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利用线粒体DNA序列进行斑海豹鉴定的研究
被引量：
1
1
作者
孙凡越
高祥刚
+1 位作者
韩家波
赫崇波
《水产科学》
CAS
北大核心
2008年第5期254-256,共3页
通过对待鉴定的血液样品中线粒体控制区扩增和序列测定,并与基因库中序列比对分析,成功地对斑海豹进行了种类鉴定。本研究所用方法在野生珍稀动物的种类鉴定中有很好的应用价值。
关键词
斑海豹
线粒体DNA
控制区
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职称材料
辽东湾斑海豹(Phoca largha)线粒体D-loop区异质型研究初探
被引量：
2
2
作者
高祥刚
孙凡越
+3 位作者
李云峰
鹿志创
韩家波
赫崇波
《生物技术通报》
CAS
CSCD
北大核心
2009年第S1期248-261,276,共15页
采用PCR技术和DNA克隆测序技术,随机测定了3头斑海豹mtDNA控制区(D-loop区)CSB-3上、下游1000 bp左右的序列,每头斑海豹任选14个克隆菌斑进行测序,结果所得序列均无重复,得到42个单倍型。结合GenBank已发表的斑海豹mtDNA控制区序列(Phoc...
采用PCR技术和DNA克隆测序技术,随机测定了3头斑海豹mtDNA控制区(D-loop区)CSB-3上、下游1000 bp左右的序列,每头斑海豹任选14个克隆菌斑进行测序,结果所得序列均无重复,得到42个单倍型。结合GenBank已发表的斑海豹mtDNA控制区序列(Phoca largha,AM181031),通过ClustalX1.83、MEGA3.1和FastPCRv3.6等生物信息学软件进行序列比对,发现我国珍稀保护动物斑海豹个体内线粒体DNA(mtDNA)的控制区CSB-3之后存在异质型现象,且存在数目不等的串联重复序列。从分子水平进行了不同类型重复序列变化规律的研究,初探了mtDNA控制区异质型在斑海豹中的存在情况。
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关键词
斑海豹
MTDNA控制区
串联重复序列
异质型
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职称材料
辽东湾斑海豹遗传多样性的AFLP分析
被引量：
1
3
作者
赫崇波
高祥刚
+3 位作者
孙凡越
鹿志创
马志强
韩家波
《生物技术通报》
CAS
CSCD
2008年第S1期347-351,共5页
利用AFLP标记技术对辽东湾斑海豹的遗传多样性进行分析。采用7对AFLP引物对斑海豹3个群体(按不同采样年份分类)43个个体扩增共得到241个位点,3个群体内的多态位点比例为80.45%～95.85%,总多态位点比例为99.59%。群体的香农(Shannon)多...
利用AFLP标记技术对辽东湾斑海豹的遗传多样性进行分析。采用7对AFLP引物对斑海豹3个群体(按不同采样年份分类)43个个体扩增共得到241个位点,3个群体内的多态位点比例为80.45%～95.85%,总多态位点比例为99.59%。群体的香农(Shannon)多样性指数为0.3817～0.4716,群体间的遗传距离在0.1742～0.4023之间。2007年群体的多态位点比例、Shannon多样性指数均高于2006年群体,2005年群体处于中等水平。用NTSYS软件进行个体聚类及UPGMA方法构建的群体系统树,发现3个群体的个体基本随机聚到一起,界限不十分明显,说明3年的群体差异不明显,甚至可以认为它们是混合群体。结果表明,斑海豹群体遗传多样性水平较低,遗传结构趋于简单化,且存在较强的基因交流。
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关键词
斑海豹
遗传多样性
AFLP分析
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职称材料
题名
利用线粒体DNA序列进行斑海豹鉴定的研究
被引量：
1
1
作者
孙凡越
高祥刚
韩家波
赫崇波
机构
辽宁师范大学生命科学学院
辽宁省海洋水产科学研究院
出处
《水产科学》
CAS
北大核心
2008年第5期254-256,共3页
基金
国际爱护动物基金会赞助(IFAW)
文摘
通过对待鉴定的血液样品中线粒体控制区扩增和序列测定,并与基因库中序列比对分析,成功地对斑海豹进行了种类鉴定。本研究所用方法在野生珍稀动物的种类鉴定中有很好的应用价值。
关键词
斑海豹
线粒体DNA
控制区
Keywords
spotted seal （ Phoca largha）
mtDNA
control region
分类号
Q349.2 [生物学—遗传学]
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职称材料
题名
辽东湾斑海豹(Phoca largha)线粒体D-loop区异质型研究初探
被引量：
2
2
作者
高祥刚
孙凡越
李云峰
鹿志创
韩家波
赫崇波
机构
辽宁省海洋水产科学研究院辽宁省海洋水产分子生物学重点实验室
辽宁师范大学生命科学院
出处
《生物技术通报》
CAS
CSCD
北大核心
2009年第S1期248-261,276,共15页
基金
国家海洋908项目辽宁专项(LN-908-01-01-06)
辽宁省海洋与渔业科研计划项目(200801)
文摘
采用PCR技术和DNA克隆测序技术,随机测定了3头斑海豹mtDNA控制区(D-loop区)CSB-3上、下游1000 bp左右的序列,每头斑海豹任选14个克隆菌斑进行测序,结果所得序列均无重复,得到42个单倍型。结合GenBank已发表的斑海豹mtDNA控制区序列(Phoca largha,AM181031),通过ClustalX1.83、MEGA3.1和FastPCRv3.6等生物信息学软件进行序列比对,发现我国珍稀保护动物斑海豹个体内线粒体DNA(mtDNA)的控制区CSB-3之后存在异质型现象,且存在数目不等的串联重复序列。从分子水平进行了不同类型重复序列变化规律的研究,初探了mtDNA控制区异质型在斑海豹中的存在情况。
关键词
斑海豹
MTDNA控制区
串联重复序列
异质型
Keywords
Spotted seal
D-loop region of mitochondria DNA
Tandem repeat?array
Heteroplasmy
分类号
Q75 [生物学—分子生物学]
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职称材料
题名
辽东湾斑海豹遗传多样性的AFLP分析
被引量：
1
3
作者
赫崇波
高祥刚
孙凡越
鹿志创
马志强
韩家波
机构
辽宁省海洋水产科学研究院
辽宁师范大学生命科学院
出处
《生物技术通报》
CAS
CSCD
2008年第S1期347-351,共5页
基金
国家海洋908项目辽宁专项(项目编号:LN-908-01-01-06)资助
国际爱护动物基金会赞助项目(IFAW)
文摘
利用AFLP标记技术对辽东湾斑海豹的遗传多样性进行分析。采用7对AFLP引物对斑海豹3个群体(按不同采样年份分类)43个个体扩增共得到241个位点,3个群体内的多态位点比例为80.45%～95.85%,总多态位点比例为99.59%。群体的香农(Shannon)多样性指数为0.3817～0.4716,群体间的遗传距离在0.1742～0.4023之间。2007年群体的多态位点比例、Shannon多样性指数均高于2006年群体,2005年群体处于中等水平。用NTSYS软件进行个体聚类及UPGMA方法构建的群体系统树,发现3个群体的个体基本随机聚到一起,界限不十分明显,说明3年的群体差异不明显,甚至可以认为它们是混合群体。结果表明,斑海豹群体遗传多样性水平较低,遗传结构趋于简单化,且存在较强的基因交流。
关键词
斑海豹
遗传多样性
AFLP分析
Keywords
Spotted seal(Phoca largha)
Genetic diversity
AFLP analysis
分类号
Q953 [生物学—动物学]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
利用线粒体DNA序列进行斑海豹鉴定的研究
孙凡越
高祥刚
韩家波
赫崇波
《水产科学》
CAS
北大核心
2008
1
在线阅读
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职称材料
2
辽东湾斑海豹(Phoca largha)线粒体D-loop区异质型研究初探
高祥刚
孙凡越
李云峰
鹿志创
韩家波
赫崇波
《生物技术通报》
CAS
CSCD
北大核心
2009
2
在线阅读
下载PDF
职称材料
3
辽东湾斑海豹遗传多样性的AFLP分析
赫崇波
高祥刚
孙凡越
鹿志创
马志强
韩家波
《生物技术通报》
CAS
CSCD
2008
1
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职称材料
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