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虾源达卡气单胞菌全基因组分析和致病性研究
被引量：
5
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作者
渠凤甜
周海健
+6 位作者
薛佳琦
杜小莉
胡锦瑞
崔志刚
谢桂林
刘辰庚
孟双
《中国比较医学杂志》
CAS
北大核心
2023年第3期24-36,共13页
目的为了解虾源达卡气单胞菌的毒力、耐药基因分布和全基因组信息,并初步评估达卡气单胞菌的致病性。方法对虾源分离株进行分子鉴定和多位点序列分型;利用β-溶血和胞外蛋白酶实验、秀丽隐杆线虫液体毒性实验、细胞毒实验、小鼠实验及...
目的为了解虾源达卡气单胞菌的毒力、耐药基因分布和全基因组信息,并初步评估达卡气单胞菌的致病性。方法对虾源分离株进行分子鉴定和多位点序列分型;利用β-溶血和胞外蛋白酶实验、秀丽隐杆线虫液体毒性实验、细胞毒实验、小鼠实验及毒力基因检测研究其致病性;通过药敏实验及耐药基因检测分析其耐药特征;利用eggnog、Prophage Hunter工具对全基因组序列进行分析。结果菌株18FX22鉴定为达卡气单胞菌。该菌的致病性主要表现:有β-溶血能力和胞外蛋白酶活性;对秀丽隐杆线虫、小鼠成纤维细胞和小鼠均有致病性。经检测,该菌携带7种毒力基因和12种耐药基因,发现其对阿莫西林/克拉维酸、头孢唑林和多粘菌素3种药物有耐药性。全基因组测序结果发现:18FX22的全基因组大小为4811079 bp,GC含量为61.33%。COG注释发现18FX22共有3850个基因,具有20类功能。前噬菌体预测结果发现18FX22的基因组中含有2个前噬菌体序列。全球达卡气单胞菌的聚类结果显示该菌与GCA016729585的进化关系更近。结论本研究从商品虾分离出达卡气单胞菌,发现该菌株的毒性较强,指示应加强海鲜食品安全的管控,并为达卡气单胞菌的防治提供参考。
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关键词
达卡气单胞菌
致病性
全基因组测序
前噬菌体
COG功能分析
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题名
虾源达卡气单胞菌全基因组分析和致病性研究
被引量：
5
1
作者
渠凤甜
周海健
薛佳琦
杜小莉
胡锦瑞
崔志刚
谢桂林
刘辰庚
孟双
机构
中国疾病预防控制中心传染病预防控制所
东北农业
大学
生命
科
学学院
华北理工
大学
临床医学院
首都医科大学附属北京安定医院检验科
出处
《中国比较医学杂志》
CAS
北大核心
2023年第3期24-36,共13页
基金
北京市属医院科研培育计划(PX2022077)。
文摘
目的为了解虾源达卡气单胞菌的毒力、耐药基因分布和全基因组信息,并初步评估达卡气单胞菌的致病性。方法对虾源分离株进行分子鉴定和多位点序列分型;利用β-溶血和胞外蛋白酶实验、秀丽隐杆线虫液体毒性实验、细胞毒实验、小鼠实验及毒力基因检测研究其致病性;通过药敏实验及耐药基因检测分析其耐药特征;利用eggnog、Prophage Hunter工具对全基因组序列进行分析。结果菌株18FX22鉴定为达卡气单胞菌。该菌的致病性主要表现:有β-溶血能力和胞外蛋白酶活性;对秀丽隐杆线虫、小鼠成纤维细胞和小鼠均有致病性。经检测,该菌携带7种毒力基因和12种耐药基因,发现其对阿莫西林/克拉维酸、头孢唑林和多粘菌素3种药物有耐药性。全基因组测序结果发现:18FX22的全基因组大小为4811079 bp,GC含量为61.33%。COG注释发现18FX22共有3850个基因,具有20类功能。前噬菌体预测结果发现18FX22的基因组中含有2个前噬菌体序列。全球达卡气单胞菌的聚类结果显示该菌与GCA016729585的进化关系更近。结论本研究从商品虾分离出达卡气单胞菌,发现该菌株的毒性较强,指示应加强海鲜食品安全的管控,并为达卡气单胞菌的防治提供参考。
关键词
达卡气单胞菌
致病性
全基因组测序
前噬菌体
COG功能分析
Keywords
Aeromonas dhakensis
pathogenicity
whole-genome sequencing
Protophage
COG function analysis
分类号
R-33 [医药卫生]
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题名
作者
出处
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1
虾源达卡气单胞菌全基因组分析和致病性研究
渠凤甜
周海健
薛佳琦
杜小莉
胡锦瑞
崔志刚
谢桂林
刘辰庚
孟双
《中国比较医学杂志》
CAS
北大核心
2023
5
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