期刊导航
期刊开放获取
上海教育软件发展有限公..
期刊文献
+
任意字段
题名或关键词
题名
关键词
文摘
作者
第一作者
机构
刊名
分类号
参考文献
作者简介
基金资助
栏目信息
任意字段
题名或关键词
题名
关键词
文摘
作者
第一作者
机构
刊名
分类号
参考文献
作者简介
基金资助
栏目信息
检索
高级检索
期刊导航
共找到
1
篇文章
<
1
>
每页显示
20
50
100
已选择
0
条
导出题录
引用分析
参考文献
引证文献
统计分析
检索结果
已选文献
显示方式：
文摘
详细
列表
相关度排序
被引量排序
时效性排序
基于基因扰动及变分逼近技术的基因调控网络推断
1
作者
董自健
宋铁成
袁创
《东南大学学报（自然科学版）》
EI
CAS
CSCD
北大核心
2013年第6期1147-1151,共5页
为了有效提高基因调控网络推断的精度,基于基因表达数据和基因扰动数据,将基因调控网络建模为结构方程模型,并进一步转化为验证性因子分析(CFA)模型,然后使用贝叶斯方法求解CFA模型参数.在贝叶斯分析中,为减少计算量,不采用常用的马尔科...
为了有效提高基因调控网络推断的精度,基于基因表达数据和基因扰动数据,将基因调控网络建模为结构方程模型,并进一步转化为验证性因子分析(CFA)模型,然后使用贝叶斯方法求解CFA模型参数.在贝叶斯分析中,为减少计算量,不采用常用的马尔科夫-蒙特卡洛抽样方法,而是采用变分逼近技术对参数的联合后验分布进行因式化,并获得参数的后验包含概率分布及参数的后验分布.同时使用重要性抽样技术对CFA模型的推断参数进行加权平均.仿真结果表明,CFA模型和变分逼近技术是有效和可靠的.根据实验数据,使用所提算法推导了具有35个基因的酵母基因调控网络.
展开更多
关键词
基因调控网络
验证性因子分析模型
变分逼近
重要性抽样
在线阅读
下载PDF
职称材料
题名
基于基因扰动及变分逼近技术的基因调控网络推断
1
作者
董自健
宋铁成
袁创
机构
东南
大学
信息
科学与工程学院
淮海工学院电子工程学院
香港理工大学医疗科技及信息学系
出处
《东南大学学报（自然科学版）》
EI
CAS
CSCD
北大核心
2013年第6期1147-1151,共5页
基金
国家自然科学基金资助项目(61271207)
江苏省自然科学基金资助项目(BK2011398)
江苏省高校优秀中青年骨干教师和校长境外研修计划资助项目
文摘
为了有效提高基因调控网络推断的精度,基于基因表达数据和基因扰动数据,将基因调控网络建模为结构方程模型,并进一步转化为验证性因子分析(CFA)模型,然后使用贝叶斯方法求解CFA模型参数.在贝叶斯分析中,为减少计算量,不采用常用的马尔科夫-蒙特卡洛抽样方法,而是采用变分逼近技术对参数的联合后验分布进行因式化,并获得参数的后验包含概率分布及参数的后验分布.同时使用重要性抽样技术对CFA模型的推断参数进行加权平均.仿真结果表明,CFA模型和变分逼近技术是有效和可靠的.根据实验数据,使用所提算法推导了具有35个基因的酵母基因调控网络.
关键词
基因调控网络
验证性因子分析模型
变分逼近
重要性抽样
Keywords
gene regulatory network （GRN）
confirmatory factor analysis （CFA） model
variational approximation
importance sampling
分类号
Q78 [生物学—分子生物学]
在线阅读
下载PDF
职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
基于基因扰动及变分逼近技术的基因调控网络推断
董自健
宋铁成
袁创
《东南大学学报（自然科学版）》
EI
CAS
CSCD
北大核心
2013
0
在线阅读
下载PDF
职称材料
已选择
0
条
导出题录
引用分析
参考文献
引证文献
统计分析
检索结果
已选文献
上一页
1
下一页
到第
页
确定
用户登录
登录
IP登录
使用帮助
返回顶部
