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IGFBP6在不稳定颈动脉斑块中的作用:生物信息学分析与实验验证
被引量：
2
1
作者
李玉岩
梁莹莹
+2 位作者
周洁信
车飞
付金霞
《解放军医学杂志》
CAS
CSCD
北大核心
2024年第6期701-710,共10页
目的探讨不稳定颈动脉粥样硬化斑块的差异表达基因(DEGs)及其分子相互作用。方法从基因表达数据库(GEO)和欧洲生物信息学研究所数据库下载颈动脉斑块患者的基因表达数据集GSE41571、GSE118481和E-MTAB-2055。采用基因本体生物学过程(GO-...
目的探讨不稳定颈动脉粥样硬化斑块的差异表达基因(DEGs)及其分子相互作用。方法从基因表达数据库(GEO)和欧洲生物信息学研究所数据库下载颈动脉斑块患者的基因表达数据集GSE41571、GSE118481和E-MTAB-2055。采用基因本体生物学过程(GO-BP)富集分析、京都基因与基因组百科全书(KEGG)富集分析、蛋白-蛋白相互作用(PPI)网络、miRNAs/转录因子与靶基因的相互关系及药物-基因相互作用等方法,分析至少两个数据集中不稳定颈动脉斑块的共调控DEGs。采用定量实时PCR(qRT-PCR)和酶联免疫吸附试验(ELISA)检测颈动脉粥样硬化斑块患者58例的颈动脉斑块和血浆中部分DEGs的表达水平。结果GO富集分析显示,不稳定颈动脉斑块的DEGs主要富集在与炎症反应相关的基因和细胞外基质结构基因;KEGG富集分析显示,不稳定颈动脉斑块中上调的DEGs富集于细胞外基质受体相互作用、PI3K-Akt、Hippo信号通路及转化生长因子-β(TGF-β)信号通路,下调的DEGs主要富集于溶酶体、吞噬体及趋化因子过程。PPI网络分析结果显示,COL1A2、COL4A2、胰岛素样生长因子结合蛋白6(IGFBP6)、COL4A5、C1QA、CXCL10、CXCL2、CXCR4和CSF1R等可能在PPI网络中起重要作用。药物-基因相互作用的预测显示,CSF1R的药物相互作用最多,CXCL2受药物拮抗程度最高,IGFBP6受药物激活程度最高。qRT-PCR检测结果显示,与稳定斑块组比较,不稳定斑块组IGFBP6表达水平明显降低(P<0.001)。ELISA法检测结果显示,不稳定斑块组血浆IGFBP6浓度明显低于稳定斑块组(P<0.0001)。受试者工作特征曲线分析结果显示,采用血浆IGFBP6水平鉴别不稳定斑块的曲线下面积为0.894(95%CI 0.810~0.977),截断值为142.08 ng/ml。结论IGFBP6可能成为预测不稳定颈动脉斑块的重要生物标志物。
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关键词
动脉粥样硬化
卒中
生物信息学
胰岛素样生长因子结合蛋白6
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职称材料
45例急性冠状动脉综合征患者血液中基质金属蛋白酶含量变化
2
作者
梁波
王艳霞
张迎春
《中国心血管杂志》
2006年第2期109-110,共2页
目的探讨基质金属蛋白酶(MMP)与冠状动脉粥样硬化斑块稳定性的相关性。方法急性冠状动脉综合征(ACS)患者在入院即刻、入院一周、出院时,测定血浆MMP浓度,并与对照组比较分析。结果ACS组血清MMP浓度明显高于对照组,且差异有统计学意义。...
目的探讨基质金属蛋白酶(MMP)与冠状动脉粥样硬化斑块稳定性的相关性。方法急性冠状动脉综合征(ACS)患者在入院即刻、入院一周、出院时,测定血浆MMP浓度,并与对照组比较分析。结果ACS组血清MMP浓度明显高于对照组,且差异有统计学意义。结论MMP与冠状动脉斑块不稳定性呈密切相关,可望作为冠状动脉斑块不稳定性的参考指标。
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关键词
基质金属蛋白酶
急性冠状动脉综合征
斑块不稳定性
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职称材料
题名
IGFBP6在不稳定颈动脉斑块中的作用:生物信息学分析与实验验证
被引量：
2
1
作者
李玉岩
梁莹莹
周洁信
车飞
付金霞
机构
齐齐哈尔
医学院
附属
第二
医院
神经
内科
齐齐哈尔医学院附属第二医院心血管内科
出处
《解放军医学杂志》
CAS
CSCD
北大核心
2024年第6期701-710,共10页
基金
齐齐哈尔市科技计划创新激励项目(CSFGG-2020148)。
文摘
目的探讨不稳定颈动脉粥样硬化斑块的差异表达基因(DEGs)及其分子相互作用。方法从基因表达数据库(GEO)和欧洲生物信息学研究所数据库下载颈动脉斑块患者的基因表达数据集GSE41571、GSE118481和E-MTAB-2055。采用基因本体生物学过程(GO-BP)富集分析、京都基因与基因组百科全书(KEGG)富集分析、蛋白-蛋白相互作用(PPI)网络、miRNAs/转录因子与靶基因的相互关系及药物-基因相互作用等方法,分析至少两个数据集中不稳定颈动脉斑块的共调控DEGs。采用定量实时PCR(qRT-PCR)和酶联免疫吸附试验(ELISA)检测颈动脉粥样硬化斑块患者58例的颈动脉斑块和血浆中部分DEGs的表达水平。结果GO富集分析显示,不稳定颈动脉斑块的DEGs主要富集在与炎症反应相关的基因和细胞外基质结构基因;KEGG富集分析显示,不稳定颈动脉斑块中上调的DEGs富集于细胞外基质受体相互作用、PI3K-Akt、Hippo信号通路及转化生长因子-β(TGF-β)信号通路,下调的DEGs主要富集于溶酶体、吞噬体及趋化因子过程。PPI网络分析结果显示,COL1A2、COL4A2、胰岛素样生长因子结合蛋白6(IGFBP6)、COL4A5、C1QA、CXCL10、CXCL2、CXCR4和CSF1R等可能在PPI网络中起重要作用。药物-基因相互作用的预测显示,CSF1R的药物相互作用最多,CXCL2受药物拮抗程度最高,IGFBP6受药物激活程度最高。qRT-PCR检测结果显示,与稳定斑块组比较,不稳定斑块组IGFBP6表达水平明显降低(P<0.001)。ELISA法检测结果显示,不稳定斑块组血浆IGFBP6浓度明显低于稳定斑块组(P<0.0001)。受试者工作特征曲线分析结果显示,采用血浆IGFBP6水平鉴别不稳定斑块的曲线下面积为0.894(95%CI 0.810~0.977),截断值为142.08 ng/ml。结论IGFBP6可能成为预测不稳定颈动脉斑块的重要生物标志物。
关键词
动脉粥样硬化
卒中
生物信息学
胰岛素样生长因子结合蛋白6
Keywords
atherosclerosis
apoplexy
bioinformatics
insulin-like growth factor binding protein 6
分类号
R543.3 [医药卫生—心血管疾病]
R743.3 [医药卫生—神经病学与精神病学]
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职称材料
题名
45例急性冠状动脉综合征患者血液中基质金属蛋白酶含量变化
2
作者
梁波
王艳霞
张迎春
机构
齐齐哈尔医学院附属第二医院心血管内科
出处
《中国心血管杂志》
2006年第2期109-110,共2页
基金
齐齐哈尔科技局指导性计划项目及齐齐哈尔医学院重点科研项目编号:(XY2004-44-10)
文摘
目的探讨基质金属蛋白酶(MMP)与冠状动脉粥样硬化斑块稳定性的相关性。方法急性冠状动脉综合征(ACS)患者在入院即刻、入院一周、出院时,测定血浆MMP浓度,并与对照组比较分析。结果ACS组血清MMP浓度明显高于对照组,且差异有统计学意义。结论MMP与冠状动脉斑块不稳定性呈密切相关,可望作为冠状动脉斑块不稳定性的参考指标。
关键词
基质金属蛋白酶
急性冠状动脉综合征
斑块不稳定性
Keywords
Matrix metalloproteases
Acute coronary syndromes
Plaque instability
分类号
R541.4 [医药卫生—心血管疾病]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
IGFBP6在不稳定颈动脉斑块中的作用:生物信息学分析与实验验证
李玉岩
梁莹莹
周洁信
车飞
付金霞
《解放军医学杂志》
CAS
CSCD
北大核心
2024
2
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职称材料
2
45例急性冠状动脉综合征患者血液中基质金属蛋白酶含量变化
梁波
王艳霞
张迎春
《中国心血管杂志》
2006
0
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职称材料
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