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小豆抗锈病基因VaRust1的初步定位
1
作者
徐晓丹
冷淼
+4 位作者
张明媛
孙伟娜
柯希望
殷丽华
左豫虎
《黑龙江八一农垦大学学报》
2025年第4期8-16,共9页
为挖掘小豆抗锈病基因,用小豆抗病品种LJ01与感病品种宝清红进行杂交,获得LJO1/宝清红F_(1),F_(1)自交构建F_(2)群体。通过对亲本及F_(1)、F_(2)接种小豆锈菌菌株ZXLO1进行抗性鉴定,明确小豆抗锈病品种LJO1对小豆锈菌菌株ZXL01的抗性由...
为挖掘小豆抗锈病基因,用小豆抗病品种LJ01与感病品种宝清红进行杂交,获得LJO1/宝清红F_(1),F_(1)自交构建F_(2)群体。通过对亲本及F_(1)、F_(2)接种小豆锈菌菌株ZXLO1进行抗性鉴定,明确小豆抗锈病品种LJO1对小豆锈菌菌株ZXL01的抗性由一个隐性基因控制。利用分离分组分析法(Bulked segrgant analysis,BSA),对抗病亲本LJO1、感病亲本宝清红及LJO1/宝清红F_(2)群体构建的抗感池进行差异标记分析,初步将LJ01的抗锈基因定位于3号染色体20467677~26201507bp区域内,命名为VaRust1。开发该区间内的SNP分子标记,经遗传连锁分析发现,11个SNP分子标记和抗锈病基因VaRust1有连锁关系,其中分子标记Vaby0001、Vaby0003、Vaby0011和小豆抗锈病基因VaRust1连锁最为紧密,遗传距离均为5.69cM。小豆抗锈病基因VaRust1定位区间内基因预测显示,该区间存在52个基因,其中37个基因具有功能注释,基因HKW66_Vig0249750、HKW66_Vig0249920和HKW66_Vig0249830分别编码WRKY转录因子、丝氨酸/苏氨酸激酶及F-box/LRR结构蛋白,可作为小豆抗锈病候选基因。
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关键词
小豆
锈病
基因定位
SNP
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职称材料
小豆Dirigent基因家族鉴定及锈菌侵染对不同成员表达的影响
被引量：
4
2
作者
柯希望
苑梦琦
+3 位作者
徐晓丹
殷丽华
郭永霞
左豫虎
《作物学报》
CAS
CSCD
北大核心
2022年第11期2774-2785,共12页
为明确Dirigent (DIR)基因在小豆抗锈病中的作用,采用生物信息学方法,对小豆DIR基因家族(VaDIRs)进行了全基因组鉴定,结果发现小豆中共有33个DIR基因,其中29个成员分别定位在8条染色体上,系统进化分析表明,VaDIRs包括DIR-a、DIR-b/d、DI...
为明确Dirigent (DIR)基因在小豆抗锈病中的作用,采用生物信息学方法,对小豆DIR基因家族(VaDIRs)进行了全基因组鉴定,结果发现小豆中共有33个DIR基因,其中29个成员分别定位在8条染色体上,系统进化分析表明,VaDIRs包括DIR-a、DIR-b/d、DIR-e和DIR-f四个亚家族,对VaDIRs成员启动子区顺式作用元件的分析发现,VaDIRs启动子区均包含激素、病原体应答等元件。对小豆抗锈病品种接种后不同时间的转录组数据分析发现,差异表达基因中共有17个VaDIRs成员,其中6个于接种后24 h显著上调,2个于接种后24 h和48 h均高量表达。进一步应用qRT-PCR技术对上述8个基因在抗、感品种中应答锈菌侵染的表达分析表明,高抗品种中VaDIR14、VaDIR16和VaDIR33的表达量在锈菌侵染不同阶段均显著高于感病品种。上述结果表明,VaDIRs家族成员可作为正调节因子参与小豆对锈病的抗性。
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关键词
小豆(Vigna
angularis)
小豆锈病
豇豆单胞锈菌(Uromyces
vignae)
DIR基因
基因家族
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职称材料
题名
小豆抗锈病基因VaRust1的初步定位
1
作者
徐晓丹
冷淼
张明媛
孙伟娜
柯希望
殷丽华
左豫虎
机构
黑龙江八一农垦大学农学院/黑龙江省作物有害生物互作生物学及生态防控重点实验室/国家杂粮工程技术研究中心
出处
《黑龙江八一农垦大学学报》
2025年第4期8-16,共9页
基金
黑龙江省自然科学基金项目(LH2024C081)
黑龙江八一农垦大学“三纵”科研计划项目(ZRCPY202301)。
文摘
为挖掘小豆抗锈病基因,用小豆抗病品种LJ01与感病品种宝清红进行杂交,获得LJO1/宝清红F_(1),F_(1)自交构建F_(2)群体。通过对亲本及F_(1)、F_(2)接种小豆锈菌菌株ZXLO1进行抗性鉴定,明确小豆抗锈病品种LJO1对小豆锈菌菌株ZXL01的抗性由一个隐性基因控制。利用分离分组分析法(Bulked segrgant analysis,BSA),对抗病亲本LJO1、感病亲本宝清红及LJO1/宝清红F_(2)群体构建的抗感池进行差异标记分析,初步将LJ01的抗锈基因定位于3号染色体20467677~26201507bp区域内,命名为VaRust1。开发该区间内的SNP分子标记,经遗传连锁分析发现,11个SNP分子标记和抗锈病基因VaRust1有连锁关系,其中分子标记Vaby0001、Vaby0003、Vaby0011和小豆抗锈病基因VaRust1连锁最为紧密,遗传距离均为5.69cM。小豆抗锈病基因VaRust1定位区间内基因预测显示,该区间存在52个基因,其中37个基因具有功能注释,基因HKW66_Vig0249750、HKW66_Vig0249920和HKW66_Vig0249830分别编码WRKY转录因子、丝氨酸/苏氨酸激酶及F-box/LRR结构蛋白,可作为小豆抗锈病候选基因。
关键词
小豆
锈病
基因定位
SNP
Keywords
adzuki bean
rust
genemapping
SNP
分类号
S435 [农业科学—农业昆虫与害虫防治]
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职称材料
题名
小豆Dirigent基因家族鉴定及锈菌侵染对不同成员表达的影响
被引量：
4
2
作者
柯希望
苑梦琦
徐晓丹
殷丽华
郭永霞
左豫虎
机构
黑龙江八一农垦大学农学院/黑龙江省作物有害生物互作生物学及生态防控重点实验室/国家杂粮工程技术研究中心
出处
《作物学报》
CAS
CSCD
北大核心
2022年第11期2774-2785,共12页
基金
国家自然科学基金项目(32102173)
黑龙江省自然科学基金项目(YQ2020C034)
黑龙江八一农垦大学研究生创新项目(YJSCX2021-Y50)资助。
文摘
为明确Dirigent (DIR)基因在小豆抗锈病中的作用,采用生物信息学方法,对小豆DIR基因家族(VaDIRs)进行了全基因组鉴定,结果发现小豆中共有33个DIR基因,其中29个成员分别定位在8条染色体上,系统进化分析表明,VaDIRs包括DIR-a、DIR-b/d、DIR-e和DIR-f四个亚家族,对VaDIRs成员启动子区顺式作用元件的分析发现,VaDIRs启动子区均包含激素、病原体应答等元件。对小豆抗锈病品种接种后不同时间的转录组数据分析发现,差异表达基因中共有17个VaDIRs成员,其中6个于接种后24 h显著上调,2个于接种后24 h和48 h均高量表达。进一步应用qRT-PCR技术对上述8个基因在抗、感品种中应答锈菌侵染的表达分析表明,高抗品种中VaDIR14、VaDIR16和VaDIR33的表达量在锈菌侵染不同阶段均显著高于感病品种。上述结果表明,VaDIRs家族成员可作为正调节因子参与小豆对锈病的抗性。
关键词
小豆(Vigna
angularis)
小豆锈病
豇豆单胞锈菌(Uromyces
vignae)
DIR基因
基因家族
Keywords
Vigna angularis
adzuki bean rust
Uromyces vignae
DIR gene
gene family
分类号
S435.21 [农业科学—农业昆虫与害虫防治]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
小豆抗锈病基因VaRust1的初步定位
徐晓丹
冷淼
张明媛
孙伟娜
柯希望
殷丽华
左豫虎
《黑龙江八一农垦大学学报》
2025
0
在线阅读
下载PDF
职称材料
2
小豆Dirigent基因家族鉴定及锈菌侵染对不同成员表达的影响
柯希望
苑梦琦
徐晓丹
殷丽华
郭永霞
左豫虎
《作物学报》
CAS
CSCD
北大核心
2022
4
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