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基于后缀树思想构造Web生物数据搜索的数据模型
被引量：
1
1
作者
喻钧
王长元
+1 位作者
Sven Schuierer
喻萌
《西安工程科技学院学报》
2006年第2期206-209,共4页
针对Web上的公共生物学数据资源,提出一种适合于在线搜索生物学数据的数据模型.该模型基于后缀树思想,通过建立生物体的DNA、RNA、蛋白质序列数据的后缀树结构,并将之转化为更加空间有效的后缀数组,然后搜索数组以找到查询序列的近似匹...
针对Web上的公共生物学数据资源,提出一种适合于在线搜索生物学数据的数据模型.该模型基于后缀树思想,通过建立生物体的DNA、RNA、蛋白质序列数据的后缀树结构,并将之转化为更加空间有效的后缀数组,然后搜索数组以找到查询序列的近似匹配.结果表明,这种数据模型比常规的线性搜索模型在时间和空间开销上更加高效.
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关键词
生物学数据库
搜索
后缀树
后缀数组
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题名
基于后缀树思想构造Web生物数据搜索的数据模型
被引量：
1
1
作者
喻钧
王长元
Sven Schuierer
喻萌
机构
西安工业学院计算机科学与工程学院
institut fuer informatik albert-ludwigs-universitaet freiburg
中国航空工业第一集团公司飞行自动控制研究所
出处
《西安工程科技学院学报》
2006年第2期206-209,共4页
文摘
针对Web上的公共生物学数据资源,提出一种适合于在线搜索生物学数据的数据模型.该模型基于后缀树思想,通过建立生物体的DNA、RNA、蛋白质序列数据的后缀树结构,并将之转化为更加空间有效的后缀数组,然后搜索数组以找到查询序列的近似匹配.结果表明,这种数据模型比常规的线性搜索模型在时间和空间开销上更加高效.
关键词
生物学数据库
搜索
后缀树
后缀数组
Keywords
biological database
searching
suffix tree
suffix array
分类号
TP311.12 [自动化与计算机技术—计算机软件与理论]
G354.4 [文化科学—情报学]
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作者
出处
发文年
被引量
操作
1
基于后缀树思想构造Web生物数据搜索的数据模型
喻钧
王长元
Sven Schuierer
喻萌
《西安工程科技学院学报》
2006
1
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