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基于SCoT、SRAP和SSR分子标记的220份辣椒种质资源遗传多样性分析
1
作者 裴红霞 汪露瑶 +1 位作者 李生梅 高晶霞 《生物技术通报》 北大核心 2025年第8期165-174,共10页
【目的】深入解析保存在宁夏农林科学院辣椒种质资源的遗传多样性和亲缘关系,为辣椒种质资源的引进、保护和应用提供重要的理论依据。【方法】采用SCoT、SRAP和SSR 3种分子标记技术,对收集于全国15个地区的220份辣椒种质资源进行遗传多... 【目的】深入解析保存在宁夏农林科学院辣椒种质资源的遗传多样性和亲缘关系,为辣椒种质资源的引进、保护和应用提供重要的理论依据。【方法】采用SCoT、SRAP和SSR 3种分子标记技术,对收集于全国15个地区的220份辣椒种质资源进行遗传多样性分析。【结果】6个SCoT标记分别扩增出1-4条条带,14个SRAP标记分别扩增出2-4条条带,3个SSR标记分别扩增出2-5条条带,且所有标记均表现出100%的多态性条带百分比。进一步分析发现,SSR标记的平均多态性信息指数(PIC)最高,达到0.77,显著高于SCoT(0.55)和SRAP(0.55),表明SSR标记在遗传多态性检测中更具优势,其中,HpmsE088为最优SSR标记。聚类分析、主坐标分析和群体遗传结构分析将15个地区的种质划分为两大类群(Group 1和Group 2),其中Group 1包含中国四川、中国辽宁、中国新疆、中国山东、中国宁夏和中国湖南的种质,Group 2则包括中国(云南、江苏、河南、甘肃、北京和安徽)、荷兰、日本和美国的种质。此外,83.2%的种质表现出较高的纯合性。果形特征与聚类分组存在一定的相关性,Group 1中线形果实的辣椒种质比例显著高于Group 2,而所有短牛角形果实的辣椒种质均被归入Group 2。【结论】保存在宁夏农林科学院的辣椒种质资源具有较高的遗传多样性,根据遗传信息主要可以被划分为2组。 展开更多
关键词 辣椒 遗传多样性 SCoT标记 srap标记 SSR标记
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基于SRAP和ISSR标记的花椒种质资源遗传多样性及群体结构分析
2
作者 李晋华 汪志燚 +4 位作者 王少铭 冷家归 侯颖辉 罗莉斯 李德文 《种子》 北大核心 2025年第1期10-18,30,共10页
为探究国内花椒种质资源遗传多样性及群体结构,本研究采用ISSR和SRAP分子标记技术对48份花椒资源进行遗传多样性、亲缘关系及群体结构分析。结果表明,利用筛选的6对SRAP、7条ISSR引物分别扩增出43条、56条多态性条带,多态性比率分别为87... 为探究国内花椒种质资源遗传多样性及群体结构,本研究采用ISSR和SRAP分子标记技术对48份花椒资源进行遗传多样性、亲缘关系及群体结构分析。结果表明,利用筛选的6对SRAP、7条ISSR引物分别扩增出43条、56条多态性条带,多态性比率分别为87.73%、88.89%;48份花椒种质材料的平均Nei's遗传多样性指数为0.4372,平均Shannon's信息指数为0.6217。根据不同来源地,对8个花椒群体进行遗传多样性分析,遗传多样性排序表现为贵州省遵义市群体>陕西省群体>四川省群体>贵州省黔西南州群体>江西省群体>贵州省铜仁市群体>贵州省黔东南州群体>贵州省贵阳市群体;分子遗传变异分析表明,在花椒种质资源总遗传变异中,92%的变异发生在种源内,只有8%的变异发生在种源间;Structure群体遗传结构和UPGMA聚类结果表明,种源间存在中等程度的基因交流现象。利用SRAP和ISSR标记可以对花椒种质资源进行较高效的多态性检出,花椒种质资源的种间遗传分化明显,而同一种类不同来源地资源的遗传分化较小。 展开更多
关键词 花椒 srap分子标记 ISSR分子标记 遗传多样性 群体结构分析
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基于SRAP分子标记的沙芥居群遗传多样性分析
3
作者 门岩 杨忠仁 +3 位作者 黄修梅 张晓辉 郝丽珍 张凤兰 《安徽农业科学》 2025年第19期89-92,共4页
[目的]探究不同地区沙芥居群的遗传多样性与亲缘关系。[方法]应用SRAP分子标记技术对沙芥7个居群84份植物叶片进行PCR扩增,并计算多态位点、Nei’s多样性指数等遗传参数。[结果]挑选出14对SRAP引物,它们的扩增多态性高,条带清晰。经过... [目的]探究不同地区沙芥居群的遗传多样性与亲缘关系。[方法]应用SRAP分子标记技术对沙芥7个居群84份植物叶片进行PCR扩增,并计算多态位点、Nei’s多样性指数等遗传参数。[结果]挑选出14对SRAP引物,它们的扩增多态性高,条带清晰。经过一系列检测后,结果显示共138个位点被检出,其中多态位点百分比达到92.70%;Nei’s基因多样性指数平均值、Shannon’s信息多样性指数平均值、总基因多样性指数、遗传分化系数和基因流值分别为0.2204、0.3315、0.3112、0.2917和1.2140。沙芥不同居群之间存在一定的遗传分化,大部分发生在居群内,约占70.83%,29.17%发生在居群间。[结论]该研究结果可为后续开展沙芥珍稀物种的保护和利用奠定基础。 展开更多
关键词 沙芥 遗传多样性 亲缘关系 srap标记
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杉木球果形态变异及与SRAP标记的关联分析
4
作者 林慧珠 曾韦珊 +2 位作者 黄荣 黄少伟 郑会全 《西南林业大学学报(自然科学)》 北大核心 2025年第2期50-57,共8页
为揭示杉木不同亲本球果的变异特征及其遗传基础,挖掘与杉木球果形态相关联的分子标记,对广东杉木第3代种子园中50个亲本的球果形态指标进行测定,在分析遗传多样性的基础上,将球果形态数据与SRAP分子标记进行关联分析。结果表明:球果形... 为揭示杉木不同亲本球果的变异特征及其遗传基础,挖掘与杉木球果形态相关联的分子标记,对广东杉木第3代种子园中50个亲本的球果形态指标进行测定,在分析遗传多样性的基础上,将球果形态数据与SRAP分子标记进行关联分析。结果表明:球果形态特征在亲本间存在极显著差异;各球果表型变异系数达到了11.01%~31.90%,遗传变异系数达到了8.13%~21.54%,所有球果性状的重复力均高于0.8,说明杉木球果形态特征变化受到强烈的遗传因素控制。关联分析共得到59个标记与8个性状显著关联,其中与球果纵径、球果横径、单个球果鲜质量、球果体积、苞鳞层数、苞鳞总数、苞鳞长和苞鳞宽显著关联的标记分别有9、10、6、3、6、9、8、8个。 展开更多
关键词 杉木 球果 多态性 亲本 srap 关联分析
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运用SRAP和SSR分子标记鉴定铁皮石斛与金钗石斛F1代杂种的真实性 被引量：1
5
作者 杜俊峰 袁瑗 +1 位作者 邓春莉 任羽 《现代园艺》 2025年第2期6-8,共3页
为了鉴定铁皮石斛和金钗石斛杂交F1代杂种的真实性,运用SRAP和SSR分子标记鉴定F1代。结果表明,从20对SR AP引物和10对SSR引物中各选出1对用于22株F1代鉴定,鉴定结果为21株是真杂交种,真杂交种率为95.4%。由此可知,用SSR和SRAP标记鉴定... 为了鉴定铁皮石斛和金钗石斛杂交F1代杂种的真实性,运用SRAP和SSR分子标记鉴定F1代。结果表明,从20对SR AP引物和10对SSR引物中各选出1对用于22株F1代鉴定,鉴定结果为21株是真杂交种,真杂交种率为95.4%。由此可知,用SSR和SRAP标记鉴定石斛杂交后代可行,对加快石斛育种的速度,缩短育种的时间年限和石斛的种质资源保护具有重要意义。 展开更多
关键词 SSR分子标记 srap分子标记 铁皮石斛 金钗石斛 杂种鉴定
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烟草DNA的提取与SRAP反应体系的建立 被引量：66
6
作者 梁景霞 祁建民 +4 位作者 吴为人 周东新 陈顺辉 王涛 陶爱芬 《中国烟草学报》 EI CAS CSCD 2005年第4期33-38,共6页
以10个烟草栽培品种为试验材料,研究了烟草DNA的提取方法以及对建立烟草SRAP-PCR反应体系的影响因子设置梯度实验,筛选和建立可扩增多态性高、重复性好、带型清晰的最佳SRAP-PCR反应条件:在25μL的反应体系中,MgCl22.0mmol、dNTP200μm... 以10个烟草栽培品种为试验材料,研究了烟草DNA的提取方法以及对建立烟草SRAP-PCR反应体系的影响因子设置梯度实验,筛选和建立可扩增多态性高、重复性好、带型清晰的最佳SRAP-PCR反应条件:在25μL的反应体系中,MgCl22.0mmol、dNTP200μmol,上下引物各30ng、DNA模板40ng、DNA聚合酶1.5U,扩增程序为:在94℃预变性5min,反应前5个循环在94℃1min,33℃1min,72℃1min条件下运行;随后的30个循环复性温度提高到53℃,最后72℃延伸5min。本文还讨论了不同分子标记在烟草中应用的优缺点以及SRAP分子标记在烟草上的应用前景,提出了应用SRAP分子标记构建烟草遗传图谱的可行性。 展开更多
关键词 烟草 DNA提取 srap反应体系 PCR反应体系 DNA模板 srap 提取方法 DNA聚合酶 分子标记 MGCL2
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怀地黄SRAP分子标记体系的建立与DNA指纹图谱的构建 被引量：14
7
作者 谷凤平 周春娥 +4 位作者 路淑霞 姚换灵 王芳 段红英 周延清 《河南师范大学学报（自然科学版）》 CAS CSCD 北大核心 2009年第3期175-178,共4页
以怀地黄DNA为模板,进行SRAP反应条件的优化及DNA指纹图谱构建,优化的反应体系为:25μL的体积中,模板DNA 20 ng,Mg2+浓度2.5 mmol.L-1,上下游引物各0.36μmol.L-1,dNTPs 0.30 mmol.L-1,Taq DNA酶2.0 U.构建了怀地黄23个品种的DNA指纹图... 以怀地黄DNA为模板,进行SRAP反应条件的优化及DNA指纹图谱构建,优化的反应体系为:25μL的体积中,模板DNA 20 ng,Mg2+浓度2.5 mmol.L-1,上下游引物各0.36μmol.L-1,dNTPs 0.30 mmol.L-1,Taq DNA酶2.0 U.构建了怀地黄23个品种的DNA指纹图谱,为怀地黄品种鉴定、遗传多样性分析、分子标记辅助育种和质量综合评价等研究奠定了基础. 展开更多
关键词 怀地黄 srap扩增体系优化 srap DNA指纹图谱
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甜菜SRAP-PCR反应体系的优化 被引量：13
8
作者 王华忠 吴则东 +1 位作者 韩英 王丛玲 《中国糖料》 2007年第2期1-4,共4页
为了建立适宜甜菜的SRAP反应体系,以40个不同类型的甜菜品系为试验材料,研究了PCR反应体系的主要成分对SRAP扩增结果的影响。对SRAP反应体系中的DNA模板浓度、Taq DNA聚合酶浓度、引物浓度以及dNTP浓度进行了探索,确立了适合甜菜的SRAP... 为了建立适宜甜菜的SRAP反应体系,以40个不同类型的甜菜品系为试验材料,研究了PCR反应体系的主要成分对SRAP扩增结果的影响。对SRAP反应体系中的DNA模板浓度、Taq DNA聚合酶浓度、引物浓度以及dNTP浓度进行了探索,确立了适合甜菜的SRAP反应体系为:在20μL反应体系中,模板DNA为40ng,Taq DNA聚合酶1.0U,引物60ng,dNTP(2.5mmol/L)为1.6μL,扩增程序为94℃预变性3min,反应前5个循环在94℃1min,35℃1min,72℃1min的条件下运行;随后的35个循环复性温度提高到50℃,最后72℃延伸10min。并利用该反应体系对甜菜40个不同品系进行SRAP反应,用6%的变性聚丙烯酰胺凝胶电泳检测,不同品系间DNA谱带多态性丰富,证实该体系稳定可靠,可以用于甜菜的分子标记研究。 展开更多
关键词 甜菜 srap标记 srap—PCR反应条件 变性聚丙烯酰胺凝胶
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河南省牛至及其近缘种甘牛至SRAP遗传多样性分析与指纹图谱构建 被引量：2
9
作者 田慧鑫 于婵 +7 位作者 杨帆 苏亚楠 王晓东 周艳 李贺敏 黄勇 梁妍 夏至 《河南农业科学》 北大核心 2025年第1期55-65,共11页
探讨河南省不同区域分布的牛至(Origanum vulgare)及其近缘种甘牛至(Origanum majorana)遗传多样性和亲缘关系,为牛至及甘牛至种质资源保护、开发利用提供参考。采用相关序列扩增多态性(Sequence-related amplified polymorphism,SRAP)... 探讨河南省不同区域分布的牛至(Origanum vulgare)及其近缘种甘牛至(Origanum majorana)遗传多样性和亲缘关系,为牛至及甘牛至种质资源保护、开发利用提供参考。采用相关序列扩增多态性(Sequence-related amplified polymorphism,SRAP)分子标记方法,选取牛至野生居群(7个)、栽培居群(1个)及甘牛至栽培居群(1个)共9个居群77份牛至和甘牛至种质资源进行遗传多样性分析,构建DNA指纹图谱。结果表明,9对引物共扩增出98个条带,多态性条带94条,多态性条带比率为95.92%,平均每对引物扩增出10.89条。等位基因数(Na)为1.9592、有效等位基因数(Ne)为1.4195、Nei基因多样性指数(H)为0.2632、Shannon’s指数(I)为0.4119。基于SRAP分子标记数据建立的UPGMA亲缘关系聚类图,遗传相似系数介于0.66~0.95。当遗传相似系数为0.66时,将牛至和甘牛至分为2个单独分支。在遗传相似系数为0.75时,不同区域牛至分为5个分支。综上,SRAP分子标记可以有效鉴别牛至与甘牛至;河南省南阳牛至种群遗传多样性高于其他区域;筛选出了5对SRAP引物(Me1/em6、Me1/em11、Me3/em4、Me3/em11、Me5/em3)构建牛至和甘牛至种质DNA指纹图谱。 展开更多
关键词 牛至 甘牛至 相关序列扩增多态性 遗传多样性 DNA指纹图谱
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ISSR和SRAP分子标记在石斛属植物杂交育种上的应用效果
10
作者 黄佳维 陈小玲 +1 位作者 陈前程 余松金 《现代农业科技》 2025年第12期145-148,共4页
以6种石斛为试验材料,采用简单重复序列间扩增(ISSR)和序列相关扩增多态性(SRAP)2种分子标记技术对其进行遗传多样性分析。结果表明:ISSR引物共扩增出69条条带,多态性比例达100%,SRAP引物共扩增出78条条带,多态性比例达99%。2种分子标... 以6种石斛为试验材料,采用简单重复序列间扩增(ISSR)和序列相关扩增多态性(SRAP)2种分子标记技术对其进行遗传多样性分析。结果表明:ISSR引物共扩增出69条条带,多态性比例达100%,SRAP引物共扩增出78条条带,多态性比例达99%。2种分子标记的聚类分析结果均将杯鞘石斛、喇叭唇石斛和紫婉石斛聚为一组,与传统分类结果和杂交结果一致,而兜唇石斛自成一组。区别在于ISSR分子标记将重唇石斛和黄喉石斛分开各自为一组,而SRAP分子标记将两者归为一组,遗传相似系数为0.500,与杂交结果相符。综上所述,ISSR和SRAP 2种分子标记均能在一定程度上指导石斛属植物的分类,ISSR在多态性分析上效果更好,SRAP则更能准确地表达种间亲缘关系,对杂交育种亲本的选择具有指导意义。 展开更多
关键词 石斛 杂交育种 ISSR srap 遗传多样性 结实率
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19个苦荞种质资源的SRAP分析
11
作者 郑竹 解芬 文霞 《农技服务》 2025年第1期23-26,共4页
为提高苦荞种质资源利用效率和其杂交亲本的选配提供参考,利用琼脂糖凝胶电泳对野苦荞、黑丰1号的144对SRAP正反引物组合扩增产物进行筛选,筛选出14对多态性较好的引物组合,并对19份苦荞种质资源进行SRAP-PCR扩增。结果表明:PCR扩增共... 为提高苦荞种质资源利用效率和其杂交亲本的选配提供参考,利用琼脂糖凝胶电泳对野苦荞、黑丰1号的144对SRAP正反引物组合扩增产物进行筛选,筛选出14对多态性较好的引物组合,并对19份苦荞种质资源进行SRAP-PCR扩增。结果表明:PCR扩增共检测出69个等位变异,平均每对引物组合可检出4.643个等位变异。UPGMA聚类分析表明,19个苦荞供试材料遗传相似系数变幅为0.37~0.72,当遗传相似系数为0.39时,可将19份苦荞品种分为2类;当遗传相似系数为0.418时,可分为4类,说明19个苦荞品种在遗传组成上具有一定的差异,SRAP引物适用于苦荞多态性分析。 展开更多
关键词 苦荞 srap分子标记 聚类分析 遗传多样性
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美味扇菇SRAP-PCR反应体系优化及菌盖颜色特异性引物筛选
12
作者 张警丹 杨婷 +2 位作者 张慧敏 丁佳瑶 姜婉竹 《食药用菌》 2025年第5期350-356,共7页
以采自吉林省白山市的两个野生美味扇菇菌株(编号M3,M6)为试材,采用单因素试验法,对SRAP-PCR反应的Taq DNA聚合酶用量、Mg^(2+)浓度、dNTPs浓度、引物浓度和模板DNA用量等关键因素进行优化,并对SRAP引物进行特异性条带筛选。结果表明:... 以采自吉林省白山市的两个野生美味扇菇菌株(编号M3,M6)为试材,采用单因素试验法,对SRAP-PCR反应的Taq DNA聚合酶用量、Mg^(2+)浓度、dNTPs浓度、引物浓度和模板DNA用量等关键因素进行优化,并对SRAP引物进行特异性条带筛选。结果表明:美味扇菇SRAP-PCR的最优反应体系为Taq DNA聚合酶1.0 U、Mg^(2+)3.0 mmol/L、dNTPs 0.5 mmol/L、引物0.2μmol/L、模板DNA 40 ng/μL、ddH_(2)O补足至20μL。采用优化后的体系对153对SRAP引物进行筛选,有124对引物可以扩增出目的条带(引物有效性81.05%),其中105对引物组合能扩增出清晰且多态性较高的条带。研究结果可为美味扇菇分子标记开发及遗传多样性分析提供理论依据。 展开更多
关键词 美味扇菇 srap-PCR 体系优化 引物筛选
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白及SRAP-PCR反应体系正交设计优化及引物筛选
13
作者 桂腾琴 李春艳 +2 位作者 韦燕 武忠亮 张思平 《福建农业科技》 2025年第3期18-24,共7页
建立白及Bletilla striata Rchb.f.最佳SRAP-PCR(sequence-related amplified polymorphism polymerase chain reaction,SRAP-PCR)反应体系,为从分子水平开展白及不同地理群体的分子遗传学评价研究提供相关的技术支持。以采自于贵州省... 建立白及Bletilla striata Rchb.f.最佳SRAP-PCR(sequence-related amplified polymorphism polymerase chain reaction,SRAP-PCR)反应体系,为从分子水平开展白及不同地理群体的分子遗传学评价研究提供相关的技术支持。以采自于贵州省安龙县白及嫩叶为材料,应用正交设计L_(9)(3^(4))对反应体系中4个因素(引物、Taq DNA聚合酶、Mg2+和dNTPs)的用量进行优化,正交设计引物组合为(Me1/Em1),探索建立白及最佳SRAP-PCR反应体系并对引物进行筛选,筛选稳定性高、多态性好的引物组合。结果表明:白及的最佳SRAP-PCR反应体系(25μL)为:2.50μL10×Buffer、2.50 mmol·L^(−1)Mg^(2+)、0.30 mmol·L^(−1)dNTPs、0.25μmol·L^(−1)引物、1.50 U Taq DNA聚合酶以及20~80 ng模板DNA。利用21份白及对最佳SRAP-PCR反应体系稳定性检测,该体系稳定性高、重复性好。以白及基因组DNA为模板,选用最佳的SRAP-PCR反应体系对80对引物组合进行筛选,最终获得多态性引物13对,共扩增出182个位点,其中多态性位点152个,多态性位点百分比为83.52%。该体系稳定性高、重复性好,为后续遗传多样性研究提供相关的技术支持。 展开更多
关键词 白及 正交设计 srap-PCR 体系优化 引物筛选
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番茄SRAP-PCR体系优化与品种分子鉴定 被引量：70
14
作者 王燕 龚义勤 +4 位作者 赵统敏 刘广 郁樊敏 叶海龙 柳李旺 《南京农业大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2007年第1期23-29,共7页
对番茄基因组DNA的SRAP-PCR体系中Mg^2＋、dNTPs和引物浓度进行了优化，结果表明反应体系中适宜浓度为Mg^2＋ 1．5—3．0mmol·L^-1，dNTPs0．05—0．20mmol·L^-1，引物0．25μmol·L^-1；模板DNA为10～20ng（10μL反应体... 对番茄基因组DNA的SRAP-PCR体系中Mg^2＋、dNTPs和引物浓度进行了优化，结果表明反应体系中适宜浓度为Mg^2＋ 1．5—3．0mmol·L^-1，dNTPs0．05—0．20mmol·L^-1，引物0．25μmol·L^-1；模板DNA为10～20ng（10μL反应体系）。运用优化的体系，筛选获得3个合作906与其父母本多态性标记引物组合。利用15个引物组合对11个番茄主要品种以及1个近缘野生种进行种质鉴定的SRAP标记分析，10个多态性的引物组合共检测到55个多态性位点，平均每个引物可鉴别3．7个品种，双引物组合me8／em8-1与me6—1／em14-1可以区分所有供试材料。应用NTSYS-pc软件进行聚类分析（UPGMA），园艺性状相似的品种在较近的遗传距离聚类，表明SRAP可有效用于番茄品种资源鉴定与遗传多样性分析。 展开更多
关键词 番茄 srap 体系优化 品种鉴定
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烟草SRAP和ISSR分子遗传连锁图谱构建 被引量：45
15
作者 马红勃 祁建民 +7 位作者 李延坤 梁景霞 王涛 兰涛 陈顺辉 陶爱芬 林荔辉 吴建梅 《作物学报》 CAS CSCD 北大核心 2008年第11期1958-1963,共6页
采用烤烟品种台烟7号与白肋烟品种白肋21杂交,构建了187个单株的F2遗传作图群体,利用所筛选的68个能扩增出多态性条带的SRAP和ISSR引物,对F2作图群体进行PCR扩增和遗传连锁分析,初步构建了一张包含26个连锁群、112个(92个SRAP和20个ISSR... 采用烤烟品种台烟7号与白肋烟品种白肋21杂交,构建了187个单株的F2遗传作图群体,利用所筛选的68个能扩增出多态性条带的SRAP和ISSR引物,对F2作图群体进行PCR扩增和遗传连锁分析,初步构建了一张包含26个连锁群、112个(92个SRAP和20个ISSR)标记位点的烟草遗传连锁图谱。该图谱覆盖长度为1560.2cM,平均图距18.1cM。有16个标记未进入连锁群。26个连锁群包含2～20标记不等,连锁群遗传距离0～291.0cM。连锁群上有24.1%的标记出现偏分离,主要集中在LG1和LG4连锁群上,其余分散在不同连锁群。该图谱为烟草重要农艺性状的基因定位、以及分子标记辅助选择等研究奠定基础。 展开更多
关键词 烟草 srap ISSR 遗传连锁图谱
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以SRAP和EST-SSR标记分析芝麻种质资源的遗传多样性 被引量：40
16
作者 张鹏 张海洋 +3 位作者 郭旺珍 郑永战 魏利斌 张天真 《作物学报》 CAS CSCD 北大核心 2007年第10期1696-1702,共7页
利用SRAP和EST-SSR分子标记对192份国内外芝麻种质资源进行遗传多样性分析。结果表明,2种标记都能很好地揭示品种间遗传关系;在31对SRAP引物组合扩增的270个等位基因中多态性占62.08%,平均每对引物可以检测5.45个;25对SSR引物扩增的136... 利用SRAP和EST-SSR分子标记对192份国内外芝麻种质资源进行遗传多样性分析。结果表明,2种标记都能很好地揭示品种间遗传关系;在31对SRAP引物组合扩增的270个等位基因中多态性占62.08%,平均每对引物可以检测5.45个;25对SSR引物扩增的136个等位基因中56.28%呈多态性,平均每对检测引物产生3.04个。UPGMA聚类结果显示,在相似性系数为0.70时,192份材料可被分为3个类群;阈值为0.75时类群Ⅰ又可分为6组,表明芝麻品种遗传多样性比较丰富。我国南部地区芝麻品种遗传多样性(多样性指数Hi=2.572)较中部(Hi=2.117)和北部地区(Hi=2.114)丰富。分析结果将有助于更好地保护和利用芝麻种质资源,并为育种工作提供依据。 展开更多
关键词 芝麻 srap EST-SSR 遗传多样性 种质资源
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野生狗牙根种质遗传多样性的SRAP研究 被引量：54
17
作者 易杨杰 张新全 +3 位作者 黄琳凯 凌瑶 马啸 刘伟 《遗传》 CAS CSCD 北大核心 2008年第1期94-100,共7页
采用SRAP分子标记技术,对采自中国四川、重庆、贵州、西藏四省区的32份野生狗牙根(Cynodon dactylon)材料进行遗传多样性分析,获得下述结果:(1)用14对引物组合共得到132条多态性条带,平均每对引物扩增出9.4条多态带,多态性位点百分率为7... 采用SRAP分子标记技术,对采自中国四川、重庆、贵州、西藏四省区的32份野生狗牙根(Cynodon dactylon)材料进行遗传多样性分析,获得下述结果:(1)用14对引物组合共得到132条多态性条带,平均每对引物扩增出9.4条多态带,多态性位点百分率为79.8%,材料间的遗传相似系数范围在0.591到0.957之间,平均GS值为0.759,这些结果说明,供试野生狗牙根具有较为丰富的遗传多样性;(2)对所有材料进行聚类分析,可聚为4类,大部分来自相同或相似生态地理环境的材料聚为一类,表明供试材料的聚类和其生态地理环境间有一定的相关性;(3)基于Shannon多样性指数估算了6个狗牙根生态地理类群内和类群间的遗传分化,发现类群内遗传变异占总变异的65.56%,而类群间遗传变异占总变异的34.44%;(4)对各生态地理类群基于Nei氏无偏估计的遗传一致度的聚类分析表明,各生态地理类群间的遗传分化与其所处的生态地理环境具有一定的相关性。 展开更多
关键词 狗牙根 srap 遗传多样性 聚类分析
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新型分子标记——SRAP与TRAP及其应用 被引量：166
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作者 柳李旺 龚义勤 +1 位作者 黄浩 朱献文 《遗传》 CAS CSCD 北大核心 2004年第5期777-781,共5页
SRAP与TRAP是最近发展的新型分子标记系统,具有简单、高效、高共显性、重复性、易测序等优点,尤其是可检测基因的可译框(ORFs)区域。本文对分别在芸薹属作物与向日葵中开发的SRAP、TRAP标记系统的基本原理与分析程序进行介绍。引物设计... SRAP与TRAP是最近发展的新型分子标记系统,具有简单、高效、高共显性、重复性、易测序等优点,尤其是可检测基因的可译框(ORFs)区域。本文对分别在芸薹属作物与向日葵中开发的SRAP、TRAP标记系统的基本原理与分析程序进行介绍。引物设计是SRAP与TRAP分析的关键,目前已开发出多个SRAP正、反向引物;与SRAP标记技术无须任何序列信息不同,TRAP技术需要基于已知cDNA或EST序列信息设计固定引物才可进行PCR扩增;二者PCR条件采用复性变温法,前5个循环复性温度为35℃,后30～35个循环为50℃;扩增产物可在聚丙烯酰胺或琼脂糖凝胶上电泳,同位素或银染、EB检测。目前这两种标记系统已开始在多种作物的种质资源鉴定评价、遗传图谱构建(包括转录图谱)、重要性状标记乃至基因分离克隆等方面成功应用。 展开更多
关键词 srap TRAP 分子标记
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利用SRAP标记研究四川高原青稞育成品种的遗传多样性 被引量：42
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作者 杨平 刘仙俊 +6 位作者 刘新春 李俊 王希文 何守朴 李刚 杨武云 冯宗云 《遗传》 CAS CSCD 北大核心 2008年第1期115-122,共8页
利用SRAP(Sequence-related Amplified Polymorphism)分子标记技术,对25份来自四川高原的青稞育成品种进行了遗传多样性研究。结果表明:64对引物组合共检测出999条清晰条带,62对可以获得多态性条带,多态性引物组合占96.9%,共产生225条... 利用SRAP(Sequence-related Amplified Polymorphism)分子标记技术,对25份来自四川高原的青稞育成品种进行了遗传多样性研究。结果表明:64对引物组合共检测出999条清晰条带,62对可以获得多态性条带,多态性引物组合占96.9%,共产生225条多态性条带,占总条带数的22.5%。64对引物组合共扩增出333种等位变异,平均每个引物组合检测到5.20种等位变异。遗传多样性在0(me9/em14,me9/em15)～0.8928(me6/em18)之间,平均为0.5126。聚类分析结果表明,25份材料可分成A、B、C3大类,材料聚类与其来源地有明显的相关性。25份材料间的平均遗传距离较小(0.3240),平均遗传多样性较低(0.5126),遗传基础较为狭窄。 展开更多
关键词 大麦 青稞 srap 遗传多样性 育成品种
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利用SRAP与SSR标记分析不同类型甜菜的遗传多样性 被引量：69
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作者 王华忠 吴则东 +1 位作者 王晓武 方智远 《作物学报》 CAS CSCD 北大核心 2008年第1期37-46,共10页
为选育优质甜菜新品种,指导种质资源引进和利用,为进行分子标记辅助选择育种提供科学依据,采用SRAP和SSR两种分子标记方法相结合,对甜菜单胚雄性不育系及保持系等49份材料进行遗传多样性分析。利用4个表型差异显著的甜菜品系对SRAP的64... 为选育优质甜菜新品种,指导种质资源引进和利用,为进行分子标记辅助选择育种提供科学依据,采用SRAP和SSR两种分子标记方法相结合,对甜菜单胚雄性不育系及保持系等49份材料进行遗传多样性分析。利用4个表型差异显著的甜菜品系对SRAP的64对引物组合及SSR的11对引物组合进行扩增,分别筛选出有效引物组合11对和9对。SRAP的11对引物组合共产生199条扩增带,其中有86条多态性带,多态性带的比率平均为43.7%。SSR的9对引物共产生35条扩增带,多态性比率为100%。全部材料的平均遗传距离为0.3860,平均遗传相似系数为0.6795,大约30%的材料遗传距离或遗传相似系数具显著或极显著差异。遗传相似系数平均值比较,多胚四倍体品系0.7264>单胚杂交组合0.7243>国外品种0.7060>多胚二倍体品系0.6908>单胚品系0.6837。在遗传距离0.20处,将49个甜菜材料划分为A、B、C、D4个类群,D类群又分为4个亚类,较好地显示了甜菜材料丰富的遗传多样性。表明不同甜菜品种具有相当高的异质性,国外与国内材料的遗传基础存在一定差异,但生产应用的甜菜品种间存在亲缘关系较近、遗传基础较窄的倾向。 展开更多
关键词 甜菜 SSR标记 srap标记 遗传多样性 亲缘关系
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