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cfDNA浓度及完整性在癌症中的诊断及预后价值
被引量：
2
1
作者
应超
丁晖
蔡彦宁
《实用医学杂志》
CAS
北大核心
2023年第9期1185-1189,共5页
癌症在世界范围内是一个重大的公共健康问题,有效的早期干预以及疗效监视可以降低肿瘤患者的发生以及死亡风险。在多数癌症中,外周血循环游离DNA(Circulating cell⁃free DNA,cfDNA)浓度及其完整性可能是一类有效的早期诊断、进展期患者...
癌症在世界范围内是一个重大的公共健康问题,有效的早期干预以及疗效监视可以降低肿瘤患者的发生以及死亡风险。在多数癌症中,外周血循环游离DNA(Circulating cell⁃free DNA,cfDNA)浓度及其完整性可能是一类有效的早期诊断、进展期患者识别以及预后监测指标。本文旨在综述cfDNA浓度及其完整性在不同癌症中的诊疗效能,并与当前临床上常用的肿瘤标志物进行对比,探讨该指标在临床实践中的应用价值以及前景。
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关键词
循环游离DNA
完整性
诊断
预后
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职称材料
三种游离核酸提取试剂盒对血浆cfDNA提取性能的比较
被引量：
4
2
作者
应超
蔡燕宁
+3 位作者
郝淑文
王婷
刘沅贺
赵立芳
《实用医学杂志》
CAS
北大核心
2023年第12期1556-1563,共8页
目的综合评估3种游离核酸(cfDNA)提取试剂盒,以筛选出经济可靠的商品试剂盒。方法我们使用了3种不同的试剂盒提取10名健康人血浆中的cfDNA,并使用Agilent 2100生物芯片分析仪对cfDNA片段大小和丰度进行评估。同时,我们还使用微滴式数字P...
目的综合评估3种游离核酸(cfDNA)提取试剂盒,以筛选出经济可靠的商品试剂盒。方法我们使用了3种不同的试剂盒提取10名健康人血浆中的cfDNA,并使用Agilent 2100生物芯片分析仪对cfDNA片段大小和丰度进行评估。同时,我们还使用微滴式数字PCR(ddPCR)对cfDNA中的核糖核酸酶P蛋白亚基p30(RPP30)、NADH脱氢酶亚基1(ND1)、NADH脱氢酶亚基4(ND4)基因拷贝数进行定量,并利用实时荧光定量PCR(qPCR)检测cfDNA中藤黄节杆菌序列(ALU)ALU115和ALU247的浓度。此外,我们还在混合血浆中掺入50~766 bp的DNA Ladder,然后使用上述3种提取试剂盒对其进行提取,并使用Agilent 2100生物芯片分析仪分析各DNA片段的浓度,以计算不同试剂盒对不同大小的DNA片段的回收率和提取偏好性。结果3种试剂盒从健康人血浆中纯化的100~300 bp cfDNA浓度分别为(5.10±1.99)、(4.64±3.09)和(1.82±1.29)ng/mL(P=0.006)。Kit A所提取的RPP30拷贝数显著高于Kit C(P=0.018),而Kit A和Kit B所提取的ND1和ND4拷贝数也均显著高于Kit C(P=0.001;P=0.001;P=0.001;P=0.001)。此外,Kit A所提取的cfDNA中,ALU 115和ALU 247的浓度也显著高于Kit C(P=0.009;P=0.003)。3种试剂盒对混合血浆中掺入的外源性DNA Ladder的回收率差异有统计学意义(P<0.001),同时Kit B和Kit C对不同大小的DNA片段也存在提取偏好性。结论Kit A性能最佳,Kit B是一种低成本替代方案,其工作流程更简单省时。
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关键词
游离DNA
提取试剂盒
核酸提取
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职称材料
题名
cfDNA浓度及完整性在癌症中的诊断及预后价值
被引量：
2
1
作者
应超
丁晖
蔡彦宁
机构
首都医科大学宣武医院
神经生物学研究室
教育部神经变性病重点实验室
国家老年疾病
临床
医学研究
中心
首都医科大学宣武医院临床样本中心
出处
《实用医学杂志》
CAS
北大核心
2023年第9期1185-1189,共5页
基金
国家重点研发计划(编号:2021YFC2501205)。
文摘
癌症在世界范围内是一个重大的公共健康问题,有效的早期干预以及疗效监视可以降低肿瘤患者的发生以及死亡风险。在多数癌症中,外周血循环游离DNA(Circulating cell⁃free DNA,cfDNA)浓度及其完整性可能是一类有效的早期诊断、进展期患者识别以及预后监测指标。本文旨在综述cfDNA浓度及其完整性在不同癌症中的诊疗效能,并与当前临床上常用的肿瘤标志物进行对比,探讨该指标在临床实践中的应用价值以及前景。
关键词
循环游离DNA
完整性
诊断
预后
Keywords
circulating free DNA
integrity
diagnosis
prognosis
分类号
R73-3 [医药卫生—肿瘤]
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职称材料
题名
三种游离核酸提取试剂盒对血浆cfDNA提取性能的比较
被引量：
4
2
作者
应超
蔡燕宁
郝淑文
王婷
刘沅贺
赵立芳
机构
首都医科大学宣武医院
神经生物学研究室
教育部神经变性病重点实验室
国家老年疾病
临床
医学研究
中心
首都医科大学宣武医院临床样本中心
河北
医科大
学第一
医院
神经内科
出处
《实用医学杂志》
CAS
北大核心
2023年第12期1556-1563,共8页
基金
国家重点研发计划(编号:2021YFC2501205)。
文摘
目的综合评估3种游离核酸(cfDNA)提取试剂盒,以筛选出经济可靠的商品试剂盒。方法我们使用了3种不同的试剂盒提取10名健康人血浆中的cfDNA,并使用Agilent 2100生物芯片分析仪对cfDNA片段大小和丰度进行评估。同时,我们还使用微滴式数字PCR(ddPCR)对cfDNA中的核糖核酸酶P蛋白亚基p30(RPP30)、NADH脱氢酶亚基1(ND1)、NADH脱氢酶亚基4(ND4)基因拷贝数进行定量,并利用实时荧光定量PCR(qPCR)检测cfDNA中藤黄节杆菌序列(ALU)ALU115和ALU247的浓度。此外,我们还在混合血浆中掺入50~766 bp的DNA Ladder,然后使用上述3种提取试剂盒对其进行提取,并使用Agilent 2100生物芯片分析仪分析各DNA片段的浓度,以计算不同试剂盒对不同大小的DNA片段的回收率和提取偏好性。结果3种试剂盒从健康人血浆中纯化的100~300 bp cfDNA浓度分别为(5.10±1.99)、(4.64±3.09)和(1.82±1.29)ng/mL(P=0.006)。Kit A所提取的RPP30拷贝数显著高于Kit C(P=0.018),而Kit A和Kit B所提取的ND1和ND4拷贝数也均显著高于Kit C(P=0.001;P=0.001;P=0.001;P=0.001)。此外,Kit A所提取的cfDNA中,ALU 115和ALU 247的浓度也显著高于Kit C(P=0.009;P=0.003)。3种试剂盒对混合血浆中掺入的外源性DNA Ladder的回收率差异有统计学意义(P<0.001),同时Kit B和Kit C对不同大小的DNA片段也存在提取偏好性。结论Kit A性能最佳,Kit B是一种低成本替代方案,其工作流程更简单省时。
关键词
游离DNA
提取试剂盒
核酸提取
Keywords
Cell⁃free DNA
extraction kit
nucleic acid extraction
分类号
R446.1 [医药卫生—诊断学]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
cfDNA浓度及完整性在癌症中的诊断及预后价值
应超
丁晖
蔡彦宁
《实用医学杂志》
CAS
北大核心
2023
2
在线阅读
下载PDF
职称材料
2
三种游离核酸提取试剂盒对血浆cfDNA提取性能的比较
应超
蔡燕宁
郝淑文
王婷
刘沅贺
赵立芳
《实用医学杂志》
CAS
北大核心
2023
4
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