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小麦AP2/ERF转录因子家族生物信息学分析
被引量：
8
1
作者
卞云迪
张驰
+6 位作者
王雪晴
杨晨晓
王光钰
刘晓颖
王颖
方芳
王振英
《天津师范大学学报（自然科学版）》
CAS
北大核心
2022年第4期39-45,共7页
为了探究AP2/ERF基因家族在小麦基因组中的分布及功能,利用生物信息学方法和小麦全基因组数据信息,在小麦全基因组范围内共鉴定出74个TaAP2/ERF转录因子基因.鉴定所得基因编码的蛋白大多数呈酸性,且大部分被定位在细胞核中,与多数转录...
为了探究AP2/ERF基因家族在小麦基因组中的分布及功能,利用生物信息学方法和小麦全基因组数据信息,在小麦全基因组范围内共鉴定出74个TaAP2/ERF转录因子基因.鉴定所得基因编码的蛋白大多数呈酸性,且大部分被定位在细胞核中,与多数转录因子蛋白相关报道一致.这些基因的启动子区包含多个应答植物激素和环境因子的顺式作用元件,如茉莉酸、脱落酸、光响应、厌氧和低温胁迫等.热图分析发现了6个在生物和非生物胁迫下特异表达的基因:AP2-S基因在非生物胁迫下特异表达;CBFIIId亚家族的3个基因(CBFIIId-B19、CBFIIId-D19和CBFIIId-24.1)结构相同,在非生物胁迫下特异表达;CBFIVb-D21和CBF2基因能够对小麦的病原菌侵染作出响应.
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关键词
小麦
全基因组鉴定
AP2/ERF转录因子家族
基因结构
表达分析
在线阅读
下载PDF
职称材料
栽培小麦Brock中抗白粉病相关基因TaRPP13-1B的克隆及功能分析
被引量：
2
2
作者
刘晓颖
张驰
+6 位作者
王雪晴
杨晨晓
王光钰
卞云迪
方芳
王颖
王振英
《作物学报》
CAS
CSCD
北大核心
2023年第2期392-401,共10页
白粉病是小麦生产中的主要病害之一,发掘抗病基因并实现抗病基因转育是提高作物抗病性的最经济有效的方法。本研究克隆了一个位于小麦染色体1B上、具有典型CC、NBS和LRR结构域的基因TaRPP13-1B。接种白粉菌后,TaRPP13-1B基因在抗病小麦B...
白粉病是小麦生产中的主要病害之一,发掘抗病基因并实现抗病基因转育是提高作物抗病性的最经济有效的方法。本研究克隆了一个位于小麦染色体1B上、具有典型CC、NBS和LRR结构域的基因TaRPP13-1B。接种白粉菌后,TaRPP13-1B基因在抗病小麦Brock和BJ-1中表达量虽然出现上下调波动,但平均表达水平一直高于感病小麦品种京411。采用病毒诱导的基因沉默和转基因过表达技术进行功能分析,发现抑制目标基因表达,抗病小麦品种Brock对白粉菌的抗性显著降低;过表达TaRPP13-1B的转基因小麦津强5号对白粉菌抗性明显提高。说明TaRPP13-1B基因参与小麦抗白粉病的防御反应过程。该研究为小麦抗病品种的选育提供了有价值的备选基因。
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关键词
小麦
NBS-LRR类基因
TaRPP13-1B
抗白粉病
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职称材料
题名
小麦AP2/ERF转录因子家族生物信息学分析
被引量：
8
1
作者
卞云迪
张驰
王雪晴
杨晨晓
王光钰
刘晓颖
王颖
方芳
王振英
机构
天津师范大学生命科学学院
天津市动植物抗性重点实验室
天津市宝坻区林业发展服务中心
出处
《天津师范大学学报（自然科学版）》
CAS
北大核心
2022年第4期39-45,共7页
基金
国家自然科学基金资助项目(31071671)
天津市科技支撑项目(18YFZCNC01100,17JCZDJC34100)。
文摘
为了探究AP2/ERF基因家族在小麦基因组中的分布及功能,利用生物信息学方法和小麦全基因组数据信息,在小麦全基因组范围内共鉴定出74个TaAP2/ERF转录因子基因.鉴定所得基因编码的蛋白大多数呈酸性,且大部分被定位在细胞核中,与多数转录因子蛋白相关报道一致.这些基因的启动子区包含多个应答植物激素和环境因子的顺式作用元件,如茉莉酸、脱落酸、光响应、厌氧和低温胁迫等.热图分析发现了6个在生物和非生物胁迫下特异表达的基因:AP2-S基因在非生物胁迫下特异表达;CBFIIId亚家族的3个基因(CBFIIId-B19、CBFIIId-D19和CBFIIId-24.1)结构相同,在非生物胁迫下特异表达;CBFIVb-D21和CBF2基因能够对小麦的病原菌侵染作出响应.
关键词
小麦
全基因组鉴定
AP2/ERF转录因子家族
基因结构
表达分析
Keywords
wheat
genome-wide identification
AP2/ERF transcription factor family
gene structure
expression analysis
分类号
Q946 [生物学—植物学]
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职称材料
题名
栽培小麦Brock中抗白粉病相关基因TaRPP13-1B的克隆及功能分析
被引量：
2
2
作者
刘晓颖
张驰
王雪晴
杨晨晓
王光钰
卞云迪
方芳
王颖
王振英
机构
天津师范大学生命科学学院/天津市动植物抗性重点实验室
天津市宝坻区林业发展服务中心
出处
《作物学报》
CAS
CSCD
北大核心
2023年第2期392-401,共10页
基金
国家自然科学基金项目(31071671)
天津市科技支撑项目(18YFZCNC01100,17JCZDJC34100)资助。
文摘
白粉病是小麦生产中的主要病害之一,发掘抗病基因并实现抗病基因转育是提高作物抗病性的最经济有效的方法。本研究克隆了一个位于小麦染色体1B上、具有典型CC、NBS和LRR结构域的基因TaRPP13-1B。接种白粉菌后,TaRPP13-1B基因在抗病小麦Brock和BJ-1中表达量虽然出现上下调波动,但平均表达水平一直高于感病小麦品种京411。采用病毒诱导的基因沉默和转基因过表达技术进行功能分析,发现抑制目标基因表达,抗病小麦品种Brock对白粉菌的抗性显著降低;过表达TaRPP13-1B的转基因小麦津强5号对白粉菌抗性明显提高。说明TaRPP13-1B基因参与小麦抗白粉病的防御反应过程。该研究为小麦抗病品种的选育提供了有价值的备选基因。
关键词
小麦
NBS-LRR类基因
TaRPP13-1B
抗白粉病
Keywords
wheat
NBS-LRR gene
TaRPP13-1B
powdery mildew resistance
分类号
S435.121.46 [农业科学—农业昆虫与害虫防治]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
小麦AP2/ERF转录因子家族生物信息学分析
卞云迪
张驰
王雪晴
杨晨晓
王光钰
刘晓颖
王颖
方芳
王振英
《天津师范大学学报（自然科学版）》
CAS
北大核心
2022
8
在线阅读
下载PDF
职称材料
2
栽培小麦Brock中抗白粉病相关基因TaRPP13-1B的克隆及功能分析
刘晓颖
张驰
王雪晴
杨晨晓
王光钰
卞云迪
方芳
王颖
王振英
《作物学报》
CAS
CSCD
北大核心
2023
2
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职称材料
已选择
0
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引证文献
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