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RNA SNP Detection Method With Improved Specificity Based on Dual-competitive-padlock-probe
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作者 zhang qin-qin LI Jin-Ze +6 位作者 zhang Wei LI Chuan-Yu zhang Zhi-Qi YAO Jia DU Hong ZHOU Lian-Qun GUO Zhen 《生物化学与生物物理进展》 SCIE CAS CSCD 北大核心 2024年第11期3021-3033,共13页
Objective The detection of RNA single nucleotide polymorphism(SNP)is of great importance due to their association with protein expression related to various diseases and drug responses.At present,splintR ligase-assist... Objective The detection of RNA single nucleotide polymorphism(SNP)is of great importance due to their association with protein expression related to various diseases and drug responses.At present,splintR ligase-assisted methods are important approaches for RNA direct detection,but its specificity will be limited when the fidelity of ligases is not ideal.The aim of this study was to create a method to improve the specificity of splintR ligase for RNA detection.Methods In this study,a dualcompetitive-padlock-probe(DCPLP)assay without the need for additional enzymes or reactions is proposed to improve specificity of splintR ligase ligation.To verify the method,we employed dual competitive padlock probe-mediated rolling circle amplification(DCPLP-RCA)to genotype the CYP2C9 gene.Results The specificity was well improved through the competition and strand displacement of dual padlock probe,with an 83.26%reduction in nonspecific signal.By detecting synthetic RNA samples,the method demonstrated a dynamic detection range of 10 pmol/L-1 nmol/L.Furthermore,clinical samples were applied to the method to evaluate its performance,and the genotyping results were consistent with those obtained using the qPCR method.Conclusion This study has successfully established a highly specific direct RNA SNP detection method,and provided a novel avenue for accurate identification of various types of RNAs. 展开更多
关键词 RNA single nucleotide polymorphism GENOTYPING rolling circle amplification dual padlock probe
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多酚物质催化Fe3O4/Fenton降解MB的研究 被引量:4
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作者 华亚妮 肖娟 +2 位作者 章琴琴 崔畅 王川 《安全与环境学报》 CAS CSCD 北大核心 2018年第3期1075-1081,共7页
为了探究多酚物质在异相Fenton反应体系中的作用,以商用Fe3O4为催化剂,亚甲基蓝(Methylene Blue,MB)为目标污染物,研究了外加邻苯二酚(Catechol)和没食子酸(Gallic Acid,GA)对Fe3O4异相Fenton降解MB的影响。考察了多酚浓度、H2O2... 为了探究多酚物质在异相Fenton反应体系中的作用,以商用Fe3O4为催化剂,亚甲基蓝(Methylene Blue,MB)为目标污染物,研究了外加邻苯二酚(Catechol)和没食子酸(Gallic Acid,GA)对Fe3O4异相Fenton降解MB的影响。考察了多酚浓度、H2O2浓度、溶液初始p H值等因素对MB去除的影响,并探究了其降解机理。结果表明,在体系Fe3O4质量浓度为1.0 g/L、MB浓度为0.1 mmol/L、H2O2浓度为160 mmol/L、初始p H值为7.3的条件下,分别加入0.1 mmol/L的邻苯二酚和0.1 mmol/L的GA,MB的去除率由63%分别增加至79%和90%。多酚的加入不仅能够促进Fe3O4对MB的吸附,提高MB在催化剂表面的局部浓度,还能够增强Fe3O4对H2O2的催化分解能力,产生更多的羟基自由基(·OH),从而促进了MB的去除,同时显著减少了H2O2的用量,提高了H2O2的利用效率。 展开更多
关键词 环境工程学 多酚 FE3O4 异相Fenton 催化降解 亚甲基蓝
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多倍体银鲫nanos2等位多态性、共线性和表达模式分析 被引量:3
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作者 张琴琴 周莉 +4 位作者 李志 甘瑞海 俞兆曦 桂建芳 汪洋 《水生生物学报》 CAS CSCD 北大核心 2020年第5期1087-1096,共10页
为研究生殖干细胞(Germline stem cells, GSCs)的标记基因nanos2的功能,在银鲫(Carassius gibelio)中克隆了两个nanos2的同源基因(Homologs),将其命名为Cgnanos2a和Cgnanos2b,等位、系统进化树和共线性分析表明,在银鲫进化历程中发生了... 为研究生殖干细胞(Germline stem cells, GSCs)的标记基因nanos2的功能,在银鲫(Carassius gibelio)中克隆了两个nanos2的同源基因(Homologs),将其命名为Cgnanos2a和Cgnanos2b,等位、系统进化树和共线性分析表明,在银鲫进化历程中发生了额外的两轮多倍化事件,是一个异源六倍体。qPCR分析表明Cgnanos2a和Cgnanos2b在5月龄银鲫精巢中的表达水平最高,其次是卵巢;对在孵化后25—190d的卵巢中的表达动态分析表明,孵化后25d的卵巢中的Cgnanos2a和Cgnanos2b转录水平最高,随后表达水平急剧下降;并且Cgnanos2a和Cgnanos2b呈现出偏向表达的特征。切片RNA原位杂交实验结果表明, Cgnanos2a和Cgnanos2b均特异地在银鲫卵巢邻近生殖上皮的胞囊(Cyst)中一类直径小于20μm的细胞中表达, Cgnanos2a在精巢精小囊边缘一类单个或两个紧紧相邻的细胞中高表达,推测是银鲫的GSCs。此外,还可在精原细胞和初级精母细胞中检测到Cgnanos2a和Cgnanos2b的转录本。研究通过对nanos2阳性细胞的追踪描绘了银鲫卵巢早期胞囊的发育过程,为后续分离银鲫GSCs奠定了基础;同时对银鲫nanos2两个歧化的部分同源基因的序列特征、进化及表达特征分析,为研究鱼类多次多倍化事件后重复基因的进化提供了一个典型例子。 展开更多
关键词 生殖干细胞 银鲫 六倍体 nanos2 偏向表达
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山药中熊果苷通过ERβ抑制LPS诱导NRK-52e细胞凋亡 被引量:2
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作者 张贝贝 曾梦楠 +5 位作者 贾菊芳 郭彭莉 刘萌 张钦钦 冯卫生 郑晓珂 《中国药理学通报》 CAS CSCD 北大核心 2022年第3期403-410,共8页
目的探究山药中熊果苷(arbutin,Ar)对LPS诱导NRK-52e细胞凋亡的干预作用及潜在机制。方法建立LPS诱导的NRK-52e细胞损伤模型,将细胞分为正常组、LPS组(1 mg·L^(-1))、低剂量Ar(LPS,1 mg·L^(-1)+Ar,5μmol·L^(-1))和高剂... 目的探究山药中熊果苷(arbutin,Ar)对LPS诱导NRK-52e细胞凋亡的干预作用及潜在机制。方法建立LPS诱导的NRK-52e细胞损伤模型,将细胞分为正常组、LPS组(1 mg·L^(-1))、低剂量Ar(LPS,1 mg·L^(-1)+Ar,5μmol·L^(-1))和高剂量Ar(LPS,1 mg·L^(-1)+Ar,10μmol·L^(-1))及其对应的抑制剂THC组(1μmol·L^(-1)),检测细胞活力;流式细胞术检测ROS、细胞凋亡水平、Ca2+浓度及线粒体膜电位;In cell western技术检测细胞凋亡关键蛋白表达水平;结果Ar可有效调节LPS诱导的NRK-52e细胞ROS水平、Ca^(2+)浓度、凋亡关键蛋白和ERβ水平,抑制线粒体膜电位下降,但是该作用被雌激素受体β抑制剂THC所阻断,且Ar与ERβ具有较好的结合活性。结论Ar可能通过ERβ抑制LPS诱导NRK-52e细胞凋亡。 展开更多
关键词 山药 Ar 雌激素 LPS NRK-52E细胞 细胞凋亡
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钙钛矿材料在环境催化领域的应用现状及进展 被引量:4
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作者 李超 李再兴 +7 位作者 陈晓飞 张琴琴 马伟涛 牛建瑞 邢茜 田占伟 张晨阳 祁浩杰 《分子催化》 CAS CSCD 北大核心 2022年第3期287-300,I0004,共15页
日益严重的环境问题和有限的资源促使人们积极探索提高污染物处理效率的途径和方法.多相催化剂在环境污染高效治理中扮演着重要的角色,因此,高活性和高稳定性新型多相催化剂的开发成为一项非常有吸引力和具有挑战性的任务.钙钛矿材料因... 日益严重的环境问题和有限的资源促使人们积极探索提高污染物处理效率的途径和方法.多相催化剂在环境污染高效治理中扮演着重要的角色,因此,高活性和高稳定性新型多相催化剂的开发成为一项非常有吸引力和具有挑战性的任务.钙钛矿材料因其高催化活性和稳定的晶体结构成为环境催化领域的研究热点.我们综述了钙钛矿材料特性、制备方法、新型钙钛矿材料发展现状和在环境催化领域的应用现状,并对其面临的挑战及未来发展方向进行了讨论. 展开更多
关键词 钙钛矿 ABO3 环境催化 进展
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透明质酸凝胶的制备及其在关节软骨再生中的应用 被引量:2
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作者 张勤勤 谌亮 +1 位作者 岑莲 于凤宾 《现代化工》 CAS CSCD 北大核心 2019年第10期128-131,共4页
透明质酸(HA)较短的生物体内停留时间在一定程度上限制了其应用,以1,4-丁二醇二缩水甘油醚(BDDE)为交联剂对HA进行化学改性,制备了HA凝胶,并考察了其力学性能、流变性、溶胀性以及HA凝胶的关节软骨再生性能。结果表明,HA凝胶断裂伸长率... 透明质酸(HA)较短的生物体内停留时间在一定程度上限制了其应用,以1,4-丁二醇二缩水甘油醚(BDDE)为交联剂对HA进行化学改性,制备了HA凝胶,并考察了其力学性能、流变性、溶胀性以及HA凝胶的关节软骨再生性能。结果表明,HA凝胶断裂伸长率为159%,是一种弹性凝胶;其横截面表现出多孔联通结构,孔径在40μm左右;溶胀性约为凝胶干重的33倍,具有很强的吸水能力。将HA凝胶用于兔子关节软骨缺损修复,8周后发现其能促进关节软骨再生。因此,该工艺制备的HA凝胶有望用于关节软骨缺损修复的生物医用材料。 展开更多
关键词 透明质酸 凝胶 软骨修复
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机械钻机电代油节能减排效果测试方法研究 被引量:6
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作者 张健 周霞 +3 位作者 刘旭 赵猛 张钦钦 黑亮 《钻采工艺》 CAS 北大核心 2020年第5期82-83,109,I0006,共4页
针对石油钻井企业近年逐步推广电代油节能技术,介绍了机械钻机电代油技术的改造原理,并将电代油钻机与普通柴油动力钻机从工作性能、使用能耗、环保效益等方面进行了对比,分析了电代油钻机的各种优势。为更好地对机械钻机使用电代油技... 针对石油钻井企业近年逐步推广电代油节能技术,介绍了机械钻机电代油技术的改造原理,并将电代油钻机与普通柴油动力钻机从工作性能、使用能耗、环保效益等方面进行了对比,分析了电代油钻机的各种优势。为更好地对机械钻机使用电代油技术的节能减排效果进行有效评价文章采用电代油技术改造前后节能减排指标对比的方法,从节能效果和减排效果两个方面分别介绍了评价所需测试计算的原理和方法,并对评价所涉及的柴油发动机、电力变压器、电动机等主要能源转换和使用设备的运行效率计算方法进行了详细阐述。最后,利用本方法对四川长宁区块作业的某机械钻机电代油改造后的节能减排效果进行了现场测试与评价,验证了本方法的有效性和可操作性。 展开更多
关键词 钻机 电代油 节能减排 测试
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Drying Characteristics of Microwave-assisted Foam Drying of Corn Soaking Water
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作者 Li Qiang Sun Yu +2 位作者 Xu Xiang-wen zhang qin-qin Zheng Xian-zhe 《Journal of Northeast Agricultural University(English Edition)》 CAS 2013年第1期53-59,共7页
To improve the industrial utilization of corn soaking water, the yeast protein powder was produced by microwave-assisted foam drying. Firstly, preparation experiments were carded out, which included the foaming charac... To improve the industrial utilization of corn soaking water, the yeast protein powder was produced by microwave-assisted foam drying. Firstly, preparation experiments were carded out, which included the foaming characteristic experiments of fermentation broth and that about the effects of carbon and nitrogen ratio on solid content in the fermentation broth. Secondly, the drying characteristics experiment of corn soaking water was studied, which selected the microwave power, material amount and thickness as the influencing factors for the single experiment. The results showed that the final moisture content (d.b.) and drying rate were significantly affected by those factors. 展开更多
关键词 corn soaking water microwave drying foam drying final moisture content (d.b.) drying rate
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