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利用基因表达谱筛选肝细胞癌中炎性微环境形成相关新基因的研究
1
作者
于津浦
Tine Casneuf
+3 位作者
刘芃芃
Hans Winkler
任秀宝
郝希山
《中国肿瘤临床》
CAS
CSCD
北大核心
2011年第21期1304-1309,共6页
目的:利用基因表达谱芯片筛选肝细胞癌(HCC)中的差异表达基因,并分析神经降压素(NTS)表达与HCC中炎性微环境形成的相互关系。方法:收集10例原发性HCC癌与癌旁组织,提取RNA进行Affvmetrix全基因组表达谱芯片检测,同时整合GEO数据库中同...
目的:利用基因表达谱芯片筛选肝细胞癌(HCC)中的差异表达基因,并分析神经降压素(NTS)表达与HCC中炎性微环境形成的相互关系。方法:收集10例原发性HCC癌与癌旁组织,提取RNA进行Affvmetrix全基因组表达谱芯片检测,同时整合GEO数据库中同芯片平台的亚洲人原发性HCC的mRNA表达谱数据30例,利用R2.9.0软件获得差异基因列表,应用Metacore2.5,Pathway studio6.0和Ingenuity1.0软件进行信号通路分析。最后,结合HE染色比较不同NTS表达水平的HCC标本中炎症反应强度。结果:所有RNA样品无降解,各芯片数据的信号强度分布均一。SMA聚类和信号通路分析结果显示40例HCC标本中存在一组独特亚群,呈现神经降压素(NTS)高表达,并伴有胞外间质重构、细胞粘附、白细胞移动、血管新生等生物学过程显著增强。HE染色证实NTS高表达标本中炎细胞浸润、纤维增生和血管生成明显高于NTS低表达的标本。结论:NTS高表达可能促进HCC中炎性环境的形成。
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关键词
肝细胞癌
神经降压素
炎性微环境
肿瘤转移
基因表达谱
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职称材料
题名
利用基因表达谱筛选肝细胞癌中炎性微环境形成相关新基因的研究
1
作者
于津浦
Tine Casneuf
刘芃芃
Hans Winkler
任秀宝
郝希山
机构
天津医科大学附属肿瘤医院免疫室天津市肿瘤防治重点实验室
天津医科大学附属肿瘤医院免疫室强生联合实验室
johnson & johnson pharmaceutical research & development
出处
《中国肿瘤临床》
CAS
CSCD
北大核心
2011年第21期1304-1309,共6页
文摘
目的:利用基因表达谱芯片筛选肝细胞癌(HCC)中的差异表达基因,并分析神经降压素(NTS)表达与HCC中炎性微环境形成的相互关系。方法:收集10例原发性HCC癌与癌旁组织,提取RNA进行Affvmetrix全基因组表达谱芯片检测,同时整合GEO数据库中同芯片平台的亚洲人原发性HCC的mRNA表达谱数据30例,利用R2.9.0软件获得差异基因列表,应用Metacore2.5,Pathway studio6.0和Ingenuity1.0软件进行信号通路分析。最后,结合HE染色比较不同NTS表达水平的HCC标本中炎症反应强度。结果:所有RNA样品无降解,各芯片数据的信号强度分布均一。SMA聚类和信号通路分析结果显示40例HCC标本中存在一组独特亚群,呈现神经降压素(NTS)高表达,并伴有胞外间质重构、细胞粘附、白细胞移动、血管新生等生物学过程显著增强。HE染色证实NTS高表达标本中炎细胞浸润、纤维增生和血管生成明显高于NTS低表达的标本。结论:NTS高表达可能促进HCC中炎性环境的形成。
关键词
肝细胞癌
神经降压素
炎性微环境
肿瘤转移
基因表达谱
Keywords
Hepatocellular carcinoma
Neurotensin
Inflammatory microenvironment
Metastasis
Gene expression profiling
分类号
R735.7 [医药卫生—肿瘤]
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作者
出处
发文年
被引量
操作
1
利用基因表达谱筛选肝细胞癌中炎性微环境形成相关新基因的研究
于津浦
Tine Casneuf
刘芃芃
Hans Winkler
任秀宝
郝希山
《中国肿瘤临床》
CAS
CSCD
北大核心
2011
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