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异染色质相关蛋白TRIM28调控锌指蛋白和原钙黏蛋白家族基因的转录
1
作者
张翔宇
卜佳晨
《生物化学与生物物理进展》
SCIE
CAS
CSCD
北大核心
2022年第6期1135-1145,共11页
目的TRIM28是一种异染色质相关蛋白,通过和SETDB1、HP1相互作用参与H3K9me3修饰的建立,本文旨在更深入地研究TRIM28的相关功能。方法本文利用CRISPR/Cas9技术、染色质免疫共沉淀技术、免疫印迹技术和实时荧光定量PCR技术,建立HEK293F Tr...
目的TRIM28是一种异染色质相关蛋白,通过和SETDB1、HP1相互作用参与H3K9me3修饰的建立,本文旨在更深入地研究TRIM28的相关功能。方法本文利用CRISPR/Cas9技术、染色质免疫共沉淀技术、免疫印迹技术和实时荧光定量PCR技术,建立HEK293F Trim28基因敲除细胞系,分析一系列实验数据结果。结果Trim28主要抑制内源表达水平较低的基因转录,进一步分析发现Trim28调控锌指蛋白家族基因和原钙黏蛋白β家族基因的转录。在Trim28敲除细胞系中,锌指蛋白家族基因H3K27ac修饰、H3K4me1修饰和H3K4me3修饰都显著上升,H3K9me3修饰下降。原钙黏蛋白β家族基因的H3K4me3修饰显著上升,H3K9me3修饰下降。结论这些结果提示TRIM28通过改变染色质的开放程度调控锌指蛋白和原钙黏蛋白β家族基因的转录,为更深入研究TRIM28的功能提供了新的思路。
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关键词
TRIM28
异染色质
H3K9me3
原钙黏蛋白β家族
锌指蛋白家族
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职称材料
题名
异染色质相关蛋白TRIM28调控锌指蛋白和原钙黏蛋白家族基因的转录
1
作者
张翔宇
卜佳晨
机构
中国科学院生物物理研究所
出处
《生物化学与生物物理进展》
SCIE
CAS
CSCD
北大核心
2022年第6期1135-1145,共11页
文摘
目的TRIM28是一种异染色质相关蛋白,通过和SETDB1、HP1相互作用参与H3K9me3修饰的建立,本文旨在更深入地研究TRIM28的相关功能。方法本文利用CRISPR/Cas9技术、染色质免疫共沉淀技术、免疫印迹技术和实时荧光定量PCR技术,建立HEK293F Trim28基因敲除细胞系,分析一系列实验数据结果。结果Trim28主要抑制内源表达水平较低的基因转录,进一步分析发现Trim28调控锌指蛋白家族基因和原钙黏蛋白β家族基因的转录。在Trim28敲除细胞系中,锌指蛋白家族基因H3K27ac修饰、H3K4me1修饰和H3K4me3修饰都显著上升,H3K9me3修饰下降。原钙黏蛋白β家族基因的H3K4me3修饰显著上升,H3K9me3修饰下降。结论这些结果提示TRIM28通过改变染色质的开放程度调控锌指蛋白和原钙黏蛋白β家族基因的转录,为更深入研究TRIM28的功能提供了新的思路。
关键词
TRIM28
异染色质
H3K9me3
原钙黏蛋白β家族
锌指蛋白家族
Keywords
TRIM28
heterochromatin
H3K9me3
protocadherin proteinβfamily
zinc finger protein family
分类号
Q75 [生物学—分子生物学]
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题名
作者
出处
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1
异染色质相关蛋白TRIM28调控锌指蛋白和原钙黏蛋白家族基因的转录
张翔宇
卜佳晨
《生物化学与生物物理进展》
SCIE
CAS
CSCD
北大核心
2022
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