野生木姜叶柯居群24个样本中共扩增出38个位点,每对引物平均扩增出9.5个位点,其中多态性位点共21个,多态性比率为55.26%。3个木姜叶柯居群的平均等位基因数(Na)、平均有效等位基因数(Ne)、Nei’s基因多样性(H')和Shannon’s信息指数(I)分别为1.55、1.30、0.18和0.27,总遗传多样性(Ht)、居群内遗传多样性(Hs)和遗传分化系数(Gst)分别为0.18、0.11和0.36,基因流(Nm)为0.90(<1.00),说明3个居群间存在一定程度的基因交流,但基因交流程度有限。【结论】木姜叶柯SRAP-PCR扩增效果对引物浓度最敏感。建立木姜叶柯的SRAP-PCR最佳反应体系和筛选到的SRAP引物扩增条带清晰稳定,多态性丰富,能较好地反映出不同木姜叶柯个体和居群间的亲缘关系,可应用于木姜叶柯种质资源的遗传多样性和遗传结构分析。 展开更多
关键词 木姜叶柯 srap-PCR 反应体系 优化 引物筛选 遗传多样性
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利用SRAP标记鉴定结球甘蓝‘寒玉20’种子遗传纯度 被引量：1
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作者 曹婧 孙春青 +3 位作者 戴忠良 陈辉 山溪 陈波平 《现代园艺》 2024年第21期48-50,共3页
为鉴定结球甘蓝品种‘寒玉20’种子的遗传纯度,利用SRAP分子标记技术对结球甘蓝‘寒玉20’F1杂种DNA多态性进行分析;对280个随机引物组合进行了检测,共筛选出4个可用于鉴定结球甘蓝‘寒玉20’种子遗传纯度的引物组合;运用这些有效引物组... 为鉴定结球甘蓝品种‘寒玉20’种子的遗传纯度,利用SRAP分子标记技术对结球甘蓝‘寒玉20’F1杂种DNA多态性进行分析;对280个随机引物组合进行了检测,共筛选出4个可用于鉴定结球甘蓝‘寒玉20’种子遗传纯度的引物组合;运用这些有效引物组合,对甘蓝的192个单株进行遗传纯度检测,鉴定出此批甘蓝种子纯度约为91.93%。结果表明,SRAP分子标记技术能够在甘蓝基因组中产生较高的多态性位点且重复性好,可作为甘蓝新品种纯度鉴定的有效工具。 展开更多
关键词 结球甘蓝 种子 遗传纯度 srap
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烟草DNA的提取与SRAP反应体系的建立 被引量：66
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作者 梁景霞 祁建民 +4 位作者 吴为人 周东新 陈顺辉 王涛 陶爱芬 《中国烟草学报》 EI CAS CSCD 2005年第4期33-38,共6页
以10个烟草栽培品种为试验材料,研究了烟草DNA的提取方法以及对建立烟草SRAP-PCR反应体系的影响因子设置梯度实验,筛选和建立可扩增多态性高、重复性好、带型清晰的最佳SRAP-PCR反应条件:在25μL的反应体系中,MgCl22.0mmol、dNTP200μm... 以10个烟草栽培品种为试验材料,研究了烟草DNA的提取方法以及对建立烟草SRAP-PCR反应体系的影响因子设置梯度实验,筛选和建立可扩增多态性高、重复性好、带型清晰的最佳SRAP-PCR反应条件:在25μL的反应体系中,MgCl22.0mmol、dNTP200μmol,上下引物各30ng、DNA模板40ng、DNA聚合酶1.5U,扩增程序为:在94℃预变性5min,反应前5个循环在94℃1min,33℃1min,72℃1min条件下运行;随后的30个循环复性温度提高到53℃,最后72℃延伸5min。本文还讨论了不同分子标记在烟草中应用的优缺点以及SRAP分子标记在烟草上的应用前景,提出了应用SRAP分子标记构建烟草遗传图谱的可行性。 展开更多
关键词 烟草 DNA提取 srap反应体系 PCR反应体系 DNA模板 srap 提取方法 DNA聚合酶 分子标记 MGCL2
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罂粟种质资源遗传多样性和亲缘关系的SRAP分析
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作者 王玉红 王笑 +3 位作者 张兆萍 魏玉杰 苏毓杰 杨振华 《福建农业科技》 CAS 2024年第5期33-38,共6页
探明罂粟种质资源遗传多样性和亲缘关系,为罂粟遗传育种研究和种质指纹图谱奠定工作基础。利用形态标记和SRAP分子标记两种方法对25份罂粟资源的13个农艺性状进行测定、分析。结果表明:从12对SRAP引物中共筛选出11对多态性明显、条带清... 探明罂粟种质资源遗传多样性和亲缘关系,为罂粟遗传育种研究和种质指纹图谱奠定工作基础。利用形态标记和SRAP分子标记两种方法对25份罂粟资源的13个农艺性状进行测定、分析。结果表明:从12对SRAP引物中共筛选出11对多态性明显、条带清晰的引物组合,对25份供试材料基因组DNA分子进行扩增,共扩增出210条谱带,其中多态性条带81条,多态性比率为38.57%。SRAP聚类分析结果表明:25份罂粟材料的遗传相似系数在0.907~0.992,当相似系数在0.936处作切割线,可将25份供试材料分为5个大类和若干亚类。对供试罂粟材料的花色、叶形等农艺性状进行调查分析,当欧式距离为5.0时,可将所有罂粟材料可以分为12个大类和若干亚类。综上分析表明25份罂粟种质资源遗传多样性较丰富,形态标记和SRAP分子聚类可以用于研究罂粟种质资源遗传多样性和亲缘关系分析,研究结果可为罂粟遗传育种研究和种质指纹图谱奠定工作基础。 展开更多
关键词 罂粟 农艺性状 遗传多样性 srap标记
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