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题名胆管癌胆汁蛋白质样品制备和双向电泳条件的优化
被引量:2
- 1
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作者
吕济相
王济明
罗诗樵
黄国飞
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机构
重庆医科大学附属第一医院肝胆外科
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出处
《生物技术通报》
CAS
CSCD
北大核心
2009年第8期125-127,133,共4页
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基金
重庆市卫生局2007年度医学科研项目计划(07-01-003)
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文摘
采用合适的裂解液和沉淀方法,提取胆管癌胆汁中的蛋白质,获得分辨率高、重复性好的蛋白质双向电泳图谱。通过不同裂解液和蛋白质沉淀方法提取胆汁蛋白的效果比较,设计了不同的样品制备方法,并且对双向电泳(2-DE)的条件进行优化。结果显示,试验确定了适合胆管癌胆汁的裂解液配方(LSⅣ),丙酮沉淀的蛋白分布完整,沉淀效率相对较高。高伏时、长时间的等电聚焦可以获得高分辨率、重复性好的蛋白质双向电泳图谱。因此,本方法可以应用到胆管癌胆汁蛋白的提取,也可以对其他体液蛋白质样品的制备和双向电泳提供借鉴。
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关键词
胆管癌
样品制备
双向电泳
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Keywords
Cholangiocarcinoma Sample preparation Two-dimensional gel electrophoresis
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分类号
R735.8
[医药卫生—肿瘤]
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题名胆管癌的蛋白质组学分析
被引量:1
- 2
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作者
吕济相
王济明
罗诗樵
黄国飞
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机构
重庆医科大学附属第一医院肝胆外科
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出处
《中国癌症杂志》
CAS
CSCD
北大核心
2010年第6期411-415,共5页
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基金
重庆市卫生局2007年度医学科研项目计划(07-01-003)
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文摘
背景与目的:胆管癌是目前常见的消化道恶性肿瘤,早期诊断困难,总体5年生存率极低,所以改善预后的关键在于早期诊断。近年来,蛋白质组学的迅猛发展,为检测肿瘤标志物提供了一种新技术。本研究通过比较胆管癌组织与正常胆管组织的蛋白质组表达差异,寻找胆管癌相关的蛋白质,选择敏感的分子标志物。方法:运用蛋白质组学技术,对16例胆管癌患者的胆管癌组织和正常胆管组织进行胶内差异双向凝胶电泳(2-DE),选择差异表达超过2倍的蛋白质进行MALDI-TOF质谱分析和生物信息学分析。结果:成功建立胆管癌组织和正常组织的双向凝胶电泳图谱,胆管癌组织和正常胆管组织平均蛋白质斑点数分别为1087和1048,其中表达差异超过2倍的斑点共有32个,质谱分析和数据库检索共鉴定出l8种蛋白质,包括衔接蛋白成纤维细胞生长因子受体底物2(fibroblast growth factor recptor substrate2,FRS2)、连环蛋白(catenin,beta1)、细胞外信号调节激酶(extracellular response kinase)等。从功能上分析,这些差异蛋白质与癌细胞的发生、增殖、分化、转移等相关。结论:胆管癌组织与正常胆管组织间有l8种差异蛋白质可能为研究胆管癌的生物学行为提供新的分子标记物。
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关键词
胆管癌
蛋白质组学
双向凝胶电泳
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Keywords
cholangiocarcinoma
proteomic
two-dimensional gel electrophoresis
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分类号
R735.8
[医药卫生—肿瘤]
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题名人胆管癌与正常人胆汁蛋白质组学研究
被引量:7
- 3
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作者
黄国飞
王济明
罗诗樵
吕济相
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机构
重庆医科大学附属第一医院肝胆外科
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出处
《中国癌症杂志》
CAS
CSCD
北大核心
2009年第2期106-111,共6页
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基金
重庆市卫生局2007年度医学科研项目计划(No:07-1-003)
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文摘
背景与目的:胆管癌是目前常见的消化道恶性肿瘤,由于大多数患者确诊时疾病已属中晚期,总体5年生存率极低,所以改善预后的关键在于早期诊断。近年来,蛋白质组学的迅猛发展,为检测肿瘤标志物提供了一种新技术。本研究采用蛋白质组学的相关技术,建立胆汁蛋白质组双向电泳图谱,筛选胆管癌患者胆汁和正常人胆汁中的差异表达蛋白,以发现可能用于早期诊断胆管癌的肿瘤标志物。方法:收集胆管癌患者和正常人胆汁标本,经脱盐、脱脂纯化处理后提取蛋白,进行二维电泳,应用PDQuest 8.02D图像软件对银离子染色的双向电泳图像进行分析,并对差异表达的蛋白质行质谱鉴定。结果:成功建立胆管癌和正常人胆汁的双向凝胶电泳图谱,其图谱上平均蛋白质点数分别为(352±23)个和(317±26)个。选取其中表达差异超过2倍的蛋白质斑点10个,行质谱分析和数据库检索,鉴定出5种有意义的蛋白质,包括(angiopoienrelated protein 1)、(fibroblast growth factor substrate 2)、(catenin,beta 1)、(kertain,typeⅠ cytoskeletal 16)和(ras-related protein 37)。从功能上分析这些差异蛋白质与癌细胞的发生、增殖、分化、转移等相关。结论:蛋白质组学能很好地显示胆管癌患者与正常人胆汁间的差异表达蛋白,研究鉴定的5种差异表达蛋白质可能为研究胆管癌的生物学行为提供新的分子标志物。
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关键词
胆管癌
人胆汁
蛋白质组学
双向凝胶电泳
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Keywords
cholangiocarcinoma
human bile
proteomics
two-dimensional gel electrophoresis
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分类号
R735.8
[医药卫生—肿瘤]
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