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工业大麻ZF-HD转录因子的鉴定及表达分析
被引量：
1
1
作者
翟莹
高双
+5 位作者
王志刚
赵明
祁宏英
马天意
张军
李珊珊
《西南农业学报》
CSCD
北大核心
2024年第6期1188-1195,共8页
【目的】对工业大麻ZF-HD(Zinc finger-homeodomain)转录因子进行鉴定和表达模式分析,为ZF-HD功能研究及工业大麻遗传性状的改良提供理论参考。【方法】对5个工业大麻ZF-HD转录因子的基因结构、蛋白理化性质、蛋白系统进化关系和启动子...
【目的】对工业大麻ZF-HD(Zinc finger-homeodomain)转录因子进行鉴定和表达模式分析,为ZF-HD功能研究及工业大麻遗传性状的改良提供理论参考。【方法】对5个工业大麻ZF-HD转录因子的基因结构、蛋白理化性质、蛋白系统进化关系和启动子顺式作用元件进行生物信息学分析,通过实时荧光定量PCR(qRT-PCR)对基因表达量进行检测。【结果】5个CsZF-HD基因分布于大麻基因组的2条染色体上,其编码序列长度为783~1185 bp,编码260~394个氨基酸残基,蛋白分子量为27.95~43.33 ku,理论等电点为7.46~8.87。它们编码的蛋白均含有1个保守的ZF-HD_dimer结构域,均为不稳定的亲水性蛋白且定位于细胞核中。ZF-HD蛋白家族分为3个亚族(A、B和C),CsZF-HD1和CsZF-HD2属于A亚族,CsZF-HD3属于C亚族,CsZF-HD4和CsZF-HD5属于B亚族。CsZF-HD1和CsZF-HD2在茎和叶中的表达量相差不明显,在根中表达量最低;CsZF-HD3在茎中的表达量最高,叶中表达量最低;CsZF-HD4在叶中的表达量最高,根中表达量最低;CsZF-HD5在根中表达量最高,茎中表达量最低。5个CsZF-HD基因均对盐和干旱胁迫响应,其中CsZF-HD1和CsZF-HD3在盐和干旱胁迫下表达量升高最明显。5个CsZF-HD基因启动子序列中均含有不同种类和数量的逆境相关顺式作用元件。【结论】ZF-HD转录因子可能在工业大麻应对盐和干旱胁迫时发挥转录调控作用。
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关键词
工业大麻
ZF-HD转录因子
生物信息学分析
干旱胁迫
盐胁迫
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职称材料
题名
工业大麻ZF-HD转录因子的鉴定及表达分析
被引量：
1
1
作者
翟莹
高双
王志刚
赵明
祁宏英
马天意
张军
李珊珊
机构
齐齐哈尔
大学
生命科学与农林学院
齐齐哈尔
大学
寒区麻及制品教育部工程研究
中心
齐齐哈尔
大学
化学与化学工程学院
齐齐哈尔
大学
国家
市场监管
技术创新
中心
(
工业
大麻
)
黑龙江省农业科学院畜牧兽医分院
出处
《西南农业学报》
CSCD
北大核心
2024年第6期1188-1195,共8页
基金
黑龙江省省属高等学校基本科研业务费科研项目(145109506)
高教强省科研专项科技成果产业化攻关项目(135209264)。
文摘
【目的】对工业大麻ZF-HD(Zinc finger-homeodomain)转录因子进行鉴定和表达模式分析,为ZF-HD功能研究及工业大麻遗传性状的改良提供理论参考。【方法】对5个工业大麻ZF-HD转录因子的基因结构、蛋白理化性质、蛋白系统进化关系和启动子顺式作用元件进行生物信息学分析,通过实时荧光定量PCR(qRT-PCR)对基因表达量进行检测。【结果】5个CsZF-HD基因分布于大麻基因组的2条染色体上,其编码序列长度为783~1185 bp,编码260~394个氨基酸残基,蛋白分子量为27.95~43.33 ku,理论等电点为7.46~8.87。它们编码的蛋白均含有1个保守的ZF-HD_dimer结构域,均为不稳定的亲水性蛋白且定位于细胞核中。ZF-HD蛋白家族分为3个亚族(A、B和C),CsZF-HD1和CsZF-HD2属于A亚族,CsZF-HD3属于C亚族,CsZF-HD4和CsZF-HD5属于B亚族。CsZF-HD1和CsZF-HD2在茎和叶中的表达量相差不明显,在根中表达量最低;CsZF-HD3在茎中的表达量最高,叶中表达量最低;CsZF-HD4在叶中的表达量最高,根中表达量最低;CsZF-HD5在根中表达量最高,茎中表达量最低。5个CsZF-HD基因均对盐和干旱胁迫响应,其中CsZF-HD1和CsZF-HD3在盐和干旱胁迫下表达量升高最明显。5个CsZF-HD基因启动子序列中均含有不同种类和数量的逆境相关顺式作用元件。【结论】ZF-HD转录因子可能在工业大麻应对盐和干旱胁迫时发挥转录调控作用。
关键词
工业大麻
ZF-HD转录因子
生物信息学分析
干旱胁迫
盐胁迫
Keywords
Hemp
ZF-HD transcription factor
Bioinformatics analysis
Drought stress
Salt stress
分类号
S563.3 [农业科学—作物学]
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作者
出处
发文年
被引量
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1
工业大麻ZF-HD转录因子的鉴定及表达分析
翟莹
高双
王志刚
赵明
祁宏英
马天意
张军
李珊珊
《西南农业学报》
CSCD
北大核心
2024
1
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