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细胞分子生物学技术在靶向药物筛选中的应用
1
作者
刘明
赵琦
+1 位作者
李亚男
胡文祥
《生物技术通报》
CAS
CSCD
北大核心
2009年第6期62-66,共5页
随着细胞及分子生物学的发展,新技术方法越来越多地用于新靶点建立和药物筛选研究,为药物设计、靶点的选择和用药方案的确定提供理论依据,同时使药物筛选有了更高的特异性,对药物筛选和药理学研究起到了极大的促进作用。论述了功能基因...
随着细胞及分子生物学的发展,新技术方法越来越多地用于新靶点建立和药物筛选研究,为药物设计、靶点的选择和用药方案的确定提供理论依据,同时使药物筛选有了更高的特异性,对药物筛选和药理学研究起到了极大的促进作用。论述了功能基因的筛选、高通量细胞筛选和高内涵筛选技术、反义核酸技术、转基因/基因敲除技术、基因芯片、蛋白质芯片、组织芯片、酶免疫分析、荧光免疫分析、流式细胞技术等方法在靶向药物筛选中的应用。
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关键词
生物技术
药物筛选
分子药理学
受体学
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职称材料
芬太尼类化合物与阿片μ受体相互作用的分子对接与分子动力学模拟
被引量：
9
2
作者
李博
刘明
胡文祥
《物理化学学报》
SCIE
CAS
CSCD
北大核心
2010年第1期206-214,共9页
采用分子对接和分子动力学(MD)模拟方法研究了芬太尼类化合物与阿片μ受体的相互作用机制.先用AutoDock4.0程序将芬太尼类化合物对接到同源模建的阿片μ受体结构中,再用GROMACS程序包在水溶液体系中分别对12个芬太尼激动剂和阿片μ受体...
采用分子对接和分子动力学(MD)模拟方法研究了芬太尼类化合物与阿片μ受体的相互作用机制.先用AutoDock4.0程序将芬太尼类化合物对接到同源模建的阿片μ受体结构中,再用GROMACS程序包在水溶液体系中分别对12个芬太尼激动剂和阿片μ受体蛋白复合物进行了MD模拟研究,优化对接复合物的结构,最后利用MM-PBSA方法,在APBS程序中计算芬太尼类衍生物与阿片μ受体的结合自由能,计算出的受体配合物结合常数(Ki)与其实验值吻合较好,并预测了化合物的活性排序.结果表明,复合物蛋白结构与空载受体蛋白结构有较大差异,特别是胞内区IL2、IL3和跨膜区段TM4骨架构象变化较大,不同的化合物对受体结构影响也有差异,活性较好的化合物会增加蛋白特定区域结构的柔性.芬太尼类化合物可能是通过和受体结合后诱导阿片μ受体构象转变为活性构象,引起一系列的信号传导激活G蛋白,从而引发生理效应.
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关键词
分子动力学
芬太尼
阿片Μ受体
分子对接
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职称材料
题名
细胞分子生物学技术在靶向药物筛选中的应用
1
作者
刘明
赵琦
李亚男
胡文祥
机构
首都师范大学
生命科学学院
首都师范大学物理有机与药物化学研究所
出处
《生物技术通报》
CAS
CSCD
北大核心
2009年第6期62-66,共5页
基金
国家自然科学基金资助项目(20872095)
文摘
随着细胞及分子生物学的发展,新技术方法越来越多地用于新靶点建立和药物筛选研究,为药物设计、靶点的选择和用药方案的确定提供理论依据,同时使药物筛选有了更高的特异性,对药物筛选和药理学研究起到了极大的促进作用。论述了功能基因的筛选、高通量细胞筛选和高内涵筛选技术、反义核酸技术、转基因/基因敲除技术、基因芯片、蛋白质芯片、组织芯片、酶免疫分析、荧光免疫分析、流式细胞技术等方法在靶向药物筛选中的应用。
关键词
生物技术
药物筛选
分子药理学
受体学
Keywords
Biotechnology Drug screening Molecular pharmacology Receptorology
分类号
R96 [医药卫生—药理学]
在线阅读
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职称材料
题名
芬太尼类化合物与阿片μ受体相互作用的分子对接与分子动力学模拟
被引量：
9
2
作者
李博
刘明
胡文祥
机构
首都师范大学物理有机与药物化学研究所
首都师范大学
生命科学学院
出处
《物理化学学报》
SCIE
CAS
CSCD
北大核心
2010年第1期206-214,共9页
基金
国家自然科学基金(20872095)资助项目~~
文摘
采用分子对接和分子动力学(MD)模拟方法研究了芬太尼类化合物与阿片μ受体的相互作用机制.先用AutoDock4.0程序将芬太尼类化合物对接到同源模建的阿片μ受体结构中,再用GROMACS程序包在水溶液体系中分别对12个芬太尼激动剂和阿片μ受体蛋白复合物进行了MD模拟研究,优化对接复合物的结构,最后利用MM-PBSA方法,在APBS程序中计算芬太尼类衍生物与阿片μ受体的结合自由能,计算出的受体配合物结合常数(Ki)与其实验值吻合较好,并预测了化合物的活性排序.结果表明,复合物蛋白结构与空载受体蛋白结构有较大差异,特别是胞内区IL2、IL3和跨膜区段TM4骨架构象变化较大,不同的化合物对受体结构影响也有差异,活性较好的化合物会增加蛋白特定区域结构的柔性.芬太尼类化合物可能是通过和受体结合后诱导阿片μ受体构象转变为活性构象,引起一系列的信号传导激活G蛋白,从而引发生理效应.
关键词
分子动力学
芬太尼
阿片Μ受体
分子对接
Keywords
Molecular dynamics
Fentanyl
μ-opioid receptor
Molecular docking
分类号
R96 [医药卫生—药理学]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
细胞分子生物学技术在靶向药物筛选中的应用
刘明
赵琦
李亚男
胡文祥
《生物技术通报》
CAS
CSCD
北大核心
2009
0
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职称材料
2
芬太尼类化合物与阿片μ受体相互作用的分子对接与分子动力学模拟
李博
刘明
胡文祥
《物理化学学报》
SCIE
CAS
CSCD
北大核心
2010
9
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职称材料
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