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福建省猪圆环病毒4型PCR检测及全基因组序列分析
被引量：
10
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作者
刘建奎
李娜
+6 位作者
吴熠丹
邓小莺
毛婉
黄晓紫
张焦杰
黄夏玲
魏春华
《动物医学进展》
北大核心
2021年第8期33-38,共6页
为了解福建省猪圆环病毒4型(PCV4)流行株的现状和遗传演化,收集了2018年-2019年福建省规模化猪场200份疑似断奶仔猪多系统衰竭综合征(PMWS)的猪组织病料或血清,通过荧光定量PCR方法进行PCV4的核酸检测。结果表明,200份检测样品中PCV4核...
为了解福建省猪圆环病毒4型(PCV4)流行株的现状和遗传演化,收集了2018年-2019年福建省规模化猪场200份疑似断奶仔猪多系统衰竭综合征(PMWS)的猪组织病料或血清,通过荧光定量PCR方法进行PCV4的核酸检测。结果表明,200份检测样品中PCV4核酸阳性的有4份,检出率为2%(4/200),成功克隆了1个PCV4全基因组序列(FJ-PCV4)。FJ-PCV4的基因组全长为1 770 bp,与国内PCV4代表毒株(GenBank登录号MK948416和MK986820)核苷酸序列同源性为98.8%~99.2%,与PCV1、PCV2及PCV3代表毒株Eng-1970、AF055392、AF055394、DK1980PMWSfree、BDH、 MN2016和MO2015等的核苷酸同源性为43.3%~52.0%,而与水貂圆环病毒Mink circovirus strain SD16、Mink circovirus strain MiCV-DL13同源性为68.1%~68.2%,表明PCV4是一种不同于PCV1、PCV2和PCV3的新型圆环病毒。研究结果为PCV4的分子流行病学研究提供了基础资料。
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关键词
猪圆环病毒4型
全基因组
Cap基因
序列分析
系统发育
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题名
福建省猪圆环病毒4型PCR检测及全基因组序列分析
被引量：
10
1
作者
刘建奎
李娜
吴熠丹
邓小莺
毛婉
黄晓紫
张焦杰
黄夏玲
魏春华
机构
龙岩学院生命科学学院/福建省家畜传染病防治与生物技术重点实验室/福建省生猪疫病防控工程技术研究中心
出处
《动物医学进展》
北大核心
2021年第8期33-38,共6页
基金
福建省科技引导项目(2018N0022)
福建省大学生创新创业训练计划资助项目(201911312034、201911312044)
+1 种基金
龙岩学院产学研项目(LC2017005)
奇迈基金项目(XLQM007)。
文摘
为了解福建省猪圆环病毒4型(PCV4)流行株的现状和遗传演化,收集了2018年-2019年福建省规模化猪场200份疑似断奶仔猪多系统衰竭综合征(PMWS)的猪组织病料或血清,通过荧光定量PCR方法进行PCV4的核酸检测。结果表明,200份检测样品中PCV4核酸阳性的有4份,检出率为2%(4/200),成功克隆了1个PCV4全基因组序列(FJ-PCV4)。FJ-PCV4的基因组全长为1 770 bp,与国内PCV4代表毒株(GenBank登录号MK948416和MK986820)核苷酸序列同源性为98.8%~99.2%,与PCV1、PCV2及PCV3代表毒株Eng-1970、AF055392、AF055394、DK1980PMWSfree、BDH、 MN2016和MO2015等的核苷酸同源性为43.3%~52.0%,而与水貂圆环病毒Mink circovirus strain SD16、Mink circovirus strain MiCV-DL13同源性为68.1%~68.2%,表明PCV4是一种不同于PCV1、PCV2和PCV3的新型圆环病毒。研究结果为PCV4的分子流行病学研究提供了基础资料。
关键词
猪圆环病毒4型
全基因组
Cap基因
序列分析
系统发育
Keywords
Porcine circovirus type 4
complete genome
Cap protein
sequence analysis
phylogeny
分类号
S852.659.2 [农业科学—基础兽医学]
Q786 [生物学—分子生物学]
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题名
作者
出处
发文年
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1
福建省猪圆环病毒4型PCR检测及全基因组序列分析
刘建奎
李娜
吴熠丹
邓小莺
毛婉
黄晓紫
张焦杰
黄夏玲
魏春华
《动物医学进展》
北大核心
2021
10
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