期刊文献+

浅谈微生物基因组的进化研究

在线阅读 下载PDF
导出
摘要 近十几年来,随着大规模DNA测序技术的飞速发展,今天拥有了包括我们人类自己在内的近千种不同细胞生物的全基因组参考序列.而如何比较分析这么多的基因组数据是生物学家面临的一大挑战。结合我们研究组的一些工作,重点介绍进化生物学家是如何利用这些丰富的基因组数据——特别是原核生物的基因组序列——通过挑选不同的分子标记。计算分析并重建这些系统发育关系,以期帮助人们更好地理解地球生命的起源与进化,生命系统对地球环境变化的作用,以及微生物与人类健康的关系等一系列科学问题。
作者 林魁
出处 《生物学通报》 2008年第5期1-3,共3页 Bulletin of Biology
基金 国家自然科学基金委的资助(30571037)
作者简介 林魁,通讯作者:教授,博士生指导教师。1963年6月生,1983年本科毕业于兰州大学数力系数学专业,1997年在兰州大学获生态学博士学位。1998年至2002年分别在新加坡国立大学生物信息学中心、新加坡分子与细胞生物学研究所以及新加坡基因组研究所从事生物信息学的研究工作。2002年8月起到北京师范大学生命科学学院从事生物信息学的教学和科研工作。目前的研究方向为微生物基因组进化、全基因组水平上蛋白质与蛋白质相互作用网络的构建与分析、蛋白质相似性比较与分类等(E—mail:linkui@bnu.edu.cn)
  • 相关文献

参考文献6

  • 1Snel B., M.A. Huynen and B.E.Dutilh.Genome trees and the nature of genome evolution.Annual Review Of Microbiology,2005,59:191-209.
  • 2Delsuc F.,H.Brinkmann and H.Philippe. Phylogenomics and the reconstruction of the tree of life.Nat Rev Genet,2005,6(5):361-75.
  • 3Coenye T.,D.Gevers et al. Towards a prokaryotic genomic taxonomy. Ferns Microbiology Reviews,2005,29(2):147--167.
  • 4Rokas A., Genomics and the tree of life. Science, 2006, 313(5795): 1897-9.
  • 5Luo Y.,C.Fu, D.Y. Zhang and K.Lin.Overlapping genes as rare genomle markers: the phylogeny of gamma-Proteobaeteria as a ease study.Trends Genet,2006.22(11) :593-6.
  • 6Luo Y., C.Fu, D.Y. Zhang and K.Lin.BPhyOG:an interactive server for genome-wide inference of bacterial phylogenies based on overlapping genes.BMC Bioinformatics,2007,8:266.

相关作者

内容加载中请稍等...

相关机构

内容加载中请稍等...

相关主题

内容加载中请稍等...

浏览历史

内容加载中请稍等...
;
使用帮助 返回顶部