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肺结核患者肺组织微生物组特征研究
被引量：
1
1
作者
王宇轩
王冲
+6 位作者
董宇杰
杜伟丽
宋婧
刘子臣
李琨
刘树库
车南颖
《中国防痨杂志》
CAS
2018年第11期1152-1158,共7页
目的 探讨肺结核患者肺部病灶坏死区、肉芽肿区和正常肺区的微生物组基本特征。方法 选取2016—2017年首都医科大学附属北京胸科医院10例临床及病理确诊为肺结核患者的福尔马林固定石蜡包埋（FFPE）的组织标本,通过显微切割技术分别获得...
目的 探讨肺结核患者肺部病灶坏死区、肉芽肿区和正常肺区的微生物组基本特征。方法 选取2016—2017年首都医科大学附属北京胸科医院10例临床及病理确诊为肺结核患者的福尔马林固定石蜡包埋（FFPE）的组织标本,通过显微切割技术分别获得FFPE组织的坏死区、肉芽肿区和正常肺区。采用高通量测序的方法,检测其微生物组特征。结果 肺结核患者肺部切除标本中主要的微生物类群（门水平,相对丰度〉1%）有Proteobacteria、Actinobacteria、Firmicutes、TM7和Bacteroidetes。在门水平上,坏死区、肉芽肿区和正常肺区的微生物群落组成未见差异。在属水平上,主要有7个类群（相对丰度〉1%）：坏死区、肉芽肿区、正常肺区相对丰度Ochrobactrum分别为（50.70±6.76）%、（56.18±7.50）%、（61.31±7.95）%;Sphingomonas分别为（7.50±2.07）%、（7.69±1.29）%、（3.81±2.08）%;Corynebacterium分别为（5.39±2.39）%、（5.23±1.39）%、（7.43±3.56）%;Brevundimonas分别为（1.67±0.42）%、（1.75±0.67）%、（2.09±0.34）%;Brevibacterium分别为（2.38±2.23）%、（2.60±2.60）%、（2.29±0.64）%;Sphingobacterium分别为（0.72±0.31）%、（0.78±0.26）%、（1.20±0.38）%和Enhydrobacter分别为（1.25±1.28）%、（0.31±0.19）%、（0.67±0.80）%。基于Bray-Curtis距离的Adonis分析结果表明,在属水平上,坏死区和正常肺区,肉芽肿区和正常肺区中微生物群落组成差异有统计学意义（F值分别为3.94和4.76,P值分别为0.005和0.002）。Mycobacterium的相对丰度非常低,主要存在于肺结核病灶的坏死区[（0.81±1.92）%]。配对样品检验结果表明Mycobacterium的相对丰度在坏死区[（0.81±1.92）%]和肉芽肿区[（0.01±0.01）%]、坏死区和正常肺区[（0.01±0.02）%]中差异有统计学意义（Z值分别为2.10和-2.37,P值分别为0.036和0.018）。结论 结核病患者肺部自坏死区、肉芽肿区到正常肺的组织变化中,Sphingomonas、Enhydrobacter、Kocuria和Mycobacterium的相对丰度整体呈下降趋势,而Ochrobactrum和Sphingobacterium的相对丰度总体呈上升趋势。肺结核患者肺部菌群的变化特征可能与肺结核的发病有重要关系。
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关键词
结核
肺
活组织检查
石蜡包埋
高通量核苷酸测序
微生物组
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职称材料
题名
肺结核患者肺组织微生物组特征研究
被引量：
1
1
作者
王宇轩
王冲
董宇杰
杜伟丽
宋婧
刘子臣
李琨
刘树库
车南颖
机构
首都医科大学
附属
北京
胸科医院
北京市
结核病
胸部
肿瘤
研究所
病理科耐药
结核病
研究
北京市
重点实验室
首都医科大学附属北京胸科医院北京市结核病胸部肿瘤研究所微创诊疗中心
出处
《中国防痨杂志》
CAS
2018年第11期1152-1158,共7页
基金
北京市科技计划医药协同科技创新研究（Z181100001918027）
北京市科学技术委员会重点项目（D181100000418003）
+2 种基金
北京市医院管理局登峰计划（DFL20151501,DFL20181601）
北京市科学技术委员会重点项目（D14117005214003）
北京市卫生与健康科技成果和适宜技术推广项目（2018-TD-41）
文摘
目的 探讨肺结核患者肺部病灶坏死区、肉芽肿区和正常肺区的微生物组基本特征。方法 选取2016—2017年首都医科大学附属北京胸科医院10例临床及病理确诊为肺结核患者的福尔马林固定石蜡包埋（FFPE）的组织标本,通过显微切割技术分别获得FFPE组织的坏死区、肉芽肿区和正常肺区。采用高通量测序的方法,检测其微生物组特征。结果 肺结核患者肺部切除标本中主要的微生物类群（门水平,相对丰度〉1%）有Proteobacteria、Actinobacteria、Firmicutes、TM7和Bacteroidetes。在门水平上,坏死区、肉芽肿区和正常肺区的微生物群落组成未见差异。在属水平上,主要有7个类群（相对丰度〉1%）：坏死区、肉芽肿区、正常肺区相对丰度Ochrobactrum分别为（50.70±6.76）%、（56.18±7.50）%、（61.31±7.95）%;Sphingomonas分别为（7.50±2.07）%、（7.69±1.29）%、（3.81±2.08）%;Corynebacterium分别为（5.39±2.39）%、（5.23±1.39）%、（7.43±3.56）%;Brevundimonas分别为（1.67±0.42）%、（1.75±0.67）%、（2.09±0.34）%;Brevibacterium分别为（2.38±2.23）%、（2.60±2.60）%、（2.29±0.64）%;Sphingobacterium分别为（0.72±0.31）%、（0.78±0.26）%、（1.20±0.38）%和Enhydrobacter分别为（1.25±1.28）%、（0.31±0.19）%、（0.67±0.80）%。基于Bray-Curtis距离的Adonis分析结果表明,在属水平上,坏死区和正常肺区,肉芽肿区和正常肺区中微生物群落组成差异有统计学意义（F值分别为3.94和4.76,P值分别为0.005和0.002）。Mycobacterium的相对丰度非常低,主要存在于肺结核病灶的坏死区[（0.81±1.92）%]。配对样品检验结果表明Mycobacterium的相对丰度在坏死区[（0.81±1.92）%]和肉芽肿区[（0.01±0.01）%]、坏死区和正常肺区[（0.01±0.02）%]中差异有统计学意义（Z值分别为2.10和-2.37,P值分别为0.036和0.018）。结论 结核病患者肺部自坏死区、肉芽肿区到正常肺的组织变化中,Sphingomonas、Enhydrobacter、Kocuria和Mycobacterium的相对丰度整体呈下降趋势,而Ochrobactrum和Sphingobacterium的相对丰度总体呈上升趋势。肺结核患者肺部菌群的变化特征可能与肺结核的发病有重要关系。
关键词
结核
肺
活组织检查
石蜡包埋
高通量核苷酸测序
微生物组
Keywords
Tuberculosis, pulmonary
Biopsy
Paraffin embedding
High-throughput nucleotidesequencing
Microbiome
分类号
R521 [医药卫生—内科学]
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题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
肺结核患者肺组织微生物组特征研究
王宇轩
王冲
董宇杰
杜伟丽
宋婧
刘子臣
李琨
刘树库
车南颖
《中国防痨杂志》
CAS
2018
1
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