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题名山羊TLR4基因的生物信息学分析
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作者
雷国栋
曾亚英
刘树梅
涂雷
王子奥
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机构
湘西土家族苗族自治州畜牧水产事务中心
阿拉善盟农畜产品质量安全中心
龙山县桂塘镇农业综合服务中心
龙山县畜牧兽医技术推广服务中心站
湖南生物机电职业技术学院动物科技学院
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出处
《当代畜禽养殖业》
2024年第6期3-7,共5页
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基金
湖南省自然科学基金项目(NO2024JJ7550)。
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文摘
为研究山羊Toll样受体4(TLR4)基因的结构与功能,本试验利用生物信息学方法对山羊TLR4基因核苷酸的相似性、氨基酸序列、蛋白理化性质、蛋白质结构和互作蛋白等进行分析。结果表明:山羊TLR4基因共编码641个氨基酸,为碱性亲水性非稳定蛋白,其中亮氨酸含量最多,占15.6%;山羊TLR4蛋白的分子式是C_(3334)H_(5245)N_(881)O_(942)S_(28),分子质量为73640.34 u,等电点为8.23;多肽链中以无规则卷曲为主,第454~641个氨基酸在膜内,属跨膜蛋白;蛋白互作表明,山羊TLR4蛋白可能通过介导脂多糖(LPS)等与Toll样受体家族2(TLR2)、白细胞分化抗原14(CD14)、肿瘤坏死因子受体相关因子6(TRAF6)和髓样分化因子88(MYD88)等蛋白发生作用,从而参与核因子-κB(NF-κB)、丝裂原活化蛋白激酶(MAPK)和非受体酪氨酸激酶(Src)等信号通路在脂代谢、炎症及生殖免疫等方面发生作用。
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关键词
山羊
TLR4基因
生物信息学
分析
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分类号
S827
[农业科学—畜牧学]
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题名牛ADSL基因的生物信息学分析
- 2
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作者
向倩
田军
贾明亮
雷国栋
曾亚英
刘树梅
涂雷
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机构
吉首市畜牧水产事务中心
湘西土家族苗族自治州畜牧水产事务中心
内蒙古阿拉善盟农畜产品质量安全中心
龙山县桂塘镇农业综合服务中心
龙山县畜牧兽医技术推广服务中心站
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出处
《当代畜禽养殖业》
2024年第4期31-35,共5页
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基金
湘西州重点研发项目(NO2021NC2002)。
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文摘
本试验利用生物信息学方法对牛ADSL基因的开放阅读框、理化性质、亲水性/疏水性、蛋白质二级结构、磷酸化位点/N-糖基化位点及跨膜区进行预测分析。结果表明:牛ADSL基因编码490个氨基酸,等电点为6.45,不稳定指数为53.53,属于不稳定蛋白;亲疏水平均值为-0.249,属于亲水蛋白;二级结构以α螺旋为主,含有243个α螺旋、44个延伸链、203个无规则卷曲,40个潜在的磷酸化位点,有1个N-糖基化位点;通过蛋白网络互作等表明,牛ADSL蛋白可能与腺苷酸基琥珀酸合成酶(ADSS)、甘氨酰胺核苷酸转甲基酶(GART)等蛋白互作,共同调节肌苷酸(IMP)含量,从而影响牛肉鲜味。说明牛ADSL基因作为催化IMP合成的双功能酶,与动物的生长、疾病的发生及肉质等相关。
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关键词
牛
ADSL基因
生物信息学
分析
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分类号
S823
[农业科学—畜牧学]
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题名山羊CD14基因及其编码蛋白的生物信息学分析
- 3
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作者
雷国栋
曾亚英
刘树梅
涂雷
王子奥
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机构
湘西土家族苗族自治州畜牧水产事务中心
内蒙古阿拉善盟农畜产品质量安全中心
龙山县桂塘镇农业综合服务中心
龙山县畜牧兽医技术推广服务中心站
湖南生物机电职业技术学院动物科技学院
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出处
《贵州畜牧兽医》
2024年第6期12-15,共4页
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基金
“湘西呆鲤基因组组装及比较基因组研究”湖南省自然科学基金项目(NO2024JJ7550)。
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文摘
为探究山羊CD14基因及其编码蛋白CD14的结构与功能,试验利用生物信息学软件对山羊CD14基因进化及其编码蛋白的氨基酸序列、蛋白质理化性质、蛋白质结构和互作蛋白进行分析。结果:山羊CD14基因与绵阳、四川羚羊、弯角大羚羊亲缘关系最近,物种间有较高的保守性。其编码的CD14蛋白共有373个氨基酸,为疏水稳定蛋白,其中亮氨酸含量最多,占15.8%;山羊CD14蛋白的分子式为C_(1772)H_(2864)N_(498)O_(515)S_(17),分子质量39 930.28 u,等电点为8.47;多肽链中以无规则卷曲为主,第1~20个氨基酸为跨膜蛋白;蛋白互作表明,山羊CD14蛋白通过与TLR2、TLR4、TLR6、CXCL8、SPI1、TYROBP、PLCG2、LY96、LOC10218632010、BPI 10个蛋白互作在细胞免疫中发挥作用。结论:山羊CD14基因与绵羊、四川羚羊、弯角大羚羊亲缘关系最近;其编码蛋白CD14是由373个氨基酸组成的以无规则卷曲为主的疏水性跨膜蛋白,结构稳定,与TLR2、TLR4、TLR6等10个蛋白关系紧密。
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关键词
山羊
CD14基因
CD14蛋白
生物信息学分析
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分类号
S827
[农业科学—畜牧学]
Q75
[生物学—分子生物学]
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