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P53凋亡刺激蛋白2介导酒精性肝病脂代谢相关基因的转录组学分析 被引量:3
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作者 张莹 刘超楠 +3 位作者 时红林 刘芳 陈德喜 时红波 《首都医科大学学报》 CAS 北大核心 2023年第1期85-92,共8页
目的应用转录组学测序探讨P53凋亡刺激蛋白2(apoptosis stimulating protein 2,ASPP2)对酒精性肝病脂代谢相关基因表达的影响。方法首先用慢病毒转染人肝细胞HL-7702细胞系,构建7702 Control-shRNA和7702 ASPP2-shRNA细胞模型。然后,两... 目的应用转录组学测序探讨P53凋亡刺激蛋白2(apoptosis stimulating protein 2,ASPP2)对酒精性肝病脂代谢相关基因表达的影响。方法首先用慢病毒转染人肝细胞HL-7702细胞系,构建7702 Control-shRNA和7702 ASPP2-shRNA细胞模型。然后,两组细胞均用400 mmol/L乙醇处理24 h,构建7702 Control-shRNA和7702 ASPP2-shRNA酒精肝模型。Illumina测序平台筛选差异表达基因,并进行基因本体(gene ontology,GO)富集分析和互作分析。结果高通量测序以P<0.05且|log 2(foldchange)|>1的筛选标准获得150个差异表达的基因,其中上调的差异基因有58个,下调92个。其中,与脂代谢相关的上调差异基因有8个,下调差异基因有7个。GO富集分析发现4个脂代谢相关的细胞组分,包括高密度脂蛋白粒子,血浆脂蛋白粒子,脂蛋白粒子以及蛋白-脂质复合物。结论本研究发现15种脂代谢相关差异基因,这些基因可能参与ASPP2介导的酒精性肝病脂代谢,为进一步研究ASPP2在酒精性肝病脂代谢中的调控机制奠定了基础。 展开更多
关键词 凋亡刺激蛋白2 酒精性肝病 脂代谢 转录组学 生物信息学
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慢性乙型肝炎及肝硬化患者血清血管生成素1、2及其比值变化与HBV DNA和ALT的相关性分析 被引量:1
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作者 林明华 常远 +2 位作者 刘芳 黄雁翔 徐航飞 《临床肝胆病杂志》 CAS 北大核心 2024年第6期1126-1129,共4页
目的分析血清血管生成素(Ang)1、2及其比值变化与慢性乙型肝炎(CHB)、肝硬化患者HBV DNA和ALT的相关性。方法选取2018年3月—2019年10月首都医科大学附属北京佑安医院收治的CHB患者99例,肝硬化患者59例,收集临床资料和血清标本;另选同... 目的分析血清血管生成素(Ang)1、2及其比值变化与慢性乙型肝炎(CHB)、肝硬化患者HBV DNA和ALT的相关性。方法选取2018年3月—2019年10月首都医科大学附属北京佑安医院收治的CHB患者99例,肝硬化患者59例,收集临床资料和血清标本;另选同期46例健康体检者作为对照组。所有患者均采用PCR法检测血清HBV DNA;采用酶联免疫吸附法检测血清Ang-1和Ang-2水平,比较各组血清Ang-1和Ang-2及Ang-1/Ang-2的差异。非正态分布的计量资料多组间比较采用Kruskal-Wallis H检验,进一步两两比较采用Bonferroni法;采用Spearman方法分析Ang-1、Ang-2、Ang-1/Ang-2与HBV DNA、ALT的相关性。结果与对照组(671.0 pg/mL)相比,CHB组(479.0 pg/mL)和肝硬化组(208.4 pg/mL)Ang-1水平显著降低(P值均<0.05);与CHB组相比,肝硬化组Ang-1水平显著降低(P<0.001)。与对照组(198.0 pg/mL)相比,CHB组(286.1 pg/mL)和肝硬化组(438.4 pg/mL)Ang-2水平显著升高(P值均<0.001);与CHB组相比,肝硬化组Ang-2水平显著升高(P<0.001)。与对照组(3.4)相比,CHB组(1.6)和肝硬化组(0.5)Ang-1/Ang-2比值显著降低(P值均<0.001);与CHB组相比,肝硬化组Ang-1/Ang-2比值显著降低(P<0.001)。Spearman分析显示,CHB组Ang-1与HBV DNA及ALT均呈负相关(r值分别为−0.400、−0.394,P值均˂0.001);Ang-2与HBV DNA及ALT均呈正相关(r值分别为0.365、0.351,P值均˂0.001);Ang-1/Ang-2与HBV DNA及ALT均呈负相关(r值分别为−0.463、−0.473,P值均˂0.001);而肝硬化组Ang-1、Ang-2及Ang-1/Ang-2均与HBV DNA和ALT无相关性(P值均˃0.05)。结论CHB、肝硬化患者血清Ang-1、Ang-2及Ang-1/Ang-2有显著改变,其中肝炎组Ang-1、Ang-2及Ang-1/Ang-2在一定程度上反映CHB患者肝损伤的程度。 展开更多
关键词 血管生成素1 血管生成素2 乙型肝炎 慢性 肝硬化 乙型肝炎病毒 丙氨酸转氨酶
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肝再生在对乙酰氨基酚诱导的肝损伤修复中的作用 被引量:2
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作者 莫胤康 范子豪 任锋 《临床肝胆病杂志》 CAS 北大核心 2024年第9期1902-1907,共6页
肝再生在对乙酰氨基酚(APAP)诱导的肝损伤后恢复中有着至关重要的作用。APAP过量服用后,通常是肝损伤程度越大,再生的程度就越大,从而导致肝损伤的消退和大多数情况下的自发恢复。然而,严重APAP过量会导致肝再生受损和无法控制的肝损伤... 肝再生在对乙酰氨基酚(APAP)诱导的肝损伤后恢复中有着至关重要的作用。APAP过量服用后,通常是肝损伤程度越大,再生的程度就越大,从而导致肝损伤的消退和大多数情况下的自发恢复。然而,严重APAP过量会导致肝再生受损和无法控制的肝损伤,导致无法恢复,甚至死亡。在APAP肝损伤后,肝脏中细胞之间的相互作用对再生反应非常重要。肝再生由多种增殖信号通路共同调控,这些通路涉及激酶、核受体、转录因子、转录共激活因子。严重的APAP过量后会抑制增殖信号通路的激活,导致细胞周期停滞和肝再生受损。虽然肝再生在APAP肝损伤后的修复过程中发挥关键作用,但目前其发挥作用的潜在机制尚不明确。本文就已有的相关研究对肝再生在APAP诱导的肝损伤中的作用进行综述,为进一步的基础研究提供参考。 展开更多
关键词 化学性与药物性肝损伤 对乙酰氨基酚 信号传导 修复
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非肝硬化乙型肝炎病毒相关肝细胞癌的转录组测序及其对患者生存的影响 被引量:3
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作者 万妍 刘芳 +1 位作者 郭闪 吴剑 《首都医科大学学报》 CAS 北大核心 2023年第5期811-820,共10页
目的通过转录组测序以及生物信息学分析探讨非肝硬化乙型肝炎病毒(hepatitis B viral,HBV)相关肝细胞癌的转录特征及与患者生存的关系。方法通过转录组测序获得非肝硬化HBV相关肝细胞癌(hepatocellular carcinoma,HCC)的差异表达基因;... 目的通过转录组测序以及生物信息学分析探讨非肝硬化乙型肝炎病毒(hepatitis B viral,HBV)相关肝细胞癌的转录特征及与患者生存的关系。方法通过转录组测序获得非肝硬化HBV相关肝细胞癌(hepatocellular carcinoma,HCC)的差异表达基因;利用基因本体(gene ontology,GO)和京都基因与基因组百科全书(Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes,KEGG)数据库富集分析获得差异表达基因涉及的生物功能过程及信号通路;通过基因-基因功能相互作用网络分析获得关键基因;利用癌症基因图谱(the cancer genome atlas,TCGA)数据库肝癌队列对关键基因进行生存预后分析。结果共发现上调差异基因3672个,下调差异基因2715个。GO功能富集分析主要涉及细胞分化、DNA复制、DNA修复、炎症反应免疫应答、细胞黏附等。KEGG通路富集主要包括细胞周期、氧化磷酸化、p53信号通路、肿瘤坏死因子(tumor necrosis factor,TNF)信号通路和核因子κB(nuclear factor kappa-B,NF-κB)信号通路等。其中丝裂原活化蛋白激酶3(mitogen-activated protein kinase 3,MAPK3)、Ras相关C3肉毒毒素底物1(ras-related C3 cotulinum toxin substrate 1,RAC1)、磷脂酶Cβ1(phospholipase C beta 1,PLCβ1)、连环蛋白β1(catenin beta 1,CTNNβ1)、非转移性细胞1(non-metastatic cells 1,NME1)基因和非转移性细胞6(non-metastatic cells 6,NME6)基因高表达与肝癌患者预后不良相关(P<0.05);FYN、细胞色素P450(cytochrome P450,CYP)2C8和CYP2C9低表达与肝癌患者预后不良有关(P<0.05)。结论非肝硬化HBV相关肝细胞癌发生涉及多个生物学过程和信号通路的改变,与肝癌患者的生存预后相关的关键基因为理解非肝硬化HBV相关HCC发生机制提供新线索。 展开更多
关键词 非肝硬化肝细胞癌 差异表达基因 信号通路
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不同复苏方式对冻存外泌体的影响
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作者 肖俐 罗淑敏 +3 位作者 徐芳 陈静 邢恩鸿 李伟华 《首都医科大学学报》 CAS 北大核心 2023年第4期639-644,共6页
目的比较4℃、37℃和室温三种不同复苏方式对冻存外泌体的影响,明确冻存外泌体的最佳复苏方式。方法将冻存血浆分成三组:4℃冰箱过夜融化复苏组、37℃水浴箱融化复苏组、室温融化复苏组。采用超速离心法提取外泌体;使用透射电镜检测外... 目的比较4℃、37℃和室温三种不同复苏方式对冻存外泌体的影响,明确冻存外泌体的最佳复苏方式。方法将冻存血浆分成三组:4℃冰箱过夜融化复苏组、37℃水浴箱融化复苏组、室温融化复苏组。采用超速离心法提取外泌体;使用透射电镜检测外泌体大小、形态结构;Amnis量化成像流式细胞仪检测外泌体的数量和所占总粒子百分比(纯度)。结果三种复苏方式中,37℃水浴箱融化复苏组得到外泌体的数量和百分比最高,与4℃冰箱融化复苏组和室温融化复苏组比较,组间差异均有统计学意义(P<0.01)。4℃冰箱过夜融化复苏组获得外泌体的数量和百分比最低。同时发现,在人的血浆外泌体中,CD9阳性外泌体的数量明显高于CD63阳性外泌体和CD81阳性外泌体,差异具有统计学意义(P<0.05)。结论37℃水浴箱融化复苏获得外泌体的数量和百分比最高,是最佳的外泌体复苏方式。在人血浆外泌体中,CD9阳性外泌体的数量及百分比最高。 展开更多
关键词 外泌体 复苏 活性
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不同培养时间对人单核细胞来源树突状细胞表型及其外泌体免疫膜蛋白的影响
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作者 罗淑敏 徐芳 +3 位作者 路鹏鹏 王一越 李传云 李伟华 《细胞与分子免疫学杂志》 2025年第11期971-977,共7页
目的探讨培养时间对人单核细胞来源树突状细胞(DC)及其外泌体(DEX)免疫膜蛋白的影响。方法采用重组粒细胞-巨噬细胞集落刺激因子(GM-CSF)和白细胞介素4(IL-4)诱导人单核细胞分化成DC,并经肿瘤坏死因子α(TNF-α)促使其成熟;超速离心法分... 目的探讨培养时间对人单核细胞来源树突状细胞(DC)及其外泌体(DEX)免疫膜蛋白的影响。方法采用重组粒细胞-巨噬细胞集落刺激因子(GM-CSF)和白细胞介素4(IL-4)诱导人单核细胞分化成DC,并经肿瘤坏死因子α(TNF-α)促使其成熟;超速离心法分离DEX,透射电子显微镜及Amnis量化成像流式细胞术鉴定DEX并检测DC及DEX的免疫膜蛋白表达情况。结果体外培养至第10天,DC表面即高表达CD11c、CD80、CD86、主要组织相容性复合体Ⅰ(MHC-Ⅰ)及MHC-Ⅱ分子,至第18天达峰值,表达率分别为CD11c(78.66±20.33)%、CD80(76.41±10.02)%、CD86(96.43±0.43)%、MHC-Ⅰ(84.71±2.96)%、MHC-Ⅱ(80.01±7.03)%,第24天后表达总体呈下降趋势(除CD80和MHC-Ⅱ外,差异均具有统计学意义);培养至第30天,仍有80%的DC表达CD80、CD86、MHC-Ⅱ分子。DEX表面免疫膜蛋白表达亦于第18天最高,随后随培养时间延长总体下降(除CD80外,差异均具有统计学意义)。相关性分析显示,DC与DEX表面的免疫膜蛋白表达水平呈显著正相关(CD11c:r=0.98;CD80:r=0.65;CD86:r=0.82;MHC-Ⅰ:r=0.86;MHC-Ⅱ:r=0.93)。结论人单核细胞来源的DC在体外培养中可高效表达免疫膜蛋白,并在一定时间内保持稳定;其分泌的DEX表面同样高表达免疫膜蛋白,且二者表达变化趋势基本一致。 展开更多
关键词 树突状细胞(DC) 外泌体 免疫膜蛋白
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