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大鼠MIP3基因的电子克隆和特性分析
被引量：
1
1
作者
张华莉
袁灿
肖献忠
《湖南医科大学学报》
CSCD
北大核心
2003年第5期441-444,共4页
210 .seq是一个在大鼠心肌缺血预适应中表达上调的表达序列标签 (expressedsequencetag ,EST) ,用GENSCAN预测、Blast(Basiclocalalignmentsearchtool)比对、序列拼接、多序列比对等生物信息学方法克隆了该EST代表的大鼠MIP3基因的cDNA...
210 .seq是一个在大鼠心肌缺血预适应中表达上调的表达序列标签 (expressedsequencetag ,EST) ,用GENSCAN预测、Blast(Basiclocalalignmentsearchtool)比对、序列拼接、多序列比对等生物信息学方法克隆了该EST代表的大鼠MIP3基因的cDNA序列。大鼠MIP3基因的开放阅读框为 1332bp ,起始密码子前同一相位存在一个终止密码子 ,起始密码子邻近的序列符合Kozak规则 ;推测编码 4 4 3个氨基酸 ,与小鼠和人的MIP3基因or tholog的同源性很高 ,但是与数据库中其它蛋白质的同源性不高。TMpred分析显示该多肽有一个跨膜区域 ,氨基端位于膜内。Motifscan分析仅发现一个脯氨酸富集区域。
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关键词
缺血预处理
克隆
生物
生物信息学
mip3
基因
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职称材料
题名
大鼠MIP3基因的电子克隆和特性分析
被引量：
1
1
作者
张华莉
袁灿
肖献忠
机构
中南大学湘雅医学院病理生理学教研室
出处
《湖南医科大学学报》
CSCD
北大核心
2003年第5期441-444,共4页
基金
国家 973重点项目 (G2 0 0 0 0 5 690 8)
国家自然科学基金 ( 3 0 170 3 73 )
文摘
210 .seq是一个在大鼠心肌缺血预适应中表达上调的表达序列标签 (expressedsequencetag ,EST) ,用GENSCAN预测、Blast(Basiclocalalignmentsearchtool)比对、序列拼接、多序列比对等生物信息学方法克隆了该EST代表的大鼠MIP3基因的cDNA序列。大鼠MIP3基因的开放阅读框为 1332bp ,起始密码子前同一相位存在一个终止密码子 ,起始密码子邻近的序列符合Kozak规则 ;推测编码 4 4 3个氨基酸 ,与小鼠和人的MIP3基因or tholog的同源性很高 ,但是与数据库中其它蛋白质的同源性不高。TMpred分析显示该多肽有一个跨膜区域 ,氨基端位于膜内。Motifscan分析仅发现一个脯氨酸富集区域。
关键词
缺血预处理
克隆
生物
生物信息学
mip3
基因
Keywords
ischemic preconditioning
cloning,organism
bioinformatics
mip3 gene
分类号
Q78 [生物学—分子生物学]
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题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
大鼠MIP3基因的电子克隆和特性分析
张华莉
袁灿
肖献忠
《湖南医科大学学报》
CSCD
北大核心
2003
1
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