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E Protein Prokaryotic Expression of Avian Infectious Bronchitis Virus
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作者 WEI Ping ZHANG Fang +3 位作者 MING Xiaobo ZENG Xiangwei ZHU Yuqing WANG Lin 《Journal of Northeast Agricultural University(English Edition)》 CAS 2008年第3期31-35,共5页
The small envelope protein (E) gene of avian infectious bronchitis virus (IBV) M41 strain was cloned, and then it was subcloned into prokaryotic expressing vector pGEX-6P-1. The recombinant plasmid was transformed... The small envelope protein (E) gene of avian infectious bronchitis virus (IBV) M41 strain was cloned, and then it was subcloned into prokaryotic expressing vector pGEX-6P-1. The recombinant plasmid was transformed into E.coli. BL21 and induced by IPTG. SDS-PAGE result showed that when objective protein fused with GST (about 20 ku), the relative molecular mass of fusion protein was 38 ku. It indicated that objective protein was about 12.4 ku. The result showed that E protein was expressed successfully, it was useful to the subsequent E protein research. 展开更多
关键词 avian infectious bronchitis virus (IBV) CORONAVIRUS small envelope protein (E) protein expression
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Prokaryotic Expression of IBV N Protein and Development of Indirect IBV N Protein-mediated ELISA
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作者 Li Wei-qun Wang Xin +6 位作者 Zhong Ming Sun Xiao-qi Zhao Lei Huang Xiao-dan Zhang Rui-li Li Guang-xing 《Journal of Northeast Agricultural University(English Edition)》 CAS 2020年第1期69-79,共11页
Avian infectious bronchitis(IB)is an acute and highly contagious disease caused by infectious bronchitis virus(IBV).In the study,according to IBV gene sequences published in Gen Bank,specific primers were designed to ... Avian infectious bronchitis(IB)is an acute and highly contagious disease caused by infectious bronchitis virus(IBV).In the study,according to IBV gene sequences published in Gen Bank,specific primers were designed to clone N gene by RT-PCR,and this gene was inserted into p ET-30a(+)vector resulting in a prokaryotic expression plasma p ET-30a-N.The results of SDS-PAGE and Western Blot analysis showed that the recombinant protein was expressed successfully and had good reactivity with IBV positive serum.Using purified recombinant N protein as a coating antigen,the indirect ELISA protocol was established and optimized,in which N protein was 2.5μg·m L^-1 of concentration,sample serum of 1:40 dilution.For clinical specimen,the IBV antibodies could be detected by this method efficiently and got nearly the same results as those of IBV-mediated ELISA.It would provide a good tool for rapid diagnosis and epidemiological study of avian infectious bronchitis. 展开更多
关键词 INFECTIOUS BRONCHITIS virus N protein PROKARYOTIC expression indirect ELISA
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Molecular Cloning,Expression,and Characterization of an Adenylyl Cyclase-associated Protein from Gossypium arboreum Fuzzless Mutant
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作者 WANG Sheng,ZHAO Guo-hong,JIA Yin-hua,DU Xiong-ming(Cotton Research Institute,Chinese Academy of Agricultural Sciences Key Laboratory of Cotton Genetic Improvement,Ministry of Agriculture,Anyang,Henan 455000,China) 《棉花学报》 CSCD 北大核心 2008年第S1期69-,共1页
CAP,an adenylyl cyclase-associated protein,is predicted to be involved in cytoskeletal organization and signal transduction.Recently,we found that CAP may play an important role in fuzz-like fiber cell initiation in c... CAP,an adenylyl cyclase-associated protein,is predicted to be involved in cytoskeletal organization and signal transduction.Recently,we found that CAP may play an important role in fuzz-like fiber cell initiation in cotton.For the further research,we isolated two CAP homologues from wild 展开更多
关键词 Molecular Cloning expression and Characterization of an Adenylyl Cyclase-associated protein from Gossypium arboreum Fuzzless Mutant CAP
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Molecular Cloning and Expression Analysis of a Cys2/His2 Type Zinc Finger Protein Gene in Upland Cotton
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作者 YANG Yu-wen,NI Wan-chao,ZHANG Bao-long,SHEN Xin-lian(Jiangsu Academy of Agriculture Sciences,48 Zhonglinjie Street,Nanjing,Jiangsu 210014,China) 《棉花学报》 CSCD 北大核心 2008年第S1期73-,共1页
The zinc finger proteins belong to the largest family of transcription factors.But there is little research of Cys2/His2 type zinc finger proteins in cotton,and there is no submission of correlating
关键词 CYS Molecular Cloning and expression Analysis of a Cys2/His2 Type Zinc Finger protein Gene in Upland Cotton
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Predictive value of thymidylate synthase expression in advanced colorectal cancer patients receiving fluoropyrimidine-based chemotherapy. Evidence from 24 studies 被引量:8
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作者 Qiu, Li-Xin Tang, Qi-Yun +4 位作者 Bai, Jian-Ling Qian , Xiao-Ping Li, Ru-Tian Liu, Bao-Rui Zheng, Ming-Hua 《南京医科大学学报(自然科学版)》 CAS CSCD 北大核心 2008年第12期1632-1632,共1页
关键词 胸苷酸 合成酶 肠癌 氟嘧啶 化疗方法
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Eukaryotic Expression and Activity Analysis of Capsid Gene of Swine Vesicular Disease Virus HK/70
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作者 TIAN Hong WU Jingyan SHANG Youjun YING Shuanghui ZHENG Haixue LIU Xiangtao XIE Qingge 《Journal of Northeast Agricultural University(English Edition)》 CAS 2009年第4期25-30,共6页
The capsid protein precursor (P1), which plays a major role for the generation of polypeptides of swine vesicular disease virus (SVDV), was cloned from SVDV HK/70 strain into the retroviral vector pBABE puro and e... The capsid protein precursor (P1), which plays a major role for the generation of polypeptides of swine vesicular disease virus (SVDV), was cloned from SVDV HK/70 strain into the retroviral vector pBABE puro and expressed in the mammalian cell line PK15 through the retroviral expression system. The activity of recombinant protein to induce immune response was evaluated in guinea pigs. IFA and Western Blot were used to detect the recombinant protein expression. The results showed that the recombinant protein could be recognized by SVDV positive serum, and animal test showed SVDV-specific antibodies. All of those results indicate that a retroviral-based vaccine carrying the capsid protein precursor (P1) of SVD is able to be expressed in the eukaryotic cell and elicites strong SVDV-specific immune responses in guinea pigs. 展开更多
关键词 swine vesicular disease virus capsid protein precursor gene gene expression immune response
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猪lncRNA5791的表达模式及互作蛋白质分析 被引量:1
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作者 张冬杰 马守正 +1 位作者 汪亮 刘娣 《江苏农业学报》 北大核心 2025年第1期112-118,共7页
为了揭示冷刺激下lncRNA5791的应答模式,本研究利用实时荧光定量PCR技术(qRT-PCR)、核质分离技术、RNA沉降(Pull down)技术全面分析lncRNA5791生物功能。结果表明,lncRNA5791在冷刺激处理的民猪背部脂肪和腹股沟脂肪中相对表达量较高,... 为了揭示冷刺激下lncRNA5791的应答模式,本研究利用实时荧光定量PCR技术(qRT-PCR)、核质分离技术、RNA沉降(Pull down)技术全面分析lncRNA5791生物功能。结果表明,lncRNA5791在冷刺激处理的民猪背部脂肪和腹股沟脂肪中相对表达量较高,在臀部脂肪中相对表达量较低。冷刺激处理后猪不同部位脂肪中lncRNA5791的相对表达量均极显著高于常温对照(P<0.01)。lncRNA5791定位于猪的9号染色体,其在细胞核和细胞质中均有分布。在脂肪细胞增殖期,lncRNA5791的表达持续受到抑制;在脂肪细胞分化期,lncRNA5791的相对表达量呈现先升高后下降的趋势。质谱分析结果表明,lncRNA5791可能与膜联蛋白A2(ANXA2)、泛素A52残留核糖体蛋白融合产物1(UBA52)和组蛋白H4(H4)互作。本研究结果为揭示lncRNA5791在冷刺激应答中的具体调控机制奠定了重要基础。 展开更多
关键词 lncRNA5791 相对表达量 亚细胞定位 互作蛋白
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西瓜NPR基因家族的鉴定及其在盐胁迫下的表达分析 被引量:1
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作者 贾云鹤 《中国瓜菜》 北大核心 2025年第1期16-24,共9页
以拟南芥NPR基因家族成员蛋白序列为查询序列,在西瓜基因组数据库中鉴定西瓜NPR基因家族成员,并对其进行生物信息学分析及盐胁迫下的表达分析。共鉴定到4个成员,将其命名为ClNPR1~ClNPR4,其编码蛋白的理化性质、保守功能结构域、重要氨... 以拟南芥NPR基因家族成员蛋白序列为查询序列,在西瓜基因组数据库中鉴定西瓜NPR基因家族成员,并对其进行生物信息学分析及盐胁迫下的表达分析。共鉴定到4个成员,将其命名为ClNPR1~ClNPR4,其编码蛋白的理化性质、保守功能结构域、重要氨基酸残基及motif分析结果与其他物种有较高的一致性,顺式作用元件分析显示,ClNPRs与非生物胁迫相关。300 mmol·L^(-1)NaCl处理耐盐材料和盐敏感材料,分别取盐胁迫0、8、24 h的叶片进行4个NPR基因的表达模式分析,结果表明,ClNPR1在盐敏感和耐盐材料中都显著上调表达,但盐胁迫24 h,ClNPR1在盐敏感材料中显著下调表达,在耐盐材料中虽然下调但还保持较高的表达水平,且在耐盐材料中的表达量显著高于盐敏感材料;盐胁迫24 h,ClNPR2和ClNPR3在盐敏感和耐盐材料中都显著上调表达,在耐盐材料中的表达量均显著高于盐敏感材料。推测ClNPRs基因在西瓜响应盐胁迫的过程中扮演重要角色。 展开更多
关键词 西瓜 NPR家族蛋白 盐胁迫 表达
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沙糖橘几丁质酶基因orange1.1t05124的克隆及原核表达
9
作者 胡亚平 陈聪 +4 位作者 吉前华 郭雁君 郭丽英 蒋惠 杨凤梅 《中国南方果树》 北大核心 2025年第1期9-15,共7页
柑橘几丁质酶作为一种重要的抗真菌蛋白,可以降解真菌细胞壁中的几丁质。利用沙糖橘的cDNA文库克隆了沙糖橘几丁质酶基因orange1.1t05124。该基因位于第8染色体末端,包含3个外显子。将该基因克隆到pEASY-Blunt E1载体中,测序验证序列无... 柑橘几丁质酶作为一种重要的抗真菌蛋白,可以降解真菌细胞壁中的几丁质。利用沙糖橘的cDNA文库克隆了沙糖橘几丁质酶基因orange1.1t05124。该基因位于第8染色体末端,包含3个外显子。将该基因克隆到pEASY-Blunt E1载体中,测序验证序列无误,随后转入大肠杆菌BL21(DE3)中,经异丙基-β-硫代半乳糖苷(IPTG)诱导生成了目的蛋白,十二烷基硫酸钠-聚丙烯酰胺凝胶电泳(SDS-PAGE电泳)验证成功表达,在产物的包涵体中纯化到了目标蛋白。通过生物信息学分析发现,该蛋白具有信号肽,定位在细胞外,是单体的球状蛋白质。通过进化树分析发现,该几丁质酶在植物中广泛存在同源蛋白质,且都含有GH19几丁质酶催化结构域。对柑橘几丁质酶基因进行克隆和表达,可为了解该基因家族的抗病机理和开发基于几丁质酶的新型生物农药、生物肥料提供基因资源。 展开更多
关键词 沙糖橘 几丁质酶基因 原核表达 抗真菌蛋白质
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木碱蓬磷酸乙醇胺甲基转移酶基因SdNMT的原核表达及分离纯化
10
作者 马盼盼 祝建波 孙国清 《西北农业学报》 北大核心 2025年第8期1476-1483,共8页
磷酸乙醇胺甲基转移酶是一种S-腺苷甲硫氨酸依赖性甲基转移酶,是催化磷酸乙醇胺三步甲基化合成磷酸胆碱的关键酶,而磷酸胆碱是植物中磷脂酰胆碱和甘氨酸甜菜碱生物合成的重要前体。木碱蓬转录组测序分析结果显示,磷酸乙醇胺甲基转移酶... 磷酸乙醇胺甲基转移酶是一种S-腺苷甲硫氨酸依赖性甲基转移酶,是催化磷酸乙醇胺三步甲基化合成磷酸胆碱的关键酶,而磷酸胆碱是植物中磷脂酰胆碱和甘氨酸甜菜碱生物合成的重要前体。木碱蓬转录组测序分析结果显示,磷酸乙醇胺甲基转移酶基因在盐胁迫下显著上调表达。本研究以800 mmol/L NaCl处理1 d的cDNA为模板扩增获得木碱蓬磷酸乙醇胺甲基转移酶基因SdNMT的编码区序列,构建原核表达载体pET28a-SdNMT并导入大肠杆菌菌株BL21。对重组蛋白进行IPTG诱导表达、表达条件筛选优化及可溶性分析,采用镍亲和层析柱纯化目标蛋白。结果显示,成功克隆的SdNMT基因编码区序列长1 485 bp,编码494个氨基酸,预测蛋白分子质量为56.56 ku,理论等电点为5.52。重组蛋白在大肠杆菌中得到可溶性表达。1.0 mmol/L IPTG,15℃培养振荡16 h是目的蛋白诱导表达的最佳条件。通过Ni NTA beads 6FF纯化获得在毫克级范围内获得纯度达85%的SdNMT蛋白。研究结果为蛋白酶活性检测提供足够的材料,为深入分析SdNMT在植物生长、发育及环境胁迫响应中的功能奠定基础。 展开更多
关键词 木碱蓬 SdNMT 原核表达 蛋白纯化
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黄瓜绿斑驳花叶病毒MP基因的原核表达及抗血清制备
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作者 任春梅 程兆榜 +4 位作者 杨柳 李硕 王海涛 陆芳 季英华 《热带作物学报》 北大核心 2025年第9期2181-2189,共9页
黄瓜绿斑驳花叶病毒(Cucumber green mottle mosaic virus,CGMMV)是危害瓜类作物的重要植物病毒之一,其运动蛋白(movement protein,MP)在病毒传播和致病过程中起关键作用。本研究通过RT-PCR克隆CGMMV的MP基因,构建原核表达载体pET-32a-... 黄瓜绿斑驳花叶病毒(Cucumber green mottle mosaic virus,CGMMV)是危害瓜类作物的重要植物病毒之一,其运动蛋白(movement protein,MP)在病毒传播和致病过程中起关键作用。本研究通过RT-PCR克隆CGMMV的MP基因,构建原核表达载体pET-32a-MP,并在大肠杆菌BL21(DE3)中成功诱导表达分子量约48 kDa的重组MP融合蛋白。利用镍柱亲和层析纯化获得高纯度蛋白(纯度≥80%),以此免疫新西南大白兔制备多克隆抗体。Western blot和ELISA分析表明,抗血清效价达409600,且能特异性识别CGMMV侵染叶片中的MP蛋白,与烟草花叶病毒(Tobacco mosaic virus,TMV)、西瓜花叶病毒(Watermelon mosaic virus,WMV)等其他病毒无交叉反应。本研究实现了CGMMV MP蛋白的原核高效表达与特异性抗体制备,为病毒快速检测、免疫组织化学及蛋白功能研究提供重要工具,对保障瓜类作物安全生产具有重要意义。 展开更多
关键词 黄瓜绿斑驳花叶病毒 运动蛋白 原核表达 抗血清
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斜纹夜蛾SlbHLH互作蛋白的筛选与验证
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作者 吴霜 罗云米 +3 位作者 曾志红 王瑢笙 余鹰 陈磊 《植物保护》 北大核心 2025年第4期39-52,共14页
为探索斜纹夜蛾Spodoptera litura bHLH转录因子在斜纹夜蛾响应微生物农药胁迫过程中的作用,采用酵母双杂交技术,以SlbHLH为诱饵蛋白,筛选经微生物农药处理后的斜纹夜蛾cDNA文库。经测序和BLAST比对分析,初步筛选出38个与SlbHLH互作的... 为探索斜纹夜蛾Spodoptera litura bHLH转录因子在斜纹夜蛾响应微生物农药胁迫过程中的作用,采用酵母双杂交技术,以SlbHLH为诱饵蛋白,筛选经微生物农药处理后的斜纹夜蛾cDNA文库。经测序和BLAST比对分析,初步筛选出38个与SlbHLH互作的蛋白。通过酵母双杂交点对点试验,验证了候选互作蛋白SlCDA、SlCHIT、SlFCP、SlHEMO、SlLCP、SlTRYP与SlbHLH之间的互作关系。经金龟子绿僵菌、短稳杆菌和苏云金芽胞杆菌处理后的RT-qPCR结果表明,在一定微生物农药及其配套处理模式下,SlbHLH的表达趋势与SlCHIT、SlFCP、SlHEMO、SlLCP的表达趋势一致,与SlTRYP的表达趋势相反,预示互作蛋白与SlbHLH可能共同参与调控斜纹夜蛾对微生物农药胁迫的响应过程。本研究为解析斜纹夜蛾bHLH转录因子及其互作蛋白的生物学功能奠定了基础。 展开更多
关键词 斜纹夜蛾 bHLH转录因子 酵母双杂交 互作蛋白 基因表达
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卵巢癌患者血清中ST2、CA125和HE4水平检测及其临床意义
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作者 田春迎 李铤 +3 位作者 陈媛媛 刘玟妍 李睿尧 于秀艳 《吉林大学学报(医学版)》 北大核心 2025年第3期778-784,共7页
目的:探讨卵巢癌患者血清中生长刺激表达基因2蛋白(ST2)、糖类抗原125 (CA125)和人附睾蛋白4 (HE4)水平在卵巢癌诊断中的价值,阐明其与卵巢癌患者临床病理参数的关系。方法:随机选取于本院就诊并经术后组织病理检查证实的卵巢良性病变... 目的:探讨卵巢癌患者血清中生长刺激表达基因2蛋白(ST2)、糖类抗原125 (CA125)和人附睾蛋白4 (HE4)水平在卵巢癌诊断中的价值,阐明其与卵巢癌患者临床病理参数的关系。方法:随机选取于本院就诊并经术后组织病理检查证实的卵巢良性病变和卵巢恶性肿瘤首诊患者136例作为研究对象,其中卵巢良性病变组53例,卵巢癌组83例,另取同期体检的55名健康女性志愿者作为健康对照组。所有研究对象入院第1天抽取空腹肘静脉血并留取血清,采用循环增强荧光免疫发光法检测各组研究对象ST2水平,化学发光法检测各组研究对象血清中CA125和HE4水平。采用受试者工作特征(ROC)曲线评估各指标诊断卵巢癌的性能,计算截断值(Cut-off值)和ROC曲线下面积(AUC)值,以AUC值代表各指标的诊断性能。采用Kendall法分析血清中ST2表达水平与卵巢癌患者TNM分期、肿瘤最大直径、远端转移、淋巴结转移、腹膜转移、癌胚抗原(CEA)、CA125、糖类抗原199 (CA199)、HE4、P53和Ki67的相关性。结果:与健康对照组比较,卵巢良性病变组患者血清中CA125水平明显升高(P<0.05);与健康对照组和卵巢良性病变组比较,卵巢癌组患者血清中ST2、CA125和HE4水平均明显升高(P<0.05)。ST2的AUC值为0.719 (95%CI:0.616~0.822), CA125的AUC值为0.868 (95%CI:0.794~0.942), HE4的AUC值为0.867 (95%CI:0.793~0.942), ST2+CA125+HE4联合检测的AUC值为0.894 (95%CI:0.832~0.955)。不同TNM分期及有无淋巴结转移、远端转移和腹膜转移的卵巢癌患者血清中ST2、CA125及HE4水平比较差异均有统计学意义(P<0.05),不同年龄和肿瘤最大直径卵巢癌患者血清中ST2、CA125及HE4水平比较差异均无统计学意义(P>0.05)。卵巢癌患者血清中ST2水平与TNM分期、远端转移、淋巴结转移、腹膜转移、CA125水平、HE4水平和Ki67水平呈正相关关系(P<0.05),ST2水平与肿瘤最大直径、CEA、CA199水平和P53水平无相关性(P>0.05)。结论:ST2、CA125和HE4在卵巢癌患者血清中高表达,血清ST2、CA125和HE4联合检测筛查卵巢癌具有较好的灵敏度及特异度,可提高卵巢癌患者的诊断效能。ST2与卵巢癌高TNM分期和癌转移有关,可能参与了卵巢癌的发生发展过程。 展开更多
关键词 卵巢癌 生长刺激表达基因2蛋白 糖类抗原125 人附睾蛋白4 血清
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高温胁迫下仿刺参体壁组织的转录组差异分析
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作者 孙红娟 蒋经伟 +11 位作者 宋钢 陈仲 关晓燕 高杉 王摆 姜苹哲 李佩佩 岳冬梅 肖瑶 潘永嘉 姜冰 董颖 《水产科学》 北大核心 2025年第4期553-561,共9页
为探明仿刺参应对高温胁迫的调控机制,采用Illumina HiSeq技术对高温组(30℃)和对照组(24℃)仿刺参幼参[(5.0±0.6)g]体壁样本进行转录组测序分析。高温组和对照组共产生了2920个差异表达基因,包括1342个上调表达基因和1578个下调... 为探明仿刺参应对高温胁迫的调控机制,采用Illumina HiSeq技术对高温组(30℃)和对照组(24℃)仿刺参幼参[(5.0±0.6)g]体壁样本进行转录组测序分析。高温组和对照组共产生了2920个差异表达基因,包括1342个上调表达基因和1578个下调表达基因。差异表达基因的KEGG信号通路分析表明,其显著富集在核糖体、内质网蛋白加工、病原互作、糖酵解和氧化磷酸化等通路中。对上下调表达基因在不同信号通路分布的研究发现,仿刺参受到热胁迫后体内信号转导活动增加,蛋白翻译活动减少,而对已有蛋白的折叠加工活动增加,整体的能量代谢下降。实时荧光定量PCR检测结果显示,5个基因在对照组和高温组的表达量相关系数R为0.87,表明转录组测序结果可靠。热休克蛋白在热胁迫响应过程中发挥重要作用,HSP90β和HSP70A/B2基因的高表达促进了蛋白的正确折叠,增强了耐热性。仿刺参幼参在应对高温胁迫时对已有蛋白的折叠加工活动增加,减少了蛋白的翻译和能量消耗,这是机体维护体内稳态、保护自身免受损伤的一种策略。对热胁迫相关基因SNP位点的分析,有助于分子标记的开发和选育耐高温苗种。 展开更多
关键词 仿刺参 高温 转录组测序 差异表达基因 热休克蛋白
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新城疫病毒HN蛋白的截短表达及间接ELISA方法建立
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作者 魏玲 王思怡 +4 位作者 熊荣园 梁洪 王怀禹 李彩虹 杨国淋 《家畜生态学报》 北大核心 2025年第3期91-95,共5页
为了建立一种快速的新城疫病毒(Newcastle disease virus,NDV)抗体检测方法,试验采用原核表达技术表达HN蛋白,以HN蛋白为检测抗原建立酶联免疫吸附测定(Enzyme linked immunosorbent assay,ELISA)方法。结果表明,获得了以包涵体形式表... 为了建立一种快速的新城疫病毒(Newcastle disease virus,NDV)抗体检测方法,试验采用原核表达技术表达HN蛋白,以HN蛋白为检测抗原建立酶联免疫吸附测定(Enzyme linked immunosorbent assay,ELISA)方法。结果表明,获得了以包涵体形式表达的重组蛋白,间接ELISA方法检测6种其它鸡病阳性血清均为阴性,其最低抗体检出效价为1∶10240,其与血凝抑制试验(Hemagglutination inhibition,HI)方法的阳性和阴性符合率分别为98.08%和92.31%,检测临床样品阳性率为91.48%。说明建立的间接ELISA方法可用于NDV免疫抗体检测和疫苗免疫效果评价。 展开更多
关键词 新城疫病毒 HN蛋白 截短表达 间接ELISA 抗体检测
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绿豆C2H2型锌指蛋白转录因子家族鉴定及非生物胁迫下的表达分析
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作者 张均 郭飞翔 +2 位作者 田文仲 李春霞 马超 《核农学报》 北大核心 2025年第9期1875-1885,I0008-I0010,共14页
C2H2型锌指转录因子家族在植物非生物胁迫应答和生长发育等生命过程中起着重要的调控作用。为明确C2H2型锌指转录因子家族在绿豆生长发育中的功能,本研究利用绿豆(Vigna radiata L.)基因组数据和生物信息学技术鉴定了C2H2转录因子,对其... C2H2型锌指转录因子家族在植物非生物胁迫应答和生长发育等生命过程中起着重要的调控作用。为明确C2H2型锌指转录因子家族在绿豆生长发育中的功能,本研究利用绿豆(Vigna radiata L.)基因组数据和生物信息学技术鉴定了C2H2转录因子,对其理化性质、系统进化、染色体定位、共线性、启动子顺式作用元件及基因结构做了预测分析,并通过绿豆转录组数据和实时荧光定量PCR(qRT-PCR)分析了其在不同组织与非生物胁迫下的表达模式。结果表明,共鉴定到60个C2H2转录因子成员,其中53个分布于9条染色体,7个成员染色体信息未知;Motif1和Motif3是绿豆C2H2转录因子家族所特有的保守基序,Motif3则是部分C2H2转录因子家族成员所特有的一段保守序列“QALGGH”;编码155~1 581个氨基酸,均为亲水性蛋白且均定位在细胞核中;系统进化将绿豆C2H2转录因子家族分为7个亚组(V1~V7)。共线性分析表明,片段复制事件均进行了纯化选择;启动子顺式作用元件分析表明,绿豆C2H2基因启动子区含有大量与生长发育、逆境胁迫和激素相关的响应元件;基因表达分析表明,叶柄、叶片、下胚轴、籽粒种皮中表达量较高(FPKM值大于10)的基因分别占25.0%、26.7%、20.0%、26.7%;qRT-PCR分析发现,VrC2H2-22和VrC2H2-46对于温度胁迫具有特异性的调控作用,VrC2H2-51对干旱胁迫的响应程度较强。本研究结果为进一步对绿豆C2H2锌指转录因子家族的功能研究提供了理论基础。 展开更多
关键词 绿豆 C2H2锌指蛋白转录因子 生物信息学 共线性分析 基因表达
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拟松材线虫类毒液过敏原蛋白基因Bm-vap-1的克隆与分析
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作者 李莉 余婧 +7 位作者 王仁刚 杨春元 林世锋 朱秀 叶子 李国红 陈越男 吴沙沙 《福建农林大学学报(自然科学版)》 北大核心 2025年第5期599-608,共10页
【目的】克隆拟松材线虫类毒液过敏原蛋白(VAP)基因Bm-vap-1,并进行表达特性分析,为深入研究Bm-vap-1基因在拟松材线虫与寄主互作过程中的作用提供参考。【方法】以拟松材线虫体前端特异cDNA文库构建和测序获得的VAP基因片段为基础,通过... 【目的】克隆拟松材线虫类毒液过敏原蛋白(VAP)基因Bm-vap-1,并进行表达特性分析,为深入研究Bm-vap-1基因在拟松材线虫与寄主互作过程中的作用提供参考。【方法】以拟松材线虫体前端特异cDNA文库构建和测序获得的VAP基因片段为基础,通过cDNA末端快速扩增(RACE)技术克隆得到该基因的全长cDNA序列,将其命名为Bm-vap-1。利用生物信息学软件预测Bm-VAP-1蛋白的理化性质、信号肽和跨膜区,并通过生物数据库对其同源性和保守结构域进行分析。然后利用实时荧光定量PCR检测该基因在拟松材线虫不同虫态中的表达水平,并利用原位杂交技术进行转录组表达定位。【结果】Bm-vap-1基因开放阅读框序列长度为621 bp,编码206个氨基酸,GenBank登录号为GU451046。编码蛋白质的分子质量为22.49 ku,理论等电点为4.61,与松材线虫、豆伞滑刃线虫和冲绳伞滑刃线虫VAP同源蛋白的序列一致性较高,含有1个典型且保守的CAP结构域,存在信号肽,无跨膜结构域,属于分泌型蛋白。实时荧光定量PCR结果显示,Bm-vap-1基因在拟松材线虫各个虫态中均有表达,但在成虫中的表达量较高。原位杂交结果表明,Bm-vap-1基因在拟松材线虫的食道腺特异表达。【结论】成功克隆了拟松材线虫Bm-vap-1基因,初步推测其编码蛋白在线虫食道腺合成,且在线虫寄生过程中分泌到体外发挥作用。 展开更多
关键词 拟松材线虫 类毒液过敏原蛋白 生物信息学 表达水平 原位杂交
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猪圆环病毒4型Cap蛋白的原核表达及多克隆抗体制备
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作者 文英会 崔鸿博 +5 位作者 陈曦艋 陈红英 李金磊 赵丽 刘占通 闫志浩 《中国畜牧兽医》 北大核心 2025年第10期4904-4911,共8页
【目的】通过原核表达系统表达猪圆环病毒4型(Porcine circovirus type 4,PCV4)衣壳蛋白(Cap),并制备其多克隆抗体,为PCV4的防控提供技术支撑。【方法】基于PCV4开放阅读框2(ORF2)基因的免疫原区域设计1对特异性引物,通过PCR扩增获得PCV... 【目的】通过原核表达系统表达猪圆环病毒4型(Porcine circovirus type 4,PCV4)衣壳蛋白(Cap),并制备其多克隆抗体,为PCV4的防控提供技术支撑。【方法】基于PCV4开放阅读框2(ORF2)基因的免疫原区域设计1对特异性引物,通过PCR扩增获得PCV4 ORF2基因序列,并将其连接至pET-28a(+)载体,构建重组表达质粒pET-28a-ORF2;将经PCR和测序鉴定正确的重组质粒pET-28a-ORF2转化大肠杆菌BL21(DE3)感受态细胞,经1 mmol/L IPTG诱导表达重组Cap蛋白,利用SDS-PAGE分析诱导的重组蛋白产物。利用尿素纯化重组Cap蛋白并通过Western blotting鉴定;将纯化的重组Cap蛋白免疫新西兰大白兔制备多克隆抗体并进行Western blotting鉴定,应用间接ELISA法检测兔血清抗体效价。【结果】PCR扩增出大小为414 bp的PCV4 ORF 2基因片段,成功构建重组表达质粒pET-28a-ORF2。SDS-PAGE分析结果显示,诱导表达的重组Cap蛋白大小为16 ku;Western blotting结果表明制备的兔源多克隆抗体具有良好的免疫原性。间接ELISA检测显示,制备的兔血清抗体效价达1∶12800。【结论】本研究利用原核表达系统成功表达了PCV4 Cap蛋白并制备了多克隆抗体,试验结果为PCV4 Cap蛋白的深入研究以及后续开发PCV4基因工程亚单位疫苗、血清学诊断试剂等提供了物质基础。 展开更多
关键词 猪圆环病毒4型(PCV4) CAP蛋白 原核表达 多克隆抗体
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激发子蛋白SbES高密度重组表达和粉剂研发
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作者 杨扬 陈奕鹏 +3 位作者 王茂存 章淑艳 刘先宝 黄贵修 《热带农业科学》 2025年第2期64-71,共8页
激发子蛋白SbES是帚枝霉属内生真菌HND5产生的一个外泌丝氨酸蛋白酶,可有效诱导多种植物产生抗病性,具有可商品化开发为植物蛋白农药的潜力。为建立该蛋白的高密度发酵及粉剂制备工艺,利用已构建好的SbES蛋白毕赤酵母异源表达菌株Pichia... 激发子蛋白SbES是帚枝霉属内生真菌HND5产生的一个外泌丝氨酸蛋白酶,可有效诱导多种植物产生抗病性,具有可商品化开发为植物蛋白农药的潜力。为建立该蛋白的高密度发酵及粉剂制备工艺,利用已构建好的SbES蛋白毕赤酵母异源表达菌株Pichia pastoris X-33(pRICZA::SbES),对该蛋白的高密度发酵条件、菌体破碎条件及适宜喷雾干燥条件进行优化。结果表明,在测试范围内,SbES蛋白毕赤酵母异源表达菌株在pH 6.5、温度28℃和菌体浓度180 g/L条件下诱导108 h,可获得最大表达量;目标异源表达菌株15%菌体浓度,在300 W功率下超声40 min,可获得最大的SbES蛋白量;SbES蛋白最适的助干剂为麦芽糊精,在5%麦芽糊精,干燥塔出风口温度为140℃的条件下干燥,SbES蛋白可保存最大的酶活性。本研究结果为激发子蛋白SbES的商品化开发提供了研究基础。 展开更多
关键词 激发子蛋白 异源表达 高密度发酵 粉剂制备 植物蛋白农药
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响应面法优化信号分子AI-2合成蛋白LuxS表达条件
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作者 李祎 韩朔 +2 位作者 王玉琪 秦梦园 吴晓敏 《河南师范大学学报(自然科学版)》 CAS 北大核心 2025年第1期136-143,I0009,共9页
群体感应是一种由自诱导物(autoinducers,AIs)介导的、细菌密度依赖的基因表达调控方式,已经被证实参与细菌多种生理功能的调控.信号分子AI-2介导的LuxS/AI-2型群体感应系统广泛存在于革兰氏阳性和阴性细菌,并备受关注.AI-2的合成依赖... 群体感应是一种由自诱导物(autoinducers,AIs)介导的、细菌密度依赖的基因表达调控方式,已经被证实参与细菌多种生理功能的调控.信号分子AI-2介导的LuxS/AI-2型群体感应系统广泛存在于革兰氏阳性和阴性细菌,并备受关注.AI-2的合成依赖于S-核糖同型半胱氨酸酶(LuxS)的催化作用,而LuxS蛋白则是由luxS基因经过转录、翻译得到的.为了探索LuxS蛋白在表达菌株Escherichia coli BL21(DE3)中的最佳表达条件,从而获得较高产量且具有一定的生物活性的LuxS蛋白.首先对LuxS蛋白结构进行预测,确定E.coli BL21(DE3)作为表达菌株.其次,在单因素优化的基础上,进一步通过响应面法优化LuxS蛋白的表达条件.在菌液浓度OD 600为0.5、诱导温度为37℃、IPTG浓度为0.5 mmol/L、诱导时间为31 h条件下,获得LuxS蛋白的最高表达量.研究成功优化了LuxS蛋白在E.coli BL21(DE3)中的诱导表达条件,获得了具有生物活性的LuxS蛋白,并在后续的研究中成功合成了具有生物活性的信号分子AI-2,为体外合成AI-2奠定了基础. 展开更多
关键词 群体感应 AI-2 LuxS蛋白 原核表达 条件优化
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