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基于基因组标记对绵羊品种分类的机器学习方法研究
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作者 乔利英 王万年 +4 位作者 张莉 庞志旭 张思颖 李一凡 刘文忠 《畜牧兽医学报》 北大核心 2025年第5期2157-2167,共11页
旨在评估基于基因组标记的机器学习(machine learning,ML)算法在品种分类中的有效性,检验不同ML算法在绵羊品种分类中的应用效果如何。本研究采用2种方式对10个绵羊品种进行单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphisms,SNPs)位点选... 旨在评估基于基因组标记的机器学习(machine learning,ML)算法在品种分类中的有效性,检验不同ML算法在绵羊品种分类中的应用效果如何。本研究采用2种方式对10个绵羊品种进行单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphisms,SNPs)位点选择,第一种利用群体间分化指数(fixation index,FST)进行选择,第二种方式是在FST的基础上使用Boruta特征选择算法对SNPs位点进一步筛选。采用K-近邻、支持向量机(support vector machines,SVM)和自适应增强(adaptive boosting,AdaBoost)等8种不同类别的ML算法对绵羊品种进行分类,采用准确性评估不同SNPs选择方式和不同ML算法在品种鉴定中的差异,鉴定绵羊品种分类的最佳组合方式。本研究采用的数据中既有遗传关系较远的品种,也有遗传相似的品种,保证了后续分析的可靠性。根据前1%的筛选标准,FST分析每次筛选出5361个SNPs位点,Boruta算法最终保留(328±11.7)个SNPs位点用于ML品种分类,且在多次迭代后,被标记为“确认”的SNPs位点得分稳定高于阴影特征和被标记的其他两类SNPs位点。Boruta算法保留的SNPs位点数远低于FST分析。在使用ML模型进行品种分类时,大多数模型的准确性均高于0.9。其中,经过Boruta算法选择SNPs位点之后使用SVM模型进行品种分类准确性最高(0.953),AdaBoost表现也同样优秀(0.947),仅使用FST选择SNPs位点之后使用NB模型分类效果最差(0.601)。除NB外,其余模型接收者操作特征曲线下面积均接近于1。无论使用哪种SNPs选择方式均具有较强的区分能力,使用Boruta算法后效果略好。根据上述结果表明,ML方法的实施有效提高了品种分类的准确性,在绵羊品种鉴定中有良好的应用潜力。 展开更多
关键词 机器学习 品种分类 基因组标记 绵羊 准确性
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西门塔尔牛胰腺间充质干细胞分离培养及生物学特性研究
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作者 王仲发 刘晏辰 +4 位作者 闫炎 李旻娟 何玉楠 关伟军 刘文忠 《中国畜牧兽医》 北大核心 2025年第6期2519-2530,共12页
【目的】分离培养西门塔尔牛胰腺间充质干细胞,建立西门塔尔牛胰腺间充质干细胞系,研究其生物学特性,为西门塔尔牛种质资源的保存提供参考。【方法】采集西门塔尔牛胰腺组织,利用酶消法和组织块贴壁法分离培养胰腺间充质干细胞,并对胰... 【目的】分离培养西门塔尔牛胰腺间充质干细胞,建立西门塔尔牛胰腺间充质干细胞系,研究其生物学特性,为西门塔尔牛种质资源的保存提供参考。【方法】采集西门塔尔牛胰腺组织,利用酶消法和组织块贴壁法分离培养胰腺间充质干细胞,并对胰腺间充质干细胞的生物学特性进行鉴定;利用免疫荧光试验和半定量PCR测定细胞表面标记物(CD34、CD73、CD90、CD166)的表达情况;通过绘制P4、P10、P16代细胞生长曲线及计算群体倍增时间测定细胞增殖能力;通过细胞克隆试验测定细胞克隆形成率,通过划痕试验计算细胞迁移率;对纯化后的细胞分别进行成骨细胞、脂肪细胞、软骨细胞诱导分化,检测胰腺间充质干细胞多向分化能力,并通过染色体核型分析试验检测细胞的遗传稳定性。【结果】采用组织块贴壁法培养可得到胰腺间充质干细胞,且传代到第3代基本纯化。半定量PCR结果显示,表面标记物(CD73、CD90、CD166)呈阳性表达,而与造血细胞相关的表面抗原CD34呈阴性表达。西门塔尔牛胰腺间充质干细胞呈现典型的S型生长曲线,P4、P10、P16代细胞群体倍增时间分别为40.22、43.09和44.50 h,细胞克隆形成率分别为26.25%、19.00%和13.50%。划痕试验测定第3代细胞迁移率为44.44%。在体外诱导分化胰腺间充质干细胞后,结果呈现出清晰的脂滴、软骨团和钙结节。核型分析结果判定,西门塔尔牛胰腺间充质干细胞为正常二倍体核型(2n=60,XY),染色体组未发生变异。【结论】从西门塔尔牛胰腺组织分离培养的胰腺间充质干细胞能够稳定遗传,增殖能力强,且具有向成骨细胞、脂肪细胞、软骨细胞分化的潜能。研究结果可为西门塔尔牛组织修复提供新方法,为西门塔尔牛种质资源的保护和保存提供种子细胞。 展开更多
关键词 西门塔尔牛 胰腺间充质干细胞 分离培养 诱导分化
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水电站机组环形吊运行机构打滑原因及对策
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作者 樊小波 张兆礼 +3 位作者 刘文忠 石教锐 董万里 刘文亮 《水电与新能源》 2025年第2期83-85,共3页
环形吊运行机构打滑直接影响机组检修效率。结合典型案例,剖析了水电站机组环形吊运行机构打滑的原因,提出了针对性的处理措施,为同类型设备的相似故障处理提供参考。
关键词 环形吊 运行机构 打滑 油泥 间隙
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利用ArcGIS的潮河流域洪水危险区的划分
4
作者 刘文忠 《河北水利》 2025年第5期31-33,共3页
现以潮河承德段作为研究区域,选取2000年—2020年年均降水量、高程、坡度、河网密度4个因子进行分析,得出每个因子在流域上的分布情况,采用优序图法对4个评价因子的权重进行计算,并构建综合评价指标体系,利用ArcGIS的空间分析计算功能,... 现以潮河承德段作为研究区域,选取2000年—2020年年均降水量、高程、坡度、河网密度4个因子进行分析,得出每个因子在流域上的分布情况,采用优序图法对4个评价因子的权重进行计算,并构建综合评价指标体系,利用ArcGIS的空间分析计算功能,得到潮河流域洪水灾害危险等级分布图,并定量计算各危险区面积占流域面积的比值得出,中高危险区占流域总面积的68%,低危险区占流域总面积的32%,中高危险区沿河分布,低危险区主要集中在丰宁县北部的部分乡镇。 展开更多
关键词 潮河流域 洪水灾害 成灾因子 洪水危险区
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高温高压下井中岩心电阻率的测定和研究 被引量:9
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作者 刘文忠 施行觉 +3 位作者 刘斌 陆仲家 谢端 徐果明 《石油地球物理勘探》 EI CSCD 北大核心 1995年第A02期165-170,共6页
在高温、高压条件下,用交流二极法LCR数字电桥测量了砂岩、灰岩和灰质角砾岩等三种岩石样品的电阻率。测量结果表明:①在140MPa压力和14℃温度范围内所有岩石样品的电阻率都随温压的上升而下降;②压力对电阻率的影响呈明显的非线性... 在高温、高压条件下,用交流二极法LCR数字电桥测量了砂岩、灰岩和灰质角砾岩等三种岩石样品的电阻率。测量结果表明:①在140MPa压力和14℃温度范围内所有岩石样品的电阻率都随温压的上升而下降;②压力对电阻率的影响呈明显的非线性,但温度对电阻率的影响则近于线性;③在对温度和压力作循环加载后,电阻率值不重复,而是在循环结束时的电阻率值较初始值小;④随着温压的上升石灰岩和灰质角砾岩的电阻率以对数形式下降,砂岩则以指数形式下降。 展开更多
关键词 岩心 高温 高压 电阻率法 测定 电法勘探
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葡萄多酚的保健作用及其在酿酒葡萄成熟度判定中的应用 被引量:24
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作者 刘文忠 奚德智 +2 位作者 刘欠欠 高年发 孟庆 《中国酿造》 CAS 北大核心 2008年第11期1-6,共6页
葡萄酒含有极其复杂的物质,其中葡萄多酚对葡萄酒品质具有决定性的作用。本文综述了当前葡萄多酚的研究成果以及在酿酒葡萄成熟度判定中的应用。通过实验证明,酿酒葡萄中葡萄多酚含量的测定值可以用于判断葡萄成熟度,对酿酒葡萄的适时... 葡萄酒含有极其复杂的物质,其中葡萄多酚对葡萄酒品质具有决定性的作用。本文综述了当前葡萄多酚的研究成果以及在酿酒葡萄成熟度判定中的应用。通过实验证明,酿酒葡萄中葡萄多酚含量的测定值可以用于判断葡萄成熟度,对酿酒葡萄的适时采收具有普遍的指导意义。 展开更多
关键词 葡萄多酚 酿酒葡萄 成熟度
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气吸式排种装置排种性能分析 被引量:17
7
作者 刘文忠 赵满全 王文明 《农机化研究》 北大核心 2008年第5期45-47,共3页
气吸式排种装置以其省种、不伤种、对种子尺寸要求不严、适应力强、易于实现单粒精播和作业速度高等优点,得到了广泛应用。为此,从结构和工作原理入手,对影响气吸式排种装置工作性能的主要因素进行了分析,并介绍了相关的试验方法,为今... 气吸式排种装置以其省种、不伤种、对种子尺寸要求不严、适应力强、易于实现单粒精播和作业速度高等优点,得到了广泛应用。为此,从结构和工作原理入手,对影响气吸式排种装置工作性能的主要因素进行了分析,并介绍了相关的试验方法,为今后免耕播种机气吸式排种装置排种性能试验提供参考。 展开更多
关键词 播种机 气吸式 性能 试验方法
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用随机回归模型估计SD-Ⅱ系猪体重的遗传和表型协方差函数 被引量:3
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作者 刘文忠 周忠孝 张沅 《畜牧兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2002年第2期119-123,共5页
用6个世代的686头SD-Ⅱ系猪的生长记录估计作为经度数据的体重的遗传和表型协方差函数。配合将年龄的勒让德多项式作为自变量的随机回归模型,用平均信息约束最大似然(AIREML)法估计回归系数间的协方差,从而得到加性遗传和永久环境协... 用6个世代的686头SD-Ⅱ系猪的生长记录估计作为经度数据的体重的遗传和表型协方差函数。配合将年龄的勒让德多项式作为自变量的随机回归模型,用平均信息约束最大似然(AIREML)法估计回归系数间的协方差,从而得到加性遗传和永久环境协方差函数的系数。结果表明,协方差函数可以反映出体重在连续的年龄尺度上的遗传和表型变异。当多项式的配合阶数k=3,即降阶配合时,便可充分描述SD-Ⅱ系猪体重的生长变化。降价配合涉及的参数较少,同时可以缓和协方差估值间的差异。 展开更多
关键词 SD-Ⅱ系猪 协方差函数 经度数据 约束最大似然法 随机回归模型 体重 遗传 表型
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VertiTrak垂直钻井技术在高陡构造天东004-X3井的应用 被引量:8
9
作者 刘文忠 易炳刚 +2 位作者 范宇 濮强 肖金裕 《钻采工艺》 CAS 北大核心 2010年第6期36-39,共4页
天东004-X3井属川东地区山前典型高陡构造井,地表实测地层倾角高达80度,相邻沙坪场构造井,在采取8~12kN钻压吊打情况下,井斜仍达到了6.3°~10.3°,且平均机械钻速仅1.15m/h。天东004-X3井在采用美国贝克休斯的VertiTrak垂直... 天东004-X3井属川东地区山前典型高陡构造井,地表实测地层倾角高达80度,相邻沙坪场构造井,在采取8~12kN钻压吊打情况下,井斜仍达到了6.3°~10.3°,且平均机械钻速仅1.15m/h。天东004-X3井在采用美国贝克休斯的VertiTrak垂直钻井技术后,取得了平均机械钻速3.63m/h、全试验井段井斜角控制在1°以内的"防斜与提速"双重效果。文中重点介绍垂直钻井系统在天东004-X3井的应用情况,并对比分析所取得的综合经济效果和应用前景。 展开更多
关键词 VTK垂直钻井技术 高陡构造 应用 井斜控制
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闸门耦合式自动投退锁定梁装置的研制及应用
10
作者 包唐伟 孟春琦 +3 位作者 张兆礼 刘文忠 樊小波 杨泞源 《水电与新能源》 2024年第11期32-34,共3页
针对极端恶劣环境中闸门锁定梁无法自动投入和退出的问题,研制了一套以闸门自身上下运行作为动力源的耦合式自动投退锁定梁装置,该装置由动力源触发器、装置移梁机构和安全控制系统共3部分组成,其中装置移梁机构接收触发器传递来的动力... 针对极端恶劣环境中闸门锁定梁无法自动投入和退出的问题,研制了一套以闸门自身上下运行作为动力源的耦合式自动投退锁定梁装置,该装置由动力源触发器、装置移梁机构和安全控制系统共3部分组成,其中装置移梁机构接收触发器传递来的动力,然后按需传递给锁定梁,从而实现闸门在启闭过程中锁定梁自动投退功能。该装置可极大降低人员操作风险与劳动强度。 展开更多
关键词 水电站 闸门 锁定梁 自动投退 耦合式
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基于诊断评估的水电工程桥式起重机检修策略探讨
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作者 张兆礼 谭大文 +2 位作者 董万里 刘文忠 周益 《水电站机电技术》 2024年第3期82-83,108,共3页
桥式起重机是水电工程的重要辅助设备,制定合理的检修策略,对其安全稳定运行具有重要意义。本文重点阐述了桥式起重机设备状态评估方法和参考检修周期,对其检修策略进行了探讨,对水电工程桥式起重机检修管理工作具有借鉴意义。
关键词 桥式起重机 检修 工作周期 评估
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猪乳头数的参数估计及翻乳头遗传方式的判定 被引量:2
12
作者 刘文忠 张绍增 +3 位作者 周忠孝 薜尚君 张学勤 焦德生 《畜牧兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 1995年第5期408-413,共6页
太原花猪总乳头数和先天有效乳头数分别为14.72和13.34个。山西黑猪分别为14.33和13.63个。乳头数具有显著的母体效应及性别和品种差异,且品种和性别间存在显著互作。按阈性状估计遗传力可以消除某些系统误差。山... 太原花猪总乳头数和先天有效乳头数分别为14.72和13.34个。山西黑猪分别为14.33和13.63个。乳头数具有显著的母体效应及性别和品种差异,且品种和性别间存在显著互作。按阈性状估计遗传力可以消除某些系统误差。山西黑猪翻乳头的出现范围大致是0~6个,多出现在2~5对乳头。翻乳头呈常染色体隐性遗传,其隐性基因频率为0.45,外显率为8.41%。由于其不完全外显,可能呈主基因遗传。 展开更多
关键词 育种 乳头数 翻乳头 阈性状 遗传方式
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气吸式排种装置排种性能试验研究 被引量:5
13
作者 刘文忠 赵满全 王文明 《农机化研究》 北大核心 2009年第9期152-156,共5页
采用正交试验方法分别就吸种孔直径、气吸室真空度、排种盘转速3个因素对气吸式排种器排玉米种子时的影响进行了试验。通过试验结果分析得出3个因素的最优组合为:吸种孔直径为6mm、气吸室真空度为3.5kPa、排种盘转速为54r/min,此时合格... 采用正交试验方法分别就吸种孔直径、气吸室真空度、排种盘转速3个因素对气吸式排种器排玉米种子时的影响进行了试验。通过试验结果分析得出3个因素的最优组合为:吸种孔直径为6mm、气吸室真空度为3.5kPa、排种盘转速为54r/min,此时合格率为92.30%;吸种孔直径对排种性能影响显著,是影响排种性能的主要因素;气吸室真空度在满足吸种要求的前提下,改变真空压力对排种质量影响不大,应保证气吸室压力的稳定性。 展开更多
关键词 气吸式 排种装置 工作参数 性能试验
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聚氨酯基AB交联聚合物的动态力学性质 被引量:2
14
作者 刘文忠 林合 +1 位作者 刘景江 韩孝族 《应用化学》 CAS CSCD 北大核心 1990年第2期40-44,共5页
用紫外光聚合方法制备出一系列不同组成的聚己二酸己二醇酯聚氨酯(PHAPU)和甲基丙烯酸甲醇(MMA)AB交联聚合物(ABCP)。用溶胀法和橡胶平台模量法测定了它们的交联密度,两种方法所得结果具有非常好的一致性。本文研究的ABCP半高宽大于60℃... 用紫外光聚合方法制备出一系列不同组成的聚己二酸己二醇酯聚氨酯(PHAPU)和甲基丙烯酸甲醇(MMA)AB交联聚合物(ABCP)。用溶胀法和橡胶平台模量法测定了它们的交联密度,两种方法所得结果具有非常好的一致性。本文研究的ABCP半高宽大于60℃,属于半相容体系。改变PHAPU和MMA的组成可以得到阻尼性能以及其他力学性能比PHAPU和PMMA更好的ABCP。 展开更多
关键词 聚氨酯 AB交联聚合物 力学性质
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安哥拉山羊的遗传改良 被引量:3
15
作者 刘文忠 张沅 《中国畜牧兽医》 CAS 2004年第3期27-30,共4页
与安哥拉山羊主要生产国相比 ,我国对安哥拉山羊的研究无论是在深度还是在广度方面都存在明显的差距 ,为保持安哥拉山羊在我国的持续稳定发展 ,对安哥拉山羊进行持续的遗传改良是必要的。作者在对安哥拉山羊的育种简史加以概述的基础上 ... 与安哥拉山羊主要生产国相比 ,我国对安哥拉山羊的研究无论是在深度还是在广度方面都存在明显的差距 ,为保持安哥拉山羊在我国的持续稳定发展 ,对安哥拉山羊进行持续的遗传改良是必要的。作者在对安哥拉山羊的育种简史加以概述的基础上 ,就主要经济性状的遗传参数、杂交育种和选种方法作了综述 ,就存在的问题予以讨论 ,并提出可能的改进方法以指导我国的安哥拉山羊生产。 展开更多
关键词 安哥拉山羊 遗传改良 遗传参数 杂交育种 选种 经济性状
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中国地方猪种间的核型似近系数 被引量:9
16
作者 刘文忠 周忠孝 《养猪》 北大核心 1994年第3期34-36,共3页
计算了16个中国地方猪种的核型似近系数,采用最短距离法进行了系统聚类。结果表明,各猪种间的核型似近系数在0.8913—0.9878之间,反映出中国猪种在核型上的高度稳定性和高度相似性。在核型上,华中型猪种更倾向于江海... 计算了16个中国地方猪种的核型似近系数,采用最短距离法进行了系统聚类。结果表明,各猪种间的核型似近系数在0.8913—0.9878之间,反映出中国猪种在核型上的高度稳定性和高度相似性。在核型上,华中型猪种更倾向于江海型;华南型更接近于西南型。 展开更多
关键词 中国地方猪种 核型似近系数
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COPU/PBMA交联共聚物网中游离末端对性能的影响 被引量:1
17
作者 刘文忠 刘景江 +1 位作者 杨惠明 韩孝族 《高分子材料科学与工程》 EI CAS CSCD 北大核心 1991年第1期19-22,共4页
制备出一系列具有不同蓖麻油游离末端含量的样品,研究了它们的力学性能、转变与松弛行为以及形态结构。结果表明,全部样品在动态力学谱上只有一个T_g,呈现出一相行为;而用透射电子显微镜观察到的却是具有微相分离的两相体系。游离末端... 制备出一系列具有不同蓖麻油游离末端含量的样品,研究了它们的力学性能、转变与松弛行为以及形态结构。结果表明,全部样品在动态力学谱上只有一个T_g,呈现出一相行为;而用透射电子显微镜观察到的却是具有微相分离的两相体系。游离末端含量的增加使T_g移向低温,明显地增加了低温区的阻尼因子,使微相分离增大,相区大小约从3.5nm增加到20nm。次级松弛与游离末端含量无关。 展开更多
关键词 蓖麻油 交联聚合物 COPU PBMA
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蓖麻油聚氨酯/乙烯类聚合物交联共聚物的动态力学性能 被引量:1
18
作者 刘文忠 刘景江 +2 位作者 杨惠明 韩孝族 侯春荣 《应用化学》 CAS CSCD 北大核心 1989年第3期6-9,共4页
本文研究了蓖麻油聚氨酯(COPU)/聚甲基丙烯酸丁酯(PBMA)交联共聚物(简称ABCP)的动态力学性能,并将其与COPU/PBMA,IPN的动态力学性能作了比较。发现在ABCP中两组份的阻尼峰互相叠加,形成半相容体系,而在IPN中阻尼峰有个宽的平台。透射电... 本文研究了蓖麻油聚氨酯(COPU)/聚甲基丙烯酸丁酯(PBMA)交联共聚物(简称ABCP)的动态力学性能,并将其与COPU/PBMA,IPN的动态力学性能作了比较。发现在ABCP中两组份的阻尼峰互相叠加,形成半相容体系,而在IPN中阻尼峰有个宽的平台。透射电镜照片表明,IPN具有更大的相区结构。这些结果证明,化学交联比物理缠结具有更大的强迫互容性。通过对COPU/乙烯类聚合物(VP)交联共聚物相容性的研究,可知COPU/PBMA,COPU/PST和COPU/PMMA交联共聚物,在动态力学性能上是半相容体系,而COPU/PMA和COPU/PBA交联共聚物是互容体系。 展开更多
关键词 蓖麻油 聚氨酯 AB交联聚合物
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猪乳头性状的遗传及其影响因素(综述) 被引量:5
19
作者 刘文忠 周忠孝 《养猪》 北大核心 1994年第4期33-34,共2页
猪乳头性状的遗传及其影响因素(综述)刘文忠,周忠孝(山西农业大学,030801)猪的育种和生产工作者通常将猪的乳头性状作为重要的繁殖性状。习惯上选留乳头多的公母猪留种,乳头数不足和乳头缺陷是淘汰猪的主要原因之一。本世... 猪乳头性状的遗传及其影响因素(综述)刘文忠,周忠孝(山西农业大学,030801)猪的育种和生产工作者通常将猪的乳头性状作为重要的繁殖性状。习惯上选留乳头多的公母猪留种,乳头数不足和乳头缺陷是淘汰猪的主要原因之一。本世纪50年代以前,猪的育种工作已经开... 展开更多
关键词 育种 乳头性状 遗传
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安哥拉山羊育种和生产中的非遗传因素 被引量:6
20
作者 刘文忠 张沅 《中国草食动物》 2004年第1期46-48,共3页
安哥拉山羊是一个具有较高经济价值的毛用品种。其主要饲养管理方式是放牧 ,因而受众多的非遗传因素影响。尽管与遗传因素相比 ,非遗传因素呈中短期效应 ,但却会在一定程度上混淆或降低遗传进展。因此 ,了解已知的非遗传因素 ,并尽可能... 安哥拉山羊是一个具有较高经济价值的毛用品种。其主要饲养管理方式是放牧 ,因而受众多的非遗传因素影响。尽管与遗传因素相比 ,非遗传因素呈中短期效应 ,但却会在一定程度上混淆或降低遗传进展。因此 ,了解已知的非遗传因素 ,并尽可能在育种和生产中加以合理把握是必要的。文章对安哥拉山羊和马海毛的主要特点加以概述的基础上 ,着重就影响安哥拉山羊育种和生产的非遗传因素作了综述。 展开更多
关键词 安哥拉山羊 育种 生产 非遗传因素
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