-
题名基于生信分析探讨金雀异黄素对非小细胞肺癌的影响
- 1
-
-
作者
产柳佳
王阳
谢楚菲
赵立春
-
机构
广西中医药大学中医药壮瑶医药研究院
首都医科大学药学院
首都医科大学附属北京地坛医院传染病研究所/新发突发传染病研究北京市重点实验室
北京市感染性疾病研究中心
贵州中医药大学药学院
-
出处
《世界中医药》
北大核心
2025年第15期2619-2625,共7页
-
基金
国家自然科学基金项目(82160775)
广西自然科学基金重点项目(2021GXNSFDA075008)。
-
文摘
目的:通过生物信息学分析和细胞生物学实验,探究金雀异黄素对非小细胞肺癌(NSCLC)A549细胞系的影响及潜在治疗靶点。方法:将肺癌细胞A549分为对照组和金雀异黄素给药组(100μmol/L),处理48 h后,使用核糖核酸(RNA)试剂盒提取细胞的RNA。将提取出的RNA进行转录组测序。所得到的差异基因在sangerbox网站进行热图和火山图分析;运用Matascape网站进行基因本体(GO)富集分析;利用在线网站Omicshare进行京都基因与基因组百科全书(KEGG)富集分析;将药物与疾病交集靶点上传至Cytoscape_v3.7.2数据平台进行蛋白质-蛋白质相互作用(PPI)分析。通过流式细胞术验证金雀异黄素对肺癌细胞周期的影响。结果:与对照组比较,金雀异黄素给药后,mRNA的表达发生了改变,2组差异明显。共筛选出4630个差异基因的表达,其中有2853个上升基因,1777个下降基因。KEGG富集分析显示,金雀异黄素给药后影响了细胞周期(Cell cycle)。细胞周期实验结果表明,金雀异黄素将肺癌细胞周期阻滞在G_(2)/M期,并同时影响了细胞有丝分裂进程。结论:金雀异黄素可能通过影响A549细胞周期、DNA复制、p53等信号通路抑制NSCLC进程。
-
关键词
生物信息学
金雀异黄素
转录组测序
非小细胞肺癌
人肺癌细胞系细胞A549
流式细胞术
细胞周期
有丝分裂
-
Keywords
Bioinformatics
Genistein
Transcriptome sequencing
Non-small cell lung cancer
A549
Flow cytometry
Cell cycle
Mitosis
-
分类号
R734.2
[医药卫生—肿瘤]
-
