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一个基于Blast程序的多重序列对齐程序——Mblast 被引量:3
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作者 孙焕东 张成岗 贺福初 《生物化学与生物物理进展》 SCIE CAS CSCD 北大核心 2001年第3期419-422,共4页
核酸序列和蛋白质序列的相似性分析日益成为生物信息学研究的核心内容 .NCBI的Blast程序是进行此类分析的最有力工具 .虽然它提供了初步的将多条序列进行综合对齐的分析方案 ,但是实际效果却很不理想 .在对Blast程序的输出结果进行仔细... 核酸序列和蛋白质序列的相似性分析日益成为生物信息学研究的核心内容 .NCBI的Blast程序是进行此类分析的最有力工具 .虽然它提供了初步的将多条序列进行综合对齐的分析方案 ,但是实际效果却很不理想 .在对Blast程序的输出结果进行仔细分析的基础上 ,基于“求同存异”的思想 ,我们编制了一个多重序列对齐程序Mblast.该程序与目前流行的序列多重对齐程序相比 ,更容易检出序列的同源区 . 展开更多
关键词 Blast程序 序列多重对齐 核酸 蛋白质 Mblast
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用ISAPI过滤器监控用户的网络访问
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作者 孙焕东 赵东升 张华 《计算机应用》 CSCD 北大核心 2001年第1期26-27,31,共3页
作为Internet服务商或网络管理员 ,如何对用户的访问身份实现监测控制 ,是网络计费管理中不容忽视的重要问题。本文介绍了一种通过ISAPI的过滤器实现帐号监控的方法 ,该方法将用户IP地址与其帐号捆绑在一起来约束用户的访问 ,从而基本... 作为Internet服务商或网络管理员 ,如何对用户的访问身份实现监测控制 ,是网络计费管理中不容忽视的重要问题。本文介绍了一种通过ISAPI的过滤器实现帐号监控的方法 ,该方法将用户IP地址与其帐号捆绑在一起来约束用户的访问 ,从而基本上杜绝了盗用他人帐号的问题 ,实现了基于web的访问认证 ,使网络计费更加公正合理。 展开更多
关键词 网络安全 访问监控 网络计费 安全认证
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基于PC/Linux的核酸序列电子延伸系统的构建及其应用 被引量:5
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作者 张成岗 孙焕东 +2 位作者 欧阳曙光 吴松峰 贺福初 《遗传》 CAS CSCD 北大核心 2002年第1期50-54,共5页
新基因全长cDNA序列的获得常常是分子生物学工作者面临的难题。人类基因组计划及其相关计划的实施导致了大量表达序列标签 (EST)的产生。利用一定的生物信息学算法 ,这些EST序列往往可用来对新基因片段进行延伸。采用Linux操作系统 ,利... 新基因全长cDNA序列的获得常常是分子生物学工作者面临的难题。人类基因组计划及其相关计划的实施导致了大量表达序列标签 (EST)的产生。利用一定的生物信息学算法 ,这些EST序列往往可用来对新基因片段进行延伸。采用Linux操作系统 ,利用Blast软件和Phrap软件以及EST数据库在微机上构建了EST序列的电子延伸系统 ,并对来自于人胎肝的 11386条EST序列和 5 11条插入片段全长cDNA序列进行了电子延伸 ,结果显示8373条EST序列和 389条插入片段全长cDNA序列得到了程度不等的延伸 ,部分结果通过RACE实验得到证实。该套系统可高效地、规模化进行EST序列的延伸 ,可为通过实验获得新基因全长cDNA序列提供重要线索。 展开更多
关键词 生物信息学 表达序列标签 CDNA 电子序列延伸 微机 核酸序列
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