摘要
本研究基于6只黑毛柯乐猪全基因组重测序对黑毛柯乐猪SNP和InDel突变位点进行挖掘并分析,对CDS区变异位点进行功能注释和通路分析。结果共检测到25179037个SNP和4129303个InDel,SNP和InDel变异位点主要分布于基因间隔区,其次是内含子区,而在CDS区的变异位点相对较少。对外显子区域的87693个SNP和6373个InDel变异位点进行GO和KEGG富集,发现诸多与免疫、代谢和感官等相关的基因,在KEGG通路中可发现多条与代谢、嗅觉信号和钙信号等相关的通路。本研究丰富了柯乐猪的遗传资源,为保护和开发柯乐猪提供了数据支持。
出处
《中国畜牧杂志》
北大核心
2025年第8期192-199,共8页
Chinese Journal of Animal Science
基金
贵州省生猪产业科技创新项目(黔农计财[2025]9号、黔农计财[2024]33号)
贵州省生猪产业技术体系健康养殖功能实验室和遵义综合试验站建设项目(GZSZCYJSTX-03、GZSZCYJSTX-07)
国家重点研发计划子课题(2022YFD1100308-01)
贵州省科技计划项目(黔科合平台人才[2021]5630号)
贵州省科技支撑计划(黔科合支撑[2021]一般147)联合资助。
作者简介
王倩倩(2002-),女,贵州织金人,在读硕士研究生,研究方向为动物遗传育种与繁殖,E-mail:2184500899@qq.com;通讯作者:张依裕(1976-),男,博士,贵州黔西人,教授,研究方向为动物遗传资源创新与健康养殖,E-mail:zyy8yyc@163.com;通讯作者:肖礼华(1977-),男,博士,正高级畜牧师,研究方向为畜牧技术推广,E-mail:27292665@qq.com。
