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lncRNA NRON通过调节TGF-β/Smad信号通路诱导心肌梗死小鼠心肌纤维化
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作者 杨超 苏涛 +5 位作者 贾迪 林岩 程昊 张奇 梁晶 张春晶 《中国医科大学学报》 北大核心 2025年第10期926-930,共5页
目的探讨长链非编码RNA(lncRNA)NRON对心肌梗死(MI)小鼠心肌纤维化的影响及作用机制。方法将32只C57BL/6小鼠随机分成Sham组、MI组、MI+shNRON组和MI+NC组,每组8只。采用实时定量PCR检测小鼠心肌组织中lncRNA NRON的表达水平;HE染色、Ma... 目的探讨长链非编码RNA(lncRNA)NRON对心肌梗死(MI)小鼠心肌纤维化的影响及作用机制。方法将32只C57BL/6小鼠随机分成Sham组、MI组、MI+shNRON组和MI+NC组,每组8只。采用实时定量PCR检测小鼠心肌组织中lncRNA NRON的表达水平;HE染色、Masson染色、免疫组织化学检测小鼠心肌病理损伤程度和心肌纤维化程度,胶原蛋白Ⅰ(colⅠ)的表达水平;Western blotting检测小鼠心肌组织中转化生长因子β1(TGF-β1)、磷酸化的Smad2(p-Smad2)、磷酸化的Smad3(p-Smad3)蛋白表达水平。结果与Sham组相比,MI组NRON的表达增加,心肌病理损伤程度、心肌纤维化程度加重,colⅠ的表达增加,TGF-β1、p-Smad2、p-Smad3蛋白表达增加;与MI组相比,MI+shNRON组NRON的表达下降,心肌病理损伤程度、心肌纤维化程度减轻,colⅠ的表达下降,TGF-β1、p-Smad2、p-Smad3蛋白表达下降。结论lncRNA NRON下调可减轻MI小鼠心肌病理损伤,抑制心肌纤维化,其分子机制可能与抑制TGF-β/Smad信号通路有关。 展开更多
关键词 长链非编码RNA NRON TGF-Β/SMAD 心肌梗死 心肌纤维化
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基于生物信息学构建肝细胞癌预后相关circRNA-miRNA-mRNA调控网络 被引量:3
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作者 袁浩桐 姜博文 +3 位作者 李真鹏 井媛旭 袁硕 杨超 《中国医科大学学报》 CAS 北大核心 2023年第5期413-419,共7页
目的应用生物信息学方法筛选肝细胞癌中差异表达的环状RNA(circRNA),构建肝癌预后相关circRNA-微RNA(miRNA)-mRNA调控网络。方法从基因表达综合(GEO)数据库中下载肝癌相关circRNA数据集,应用GEO2R工具筛选差异表达circRNA,在Circular RN... 目的应用生物信息学方法筛选肝细胞癌中差异表达的环状RNA(circRNA),构建肝癌预后相关circRNA-微RNA(miRNA)-mRNA调控网络。方法从基因表达综合(GEO)数据库中下载肝癌相关circRNA数据集,应用GEO2R工具筛选差异表达circRNA,在Circular RNA Interactome及circBank数据库中预测与circRNA相结合的miRNA,在miRDB、RNAInter及TargetScan数据中预测miRNA的靶基因,构建circRNA-miRNA-mRNA调控网络。应用DAVID软件、STRING数据库、Cytoscape软件及GEPIA数据库对靶基因进行功能注释、通路分析、蛋白质-蛋白质相互作用网络(PPI)构建及预后分析,最后确定肝癌预后相关circRNA-miRNA-核心靶基因调控网络。结果筛选出1个circRNA,为hsa_circRNA_0000301,与之结合的miRNA有4个,分别为hsamiR-377-3p、hsa-miR-767-3p、hsa-miR-1178-3p及hsa-miR-1228-3p。功能注释和通路富集分析显示靶基因主要参与泛素依赖性蛋白质分解代谢等过程,且在MAPK等多个信号通路中显著富集。通过PPI网络及预后分析筛选出3个预后相关核心靶基因,分别为EIF4E、PRKACB和NRAS。最后构建出含有1个circRNA,2个miRNA,3个靶基因的肝癌预后相关调控网络。结论本研究为深入挖掘肝癌发生的分子机制,寻找肝癌潜在的circRNA诊断标志物提供一定的研究依据。 展开更多
关键词 肝癌 环状RNA 微RNA 竞争性内源RNA
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长链非编码RNA-NRON对小鼠心肌梗死后细胞凋亡的作用机制研究 被引量:1
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作者 高涵 张春晶 +3 位作者 李淑艳 师岩 郭红艳 杨超 《中国医科大学学报》 CAS 北大核心 2024年第3期218-223,共6页
目的探讨长链非编码RNA(lncRNA)-NRON对小鼠心肌梗死(MI)后细胞凋亡的影响。方法将C57BL/6小鼠随机分为假手术(Sham)组、MI组、MI合并注入lncRNA-NRON干扰慢病毒(MI+shNRON)组和MI合并注入NC阴性对照慢病毒(MI+NC)组。采用实时PCR检测ln... 目的探讨长链非编码RNA(lncRNA)-NRON对小鼠心肌梗死(MI)后细胞凋亡的影响。方法将C57BL/6小鼠随机分为假手术(Sham)组、MI组、MI合并注入lncRNA-NRON干扰慢病毒(MI+shNRON)组和MI合并注入NC阴性对照慢病毒(MI+NC)组。采用实时PCR检测lncRNA-NRON的表达;用HE染色、TTC染色、TUNEL染色检测心肌组织病理损伤、MI面积、细胞凋亡情况;用RPIseq数据库预测lncRNA-NRON与电压依赖性阴离子通道蛋白(VDAC)的互作概率;用Western blotting检测lncRNA-NRON对VDAC蛋白表达的影响。结果lncRNA-NRON在MI组表达显著升高,特异性敲减lncRNA-NRON后,可减轻心肌组织病理损伤,减少MI面积,抑制细胞凋亡,lncRNA-NRON与VDAC的互作概率高达0.9,且lncRNA-NRON可调控VDAC的蛋白表达。结论敲减lncRNA-NRON可抑制MI后心肌损伤的发生,其机制可能是通过lncRNA-NRON与VDAC结合并抑制其表达,从而影响细胞凋亡进程。 展开更多
关键词 长链非编码RNA-NRON 心肌梗死 电压依赖性阴离子通道蛋白 细胞凋亡
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长链非编码RNA 00511抑制非小细胞肺癌H1299细胞的恶性生物学行为及其可能的机制
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作者 郭红艳 李耕慧 +6 位作者 刘波 孙晓杰 赵正林 赵学梅 杨超 高涵 赵丹 《中国肿瘤生物治疗杂志》 2025年第11期1143-1150,共8页
目的:基于生物信息学分析和体内、体外实验研究长链非编码RNA00511(LINC00511)敲减对非小细胞肺癌细胞增殖、凋亡、侵袭等恶性生物学行为的影响,并初步探究其作用机制。方法:通过基因表达谱交互分析(GEPIA)数据库分析LINC00511在非小细... 目的:基于生物信息学分析和体内、体外实验研究长链非编码RNA00511(LINC00511)敲减对非小细胞肺癌细胞增殖、凋亡、侵袭等恶性生物学行为的影响,并初步探究其作用机制。方法:通过基因表达谱交互分析(GEPIA)数据库分析LINC00511在非小细胞肺癌的表达水平,及其与患者肿瘤分期、生存期等临床特征、肿瘤细胞恶性生物学行为有关基因的相关性;利用shRNA慢病毒载体构建LINC00511敲减的H1299肺癌细胞株,克隆形成实验、划痕愈合实验和流式细胞术分别检测对H1299细胞增殖、迁移、细胞周期和凋亡能力的影响,qRT-PCR检测相关调控基因表达,WB法检测肿瘤相关蛋白的表达;构建裸鼠皮下移植瘤模型,取瘤组织进行免疫组织化学实验检测Ki67表达情况。结果:GEPIA数据库分析表明LINC00511在非小细胞肺癌组织中表达水平升高,且与该病的临床分期情况相关(P<0.05),LINC00511与肺癌中CASP3、CCNB1、CDK4等多种基因表达均有相关性(P<0.01);LINC00511敲减可抑制细胞的克隆形成和迁移能力、促进肺癌细胞凋亡并影响细胞周期进展(P<0.05,P<0.01);LINC00511敲减可下调肺癌细胞CCNB、CDK4、TGF-β1基因的表达(P<0.01),对CCND1、VEGFA基因表达无明显影响,LINC00511敲减可抑制细胞内MMP9、CTNNB1表达,上调CASP3的表达(P<0.05,P<0.01);裸鼠体内实验证实,LINC00511敲减可抑制移植瘤体组织内Ki67的表达(P<0.01)。结论:LINC00511在非小细胞肺癌组织中呈高表达,与肺癌临床分期和多种基因表达具有相关性,LINC00511敲减可能通过影响相关基因、蛋白的表达,抑制肺癌H1299细胞的恶性生物学行为。 展开更多
关键词 长链非编码RNA00511 非小细胞肺癌 H1299细胞 增殖 凋亡 细胞周期
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京尼平苷对β淀粉样蛋白诱导的神经细胞PC12凋亡的影响及相关机制研究 被引量:1
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作者 陈庆友 殷玥 +3 位作者 李莉 张艳蕉 何薇 师岩 《中华老年心脑血管病杂志》 CAS 北大核心 2022年第12期1315-1319,共5页
目的探讨京尼平苷对β淀粉样蛋白(Aβ)诱导的神经细胞PC12凋亡的影响及相关作用机制。方法体外培养神经细胞PC12,以不同浓度梯度Aβ、京尼平苷作用于PC12,细胞计数试剂盒8(CCK-8)法检测其细胞活力。PC12分为对照组(不做任何处理)、Aβ组... 目的探讨京尼平苷对β淀粉样蛋白(Aβ)诱导的神经细胞PC12凋亡的影响及相关作用机制。方法体外培养神经细胞PC12,以不同浓度梯度Aβ、京尼平苷作用于PC12,细胞计数试剂盒8(CCK-8)法检测其细胞活力。PC12分为对照组(不做任何处理)、Aβ组(32μmol/L Aβ)、京尼平苷组(32μmol/L Aβ+16μmol/L京尼平苷)和核因子E2相关因子2(Nrf2)抑制剂组(32μmol/L Aβ+16μmol/L京尼平苷+100 nmol/L鸦胆子苦醇),用CCK-8法和流式细胞仪分别检测PC12细胞活力和凋亡率;酶联免疫吸附法检测PC12细胞内活性氧、丙二醛和超氧化物歧化酶(SOD)含量;蛋白免疫印迹法检测PC12内Nrf2、血红素加氧酶1(HO-1)表达。结果与对照组比较,Aβ组PC12细胞活力及细胞内SOD、Nrf2、HO-1表达明显降低,凋亡率及细胞内活性氧、丙二醛含量明显升高,差异有统计学意义(P<0.05);与Aβ组比较,京尼平苷组PC12细胞活力及细胞内SOD、Nrf2、HO-1表达明显升高(P<0.05),凋亡率[(15.28±0.93)%vs(22.15±1.34)%,P<0.05]及细胞内活性氧[(1.58±0.22)U/ml vs(2.94±0.26)U/ml,P<0.05]、丙二醛[(5.04±0.78)μmol/ml vs(9.60±0.93)μmol/ml,P<0.05]含量明显降低;与京尼平苷组比较,Nrf2抑制剂组PC12细胞活力明显降低,差异有统计学意义[(60.23±5.56)%vs(89.68±5.72)%,P<0.05],凋亡率明显升高[(20.42±1.16)%vs(15.28±0.93)%,P<0.05]。结论京尼平苷对Aβ诱导的PC12细胞凋亡具有抑制作用,其机制可能与激活Nrf2/HO-1信号通路发挥抗氧化应激作用有关。 展开更多
关键词 淀粉样β肽类 PC12细胞 丙二醛 超氧化物歧化酶 血红素加氧酶-1 神经母细胞瘤 氧化性应激
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