摘要
目的探索多种因素致急性肺损伤(acute lung injury,ALI)/急性呼吸窘迫综合征(acute respiratory distress syndrome,ARDS)时Ⅱ型肺泡上皮细胞(alveolar typeⅡ,ATⅡ)损伤的相关分子标志物,为ALI/ARDS的疾病认知及治疗提供新依据。方法从美国国立生物技术信息中心公共数据GEO获得RNA-Seq数据集,应用R语言包筛选差异表达基因(DEGs),进行GO功能注释和KEGG富集分析。通过STRING数据库和Cytoscape软件计算蛋白互作网络分析中节点度排名前10及MCODE得分最高模块,取交集为核心基因,通过DGIdb数据库预测其潜在治疗药物。结果最终在不同的数据集中筛选出了78个共表达DEGs。GO分析发现其产物主要作为宿主细胞成分及蛋白酶体核心复合体等参与粒细胞迁移、细菌源性分子反应及细胞因子介导的信号通路等生物学过程,具有细胞因子活性、趋化因子活性及受体-配体活性等。KEGG分析发现其相关通路主要为TNF信号通路、NF-κB信号通路及细胞因子-细胞因子受体作用信号通路等;蛋白网络分析最终确定了IRF7、IFIT1、IFIT3、PSMB8、PSMB9、BST2、OASL2及ZBP1共8个核心基因,均表达上调。结论ATⅡ与ALI/ARDS发生发展密切相关,分析ATⅡ相关差异基因,从分子与细胞层面探讨治疗策略,为疾病带来新的治疗思路。
出处
《中华急诊医学杂志》
CAS
CSCD
北大核心
2024年第1期89-94,共6页
Chinese Journal of Emergency Medicine
基金
国家自然科学基金(81571882)
作者简介
通信作者:刘伟,Email:icer007@163.com。
