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福建省猪圆环病毒4型PCR检测及全基因组序列分析
被引量：
9
1
作者
刘建奎
李娜
+6 位作者
吴熠丹
邓小莺
毛婉
黄晓紫
张焦杰
黄夏玲
魏春华
《动物医学进展》
北大核心
2021年第8期33-38,共6页
为了解福建省猪圆环病毒4型(PCV4)流行株的现状和遗传演化,收集了2018年-2019年福建省规模化猪场200份疑似断奶仔猪多系统衰竭综合征(PMWS)的猪组织病料或血清,通过荧光定量PCR方法进行PCV4的核酸检测。结果表明,200份检测样品中PCV4核...
为了解福建省猪圆环病毒4型(PCV4)流行株的现状和遗传演化,收集了2018年-2019年福建省规模化猪场200份疑似断奶仔猪多系统衰竭综合征(PMWS)的猪组织病料或血清,通过荧光定量PCR方法进行PCV4的核酸检测。结果表明,200份检测样品中PCV4核酸阳性的有4份,检出率为2%(4/200),成功克隆了1个PCV4全基因组序列(FJ-PCV4)。FJ-PCV4的基因组全长为1 770 bp,与国内PCV4代表毒株(GenBank登录号MK948416和MK986820)核苷酸序列同源性为98.8%~99.2%,与PCV1、PCV2及PCV3代表毒株Eng-1970、AF055392、AF055394、DK1980PMWSfree、BDH、 MN2016和MO2015等的核苷酸同源性为43.3%~52.0%,而与水貂圆环病毒Mink circovirus strain SD16、Mink circovirus strain MiCV-DL13同源性为68.1%~68.2%,表明PCV4是一种不同于PCV1、PCV2和PCV3的新型圆环病毒。研究结果为PCV4的分子流行病学研究提供了基础资料。
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关键词
猪圆环病毒4型
全基因组
Cap基因
序列分析
系统发育
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职称材料
福建省14株PRRSV-2全基因组特性分析
被引量：
3
2
作者
魏春华
夏伟
+7 位作者
马英
李娜
吴熠丹
勾明郗
林志峰
戴爱玲
杨小燕
刘建奎
《中国预防兽医学报》
CAS
CSCD
北大核心
2019年第9期964-968,共5页
为了解福建省PRRSV的流行情况及分子特征,本研究选取14株不同年份不同谱系的PRRSV-2(lineage 3、lineage 8.7、lineage 5.1和lineage 1)进行全基因组扩增并测序分析。结果显示,福建省14株PRRSV-2基因组全长为15 016 bp^15 407 bp,与VR-2...
为了解福建省PRRSV的流行情况及分子特征,本研究选取14株不同年份不同谱系的PRRSV-2(lineage 3、lineage 8.7、lineage 5.1和lineage 1)进行全基因组扩增并测序分析。结果显示,福建省14株PRRSV-2基因组全长为15 016 bp^15 407 bp,与VR-2332、CH-1a、JXA1和NADC30的核苷酸序列同源性为82.9%~99.4%,14株PRRSV-2之间核苷酸序列同源性为82.1%~99.3%,差异较大。分离株FJCH、FJZH与JXA1-R疫苗株高度同源(99.5%~99.6%),且处于同一进化分支,推测其可能来源于疫苗株。重组分析显示14株PRRSV-2存在较高的重组概率(3/14),均发生在lineage 8.7和lineage 1之间。本研究为科学防控福建地区PRRS提供了参考数据。
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关键词
猪繁殖与呼吸综合征病毒
全基因组
遗传变异
基因重组
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职称材料
题名
福建省猪圆环病毒4型PCR检测及全基因组序列分析
被引量：
9
1
作者
刘建奎
李娜
吴熠丹
邓小莺
毛婉
黄晓紫
张焦杰
黄夏玲
魏春华
机构
龙岩学院
生命科学
学院
/福建省
家畜
传染病
防治
与生物技术
重点
实验室
/福建省
生猪
疫病
防控
工程技术
研究
中心
出处
《动物医学进展》
北大核心
2021年第8期33-38,共6页
基金
福建省科技引导项目(2018N0022)
福建省大学生创新创业训练计划资助项目(201911312034、201911312044)
+1 种基金
龙岩学院产学研项目(LC2017005)
奇迈基金项目(XLQM007)。
文摘
为了解福建省猪圆环病毒4型(PCV4)流行株的现状和遗传演化,收集了2018年-2019年福建省规模化猪场200份疑似断奶仔猪多系统衰竭综合征(PMWS)的猪组织病料或血清,通过荧光定量PCR方法进行PCV4的核酸检测。结果表明,200份检测样品中PCV4核酸阳性的有4份,检出率为2%(4/200),成功克隆了1个PCV4全基因组序列(FJ-PCV4)。FJ-PCV4的基因组全长为1 770 bp,与国内PCV4代表毒株(GenBank登录号MK948416和MK986820)核苷酸序列同源性为98.8%~99.2%,与PCV1、PCV2及PCV3代表毒株Eng-1970、AF055392、AF055394、DK1980PMWSfree、BDH、 MN2016和MO2015等的核苷酸同源性为43.3%~52.0%,而与水貂圆环病毒Mink circovirus strain SD16、Mink circovirus strain MiCV-DL13同源性为68.1%~68.2%,表明PCV4是一种不同于PCV1、PCV2和PCV3的新型圆环病毒。研究结果为PCV4的分子流行病学研究提供了基础资料。
关键词
猪圆环病毒4型
全基因组
Cap基因
序列分析
系统发育
Keywords
Porcine circovirus type 4
complete genome
Cap protein
sequence analysis
phylogeny
分类号
S852.659.2 [农业科学—基础兽医学]
Q786 [生物学—分子生物学]
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职称材料
题名
福建省14株PRRSV-2全基因组特性分析
被引量：
3
2
作者
魏春华
夏伟
马英
李娜
吴熠丹
勾明郗
林志峰
戴爱玲
杨小燕
刘建奎
机构
龙岩学院生命科学学院福建省家畜传染病防治与生物技术重点实验室/福建省生猪疫病防控工程技术研究中心
出处
《中国预防兽医学报》
CAS
CSCD
北大核心
2019年第9期964-968,共5页
基金
福建省科技厅引导性项目(2018N0022)
福建省教育厅中青年项目(JAT170571)
龙岩学院产学研项目(LC2017005),龙岩学院产学研项目(LC2016010)
文摘
为了解福建省PRRSV的流行情况及分子特征,本研究选取14株不同年份不同谱系的PRRSV-2(lineage 3、lineage 8.7、lineage 5.1和lineage 1)进行全基因组扩增并测序分析。结果显示,福建省14株PRRSV-2基因组全长为15 016 bp^15 407 bp,与VR-2332、CH-1a、JXA1和NADC30的核苷酸序列同源性为82.9%~99.4%,14株PRRSV-2之间核苷酸序列同源性为82.1%~99.3%,差异较大。分离株FJCH、FJZH与JXA1-R疫苗株高度同源(99.5%~99.6%),且处于同一进化分支,推测其可能来源于疫苗株。重组分析显示14株PRRSV-2存在较高的重组概率(3/14),均发生在lineage 8.7和lineage 1之间。本研究为科学防控福建地区PRRS提供了参考数据。
关键词
猪繁殖与呼吸综合征病毒
全基因组
遗传变异
基因重组
Keywords
porcine reproductive and respiratory syndrome virus
complete viral genome
genetic variation
recombination
分类号
S852.65 [农业科学—基础兽医学]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
福建省猪圆环病毒4型PCR检测及全基因组序列分析
刘建奎
李娜
吴熠丹
邓小莺
毛婉
黄晓紫
张焦杰
黄夏玲
魏春华
《动物医学进展》
北大核心
2021
9
在线阅读
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职称材料
2
福建省14株PRRSV-2全基因组特性分析
魏春华
夏伟
马英
李娜
吴熠丹
勾明郗
林志峰
戴爱玲
杨小燕
刘建奎
《中国预防兽医学报》
CAS
CSCD
北大核心
2019
3
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