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Restriction Fragment Length Polymorphism in the MC4R Gene and Its Genetic Effects on Carcass and Feather-down Traits in Geese
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作者 CHEN Hong-quan HUANG Hua-yun +1 位作者 CHEN Hua ZHANG Tong-yan 《畜牧兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2009年第S1期13-17,共5页
Carcass,meat quality,and feather-down traits of 123 geese from an F_1 population of Wanxi White goose(male parent)and Sichuan White goose(female parent)were measured,and an additional 12 compound indices were construc... Carcass,meat quality,and feather-down traits of 123 geese from an F_1 population of Wanxi White goose(male parent)and Sichuan White goose(female parent)were measured,and an additional 12 compound indices were constructed from the single traits,using factor analysis.The coding region of melanocortin receptor-4(MC4R)gene was amplified by PCR and the products were digested with four restriction endonucleases Hinf I,Ear I,Pst I,and Pvu II to detect restriction fragment length polymorphism(RFLP)in the MC4R gene,to analyze its associations with the traits.The only RFLP was exposed by digesting with Hinf I indicating two genotypes,HH and Hh,with frequencies of allele H and h being 0.8902 and 0.1098 in the F_1 population.Significant effects of genotype HH were found on carcass weight,eviscerated weight(with giblet),liver weight,heart weight,stomach percentage,abdominal fat percentage,breast muscle drip water loss and down proportion and many of the compound indices,and all genotypic contribution percentages(CP,genotypic effect on the population mean)were between-5%and 5%;effects of genotype Hh with the MC4R gene mutation,were not significant.Effects of genotype Hh were significant on two of the compound indices related to fat deposition:the fat index(CP=3.314%,P<0.05)and fatty acid quality(CP=1.218%,P<0.05). 展开更多
关键词 GOOSE mc4r gene RFLP economic TRAITS
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MC4R和PROP1基因多态性及合并基因型与中国美利奴羊生长性状的关联分析 被引量:14
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作者 曾献存 陈韩英 +5 位作者 贾斌 赵宗胜 惠文巧 张文祥 吴洪宾 王尊宝 《畜牧兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2011年第9期1227-1232,共6页
为了探讨MC4R和PROP1基因作为绵羊生长性状候选基因的可能性,寻找与绵羊生长性状相关的分子标记。本研究采用PCR-SSCP方法检测中国美利奴羊和德国美利奴羊MC4R和PROP1基因的多态性,分析了多态位点不同基因型及合并基因型与中国美利奴羊... 为了探讨MC4R和PROP1基因作为绵羊生长性状候选基因的可能性,寻找与绵羊生长性状相关的分子标记。本研究采用PCR-SSCP方法检测中国美利奴羊和德国美利奴羊MC4R和PROP1基因的多态性,分析了多态位点不同基因型及合并基因型与中国美利奴羊生长性状的关联性。结果表明:MC4R基因MC4R-3位点存在G894C突变,MC4R-4位点3′侧翼区存在A1223G、G1229A和T1307G3个突变位点;PROP1基因在外显子3上存在A2660G突变,导致Thr181Ala改变。关联分析表明,在中国美利奴羊群体中,MC4R-4位点不同基因型个体体斜长和腰角宽差异显著(P<0.05),优良基因型为BB;PROP1基因不同基因型个体尻宽和胸围差异显著(P<0.05),优良基因型为BB;PROP1-MC4R-4优良基因型聚合体BB-BB个体体斜长高于其它合并基因型个体(P<0.05)。结果提示绵羊MC4R和PROP1基因单核苷酸多态性及合并基因型对中国美利奴羊生长性状有一定的影响,可以作为进行绵羊生长性状分子标记辅助选择的候选基因。 展开更多
关键词 绵羊 mc4r基因 PROP1基因 合并基因型 生长性状
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鹅MC4R基因RFLP及其与胴体和羽绒性状的关联性 被引量:13
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作者 陈宏权 黄华云 +1 位作者 陈华 张同燕 《畜牧兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2008年第7期885-890,共6页
本研究利用皖西白鹅为父本与四川白鹅(母本)进行杂交,屠宰测定了123只杂种鹅的胴体性状、羽绒性状和肉质性状,运用因子分析从这些性状中提取了12个公共因子;采用4种内切酶Hinf I、EarI、PstⅠ和PvuⅡ检测了鹅黑素皮质素受体-4(MC4R)基... 本研究利用皖西白鹅为父本与四川白鹅(母本)进行杂交,屠宰测定了123只杂种鹅的胴体性状、羽绒性状和肉质性状,运用因子分析从这些性状中提取了12个公共因子;采用4种内切酶Hinf I、EarI、PstⅠ和PvuⅡ检测了鹅黑素皮质素受体-4(MC4R)基因编码区的RFLP,并分析了RFLP与鹅重要经济性状之间的关联性。结果显示,试验鹅群中仅Hinf I酶切MC4R基因编码区存在RFLP,酶切得到HH和Hh 2种基因型,其1对等位基因H和h的频率分别为0.890 2和0.109 8。分析不同基因型与鹅胴体和羽绒性状之关联性表明,HH型与鹅屠体重、半(全)净膛重、肝脏重、心脏重、肌胃率、腹脂率、胸肌失水率以及绒比重具有显著的相关性,基因型效应对群体均数的贡献率在±5%之间;当MC4R基因突变后,Hh型的这种效应未能达到显著水平,但却与产脂力(3.314%)和脂肪酸品质(1.218%)(P<0.05)2个公共因子存在显著的相关性。 展开更多
关键词 mc4r基因 RFLP 经济性状
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MC4R基因沉默对牛成纤维细胞内基因表达的影响 被引量:3
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作者 黄萌 贤明 +6 位作者 史明艳 陈燕 张路培 高会江 李俊雅 许尚忠 高雪 《畜牧兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2017年第3期403-415,共13页
旨在研究黑素皮质激素4受体基因(Melanocortin-4receptor,MC4R)沉默对牛成纤维细胞内能量与脂肪代谢相关通路上基因表达的影响,进一步揭示MC4R基因与肉牛胴体品质以及能量平衡与脂肪代谢之间的关系。本试验使用MC4R被敲降的牛成纤维细胞... 旨在研究黑素皮质激素4受体基因(Melanocortin-4receptor,MC4R)沉默对牛成纤维细胞内能量与脂肪代谢相关通路上基因表达的影响,进一步揭示MC4R基因与肉牛胴体品质以及能量平衡与脂肪代谢之间的关系。本试验使用MC4R被敲降的牛成纤维细胞系,借助深度测序技术寻找试验组(MC4R敲降)和阴性对照组(MC4R未敲降)中表达量差异显著的基因。利用GO注释聚类分析和KEGG通路富集分析对涉及能量代谢、脂肪运输及相关调控通路的差异基因进行了深入的富集分析。随机选取差异表达基因中的10个基因,利用实时定量PCR对深度测序结果进行验证。此外,本研究借助牛SNP芯片对上述目标基因的单核苷酸多态性(SNP)进行了检测,并对136头西门塔尔牛进行了基于目标基因各SNP的基因型检测。基于各SNP的分型数据,本研究进一步利用PLINK软件对SNP与牛各胴体性状的关联性进行分析。通过深度测序,在两组阳性MC4R被敲降的牛成纤维细胞系中共发现7 799个差异表达基因,其中上调基因1 703个,下调基因6 096个。显著性GO分类在两组不同干扰水平处理组间共选出与能量代谢调节、脂肪运输过程相关的差异表达基因265个,功能聚类分析进一步筛选出与能量代谢相关的基因29个。KEGG通路富集分析发现,与能量代谢、脂肪运输等过程相关的265个差异表达基因共涉及到40个不同的通路,其中与MC4R基因及能量代谢调控有密切关联的Leptin、AGRP、NPY和POMC等基因同属于脂联素信号通路。MC4R敲降引起该通路上22个基因的表达发生显著变化。实时定量PCR结果表明,所选择的10个基因(表达量上调基因:CFB、RSAD2、IFIT3、CHI3L1和BOLA-N;表达量下调基因:UPK1B、IER2、LASS3、TGFβ3和AXUD1)的mRNA表达水平与测序结果无显著差异,从而证实了深度测序数据的准确性和可重复性。此外,借助50K密度的牛SNP芯片,本研究共发现了16个SNPs位点,共涉及11个目标基因。SNPs与牛各胴体性状的关联分析结果表明,10号染色体上的TGFβ3对西门塔尔牛眼肌面积、胴体重、腰部肉厚、大腿肉厚和外脊重有显著影响(P<0.05),对眼肉重、里脊重有极显著影响(P<0.01);同样位于10号染色体的RHOJ基因对西门塔尔牛眼肌面积也有显著影响(P<0.05)。19号染色体上的KRT17基因和7号染色体上VCAN基因均显著影响西门塔尔牛肉剪切力(P<0.01,P<0.05)。1号染色体的MASP1基因对肉色有显著影响(P<0.05)。结果显示,MC4R基因沉默显著影响牛成纤维细胞内参与能量代谢、脂肪代谢和能量稳态平衡调控过程相关基因的表达,进一步证实了MC4R基因能调控肉牛能量平衡和脂肪代谢以及影响肉牛胴体品质。 展开更多
关键词 mc4r基因 基因敲降 MRNA表达量 相关性分析
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鸡MC4R基因新突变位点的发现 被引量:5
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作者 陶勇 王金玉 +1 位作者 李国辉 胡玉萍 《安徽农业科学》 CAS 北大核心 2008年第11期4528-4529,4531,共3页
[目的]为深入研究鸡MC4R基因和分子育种提供参考。[方法]采用饱和酚/氯仿法从鸡血中提取DNA,利用PCR-SSCP和DNA测序的方法,对京海黄鸡MC4R基因的单核苷酸多态性进行分析。[结果]对PCR产物进行SSCP分析,2对引物均表现出多态性。引物A得到... [目的]为深入研究鸡MC4R基因和分子育种提供参考。[方法]采用饱和酚/氯仿法从鸡血中提取DNA,利用PCR-SSCP和DNA测序的方法,对京海黄鸡MC4R基因的单核苷酸多态性进行分析。[结果]对PCR产物进行SSCP分析,2对引物均表现出多态性。引物A得到2种基因型(AA型和AB型)。引物Z也得到2种基因型(CC型和CD型)。将测序结果与发表的鸡MC4R基因序列的比较结果进行比较,发现2个单核苷酸多态位点,其中A引物扩增序列中的多态位点为662 bp处G→C的点突变造成的,而Z引物扩增序列中的多态位点是由于在733~734 bp插入了一个C碱基引起的。[结论]该研究中未检测到BB和DD纯合基因型,这可能与在京海黄鸡培育过程中采用分子标记方法进行选择有关。 展开更多
关键词 京海黄鸡 mc4r基因 SNPS
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鸡基因MC3R和MC4R的RFLP多态性及其与胴体性状的相关性 被引量:2
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作者 曹顶国 周艳 +3 位作者 雷秋霞 韩海霞 李福伟 逯岩 《湖南农业大学学报(自然科学版)》 CAS CSCD 北大核心 2010年第5期556-560,共5页
采用PCR-RFLP方法,检测黑素皮质素受体3基因(MC3R)和受体4基因(MC4R)在济宁百日鸡、汶上芦花鸡和莱芜黑鸡中的多态性,并分析各多态位点不同基因型与鸡胴体性状的相关性,在3个供试群体中共检测到2个突变位点,分别在MC3R基因1424nt处(A→G... 采用PCR-RFLP方法,检测黑素皮质素受体3基因(MC3R)和受体4基因(MC4R)在济宁百日鸡、汶上芦花鸡和莱芜黑鸡中的多态性,并分析各多态位点不同基因型与鸡胴体性状的相关性,在3个供试群体中共检测到2个突变位点,分别在MC3R基因1424nt处(A→G)和MC4R基因923nt处(G→T),并据此分别建立了2个基因的DdeⅠ和FbrⅠ限制性内切酶检测体系.MC3R基因多态位点对活体重(P=0.0418)和胸肌重(P=0.0126)有显著影响;MC4R基因多态位点对肌间脂宽(P=0.0366)有显著影响.多重比较结果表明,在MC3R基因多态位点产生的3种基因型中,MN基因型个体的活体重和胸肌重均显著高于基因型MM个体和NN个体(P<0.05),屠体重和半净膛重均显著高于MM个体,全净膛重显著高于MN个体;MC4R基因多态位点产生的3种基因型中,AB基因型个体的屠体率和肌间脂宽均显著高于基因型BB个体(P<0.05). 展开更多
关键词 MC3R基因 mc4r基因 胴体性状
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MC4R基因表达及其与鸡屠宰性状的相关分析 被引量:2
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作者 任善茂 陶勇 +2 位作者 周俊 高勤学 王金玉 《中国畜牧兽医》 CAS 北大核心 2011年第1期119-122,共4页
根据鸡MC4R mRNA和看家基因β-actin mRNA序列,分别设计1对引物,以半定量RT-PCR法研究不同品种鸡肾上腺中MC4R基因mRNA表达水平,并分析了其与屠宰性状间的相关关系。结果表明,京海黄鸡公鸡MC4R基因在肾上腺中的表达水平显著高于尤溪麻... 根据鸡MC4R mRNA和看家基因β-actin mRNA序列,分别设计1对引物,以半定量RT-PCR法研究不同品种鸡肾上腺中MC4R基因mRNA表达水平,并分析了其与屠宰性状间的相关关系。结果表明,京海黄鸡公鸡MC4R基因在肾上腺中的表达水平显著高于尤溪麻鸡公鸡(P<0.05);京海黄鸡公鸡的胴体重、胸肌重、腿肌重与MC4R基因在肾上腺中表达水平存在极显著相关(P<0.01);尤溪麻鸡公鸡的胴体重与MC4R基因在肾上腺中表达水平存在极显著相关(P<0.01),胸肌重、腿肌重与MC4R基因在肾上腺中表达水平存在显著相关(P<0.05)。 展开更多
关键词 mc4r基因 基因表达 屠宰性状
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比格犬MC4R基因与肥胖的关系研究 被引量:1
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作者 王光川 张轶博 +1 位作者 吕金钢 巴彩凤 《安徽农业科学》 CAS 2012年第14期8090-8091,8160,共3页
[目的]探讨犬黑素皮质素受体-4(MC4R)基因与肥胖的关系。[方法]通过PCR-RFLP技术分析犬MC4R基因多态性与体重的关系。通过载体构建和细胞培养技术来构建犬MC4R基因的真核表达载体并转染MDCK细胞,研究该基因的体外表达情况。最后通过小... [目的]探讨犬黑素皮质素受体-4(MC4R)基因与肥胖的关系。[方法]通过PCR-RFLP技术分析犬MC4R基因多态性与体重的关系。通过载体构建和细胞培养技术来构建犬MC4R基因的真核表达载体并转染MDCK细胞,研究该基因的体外表达情况。最后通过小鼠尾静脉高压注射重组真核表达载体的方法进行动物试验。[结果]比格犬226 bp C/A多态性与体重呈显著相关。犬MC4R基因在MDCK细胞内成功表达。MC4R重组体裸质粒注射后小鼠的体重有明显变化。[结论]MC4R基因能够促进小鼠的体重增加。该基因与肥胖的发生密切相关,将为肥胖机制的研究提供理论依据。 展开更多
关键词 mc4r 基因转染 肥胖
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黑素皮质素受体4(MC4R)基因在5个地方鸡种中的遗传多态性分析 被引量:1
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作者 周艳 雷秋霞 +5 位作者 韩海霞 李福伟 高金波 刘玮 逯岩 曹顶国 《山东农业科学》 2017年第8期127-130,共4页
本试验采用PCR-SSCP和PCR-RFLP方法分析了黑素皮质素受体4(MC4R)基因在5个地方鸡种中的遗传多态性,结果在5个供试鸡群体中检测到两个突变位点。在NC_006089.4:g.54 C>G位点中,CC基因型在莱芜黑鸡和琅琊鸡中均没有检测到,CG杂合型在... 本试验采用PCR-SSCP和PCR-RFLP方法分析了黑素皮质素受体4(MC4R)基因在5个地方鸡种中的遗传多态性,结果在5个供试鸡群体中检测到两个突变位点。在NC_006089.4:g.54 C>G位点中,CC基因型在莱芜黑鸡和琅琊鸡中均没有检测到,CG杂合型在汶上芦花鸡中表现为优势基因型,突变型GG基因型在其余4个群体中表现为优势基因型,等位基因G在所有供试群体中表现为优势等位基因。在NC_006089.4:g.315位点中,GT杂合型在汶上芦花鸡中表现为优势基因型,GG野生型在其余4个群体中表现为优势基因型,等位基因G在除汶上芦花鸡以外的4个群体中表现为优势等位基因。 展开更多
关键词 mc4r基因 PCR-SSCP PCR-RFLP 遗传多态性
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大白猪MC4R、CDC16基因多态性及其与生长性状的关联分析 被引量:14
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作者 赵聪哲 罗晓彤 +2 位作者 李兆华 张志彬 于永生 《中国畜牧兽医》 CAS 北大核心 2019年第3期792-799,共8页
本研究旨在利用高分辨率熔解曲线(high resolution melt,HRM)分型方法检测大白猪黑素皮质素受体(melanocortin-4 receptor,MC4R)和细胞分裂周期蛋白16(cell division cycle 16,CDC16)基因的多态性,并对其与大白猪的生长性状进行关联性... 本研究旨在利用高分辨率熔解曲线(high resolution melt,HRM)分型方法检测大白猪黑素皮质素受体(melanocortin-4 receptor,MC4R)和细胞分裂周期蛋白16(cell division cycle 16,CDC16)基因的多态性,并对其与大白猪的生长性状进行关联性分析。试验共采集246头大白猪的耳组织样提取基因组DNA,对小群体样本进行PCR扩增后,通过测序方法寻找两个基因在该群体中的多态性位点,针对已发现的多态性位点设计HRM专用引物,利用HRM方法对大群体进行多态性检测,将所得结果与大白猪生长性状进行关联性分析。结果表明,在MC4R基因序列中检测到1个突变位点2207A>G,2个等位基因:A和G,3个基因型:AA、AG和GG;在CDC16基因第18外显子上检测到了1个突变位点837T>C,2个等位基因:T和C,2种基因型:TT和CT。χ~2适合性检验结果显示,2个基因的基因型频率和等位基因频率在2个种群中分布差异不显著,符合Hardy-Weinberg平衡定律(P>0.05)。多态信息含量(PIC)分析显示,MC4R基因在2个群体中均处于中度多态(0.25<PIC<0.5),而CDC16基因在2个群体中均处于低度多态(PIC<0.25)。关联分析结果发现,MC4R基因对大白猪体重及日增重具有显著影响(P<0.05),CDC16基因对大白猪体高、体长和体重等均具有显著影响(P<0.05)。综上所述,MC4R与CDC16基因对大白猪的生长发育具有一定的影响,为后续大白猪肉质性状与生长性状的现代分子选育提供参考。 展开更多
关键词 大白猪 mc4r基因 CDC16基因 多态性 高分辨率熔解曲线
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鹌鹑MC4R基因编码区群体遗传变异检测分析 被引量:1
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作者 查明恒 李明丽 +1 位作者 兰国湘 鲁绍雄 《云南农业大学学报(自然科学版)》 CAS CSCD 北大核心 2011年第4期484-487,共4页
根据GenBank数据库提供的鹌鹑黑素促黑素受体4(MC4R)基因序列,设计出5对扩增引物,采用PCR-SSCP分段检测方法对朝鲜鹌鹑MC4R基因外显子区域的多态性进行了检测,并对存在多态性的DNA片段进行了序列测定。SSCP分析的结果显示,第4号引物扩... 根据GenBank数据库提供的鹌鹑黑素促黑素受体4(MC4R)基因序列,设计出5对扩增引物,采用PCR-SSCP分段检测方法对朝鲜鹌鹑MC4R基因外显子区域的多态性进行了检测,并对存在多态性的DNA片段进行了序列测定。SSCP分析的结果显示,第4号引物扩增的基因片段具有明显的多态性,并检测到了3种基因型(AA型,AB型,BB型)。将测序结果与GenBank数据库中鹌鹑MC4R基因序列进行比对,发现了一个单核苷酸多态性(SNP)位点:855bp位点存在一个T→C同义转换突变。基因型AA,AB和BB的频率分别为0.193 3,0.686 7和0.120 0;等位基因A和B的频率分别为0.536 7和0.463 3;多态信息含量(PIC)和杂合度(H)分别为0.373 6和0.497 4;χ2检验的结果表明,该突变位点的基因频率未处于Hardy-Weinberg平衡状态(P<0.01)。 展开更多
关键词 鹌鹑 mc4r基因 单核苷酸多态性
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黔北麻羊MC4R基因多态性及其与生长性状的关联分析 被引量:1
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作者 龙安炬 杨酸 +4 位作者 艾锦新 翁吉梅 张依裕 蔡惠芬 罗卫星 《中国畜牧兽医》 CAS CSCD 北大核心 2023年第1期198-209,共12页
【目的】探究黔北麻羊黑素皮质素受体-4(melanocortin receptor-4,MC4R)基因多态性及其与生长性状的关联性,为黔北麻羊的选种选育提供理论依据。【方法】选取196只6月龄黔北麻羊,利用DNA混合池结合Sanger测序筛选MC4R基因单核苷酸多态性... 【目的】探究黔北麻羊黑素皮质素受体-4(melanocortin receptor-4,MC4R)基因多态性及其与生长性状的关联性,为黔北麻羊的选种选育提供理论依据。【方法】选取196只6月龄黔北麻羊,利用DNA混合池结合Sanger测序筛选MC4R基因单核苷酸多态性(SNP)位点,并采用SPSS 22.0软件中的一般线性模型(GLM)对MC4R基因SNP位点与黔北麻羊生长性状进行关联分析。【结果】在黔北麻羊MC4R基因中发现4个SNPs位点:g.59345469 C>A和g.59346773 T>C位点分别位于5′-和3′-端非编码区(UTR);g.59345871 A>C位点突变导致第37位天冬氨酸(Asp)变为丙氨酸(Ala),引起RNA二级结构及蛋白质二级结构、三级结构发生明显改变;g.59346263 A>G位点突变导致第168位异亮氨酸(Ile)变为缬氨酸(Val),对RNA二级结构和蛋白质二级结构有明显影响。关联分析结果显示,g.59345469 C>A位点对黔北麻羊体重、胸围和管围均有显著影响(P<0.05);g.59345871 A>C位点对黔北麻羊体重、体高、管围和胸围均有显著影响(P<0.05);g.59346263 A>G位点对黔北麻羊体高、体重和胸围均有显著影响(P<0.05);g.59346773 T>C位点对黔北麻羊体重和胸围均有显著影响(P<0.05)。4个SNPs位点联合共检测到9种单倍型和21种双倍型,其联合对黔北麻羊体重、体高、胸围和管围均产生显著遗传效应(P<0.05),纯合双倍型H5H5(AAAAGGCC)个体的生长性状优于其他双倍型。【结论】黔北麻羊MC4R基因存在4个SNPs位点,与黔北麻羊体重和胸围均存在显著关联,可作为黔北麻羊体重和胸围的遗传标记用于分子育种。 展开更多
关键词 黔北麻羊 mc4r基因 单核苷酸多态性(SNP) 生长性状
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从江香猪MC4R基因SNP位点遗传性状及关联性分析 被引量:2
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作者 李俊 毛世明 +9 位作者 陈大芳 龙清孟 李平 周迪 张勇 张雄 冯文武 谭晓山 李波 申金容 《养猪》 2019年第5期73-77,共5页
试验研究MC4R基因多态性与从江香猪胴体性状的关联性,寻找影响从江香猪胴体性状的数量性状基因座(QTL),为分子标记辅助选择提供依据;利用DNA直接测序技术,对从江香猪MC4R基因的G1577A、G1699A、T1702A位点进行基因分型,采用SHEsis在线... 试验研究MC4R基因多态性与从江香猪胴体性状的关联性,寻找影响从江香猪胴体性状的数量性状基因座(QTL),为分子标记辅助选择提供依据;利用DNA直接测序技术,对从江香猪MC4R基因的G1577A、G1699A、T1702A位点进行基因分型,采用SHEsis在线软件构建单倍型。在受试群体中,发现MC4R基因的3个SNP位点均有3种基因型,构建4种单倍型,其中H3、H4、H1为主要单倍型,频率分别为42.3%、29.0%、25.7%;最小二乘分析发现,3个SNP位点与肌内脂肪、眼肌面积、背膘厚、皮厚差异性均不显著(P>0.05)。在G1577A位点上,GA基因型的肌内脂肪、背膘厚、皮厚指标依次高于GG基因型和AA基因型;而眼肌面积为:GG基因型依次高于GA基因型和AA基因型。对于G1699A位点和T1702A位点,肌内脂肪为:EF基因型>EE基因型>FF基因型,MN基因型>MM基因型>NN基因型;眼肌面积、背膘厚、皮厚为:EE基因型>EF基因型>FF基因型,MM基因型>MN基因型>NN基因型。可以考虑将GA、EF、MN基因型作为影响从江香猪肌内脂肪的有利基因型,将GG、EE、MM基因型作为影响眼肌面积的有利基因型,将AA、FF、NN基因型作为影响背膘厚和皮厚有利基因型。 展开更多
关键词 从江香猪 mc4r基因 多态性 胴体性状
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抗浪鱼MC4R基因的PCR扩增及序列分析
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作者 王汝邦 毕保良 +5 位作者 邓君明 武祥伟 吴志蕾 李永能 查明恒 孔令富 《安徽农业科学》 CAS 2014年第17期5385-5386,5397,共3页
[目的]对抗浪鱼MC4R基因进行PCR扩增。[方法]采用PCR方法,依据鲫鱼的黑素促黑素受体-4(MC4R)基因保守区的核苷酸序列,采用引物设计软件,对抗浪鱼的MC4R基因设计出一对引物进行PCR扩增和纯化测序,并利用phylip软件对抗浪鱼和其他已知MC4... [目的]对抗浪鱼MC4R基因进行PCR扩增。[方法]采用PCR方法,依据鲫鱼的黑素促黑素受体-4(MC4R)基因保守区的核苷酸序列,采用引物设计软件,对抗浪鱼的MC4R基因设计出一对引物进行PCR扩增和纯化测序,并利用phylip软件对抗浪鱼和其他已知MC4R基因序列的鱼类构建基因进化树。[结果]抗浪鱼MC4R基因的扩增长度为1 001 bp。9种鱼类的MC4R核苷酸序列聚为2大类。其中,比目鱼单独聚为一类;斑剑尾鱼、舌齿鲈、白斑角鲨、斑马鱼、抗浪鱼、黑青斑河豚、中华多纪豚和红旗东方豚聚为一类。[结论]抗浪鱼与斑马鱼的亲缘关系最近,与比目鱼的亲缘关系最远。 展开更多
关键词 抗浪鱼 mc4r基因 多聚酶链反应 进化树
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巴什拜羊MC4R基因多态性及其与生长性状的关联分析 被引量:7
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作者 黄李勇 赵雄 +2 位作者 曼则热.朱尔丁 吐尔逊阿依.牙力坤 依明.苏来曼 《草食家畜》 2018年第3期17-23,共7页
试验旨在研究黑素皮质素受体-4(melanocortin-4 receptor,MC4R)基因在巴什拜羊中的多态性及其与生长性状的关系,探寻可用于巴什拜羊选育的分子遗传标记。试验以随机采取的300只巴什拜羊个体的血样作为试验材料,运用PCR-SSCP和DNA测序等... 试验旨在研究黑素皮质素受体-4(melanocortin-4 receptor,MC4R)基因在巴什拜羊中的多态性及其与生长性状的关系,探寻可用于巴什拜羊选育的分子遗传标记。试验以随机采取的300只巴什拜羊个体的血样作为试验材料,运用PCR-SSCP和DNA测序等技术对MC4R基因的部分外显子进行遗传多态性检测并与生长性状进行关联性分析。结果发现:巴什拜羊中MC4R基因有多态性,存在2种基因型:GG和GC,且处于Hardy-Weinberg平衡(P>0.05),多态信息含量为0.159,属于低度多态(PIC<0.25)。测序结果显示,与原基因碱基序列相比,MC4R基因碱基序列在893(G→C)处发生突变。与巴什拜羊生长性状进行关联分析可知,GC型个体的胸围和体重都显著高于GG型个体(P<0.05)。巴什拜羊MC4R基因在G893C处表现的多态有可能作为一种遗传标记。 展开更多
关键词 巴什拜羊 mc4r基因 生长性状 多态性
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MC4R基因研究进展 被引量:12
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作者 左北瑶 钱宏光 《中国草食动物》 2011年第5期45-50,共6页
黑素皮质素受体-4(melanocortin-4 receptor,MC4R)是下丘脑腹内侧核分泌的一类肽类物质,为黑素皮质素受体家族5个亚型(MC1-5R)之一。在哺乳动物中,MC4R具有介导瘦蛋白(leptin)的功能,是一个调节能量平衡与能量动态平衡的重要信号分子,... 黑素皮质素受体-4(melanocortin-4 receptor,MC4R)是下丘脑腹内侧核分泌的一类肽类物质,为黑素皮质素受体家族5个亚型(MC1-5R)之一。在哺乳动物中,MC4R具有介导瘦蛋白(leptin)的功能,是一个调节能量平衡与能量动态平衡的重要信号分子,可与其内源性配体黑素皮质素激素(melanocortin,MC)或刺鼠色蛋白(agouti protein,agouti蛋白)和agouti相关蛋白(agouti related protein,AGRP)相结合,从而在控制食欲和体重稳态中起关键作用。因此,MC4R在人类肥胖研究中作为重要的调节因子倍受关注。最近有研究表明:MC4R的1232位点的G→A的突变与绵羊背膘厚度间存在关联,AG和AA型较GG型具有较高的背膘厚度。 展开更多
关键词 黑素皮质素受体-4(mc4r) mc4r基因多态性 肥胖调节因子 背膘厚度
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MC4R基因、SIM1基因在从江香猪不同组织中的mRNA表达规律研究
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作者 李俊 毛世明 +8 位作者 周迪 冯文武 李平 陈大芳 龙清孟 李建伟 谢艳 王舍 唐明宗 《养猪》 2020年第3期65-68,共4页
研究MC4R基因、SIM1基因在从江香猪不同组织中mRNA差异表达规律,探寻影响从江香猪能量代谢和脂肪沉积的数量性状基因座(QTL),为分子标记辅助选择提供依据。研究以从江香猪为试验材料,应用实时荧光定量PCR技术,检测MC4R基因、SIM1基因在... 研究MC4R基因、SIM1基因在从江香猪不同组织中mRNA差异表达规律,探寻影响从江香猪能量代谢和脂肪沉积的数量性状基因座(QTL),为分子标记辅助选择提供依据。研究以从江香猪为试验材料,应用实时荧光定量PCR技术,检测MC4R基因、SIM1基因在从江香猪不同组织的mRNA相对表达量。结果显示,MC4R基因、SIM1基因在从江香猪各组织中均有表达,不同组织之间的相对表达量存在差异,MC4R基因相对表达量依次为:脾脏>小肠>脂肪>肝脏>肺>胃>心脏>肾脏>背肌,SIM1基因相对表达量依次为:脾脏>肾脏>脂肪>肝脏>小肠>胃>肺>心脏>背肌。 展开更多
关键词 从江香猪 mc4r基因 SIM1基因 相对表达量
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飞行时间质谱法检测水牛黑素皮质素受体4基因多态性 被引量:5
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作者 邓廷贤 庞春英 +4 位作者 朱鹏 段安琴 陆杏蓉 杨炳壮 梁贤威 《中国畜牧兽医》 CAS 北大核心 2015年第7期1800-1806,共7页
应用基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱技术(MALDI-TOF-MS)检测水牛黑素皮质素受体4(MC4R)基因的多态性(SNPs),为今后建立水牛辅助标记选择策略奠定基础。以水牛MC4R基因序列为模板,利用PCR扩增测序法筛查了水牛MC4R基因13个SNPs。为进... 应用基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱技术(MALDI-TOF-MS)检测水牛黑素皮质素受体4(MC4R)基因的多态性(SNPs),为今后建立水牛辅助标记选择策略奠定基础。以水牛MC4R基因序列为模板,利用PCR扩增测序法筛查了水牛MC4R基因13个SNPs。为进一步验证筛选的可靠性,应用MALDI-TOF-MS针对380头水牛检测了8个标记的基因型。结果显示,平均检出率为98.0%,能够准确的检测出3种常见的基因型。所检SNP位点的平均最小等位基因频率(MAF)为0.24,平均杂合度为0.28,平均多态信息含量(PIC)为0.23。本研究建立的基于PCR测序法联合MALDI-TOF-MS检测水牛MC4R基因多态性的方法,具有快速、可靠和准确的特点,为今后开展水牛生产性状基因的SNP分型和检测等研究奠定了基础。 展开更多
关键词 水牛 飞行时间质谱 黑素皮质素受体4基因 SNPS
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延边黄牛黑皮质素受体-4基因多态性及其与肉质性状的相关性分析 被引量:6
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作者 冯健 李英花 严昌国 《中国畜牧兽医》 CAS 北大核心 2017年第5期1406-1413,共8页
试验旨在探索调控肉牛脂肪沉积的关键基因对肉质性状的影响,筛选影响肉牛育肥性状的候选基因。本研究以157头24月龄、体重相近的延边黄牛为研究对象,利用PCR扩增直接测序的方法,分析了延边黄牛黑皮质素受体-4(melanocortin-4receptor,MC... 试验旨在探索调控肉牛脂肪沉积的关键基因对肉质性状的影响,筛选影响肉牛育肥性状的候选基因。本研究以157头24月龄、体重相近的延边黄牛为研究对象,利用PCR扩增直接测序的方法,分析了延边黄牛黑皮质素受体-4(melanocortin-4receptor,MC4R)基因的SNPs及其与肉质性状的相关性。结果发现,延边黄牛MC4R基因在1 069bp处存在C→G突变,导致L(亮氨酸)转变为V(缬氨酸),引起蛋白质二级结构在166、243、280位氨基酸处出现α螺旋、β折叠丢失,导致三级结构中β转角的空间位置改变。经关联分析表明,该位点与延边黄牛背膘厚、亮度、黄度都存在不同程度的相关,其中GG基因型背膘厚与屠宰后黄度(3d)显著高于CC和CG基因型(P<0.05);GG、CG基因型屠宰后亮度显著高于CC基因型(P<0.05)。说明该位点与延边黄牛肉质性状存在显著相关,该突变位点可作为潜在的分子标记。 展开更多
关键词 延边黄牛 mc4r基因 SNPS 肉质性状
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陆川猪黑皮质激素受体4基因克隆及序列分析 被引量:3
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作者 谢婉 刘明君 +10 位作者 何剑雄 申玉建 陈宝剑 关志惠 张名媛 郭亚芬 兰干球 蒋钦杨 杨秀荣 梁晶 谢炳坤 《中国畜牧兽医》 CAS 北大核心 2018年第2期320-329,共10页
试验旨在对陆川猪黑皮质激素受体4(melanocortin-4receptor,MC4R)基因进行克隆及相关信息学分析。通过提取陆川猪背最长肌总RNA,采用RT-PCR、克隆等方法获得含目的基因MC4R的质粒pMD18-T-MC4R,经菌落PCR和测序鉴定正确后,应用相关生物... 试验旨在对陆川猪黑皮质激素受体4(melanocortin-4receptor,MC4R)基因进行克隆及相关信息学分析。通过提取陆川猪背最长肌总RNA,采用RT-PCR、克隆等方法获得含目的基因MC4R的质粒pMD18-T-MC4R,经菌落PCR和测序鉴定正确后,应用相关生物信息学软件对陆川猪MC4R基因的理化性质、蛋白质的结构、修饰结构和亚细胞定位等进行预测分析。结果表明,MC4R基因CDS区长999bp,编码332个氨基酸,与NCBI上公布的野猪MC4R基因序列中的CDS区存在4个碱基差异,其中175和906bp处为同义突变,110和278bp处为错义突变,分别引起第37位谷氨酸变为甘氨酸和第93位缬氨酸变为丙氨酸。同源性比对结果发现,MC4R基因在不同物种及进化的过程中具有较高的保守性。陆川猪MC4R蛋白有明显的疏水区域,不存在信号肽,但有7个跨膜结构域,其编码蛋白的二级结构元件有α-螺旋、延伸链、β-转角和无规则卷曲。修饰结构预测表明,MC4R蛋白存在多处N糖基化位点,但无O糖基化位点,可能主要分布于内质网和囊泡。本研究成功克隆了陆川猪MC4R基因,为更好地开发利用地方品种陆川猪及其繁育奠定理论基础。 展开更多
关键词 陆川猪 mc4r基因 克隆
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