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基于多组学和AlphaFold2对稻瘟灵防治稻瘟病菌的靶标鉴定

Identification of targets for control of rice blast by isoprothiolane based on multi-omics and Alphafold2
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摘要 为了分析稻瘟灵影响稻瘟病菌的关键功能和靶标,测试稻瘟灵抑制稻瘟病菌的最佳浓度,并利用转录组学、代谢组学和结构生物学方法,比较分析稻瘟灵处理稻瘟病菌后的基因、代谢物表达差异,同时利用AlphaFold2、分子对接方法对潜在靶标进行分子模拟和预测。结果表明,稻瘟灵抑制稻瘟病菌的半数效应浓度(EC50)约为17.5μmol/L,共鉴定到上调的差异基因数量为1055个,下调的差异基因数量为1846个。GO功能富集分析结果表明,用稻瘟灵处理稻瘟病菌后,使用差异基因富集的功能包括乳酸代谢、氧化还原酶活性、酰胺结合、多糖结合、碳水化合物代谢、β-葡萄糖苷酶等;受到影响的KEGG通路包括淀粉和糖代谢、氮、甘油酯代谢、脂肪酸降解和蛋白激酶等;通过基因和代谢物共表达网络分析,鉴定到3个脂质相关蛋白与稻瘟灵的相关性较高,但分子对接结果表明,仅MGG_00435编码的膜蛋白、MGG_05433编码的溶质运载家族6蛋白与稻瘟灵结合。
出处 《江苏农业科学》 北大核心 2025年第14期62-69,共8页 Jiangsu Agricultural Sciences
基金 现代农业产业科技服务项目(编号:KC23139) 徐州市科技重点研发项目(编号:KC21121)。
作者简介 凤舞剑(1976-),男,江苏睢宁人,硕士,副教授,主要从事农业有害生物菌原分离、鉴定及综合防控技术研究。E-mail:fwjedu@126.com。
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