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黄瓜绿斑驳花叶病毒广东分离物的分子鉴定 被引量:10
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作者 张卫东 权永兵 +3 位作者 廖力 徐淼锋 迟远丽 陈其文 《广东农业科学》 CAS CSCD 北大核心 2011年第20期73-76,共4页
采用RT-PCR方法,扩增并测定了黄瓜绿斑驳花叶病毒广东分离物(CGMMV-GD-GZ,CGMMV-GD-LZ,CGMMV-GD-LF)的外壳蛋白(coat protein,CP)和运动蛋白(movement protein,MP)基因序列。结果显示,CP基因序列全长486 bp,编码161个氨基酸;MP基因全长7... 采用RT-PCR方法,扩增并测定了黄瓜绿斑驳花叶病毒广东分离物(CGMMV-GD-GZ,CGMMV-GD-LZ,CGMMV-GD-LF)的外壳蛋白(coat protein,CP)和运动蛋白(movement protein,MP)基因序列。结果显示,CP基因序列全长486 bp,编码161个氨基酸;MP基因全长795 bp,编码264个氨基酸。CGMMV广东分离物与其他15个CGMMV分离物之间外壳蛋白基因核苷酸的同源性在90.9%~100%之间,运动蛋白核苷酸同源性为92.7%~100%;与同属其他13种病毒基因组核苷酸序列同源性分别仅为29.5%~56.2%和38.8%~61.8%。基于外壳蛋白和运动蛋白基因序列构建系统发育树显示,CGMMV不同分离物进化为亚洲和欧洲两大群体,3种CGMMV广东分离物与韩国、日本等亚洲分离物同源性极高,可能具有共同的侵染源。 展开更多
关键词 黄瓜绿斑驳花叶病毒 外壳蛋白基因 运动蛋白基因 分子鉴定
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基于形态与分子数据鉴定苹果异胫小卷蛾 被引量:6
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作者 徐淼锋 廖力 +3 位作者 张卫东 权永兵 迟远丽 黄永辉 《广东农业科学》 CAS 2015年第4期113-116,F0003,共5页
采用DNA条形码技术,对珠海出入境检验检疫局从南非进口的鲜橙和鲜葡萄中截获的3头卷蛾幼虫进行分子鉴定,采用通用引物LCO1490/HCO2198对其线粒体COI基因的部分序列进行PCR扩增和测序,并与Gen Bank数据库和DNA条形码数据库BOLDSYSTEMS v... 采用DNA条形码技术,对珠海出入境检验检疫局从南非进口的鲜橙和鲜葡萄中截获的3头卷蛾幼虫进行分子鉴定,采用通用引物LCO1490/HCO2198对其线粒体COI基因的部分序列进行PCR扩增和测序,并与Gen Bank数据库和DNA条形码数据库BOLDSYSTEMS v3中的已知序列比对,结果与Gen Bank中20条苹果异胫小卷蛾的序列同源性达99%以上,与BOLDSYSTEMS v3中46条苹果异胫小卷蛾的序列同源性达99%。结合幼虫的形态特征,综合判定该幼虫为苹果异胫小卷蛾Thaumatotibia leucotreta。 展开更多
关键词 苹果异胫小卷蛾 DNA条形码 幼虫 分子鉴定
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5种乳白蚁ITS序列及系统发育关系分析 被引量:3
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作者 张卫东 廖力 +4 位作者 王岚 许彩芸 权永兵 徐淼锋 迟远丽 《广东农业科学》 CAS CSCD 北大核心 2012年第19期138-141,150,共5页
对我国口岸截获的5种乳白蚁及黄胸散白蚁的ITS区基因序列进行克隆并测序,进行序列分析和构建系统发育树,探讨其系统发育关系。研究结果表明:乳白蚁rDNA-ITS基因序列长度约900 bp,CG碱基含量为62.3%,明显高于AT含量(37.7%)。同巢群3种不... 对我国口岸截获的5种乳白蚁及黄胸散白蚁的ITS区基因序列进行克隆并测序,进行序列分析和构建系统发育树,探讨其系统发育关系。研究结果表明:乳白蚁rDNA-ITS基因序列长度约900 bp,CG碱基含量为62.3%,明显高于AT含量(37.7%)。同巢群3种不同品级的乳白蚁(工蚁、兵蚁、有翅成虫)ITS序列没有遗传分歧。乳白蚁属内不同种间的同源性为94.3%~98.7%,同种不同地理种群之间的同源性均大于99%。大家白蚁C.curvignathus和塞庞乳白蚁C.sepangensis关系最近,婆罗乳白蚁C.travians与其他种进化距离最远。 展开更多
关键词 乳白蚁 核糖体DNA内转录间隔区 系统发育
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实时荧光PCR法特异性检测棉花曲叶病毒 被引量:2
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作者 张卫东 王岚 +6 位作者 冯宇梅 廖力 权永兵 水克娟 徐淼锋 迟远丽 黄永辉 《广东农业科学》 CAS 2015年第2期126-130,136,共6页
根据棉花曲叶病毒(Cotton leaf curl virus,CLCuV)运动蛋白基因序列特征,设计并合成了特异性Taqman探针和检测引物,建立该病毒的实时荧光PCR快速检测方法。结果表明:该方法可以特异性地从5个不同CLCuV分离物中扩增到荧光信号,而其他6种... 根据棉花曲叶病毒(Cotton leaf curl virus,CLCuV)运动蛋白基因序列特征,设计并合成了特异性Taqman探针和检测引物,建立该病毒的实时荧光PCR快速检测方法。结果表明:该方法可以特异性地从5个不同CLCuV分离物中扩增到荧光信号,而其他6种病毒均无扩增。建立的方法具有快速、准确、灵敏及简便等特点,可为进出境植物检疫和农业安全生产提供可靠的技术支持。 展开更多
关键词 棉花曲叶病毒(CLCuV) 运动蛋白基因 实时荧光PCR技术
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