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基于重测序技术解析凉山黑绵羊毛色形成的主效基因
1
作者
于璇璇
侯沌樱
+2 位作者
吴旻鸿
林涛
仲涛
《四川农业大学学报》
北大核心
2025年第3期724-731,743,共9页
【目的】通过对凉山黑绵羊和湖羊全基因组重测序,解析凉山黑绵羊毛色形成的主效基因,为凉山黑绵羊种质资源评价和开发利用提供理论基础。【方法】19个凉山黑绵羊和28个湖羊的DNA样本经BGISEQ DNBSEQ-T7platform平台进行测序,整合NCBI数...
【目的】通过对凉山黑绵羊和湖羊全基因组重测序,解析凉山黑绵羊毛色形成的主效基因,为凉山黑绵羊种质资源评价和开发利用提供理论基础。【方法】19个凉山黑绵羊和28个湖羊的DNA样本经BGISEQ DNBSEQ-T7platform平台进行测序,整合NCBI数据库中的巴美肉羊和无角陶赛特羊的测序数据进行PCA、选择信号和KEGG等分析。【结果】PCA结果显示凉山黑绵羊独立聚类,通过F_(ST)和θπ分析在凉山黑绵羊与湖羊、巴美肉羊、无角陶赛特羊中筛选出了U6、JAZF1和SLC26A1等受选择基因。基因型可视化分析揭示,凉山黑绵羊的KIT基因野生型频率显著高于白色绵羊品种;另外,凉山黑绵羊的TRPM1、TMEM18、MC1R和ASIP基因的纯合突变频率均显著高于白色绵羊品种。【结论】KIT、MC1R、ASIP、TMEM18和TRPM1基因是凉山黑绵羊毛色形成的关键基因,研究结果为深入理解其毛色遗传分子机制提供理论依据。
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关键词
凉山黑绵羊
毛色
重测序技术
选择信号
连锁不平衡
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题名
基于重测序技术解析凉山黑绵羊毛色形成的主效基因
1
作者
于璇璇
侯沌樱
吴旻鸿
林涛
仲涛
机构
四川农业大学动物科技学院/畜禽遗传资源发掘与创新利用四川省重点实验室
乐山师范学院/四川省林业草原竹纤维营养创新开发工程技术研究中心
出处
《四川农业大学学报》
北大核心
2025年第3期724-731,743,共9页
基金
国家重点研发计划项目(2021YFD1100204)。
文摘
【目的】通过对凉山黑绵羊和湖羊全基因组重测序,解析凉山黑绵羊毛色形成的主效基因,为凉山黑绵羊种质资源评价和开发利用提供理论基础。【方法】19个凉山黑绵羊和28个湖羊的DNA样本经BGISEQ DNBSEQ-T7platform平台进行测序,整合NCBI数据库中的巴美肉羊和无角陶赛特羊的测序数据进行PCA、选择信号和KEGG等分析。【结果】PCA结果显示凉山黑绵羊独立聚类,通过F_(ST)和θπ分析在凉山黑绵羊与湖羊、巴美肉羊、无角陶赛特羊中筛选出了U6、JAZF1和SLC26A1等受选择基因。基因型可视化分析揭示,凉山黑绵羊的KIT基因野生型频率显著高于白色绵羊品种;另外,凉山黑绵羊的TRPM1、TMEM18、MC1R和ASIP基因的纯合突变频率均显著高于白色绵羊品种。【结论】KIT、MC1R、ASIP、TMEM18和TRPM1基因是凉山黑绵羊毛色形成的关键基因,研究结果为深入理解其毛色遗传分子机制提供理论依据。
关键词
凉山黑绵羊
毛色
重测序技术
选择信号
连锁不平衡
Keywords
Liangshan Black Sheep
coat color
resequencing techniques
selection signal
linkage disequilibrium
分类号
S826.8 [农业科学—畜牧学]
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题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
基于重测序技术解析凉山黑绵羊毛色形成的主效基因
于璇璇
侯沌樱
吴旻鸿
林涛
仲涛
《四川农业大学学报》
北大核心
2025
0
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