摘要
杜梨(Pyrus betulifolia Bunge)抗逆性强,叶色随季节变化而改变,被广泛用于沿海滩涂景观改造,是园林绿化中常用树种。为了解杜梨色叶相关基因调控途径,对杜梨叶片进行转录组测序,共获得67.7 Gb测序数据,通过组装共得到60 611个基因,其中包含1 059个新基因;与8个功能数据库进行比对分析,共57 669个基因得到了功能注释,注释效率为95.15%;GO分析发现,已注释的差异表达基因共涉及49个功能组,主要集中在膜(细胞组分)、催化活性(分子功能)、代谢过程(生物学过程)等中;KEGG分析发现,差异表达基因主要富集在碳代谢和植物-病原体相互作用等生物学过程中;共筛选出10个与类黄酮相关的基因,分别属于UDPGT等6个基因家族;在杜梨叶片转录组中共筛选出452 501个SNP位点,碱基转换类型所占比例远远高于颠换类型,表明杜梨具有丰富的SNP位点信息。本研究结果可为探究杜梨色叶分子机制等提供理论依据。
出处
《江苏农业科学》
北大核心
2022年第3期58-67,共10页
Jiangsu Agricultural Sciences
基金
江苏省农业科学院探索性颠覆性创新计划[编号:ZX(21)1231]
江苏省南通市基础科学研究计划(编号:CJ2019046)。
作者简介
陈燕(1993-),女,江苏扬州人,研究实习员,主要从事彩叶植物应用和休闲农业研究。E-mail:517079542@qq.com;通信作者:李玉娟,副研究员,主要从事彩叶植物栽培应用等研究。E-mail:381260896@qq.com。
