摘要
为获得中山麻鸭细胞因子信号转导抑制因子1(Suppressor of Cytokine Signaling 1, SOCS1)基因CDS序列,明确其生物学功能,了解其在不同阶段不同组织中的表达模式,本研究以中山麻鸭雏鸭、青年鸭和成年鸭为研究对象,通过TA克隆获得CDS序列,并对序列进行生物信息学分析,采用RT-qPCR方法检测SOCS1基因在不同年龄段不同器官的表达差异。结果发现,中山麻鸭SOCS1基因CDS区长624 bp,含有22个稀有密码子,编码207个氨基酸;中山麻鸭SOCS1基因与北京鸭、凤头潜鸭和天鹅的核苷酸序列相似性分别为100%、99.4%、97.6%;进化树结果表明,中山麻鸭SOCS1基因与北京鸭的亲缘关系最近,说明SOCS1基因编码序列具有种属特异性;其编码的蛋白分子量为23.104ku,理论等电点9.71,不含N-糖基化位点,存在24个磷酸化位点,属亲水性碱性蛋白;SOCS1蛋白二级结构以无规则卷曲和α-螺旋为主,三级结构与二级结构基本一致,且SOCS1蛋白含有一个中央SH2结构域和一个SOCS盒结构域,不存在信号肽和跨膜结构,为非分泌型蛋白,主要存在于细胞核中;该蛋白共存在10个主要互作蛋白;SOCS1基因在雏鸭、青年鸭和成年鸭的各组织中均表达,在雏鸭和青年鸭的心脏表达量最高,在成年鸭的肌肉中表达量最高,且差异极显著。本研究初步阐明了SOCS1蛋白的理化性质、结构特性、功能特点及SOCS1 mRNA在雏鸭和成年鸭不同组织中的表达情况,为深入探究SOCS1基因在生物学调控中的作用机制提供了参考。
出处
《中国畜牧杂志》
北大核心
2025年第7期199-207,共9页
Chinese Journal of Animal Science
基金
广东省基础与应用基础研究基金(2022A1515012194)
广东省水禽产业技术体系创新团队(2023KJ137)。
作者简介
刘春红(1998-),女,广东梅州人,硕士,主要从事水禽疫病防控研究,E-mail:lch969525@163.com;通讯作者:张雪莲(1988-),女,黑龙江延寿人,博士,讲师,主要从事水禽疫病防控研究,E-mail:zxlsjw0312@163.com。
