期刊文献+
共找到7篇文章
< 1 >
每页显示 20 50 100
大豆KH家族基因鉴定及不同光周期下表达分析
1
作者 刘煜宁 孙明哲 +2 位作者 陈茜 沈阳 孙晓丽 《大豆科学》 北大核心 2025年第3期39-50,共12页
KH基因家族编码蛋白是含KH结构域(K homology)的核酸结合蛋白,在植物开花调控中具有重要作用。为进一步挖掘大豆光周期调控基因,本研究通过生物信息学分析、RNA-seq数据分析及qRT-PCR验证,对大豆KH基因家族进行了系统鉴定和表达模式研究... KH基因家族编码蛋白是含KH结构域(K homology)的核酸结合蛋白,在植物开花调控中具有重要作用。为进一步挖掘大豆光周期调控基因,本研究通过生物信息学分析、RNA-seq数据分析及qRT-PCR验证,对大豆KH基因家族进行了系统鉴定和表达模式研究,以阐明其结构、进化及功能。结果显示:全基因组分析鉴定出55个GmKH基因,根据进化关系分为8个亚家族。大豆KH基因家族中存在大量基因复制,并与拟南芥KH蛋白具有较高同源性。RNA-seq数据分析表明,GmKH基因在分生组织、花和种荚发育过程中高表达,在种子成熟后期、老叶和茎中表达较低;30个GmKH基因的表达显著响应光周期变化。本研究采用荧光定量PCR技术,分析了与大豆E3开花位点关键基因GmPHYA3具有相似基因结构和保守序列特征的GmKH26、GmKH34和GmKH48基因在不同光周期下的表达情况,发现这些基因的表达受光周期调控,并在长短日照下呈现相反的表达模式。研究结果为大豆KH基因家族在开花调控及光周期适应性中的功能研究提供了理论依据。 展开更多
关键词 大豆 KH家族基因 表达分析 光周期
在线阅读 下载PDF
大豆谷氨酸受体通道蛋白基因家族鉴定与表达分析
2
作者 李媛 孙志成 +4 位作者 王佳 关永旭 孙明哲 贾博为 孙晓丽 《植物遗传资源学报》 北大核心 2025年第8期1619-1633,共15页
植物谷氨酸受体通道蛋白(GLRs,glutamate receptor-like channels)是一类参与细胞代谢、种子萌发、植物生长发育及长距离信息传递的Ca2+通道蛋白。本研究通过对大豆蛋白组进行全蛋白组鉴定,共获得29个大豆GLR成员。系统进化关系表明大豆... 植物谷氨酸受体通道蛋白(GLRs,glutamate receptor-like channels)是一类参与细胞代谢、种子萌发、植物生长发育及长距离信息传递的Ca2+通道蛋白。本研究通过对大豆蛋白组进行全蛋白组鉴定,共获得29个大豆GLR成员。系统进化关系表明大豆GLR基因分为GroupⅠ~Ⅲ,同一亚家族成员基因结构、保守结构域和保守基序分布相对保守。顺式作用元件分析证实大豆GLR基因启动子区包含与激素、胁迫、光照以及植物生长发育相关调控元件。组织和胁迫表达模式分析表明,GLR基因在大豆各组织均有较高表达,且显著受盐碱胁迫诱导表达。qRT-PCR分析显示GmGLR3.13、GmGLR3.15、GmGLR4.8、GmGLR4.9和GmGLR4.10基因在盐和碱胁迫下呈现显著差异,表明其可能在胁迫应答方面具有重要作用。研究结果为深入探究大豆GLR基因在逆境应答中的作用提供重要的理论依据。 展开更多
关键词 大豆 GLR 全基因组鉴定 盐碱胁迫
在线阅读 下载PDF
过表达野生大豆耐盐碱基因GsGSTU13提高了水稻苗期耐盐碱性 被引量:2
3
作者 李宛鸿 胡冰霜 +2 位作者 孙晓丽 才晓溪 孙明哲 《作物学报》 CAS CSCD 北大核心 2024年第10期2458-2467,共10页
谷胱甘肽S-转移酶(glutathione S-transferases,GSTs)是一类高度保守的功能酶,在植物对非生物胁迫应答过程中发挥重要作用。本研究通过生物信息学分析发现,野生大豆GsGSTU13与水稻GSTU17蛋白序列相似性最高,均含有高度保守的结构域。为... 谷胱甘肽S-转移酶(glutathione S-transferases,GSTs)是一类高度保守的功能酶,在植物对非生物胁迫应答过程中发挥重要作用。本研究通过生物信息学分析发现,野生大豆GsGSTU13与水稻GSTU17蛋白序列相似性最高,均含有高度保守的结构域。为探究GsGSTU13基因对水稻耐盐碱性的影响,通过遗传转化、PCR、RT-PCR和GST活性检测,获得了2个GsGSTU13过表达转基因水稻纯合株系。苗期耐盐碱性分析显示,200 mmol L^(-1) NaHCO_(3)处理下,GsGSTU13转基因株系的活性氧积累显著低于野生型,而存活率、相对含水量、超氧化物歧化酶、过氧化物酶、过氧化氢酶和GST活性均显著高于野生型。综上,在水稻中过表达GsGSTU13基因增强了活性氧清除能力,提高了转基因水稻耐盐碱性,为耐盐碱水稻新种质创制提供了参考。 展开更多
关键词 水稻 野生大豆 耐盐碱性 谷胱甘肽S-转移酶 GsGSTU13
在线阅读 下载PDF
大豆基因组中OSCA基因家族的进化和表达分析 被引量:13
4
作者 李建伟 杨珺凯 +4 位作者 贾博为 孙明哲 刘瑀 殷奎德 孙晓丽 《中国油料作物学报》 CAS CSCD 北大核心 2017年第5期589-599,共11页
OSCA是钙通透性阳离子通道蛋白,在高渗胁迫感应中发挥重要的作用。本研究利用生物信息,筛选并鉴定出21个大豆OSCA家族成员。通过染色体定位及同源性分析表明,OSCA家族成员分布在15条染色体上,且存在大量的复制现象;通过Ka/Ks分析表明大... OSCA是钙通透性阳离子通道蛋白,在高渗胁迫感应中发挥重要的作用。本研究利用生物信息,筛选并鉴定出21个大豆OSCA家族成员。通过染色体定位及同源性分析表明,OSCA家族成员分布在15条染色体上,且存在大量的复制现象;通过Ka/Ks分析表明大豆OSCA家族基因的进化经受纯化选择压力。通过构建系统进化树,将大豆OSCA家族分为2个亚家族,第一亚家族又分为三组(GroupⅠ~Ⅲ),且各组内成员具有相似的内含子-外显子组成模式。保守性分析结果表明,大豆OSCA基因家族很保守,都包含3个功能结构域(即Late exocytosis,Cytosolic domain of 10TM putative phosphate transporter和Calcium-dependent channel);进一步组织表达分析结果表明,OSCA基因家族在不同组织的表达量不同。盐碱胁迫表达模式分析表明,OSCA3.1上调表达变化倍数最大。进一步的启动子分析结果表明,这些盐碱胁迫应答的基因启动子中存在着多种不同的胁迫响应元件,其中干旱和ABA应答相关的元件较多。以上结果为OSCA基因家族提供了新的有价值的信息,并为后续研究提供了重要参考。 展开更多
关键词 大豆 OSCA 家族分析 表达分析
在线阅读 下载PDF
GsERF6基因过表达对水稻耐盐碱性的影响 被引量:4
5
作者 才晓溪 胡冰霜 +5 位作者 沈阳 王研 陈悦 孙明哲 贾博为 孙晓丽 《作物学报》 CAS CSCD 北大核心 2023年第2期561-569,共9页
乙烯响应因子(ERF)是植物特有的一类转录因子,在响应非生物胁迫中具有重要作用。本研究通过生物信息学发现,野生大豆耐盐碱ERF转录因子GsERF6与水稻ERF同源蛋白的氨基酸序列相似性很高,均包含1个高度保守的AP2结构域。为探究GsERF6基因... 乙烯响应因子(ERF)是植物特有的一类转录因子,在响应非生物胁迫中具有重要作用。本研究通过生物信息学发现,野生大豆耐盐碱ERF转录因子GsERF6与水稻ERF同源蛋白的氨基酸序列相似性很高,均包含1个高度保守的AP2结构域。为探究GsERF6基因在水稻耐盐碱应答中的作用,通过遗传转化、PCR和半定量RT-PCR鉴定,获得了2个纯合的GsERF6过表达转基因水稻株系。表型鉴定表明,200 mmol L^(-1) NaHCO3处理下GsERF6转基因水稻的存活率、相对含水量、超氧化物歧化酶、过氧化物酶、过氧化氢酶活性、可溶性糖和脯氨酸含量均显著高于对照,活性氧积累则反之。实时荧光定量PCR分析表明,40 mmol L^(-1) NaHCO3处理6 h后渗透调节基因OsP5CS2和OsLEA14在GsERF6转基因水稻中的表达量显著高于对照。本研究表明,水稻中GsERF6的过表达可通过提高ROS清除水平、渗透调节能力及胁迫应答基因的表达来提高其耐盐碱性。 展开更多
关键词 水稻 耐盐碱 乙烯响应因子 野生大豆 GsERF6
在线阅读 下载PDF
野生大豆阳离子质子转运体CHX19.3与14-3-3蛋白的相互作用研究 被引量:5
6
作者 沈阳 才晓溪 +5 位作者 贾博为 孙明哲 周伍红 杨珺凯 胡冰霜 孙晓丽 《黑龙江八一农垦大学学报》 2020年第1期1-9,59,共10页
植物14-3-3家族作为蛋白互作的桥梁,在逆境应答过程中发挥重要作用。前期获得了一个野生大豆阳离子质子转运体CHX19.3,其能显著提高耐盐碱性。为进一步揭示CHX19.3调控耐盐碱性的分子机制,研究利用分裂泛素的酵母双杂交系统鉴定了CHX19.... 植物14-3-3家族作为蛋白互作的桥梁,在逆境应答过程中发挥重要作用。前期获得了一个野生大豆阳离子质子转运体CHX19.3,其能显著提高耐盐碱性。为进一步揭示CHX19.3调控耐盐碱性的分子机制,研究利用分裂泛素的酵母双杂交系统鉴定了CHX19.3与14-3-3家族蛋白的相互作用。结果显示成功构建了诱饵载体pBT3-STE-GsCHX19.3,GsCHX19.3-Cub-LexAVP16融合蛋白对酵母菌没有毒性,且拓扑结构符合该酵母双杂交系统。Y2H结果发现在检测的10个14-3-3蛋白中,只有GF14f能够与CHX19.3蛋白互作,其余14-3-3蛋白均不存在相互作用。研究表明野生大豆CHX19.3与14-3-3家族蛋白互作具有特异性,为进一步深入研究CHX19.3通过与GF14f互作调控耐盐碱性的分子机理奠定了基础。 展开更多
关键词 野生大豆 阳离子质子转运体 14-3-3蛋白 酵母双杂交 蛋白互作
在线阅读 下载PDF
玉米CHX基因家族全基因组鉴定与表达分析 被引量:5
7
作者 贾博为 金军 +4 位作者 庄齐 董伟峰 才晓溪 孙明哲 孙晓丽 《黑龙江八一农垦大学学报》 2022年第4期23-30,64,共9页
CHX(cation/H+exchanger)基因家族属于CPA2(cation proton antiporter 2)超家族的一员,蛋白序列的N端存在一个Na+/H+exchanger结构域。现有研究表明,植物CHX基因家族参与调控转运细胞质子和离子,在生长发育和胁迫应答中扮演重要角色。因... CHX(cation/H+exchanger)基因家族属于CPA2(cation proton antiporter 2)超家族的一员,蛋白序列的N端存在一个Na+/H+exchanger结构域。现有研究表明,植物CHX基因家族参与调控转运细胞质子和离子,在生长发育和胁迫应答中扮演重要角色。因此,研究从玉米CHX基因家族入手,首先通过全基因组水平筛选鉴定出16个玉米CHX基因。染色体定位分析表明ZmCHXs不均匀地分布在8条不同的染色体上;系统进化分析显示,16个ZmCHXs基因可分为3组,并且各组内蛋白序列和基因结构保守。组织表达特性分析发现ZmCHXs主要表达在花药中。进一步非生物胁迫表达分析结果表明,仅有GroupⅣ基因表达受冷及盐胁迫诱导。通过研究将为后续深入探究玉米CHX基因家族参与的非生物胁迫应答分子机制提供理论依据。 展开更多
关键词 玉米 CHX 非生物胁迫 生物信息学
在线阅读 下载PDF
上一页 1 下一页 到第
使用帮助 返回顶部