期刊导航
期刊开放获取
上海教育软件发展有限公..
期刊文献
+
任意字段
题名或关键词
题名
关键词
文摘
作者
第一作者
机构
刊名
分类号
参考文献
作者简介
基金资助
栏目信息
任意字段
题名或关键词
题名
关键词
文摘
作者
第一作者
机构
刊名
分类号
参考文献
作者简介
基金资助
栏目信息
检索
高级检索
期刊导航
共找到
2
篇文章
<
1
>
每页显示
20
50
100
已选择
0
条
导出题录
引用分析
参考文献
引证文献
统计分析
检索结果
已选文献
显示方式：
文摘
详细
列表
相关度排序
被引量排序
时效性排序
CC趋化因子配体20在肝细胞癌组织中的表达及其在肝细胞肝癌预后评估中作用的生物信息学分析
被引量：
7
1
作者
胡连涛
邓文俊
+7 位作者
鹿士振
孙跞
李学斌
黎楚豪
王欣然
张春斌
李玥
王伟群
《吉林大学学报（医学版）》
CAS
CSCD
北大核心
2022年第4期1010-1017,共8页
目的:研究CC趋化因子配体20(CCL20)在肝细胞肝癌(LIHC)组织中的表达,并探讨其对LIHC患者预后的影响,阐述CCL20影响LIHC恶性行为的机制。方法:采用Rstudio(4.03)软件从癌症基因图谱(TCGA)和UCSC Xena平台获取LIHC患者癌组织和癌旁组织中C...
目的:研究CC趋化因子配体20(CCL20)在肝细胞肝癌(LIHC)组织中的表达,并探讨其对LIHC患者预后的影响,阐述CCL20影响LIHC恶性行为的机制。方法:采用Rstudio(4.03)软件从癌症基因图谱(TCGA)和UCSC Xena平台获取LIHC患者癌组织和癌旁组织中CCL20 mRNA表达水平和临床数据,比较CCL20 mRNA在2种组织中的表达差异,并利用GEPIA联合GTEx数据对上述结果进行验证;采用Kaplan-Meier生存分析和Cox回归分析法分析CCL20 mRNA表达水平与LIHC患者预后的关系。通过Pearson相关分析对LIHC患者CCL20 mRNA表达水平与甲胎蛋白(AFP)水平的相关性进行分析,并通过受试者工作特征(ROC)曲线下面积(AUC)、诺谟图和校正曲线分析LIHC患者CCL20 mRNA表达水平与患者临床诊断和生存预测情况的相关性。采用TCGA数据库对LIHC患者癌组织中CCL20 mRNA的表达进行基因集富集分析(GSEA),分析CCL20 mRNA表达水平与DNA拷贝数突变和DNA甲基化水平的相关性。结果:与癌旁组织比较,LIHC患者癌组织中CCL20 mRNA表达水平明显升高(P<0.01);Kaplan-Meier生存分析,CCL20 mRNA低表达患者的预后明显优于CCL20 mRNA高表达患者(HR=1.789,P<0.01),且Cox单因素和多因素回归分析表明CCL20 mRNA表达水平为LIHC患者的独立预后因素(P<0.05);Pearson相关分析,LIHC患者癌组织中CCL20 mRNA表达水平与AFP水平呈正相关关系(P<0.01);CCL20 mRNA表达水平在LIHC患者临床诊断评估中具有一定的参考价值(AUC=0.69,P<0.01),且可有效预测LIHC患者生存率。GSEA分析,CCL20可通过趋化因子、NOD样受体(NLR)、过氧化物酶体增殖物激活受体(PPAR)和Toll样受体(TLR)等肿瘤相关信号通路参与LIHC细胞黏附、细胞因子与细胞因子受体相互作用和核糖体功能实施等过程。遗传学和表观遗传学分析,与正常二倍体组比较,拷贝数丢失组和拷贝数扩增组样本中CCL20 mRNA表达水平差异无统计学意义(P>0.05);与拷贝数丢失组比较,拷贝数扩增组样本中CCL20 mRNA表达水平明显升高(P<0.05);CCL20 mRNA表达水平与CCL20 DNA甲基化水平呈负相关关系(cor=-0.11,P<0.01)。结论:LIHC组织中CCL20 mRNA表达上调与患者预后不良有明显的关联性,CCL20通过多种信号途径参与LIHC的恶性进程,可作为评估和预测LIHC患者预后和生存的指标之一。
展开更多
关键词
CC趋化因子配体20
肝细胞肝癌
生物信息学
预后
临床诊断
在线阅读
下载PDF
职称材料
基于生物信息学分析PRKCD在肝细胞癌组织中的表达及临床意义
2
作者
胡连涛
邓文俊
+7 位作者
孙跞
鹿士振
李学斌
黎楚豪
王绎博
王欣然
李玥
王伟群
《海南医学院学报》
CAS
2022年第14期1088-1095,共8页
目的:基于生物信息学分析蛋白激酶Cδ(PKCδ,PRKCD)在肝细胞癌组织中的表达及临床意义,以期为寻找肝细胞癌的临床诊疗潜在分子标志物和靶点提供参考。方法:利用TheCancerGenome Atlas(TCGA)和UCSCXena平台获取肝细胞癌和癌旁组织中PRKCD...
目的:基于生物信息学分析蛋白激酶Cδ(PKCδ,PRKCD)在肝细胞癌组织中的表达及临床意义,以期为寻找肝细胞癌的临床诊疗潜在分子标志物和靶点提供参考。方法:利用TheCancerGenome Atlas(TCGA)和UCSCXena平台获取肝细胞癌和癌旁组织中PRKCD的mRNA表达量和临床数据,比较PRKCD mRNA在两组样本中的表达差异;利用HumanProteinAtlas数据库分析PRKCD蛋白在肝细胞癌和癌旁组织中的表达差异;利用TCGA分析PRKCD mRNA表达与肝细胞癌临床病理特征和预后的相关性;利用TCGA数据库对肝细胞癌中PRKCD表达进行GSEA富集分析,并从遗传和表观遗传学的观点分析PRKCD表达变化的原因。结果:PRKCD在肝细胞癌组织中的mRNA和蛋白质水平均显著高于癌旁组织;PRKCD表达与TNM分期、组织学级别、甲胎蛋白含量和患者生存状态相关,并且其表达水平具有一定的临床诊断准确性;Kaplan-Meier分析显示PRKCD低表达患者的预后显著优于高表达患者;单因素和多因素Cox回归分析显示,PRKCD是肝细胞癌患者独立预后因素,且TNM为Ⅲ和Ⅳ期生存曲线的风险比显著大于Ⅰ和Ⅱ期;GSEA分析显示PRKCD主要富集在细胞周期和DNA复制等过程,并与两者呈正相关性,且PRKCD主要参与了趋化因子、NOD样受体、PPAR、脂肪细胞因子和T细胞受体信号通路;遗传和表观遗传分析显示PRKCD表达水平与其基因的拷贝数呈正相关,但与其甲基化水平呈负相关。结论:PRKCD基因在肝细胞癌组织中表达上调,且其表达上调与患者预后不良具有显著相关性。
展开更多
关键词
蛋白激酶Cδ(PKCδ
PRKCD)
肝细胞癌
生物信息学分析
预后
在线阅读
下载PDF
职称材料
题名
CC趋化因子配体20在肝细胞癌组织中的表达及其在肝细胞肝癌预后评估中作用的生物信息学分析
被引量：
7
1
作者
胡连涛
邓文俊
鹿士振
孙跞
李学斌
黎楚豪
王欣然
张春斌
李玥
王伟群
机构
佳木斯大学基础医学院生理学教研室
黑龙江省微生物-免疫调解网络与相关疾病重点实验室
佳木斯大学第一临床医学院
免疫
科
漳州卫生职业学院医学技术教研室/翻译医学检测与应用技术协作创新中心
出处
《吉林大学学报（医学版）》
CAS
CSCD
北大核心
2022年第4期1010-1017,共8页
基金
黑龙江省教育厅基本科研业务费人才培养项目(2019-KYYWF-1338)。
文摘
目的:研究CC趋化因子配体20(CCL20)在肝细胞肝癌(LIHC)组织中的表达,并探讨其对LIHC患者预后的影响,阐述CCL20影响LIHC恶性行为的机制。方法:采用Rstudio(4.03)软件从癌症基因图谱(TCGA)和UCSC Xena平台获取LIHC患者癌组织和癌旁组织中CCL20 mRNA表达水平和临床数据,比较CCL20 mRNA在2种组织中的表达差异,并利用GEPIA联合GTEx数据对上述结果进行验证;采用Kaplan-Meier生存分析和Cox回归分析法分析CCL20 mRNA表达水平与LIHC患者预后的关系。通过Pearson相关分析对LIHC患者CCL20 mRNA表达水平与甲胎蛋白(AFP)水平的相关性进行分析,并通过受试者工作特征(ROC)曲线下面积(AUC)、诺谟图和校正曲线分析LIHC患者CCL20 mRNA表达水平与患者临床诊断和生存预测情况的相关性。采用TCGA数据库对LIHC患者癌组织中CCL20 mRNA的表达进行基因集富集分析(GSEA),分析CCL20 mRNA表达水平与DNA拷贝数突变和DNA甲基化水平的相关性。结果:与癌旁组织比较,LIHC患者癌组织中CCL20 mRNA表达水平明显升高(P<0.01);Kaplan-Meier生存分析,CCL20 mRNA低表达患者的预后明显优于CCL20 mRNA高表达患者(HR=1.789,P<0.01),且Cox单因素和多因素回归分析表明CCL20 mRNA表达水平为LIHC患者的独立预后因素(P<0.05);Pearson相关分析,LIHC患者癌组织中CCL20 mRNA表达水平与AFP水平呈正相关关系(P<0.01);CCL20 mRNA表达水平在LIHC患者临床诊断评估中具有一定的参考价值(AUC=0.69,P<0.01),且可有效预测LIHC患者生存率。GSEA分析,CCL20可通过趋化因子、NOD样受体(NLR)、过氧化物酶体增殖物激活受体(PPAR)和Toll样受体(TLR)等肿瘤相关信号通路参与LIHC细胞黏附、细胞因子与细胞因子受体相互作用和核糖体功能实施等过程。遗传学和表观遗传学分析,与正常二倍体组比较,拷贝数丢失组和拷贝数扩增组样本中CCL20 mRNA表达水平差异无统计学意义(P>0.05);与拷贝数丢失组比较,拷贝数扩增组样本中CCL20 mRNA表达水平明显升高(P<0.05);CCL20 mRNA表达水平与CCL20 DNA甲基化水平呈负相关关系(cor=-0.11,P<0.01)。结论:LIHC组织中CCL20 mRNA表达上调与患者预后不良有明显的关联性,CCL20通过多种信号途径参与LIHC的恶性进程,可作为评估和预测LIHC患者预后和生存的指标之一。
关键词
CC趋化因子配体20
肝细胞肝癌
生物信息学
预后
临床诊断
Keywords
CC chemokine ligand 20
Liver hepatocellular carcinoma
Bioinformatics analysis
Prognosis
Clinical diagnosis
分类号
R735.7 [医药卫生—肿瘤]
在线阅读
下载PDF
职称材料
题名
基于生物信息学分析PRKCD在肝细胞癌组织中的表达及临床意义
2
作者
胡连涛
邓文俊
孙跞
鹿士振
李学斌
黎楚豪
王绎博
王欣然
李玥
王伟群
机构
佳木斯大学基础医学院
黑龙江省微生物-免疫调解网络与相关疾病重点实验室
佳木斯大学第一临床医学院
出处
《海南医学院学报》
CAS
2022年第14期1088-1095,共8页
基金
黑龙江省属高等学校基本科研业务费优秀创新团队建设项目(2019-KYYWF-1334)。
文摘
目的:基于生物信息学分析蛋白激酶Cδ(PKCδ,PRKCD)在肝细胞癌组织中的表达及临床意义,以期为寻找肝细胞癌的临床诊疗潜在分子标志物和靶点提供参考。方法:利用TheCancerGenome Atlas(TCGA)和UCSCXena平台获取肝细胞癌和癌旁组织中PRKCD的mRNA表达量和临床数据,比较PRKCD mRNA在两组样本中的表达差异;利用HumanProteinAtlas数据库分析PRKCD蛋白在肝细胞癌和癌旁组织中的表达差异;利用TCGA分析PRKCD mRNA表达与肝细胞癌临床病理特征和预后的相关性;利用TCGA数据库对肝细胞癌中PRKCD表达进行GSEA富集分析,并从遗传和表观遗传学的观点分析PRKCD表达变化的原因。结果:PRKCD在肝细胞癌组织中的mRNA和蛋白质水平均显著高于癌旁组织;PRKCD表达与TNM分期、组织学级别、甲胎蛋白含量和患者生存状态相关,并且其表达水平具有一定的临床诊断准确性;Kaplan-Meier分析显示PRKCD低表达患者的预后显著优于高表达患者;单因素和多因素Cox回归分析显示,PRKCD是肝细胞癌患者独立预后因素,且TNM为Ⅲ和Ⅳ期生存曲线的风险比显著大于Ⅰ和Ⅱ期;GSEA分析显示PRKCD主要富集在细胞周期和DNA复制等过程,并与两者呈正相关性,且PRKCD主要参与了趋化因子、NOD样受体、PPAR、脂肪细胞因子和T细胞受体信号通路;遗传和表观遗传分析显示PRKCD表达水平与其基因的拷贝数呈正相关,但与其甲基化水平呈负相关。结论:PRKCD基因在肝细胞癌组织中表达上调,且其表达上调与患者预后不良具有显著相关性。
关键词
蛋白激酶Cδ(PKCδ
PRKCD)
肝细胞癌
生物信息学分析
预后
Keywords
Protein kinase C delta(PKCδ,PRKCD)
Liver hepatocellular carcinoma
Bioinformatics analysis
Prognosis
分类号
R735.7 [医药卫生—肿瘤]
Q811.4 [生物学—生物工程]
在线阅读
下载PDF
职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
CC趋化因子配体20在肝细胞癌组织中的表达及其在肝细胞肝癌预后评估中作用的生物信息学分析
胡连涛
邓文俊
鹿士振
孙跞
李学斌
黎楚豪
王欣然
张春斌
李玥
王伟群
《吉林大学学报（医学版）》
CAS
CSCD
北大核心
2022
7
在线阅读
下载PDF
职称材料
2
基于生物信息学分析PRKCD在肝细胞癌组织中的表达及临床意义
胡连涛
邓文俊
孙跞
鹿士振
李学斌
黎楚豪
王绎博
王欣然
李玥
王伟群
《海南医学院学报》
CAS
2022
0
在线阅读
下载PDF
职称材料
已选择
0
条
导出题录
引用分析
参考文献
引证文献
统计分析
检索结果
已选文献
上一页
1
下一页
到第
页
确定
用户登录
登录
IP登录
使用帮助
返回顶部
