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黄瓜绿斑驳花叶病毒广东分离物的分子鉴定
被引量:
10
1
作者
张卫东
权永兵
+3 位作者
廖力
徐淼锋
迟远丽
陈其文
《广东农业科学》
CAS
CSCD
北大核心
2011年第20期73-76,共4页
采用RT-PCR方法,扩增并测定了黄瓜绿斑驳花叶病毒广东分离物(CGMMV-GD-GZ,CGMMV-GD-LZ,CGMMV-GD-LF)的外壳蛋白(coat protein,CP)和运动蛋白(movement protein,MP)基因序列。结果显示,CP基因序列全长486 bp,编码161个氨基酸;MP基因全长7...
采用RT-PCR方法,扩增并测定了黄瓜绿斑驳花叶病毒广东分离物(CGMMV-GD-GZ,CGMMV-GD-LZ,CGMMV-GD-LF)的外壳蛋白(coat protein,CP)和运动蛋白(movement protein,MP)基因序列。结果显示,CP基因序列全长486 bp,编码161个氨基酸;MP基因全长795 bp,编码264个氨基酸。CGMMV广东分离物与其他15个CGMMV分离物之间外壳蛋白基因核苷酸的同源性在90.9%~100%之间,运动蛋白核苷酸同源性为92.7%~100%;与同属其他13种病毒基因组核苷酸序列同源性分别仅为29.5%~56.2%和38.8%~61.8%。基于外壳蛋白和运动蛋白基因序列构建系统发育树显示,CGMMV不同分离物进化为亚洲和欧洲两大群体,3种CGMMV广东分离物与韩国、日本等亚洲分离物同源性极高,可能具有共同的侵染源。
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关键词
黄瓜绿斑驳花叶病毒
外壳蛋白基因
运动蛋白基因
分子鉴定
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职称材料
基于形态与分子数据鉴定苹果异胫小卷蛾
被引量:
6
2
作者
徐淼锋
廖力
+3 位作者
张卫东
权永兵
迟远丽
黄永辉
《广东农业科学》
CAS
2015年第4期113-116,F0003,共5页
采用DNA条形码技术,对珠海出入境检验检疫局从南非进口的鲜橙和鲜葡萄中截获的3头卷蛾幼虫进行分子鉴定,采用通用引物LCO1490/HCO2198对其线粒体COI基因的部分序列进行PCR扩增和测序,并与Gen Bank数据库和DNA条形码数据库BOLDSYSTEMS v...
采用DNA条形码技术,对珠海出入境检验检疫局从南非进口的鲜橙和鲜葡萄中截获的3头卷蛾幼虫进行分子鉴定,采用通用引物LCO1490/HCO2198对其线粒体COI基因的部分序列进行PCR扩增和测序,并与Gen Bank数据库和DNA条形码数据库BOLDSYSTEMS v3中的已知序列比对,结果与Gen Bank中20条苹果异胫小卷蛾的序列同源性达99%以上,与BOLDSYSTEMS v3中46条苹果异胫小卷蛾的序列同源性达99%。结合幼虫的形态特征,综合判定该幼虫为苹果异胫小卷蛾Thaumatotibia leucotreta。
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关键词
苹果异胫小卷蛾
DNA条形码
幼虫
分子鉴定
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职称材料
5种乳白蚁ITS序列及系统发育关系分析
被引量:
3
3
作者
张卫东
廖力
+4 位作者
王岚
许彩芸
权永兵
徐淼锋
迟远丽
《广东农业科学》
CAS
CSCD
北大核心
2012年第19期138-141,150,共5页
对我国口岸截获的5种乳白蚁及黄胸散白蚁的ITS区基因序列进行克隆并测序,进行序列分析和构建系统发育树,探讨其系统发育关系。研究结果表明:乳白蚁rDNA-ITS基因序列长度约900 bp,CG碱基含量为62.3%,明显高于AT含量(37.7%)。同巢群3种不...
对我国口岸截获的5种乳白蚁及黄胸散白蚁的ITS区基因序列进行克隆并测序,进行序列分析和构建系统发育树,探讨其系统发育关系。研究结果表明:乳白蚁rDNA-ITS基因序列长度约900 bp,CG碱基含量为62.3%,明显高于AT含量(37.7%)。同巢群3种不同品级的乳白蚁(工蚁、兵蚁、有翅成虫)ITS序列没有遗传分歧。乳白蚁属内不同种间的同源性为94.3%~98.7%,同种不同地理种群之间的同源性均大于99%。大家白蚁C.curvignathus和塞庞乳白蚁C.sepangensis关系最近,婆罗乳白蚁C.travians与其他种进化距离最远。
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关键词
乳白蚁
核糖体DNA内转录间隔区
系统发育
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职称材料
实时荧光PCR法特异性检测棉花曲叶病毒
被引量:
2
4
作者
张卫东
王岚
+6 位作者
冯宇梅
廖力
权永兵
水克娟
徐淼锋
迟远丽
黄永辉
《广东农业科学》
CAS
2015年第2期126-130,136,共6页
根据棉花曲叶病毒(Cotton leaf curl virus,CLCuV)运动蛋白基因序列特征,设计并合成了特异性Taqman探针和检测引物,建立该病毒的实时荧光PCR快速检测方法。结果表明:该方法可以特异性地从5个不同CLCuV分离物中扩增到荧光信号,而其他6种...
根据棉花曲叶病毒(Cotton leaf curl virus,CLCuV)运动蛋白基因序列特征,设计并合成了特异性Taqman探针和检测引物,建立该病毒的实时荧光PCR快速检测方法。结果表明:该方法可以特异性地从5个不同CLCuV分离物中扩增到荧光信号,而其他6种病毒均无扩增。建立的方法具有快速、准确、灵敏及简便等特点,可为进出境植物检疫和农业安全生产提供可靠的技术支持。
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关键词
棉花曲叶病毒(CLCuV)
运动蛋白基因
实时荧光PCR技术
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职称材料
题名
黄瓜绿斑驳花叶病毒广东分离物的分子鉴定
被引量:
10
1
作者
张卫东
权永兵
廖力
徐淼锋
迟远丽
陈其文
机构
珠海出入境检验检疫局技术中心
江西农业大学农学院
出处
《广东农业科学》
CAS
CSCD
北大核心
2011年第20期73-76,共4页
基金
国家质量监督检验检疫总局重大项目(2008IK264)
文摘
采用RT-PCR方法,扩增并测定了黄瓜绿斑驳花叶病毒广东分离物(CGMMV-GD-GZ,CGMMV-GD-LZ,CGMMV-GD-LF)的外壳蛋白(coat protein,CP)和运动蛋白(movement protein,MP)基因序列。结果显示,CP基因序列全长486 bp,编码161个氨基酸;MP基因全长795 bp,编码264个氨基酸。CGMMV广东分离物与其他15个CGMMV分离物之间外壳蛋白基因核苷酸的同源性在90.9%~100%之间,运动蛋白核苷酸同源性为92.7%~100%;与同属其他13种病毒基因组核苷酸序列同源性分别仅为29.5%~56.2%和38.8%~61.8%。基于外壳蛋白和运动蛋白基因序列构建系统发育树显示,CGMMV不同分离物进化为亚洲和欧洲两大群体,3种CGMMV广东分离物与韩国、日本等亚洲分离物同源性极高,可能具有共同的侵染源。
关键词
黄瓜绿斑驳花叶病毒
外壳蛋白基因
运动蛋白基因
分子鉴定
Keywords
CGMMV
coat protein gene
movement protein gene
molecular identification
分类号
S436.421.19 [农业科学—农业昆虫与害虫防治]
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职称材料
题名
基于形态与分子数据鉴定苹果异胫小卷蛾
被引量:
6
2
作者
徐淼锋
廖力
张卫东
权永兵
迟远丽
黄永辉
机构
珠海出入境检验检疫局
出处
《广东农业科学》
CAS
2015年第4期113-116,F0003,共5页
基金
国家科技支撑计划项目(2012BAK11B03)
国家质检总局科技计划项目(2009IK277)
文摘
采用DNA条形码技术,对珠海出入境检验检疫局从南非进口的鲜橙和鲜葡萄中截获的3头卷蛾幼虫进行分子鉴定,采用通用引物LCO1490/HCO2198对其线粒体COI基因的部分序列进行PCR扩增和测序,并与Gen Bank数据库和DNA条形码数据库BOLDSYSTEMS v3中的已知序列比对,结果与Gen Bank中20条苹果异胫小卷蛾的序列同源性达99%以上,与BOLDSYSTEMS v3中46条苹果异胫小卷蛾的序列同源性达99%。结合幼虫的形态特征,综合判定该幼虫为苹果异胫小卷蛾Thaumatotibia leucotreta。
关键词
苹果异胫小卷蛾
DNA条形码
幼虫
分子鉴定
Keywords
Thaumatotibia leucotreta
DNA barcode
larvae
molecular identification
分类号
S41-33 [农业科学—植物保护]
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职称材料
题名
5种乳白蚁ITS序列及系统发育关系分析
被引量:
3
3
作者
张卫东
廖力
王岚
许彩芸
权永兵
徐淼锋
迟远丽
机构
珠海出入境检验检疫局技术中心
出处
《广东农业科学》
CAS
CSCD
北大核心
2012年第19期138-141,150,共5页
基金
国家质量监督检验检疫总局项目(2010IK255)
文摘
对我国口岸截获的5种乳白蚁及黄胸散白蚁的ITS区基因序列进行克隆并测序,进行序列分析和构建系统发育树,探讨其系统发育关系。研究结果表明:乳白蚁rDNA-ITS基因序列长度约900 bp,CG碱基含量为62.3%,明显高于AT含量(37.7%)。同巢群3种不同品级的乳白蚁(工蚁、兵蚁、有翅成虫)ITS序列没有遗传分歧。乳白蚁属内不同种间的同源性为94.3%~98.7%,同种不同地理种群之间的同源性均大于99%。大家白蚁C.curvignathus和塞庞乳白蚁C.sepangensis关系最近,婆罗乳白蚁C.travians与其他种进化距离最远。
关键词
乳白蚁
核糖体DNA内转录间隔区
系统发育
Keywords
Coptotermes
Internal transcribed spacers(ITS)
molecular phylogeny
分类号
Q969.295 [生物学—昆虫学]
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职称材料
题名
实时荧光PCR法特异性检测棉花曲叶病毒
被引量:
2
4
作者
张卫东
王岚
冯宇梅
廖力
权永兵
水克娟
徐淼锋
迟远丽
黄永辉
机构
珠海出入境检验检疫局技术中心
出处
《广东农业科学》
CAS
2015年第2期126-130,136,共6页
基金
国家质量监督检验检疫总局课题(2012IK300)
珠海出入境检验检疫局项目(ZH2012-4)
文摘
根据棉花曲叶病毒(Cotton leaf curl virus,CLCuV)运动蛋白基因序列特征,设计并合成了特异性Taqman探针和检测引物,建立该病毒的实时荧光PCR快速检测方法。结果表明:该方法可以特异性地从5个不同CLCuV分离物中扩增到荧光信号,而其他6种病毒均无扩增。建立的方法具有快速、准确、灵敏及简便等特点,可为进出境植物检疫和农业安全生产提供可靠的技术支持。
关键词
棉花曲叶病毒(CLCuV)
运动蛋白基因
实时荧光PCR技术
Keywords
cotton leaf curl virus(CLCuV)
movement protein gene
real-time fluorescent PCR
分类号
S432.41 [农业科学—植物病理学]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
黄瓜绿斑驳花叶病毒广东分离物的分子鉴定
张卫东
权永兵
廖力
徐淼锋
迟远丽
陈其文
《广东农业科学》
CAS
CSCD
北大核心
2011
10
在线阅读
下载PDF
职称材料
2
基于形态与分子数据鉴定苹果异胫小卷蛾
徐淼锋
廖力
张卫东
权永兵
迟远丽
黄永辉
《广东农业科学》
CAS
2015
6
在线阅读
下载PDF
职称材料
3
5种乳白蚁ITS序列及系统发育关系分析
张卫东
廖力
王岚
许彩芸
权永兵
徐淼锋
迟远丽
《广东农业科学》
CAS
CSCD
北大核心
2012
3
在线阅读
下载PDF
职称材料
4
实时荧光PCR法特异性检测棉花曲叶病毒
张卫东
王岚
冯宇梅
廖力
权永兵
水克娟
徐淼锋
迟远丽
黄永辉
《广东农业科学》
CAS
2015
2
在线阅读
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职称材料
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