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肉鸡圆圈病毒3型和A型多杀性巴氏杆菌混合感染的检测与分析
被引量：
1
1
作者
庄丽云
雷天宇
+8 位作者
戴婷婷
吴玲玲
朱金玲
廖悦辰
牛群
包银莉
黄翠琴
戴爱玲
郑新添
《动物医学进展》
北大核心
2024年第1期18-23,共6页
为查明福建省龙岩市某鸡场肉鸡消瘦、呼吸困难、病死率升高原因,对发病鸡进行细菌分离鉴定、16S rDNA鉴定、荚膜分型检测、药物敏感试验等分析;以及进行病毒核酸PCR检测、遗传进化分析。结果显示,从病鸡中分离的细菌在血平板上形成圆形...
为查明福建省龙岩市某鸡场肉鸡消瘦、呼吸困难、病死率升高原因,对发病鸡进行细菌分离鉴定、16S rDNA鉴定、荚膜分型检测、药物敏感试验等分析;以及进行病毒核酸PCR检测、遗传进化分析。结果显示,从病鸡中分离的细菌在血平板上形成圆形、微突起、表面光滑、奶油状的菌落;分离菌16S rDNA核苷酸序列与GenBank中公布的多杀性巴氏杆菌的同源性达到99.9%以上,菌株荚膜为A型;该菌对哌拉西林、头孢氨苄、庆大霉素等药物均表现为高度敏感;从病鸡中检测出圆圈病毒3型(GyV3)VP2基因,与GenBank(登录号MK089248)GyV3同源性最高(99.9%)。结果表明,该鸡场发生圆圈病毒3型和A型多杀性巴氏杆菌引起的混合感染病例。
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关键词
圆圈病毒3型
多杀性巴氏杆菌
混合感染
病原学分析
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职称材料
1株利用乳酸的猪源丁酸梭菌的分离鉴定及基因组序列分析
被引量：
5
2
作者
胡晓冰
林标声
+1 位作者
王振伟
郑黎静
《中国畜牧兽医》
CAS
北大核心
2022年第2期569-578,共10页
【目的】研究1株利用乳酸的猪源丁酸梭菌的基因组信息。【方法】采用厌氧培养法,通过乳酸分解培养基(LADM)初筛、梭菌增殖培养基(RCM)复筛,从饲喂乳酸菌发酵饲料的健康仔猪肠道内容物中分离利用乳酸快、丁酸转化率高的菌株,对所筛选的...
【目的】研究1株利用乳酸的猪源丁酸梭菌的基因组信息。【方法】采用厌氧培养法,通过乳酸分解培养基(LADM)初筛、梭菌增殖培养基(RCM)复筛,从饲喂乳酸菌发酵饲料的健康仔猪肠道内容物中分离利用乳酸快、丁酸转化率高的菌株,对所筛选的菌株进行形态鉴定、16S rDNA序列分析、乳酸转化特性试验、基因组重测序和框架图测序,并对其编码蛋白进行功能注释。【结果】分离得到1株分离菌LY33,基于形态和16S rDNA序列分析鉴定为丁酸梭菌。菌株LY33对乳酸具有较好的利用能力,在生长第6天可将66 mmol的乳酸基本转化完全,生成17 mmol左右的丁酸。LY33菌株的重测序表明,其编码基因整体变异较小,与参考基因组相比,LY33菌株全基因组杂合比率为0.022‰,单核苷酸多态性(SNP)位点变异总数21590个(占整个基因组0.4666%),插入缺失(InDel)突变总和594个(占0.0128%),不存在拷贝数变异(CNV),结构变异(SV)注释的变异总数103个(占0.0003%)。突变基因主要为与菌株生长、能量代谢调节、维生素合成(特别是生物素)有关的基因,分布于2条染色体的多条序列上。LY33菌株框架图测序及其编码基因蛋白的功能注释表明,其基因组序列长度4627127 bp,GC含量28.60%,含有4171个基因,编码区总长度占比84.12%,参与了糖代谢(carbohydrate metabolism)、膜转运(membrane transport)和氨基酸代谢(amino acid metabolism)等多种代谢途径转化过程,基因组中抗大环内酯类药物、抗杆菌肽、VanI糖肽抗性基因个数较多。【结论】本研究从饲喂4%乳酸菌发酵饲料的健康仔猪肠道内容物中分离到1株利用乳酸快、丁酸转化率高的LY33菌株,经鉴定为丁酸梭菌,其具有良好的应用前景,可作为一种新的微生物资源用于微生态制剂产品。
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关键词
丁酸梭菌
乳酸
分离鉴定
基因组
序列分析
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职称材料
猪蛔虫不同发育阶段09G10基因的表达分析
3
作者
黄翠琴
赖芳芳
+2 位作者
杨小燕
戴爱玲
李晓华
《动物医学进展》
CSCD
北大核心
2010年第8期60-63,共4页
为进一步鉴定和分析猪蛔虫感染相关基因,从构建的猪蛔虫感染期幼虫消减cDNA文库中筛选出一基因(EST编号为09G10),以肌动蛋白(β-actin)为内参,采用半定量RT-PCR方法分析该基因在猪蛔虫不同发育阶段的表达情况。通过09G10基因与内参β-ac...
为进一步鉴定和分析猪蛔虫感染相关基因,从构建的猪蛔虫感染期幼虫消减cDNA文库中筛选出一基因(EST编号为09G10),以肌动蛋白(β-actin)为内参,采用半定量RT-PCR方法分析该基因在猪蛔虫不同发育阶段的表达情况。通过09G10基因与内参β-actin基因的积分光密度的比值结果显示,09G10在感染期幼虫中呈现高丰度表达,在肺第3期幼虫和第4期幼虫期有微量表达,在其他各期虫体包括肝第3期幼虫、雌虫、雄虫和虫卵均未检测出该基因的表达量,表明09G10基因可能是猪蛔虫幼虫期所特有的基因,在幼虫感染宿主过程中可能扮演重要角色,为进一步研究该基因的功能提供了依据。
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关键词
猪蛔虫
感染期幼虫
半定量RT-PCR
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职称材料
题名
肉鸡圆圈病毒3型和A型多杀性巴氏杆菌混合感染的检测与分析
被引量：
1
1
作者
庄丽云
雷天宇
戴婷婷
吴玲玲
朱金玲
廖悦辰
牛群
包银莉
黄翠琴
戴爱玲
郑新添
机构
福建
农林大学动物科学
学院
龙岩学院预防兽医学与生物技术福建省高等学校重点实验室
龙岩学院
动物源性人兽共患病防控
福建省
高校工程研究中心
出处
《动物医学进展》
北大核心
2024年第1期18-23,共6页
基金
龙岩学院预防兽医学与生物技术福建省高等学校重点实验室开放基金项目(2022KF03)
动物源性人兽共患病防控福建省高校工程研究中心开放基金项目(2022K010)。
文摘
为查明福建省龙岩市某鸡场肉鸡消瘦、呼吸困难、病死率升高原因,对发病鸡进行细菌分离鉴定、16S rDNA鉴定、荚膜分型检测、药物敏感试验等分析;以及进行病毒核酸PCR检测、遗传进化分析。结果显示,从病鸡中分离的细菌在血平板上形成圆形、微突起、表面光滑、奶油状的菌落;分离菌16S rDNA核苷酸序列与GenBank中公布的多杀性巴氏杆菌的同源性达到99.9%以上,菌株荚膜为A型;该菌对哌拉西林、头孢氨苄、庆大霉素等药物均表现为高度敏感;从病鸡中检测出圆圈病毒3型(GyV3)VP2基因,与GenBank(登录号MK089248)GyV3同源性最高(99.9%)。结果表明,该鸡场发生圆圈病毒3型和A型多杀性巴氏杆菌引起的混合感染病例。
关键词
圆圈病毒3型
多杀性巴氏杆菌
混合感染
病原学分析
Keywords
Gyrovirus 3
Pasteurella multocida
mixed infection
etiological analysis
分类号
S852.659.2 [农业科学—基础兽医学]
S858.31 [农业科学—临床兽医学]
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职称材料
题名
1株利用乳酸的猪源丁酸梭菌的分离鉴定及基因组序列分析
被引量：
5
2
作者
胡晓冰
林标声
王振伟
郑黎静
机构
黄河水利职业
技术
学院
环境工程
学院
龙岩学院
生命科学
学院
龙岩学院
出处
《中国畜牧兽医》
CAS
北大核心
2022年第2期569-578,共10页
基金
2019年度河南省高等职业学校青年骨干教师培养计划(2019GZGG067)
福建省预防兽医学与兽医生物技术重点实验室开放课题项目(2019KF03)
福建省科技厅农业科技引导性项目(2020N0033)。
文摘
【目的】研究1株利用乳酸的猪源丁酸梭菌的基因组信息。【方法】采用厌氧培养法,通过乳酸分解培养基(LADM)初筛、梭菌增殖培养基(RCM)复筛,从饲喂乳酸菌发酵饲料的健康仔猪肠道内容物中分离利用乳酸快、丁酸转化率高的菌株,对所筛选的菌株进行形态鉴定、16S rDNA序列分析、乳酸转化特性试验、基因组重测序和框架图测序,并对其编码蛋白进行功能注释。【结果】分离得到1株分离菌LY33,基于形态和16S rDNA序列分析鉴定为丁酸梭菌。菌株LY33对乳酸具有较好的利用能力,在生长第6天可将66 mmol的乳酸基本转化完全,生成17 mmol左右的丁酸。LY33菌株的重测序表明,其编码基因整体变异较小,与参考基因组相比,LY33菌株全基因组杂合比率为0.022‰,单核苷酸多态性(SNP)位点变异总数21590个(占整个基因组0.4666%),插入缺失(InDel)突变总和594个(占0.0128%),不存在拷贝数变异(CNV),结构变异(SV)注释的变异总数103个(占0.0003%)。突变基因主要为与菌株生长、能量代谢调节、维生素合成(特别是生物素)有关的基因,分布于2条染色体的多条序列上。LY33菌株框架图测序及其编码基因蛋白的功能注释表明,其基因组序列长度4627127 bp,GC含量28.60%,含有4171个基因,编码区总长度占比84.12%,参与了糖代谢(carbohydrate metabolism)、膜转运(membrane transport)和氨基酸代谢(amino acid metabolism)等多种代谢途径转化过程,基因组中抗大环内酯类药物、抗杆菌肽、VanI糖肽抗性基因个数较多。【结论】本研究从饲喂4%乳酸菌发酵饲料的健康仔猪肠道内容物中分离到1株利用乳酸快、丁酸转化率高的LY33菌株,经鉴定为丁酸梭菌,其具有良好的应用前景,可作为一种新的微生物资源用于微生态制剂产品。
关键词
丁酸梭菌
乳酸
分离鉴定
基因组
序列分析
Keywords
Clostridium butyricum
lactic acid
isolation and identification
genome
sequence analysis
分类号
Q939.94 [生物学—微生物学]
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职称材料
题名
猪蛔虫不同发育阶段09G10基因的表达分析
3
作者
黄翠琴
赖芳芳
杨小燕
戴爱玲
李晓华
机构
龙岩学院
生命科学
学院
龙岩学院预防兽医学与生物技术福建省高等学校重点实验室
出处
《动物医学进展》
CSCD
北大核心
2010年第8期60-63,共4页
基金
福建省自然科学基金项目(2008J0070)
福建省教育厅科技计划A类项目(JA08232)
文摘
为进一步鉴定和分析猪蛔虫感染相关基因,从构建的猪蛔虫感染期幼虫消减cDNA文库中筛选出一基因(EST编号为09G10),以肌动蛋白(β-actin)为内参,采用半定量RT-PCR方法分析该基因在猪蛔虫不同发育阶段的表达情况。通过09G10基因与内参β-actin基因的积分光密度的比值结果显示,09G10在感染期幼虫中呈现高丰度表达,在肺第3期幼虫和第4期幼虫期有微量表达,在其他各期虫体包括肝第3期幼虫、雌虫、雄虫和虫卵均未检测出该基因的表达量,表明09G10基因可能是猪蛔虫幼虫期所特有的基因,在幼虫感染宿主过程中可能扮演重要角色,为进一步研究该基因的功能提供了依据。
关键词
猪蛔虫
感染期幼虫
半定量RT-PCR
Keywords
Ascaris suum
infective larva
semi-quantitative RT-PCR
分类号
S852.731 [农业科学—基础兽医学]
Q786 [生物学—分子生物学]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
肉鸡圆圈病毒3型和A型多杀性巴氏杆菌混合感染的检测与分析
庄丽云
雷天宇
戴婷婷
吴玲玲
朱金玲
廖悦辰
牛群
包银莉
黄翠琴
戴爱玲
郑新添
《动物医学进展》
北大核心
2024
1
在线阅读
下载PDF
职称材料
2
1株利用乳酸的猪源丁酸梭菌的分离鉴定及基因组序列分析
胡晓冰
林标声
王振伟
郑黎静
《中国畜牧兽医》
CAS
北大核心
2022
5
在线阅读
下载PDF
职称材料
3
猪蛔虫不同发育阶段09G10基因的表达分析
黄翠琴
赖芳芳
杨小燕
戴爱玲
李晓华
《动物医学进展》
CSCD
北大核心
2010
0
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职称材料
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