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HCV 3b亚型全长序列测定及基线耐药相关置换的分析
被引量:
1
1
作者
黄杰庭
许茹
+5 位作者
廖峭
王敏
单振刚
尤庆柱
戎霞
付涌水
《临床肝胆病杂志》
CAS
北大核心
2020年第1期94-97,共4页
目的探讨二代测序法(NGS)在HCV 3b全长序列及基线耐药相关置换(RAS)检测中的应用。方法从1例2016年7月在广州血液中心献血的献血者(HCV RNA阳性)血浆中提取核酸,经序列非依赖性扩增后,构建测序文库并采用illumina Hiseq进行深度测序,然...
目的探讨二代测序法(NGS)在HCV 3b全长序列及基线耐药相关置换(RAS)检测中的应用。方法从1例2016年7月在广州血液中心献血的献血者(HCV RNA阳性)血浆中提取核酸,经序列非依赖性扩增后,构建测序文库并采用illumina Hiseq进行深度测序,然后通过生物信息学方法分析HCV全长序列、病毒基因分型以及针对直接抗病毒药物(DAA)的基线RAS。结果NGS获得8.4 Gb原始测序数据,序列数(reads)超过56 M。经生物信息学分析获得HCV全长序列,平均测序深度为488007,基因分型结果为3b亚型。病毒氨基酸序列里含有12个RAS,分别是NS3区域的Y56H、Q80K、Q80R、A156G,NS5A区域的M28G、Q/A30G、Q/A30K、L31F、L31M、Y93H,以及NS5B区域的S282T和V321A,其中位于NS5A区域的Q/A30K和L31M属于高丰度RAS(99.16%和98.37%),其余10个RAS丰度较低(<0.5%)。结论NGS用于HCV 3b亚型的全长序列检测和基因分型,最终鉴定出基线RAS,对于HCV 3b的流行病学研究和DAA治疗方案的制订有重要意义。
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关键词
肝炎病毒属
高通量核苷酸序列分析
基因型
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职称材料
低温鲜牛奶预防鼻咽癌放疗后口腔黏膜反应的效果观察
被引量:
5
2
作者
罗先娣
林利萍
肖辉
《护理学杂志》
2012年第12期66-67,共2页
目的探讨低温鲜牛奶对鼻咽癌放疗患者口腔黏膜反应的预防效果。方法将80例鼻咽癌放疗患者随机分为对照组和观察组各40例。对照组放疗期间给予复方硼酸溶液含漱,并给予正确的口腔卫生及饮食指导;观察组在此基础上每天在放疗后立即缓慢吸...
目的探讨低温鲜牛奶对鼻咽癌放疗患者口腔黏膜反应的预防效果。方法将80例鼻咽癌放疗患者随机分为对照组和观察组各40例。对照组放疗期间给予复方硼酸溶液含漱,并给予正确的口腔卫生及饮食指导;观察组在此基础上每天在放疗后立即缓慢吸吮低温(4℃)鲜牛奶250mL,直至全程放疗结束。结果两组患者口腔黏膜反应程度比较,差异有统计学意义(P<0.01)。结论低温鲜牛奶可减轻鼻咽癌放疗引起的口腔黏膜反应,延迟其发生时间,减轻患者痛苦。
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关键词
鼻咽肿瘤
放射疗法
口腔黏膜反应
低温鲜牛奶
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职称材料
题名
HCV 3b亚型全长序列测定及基线耐药相关置换的分析
被引量:
1
1
作者
黄杰庭
许茹
廖峭
王敏
单振刚
尤庆柱
戎霞
付涌水
机构
广州血液中心
广州市医学重点实验室(血液安全重点实验室)
韶关市第一人民医院耳鼻喉科
南方医科大学检验与生物技术学院输血医学系
出处
《临床肝胆病杂志》
CAS
北大核心
2020年第1期94-97,共4页
基金
广州市医药卫生科技项目(20161A011058)
广东省医学科学技术研究基金项目(A2018499)
广州市医学重点学科建设项目
文摘
目的探讨二代测序法(NGS)在HCV 3b全长序列及基线耐药相关置换(RAS)检测中的应用。方法从1例2016年7月在广州血液中心献血的献血者(HCV RNA阳性)血浆中提取核酸,经序列非依赖性扩增后,构建测序文库并采用illumina Hiseq进行深度测序,然后通过生物信息学方法分析HCV全长序列、病毒基因分型以及针对直接抗病毒药物(DAA)的基线RAS。结果NGS获得8.4 Gb原始测序数据,序列数(reads)超过56 M。经生物信息学分析获得HCV全长序列,平均测序深度为488007,基因分型结果为3b亚型。病毒氨基酸序列里含有12个RAS,分别是NS3区域的Y56H、Q80K、Q80R、A156G,NS5A区域的M28G、Q/A30G、Q/A30K、L31F、L31M、Y93H,以及NS5B区域的S282T和V321A,其中位于NS5A区域的Q/A30K和L31M属于高丰度RAS(99.16%和98.37%),其余10个RAS丰度较低(<0.5%)。结论NGS用于HCV 3b亚型的全长序列检测和基因分型,最终鉴定出基线RAS,对于HCV 3b的流行病学研究和DAA治疗方案的制订有重要意义。
关键词
肝炎病毒属
高通量核苷酸序列分析
基因型
Keywords
hepacivirus
high-throughput nucleotide sequencing
genotype
分类号
R512.63 [医药卫生—内科学]
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职称材料
题名
低温鲜牛奶预防鼻咽癌放疗后口腔黏膜反应的效果观察
被引量:
5
2
作者
罗先娣
林利萍
肖辉
机构
韶关市第一人民医院耳鼻喉科
韶关市第一人民医院
放疗科
出处
《护理学杂志》
2012年第12期66-67,共2页
文摘
目的探讨低温鲜牛奶对鼻咽癌放疗患者口腔黏膜反应的预防效果。方法将80例鼻咽癌放疗患者随机分为对照组和观察组各40例。对照组放疗期间给予复方硼酸溶液含漱,并给予正确的口腔卫生及饮食指导;观察组在此基础上每天在放疗后立即缓慢吸吮低温(4℃)鲜牛奶250mL,直至全程放疗结束。结果两组患者口腔黏膜反应程度比较,差异有统计学意义(P<0.01)。结论低温鲜牛奶可减轻鼻咽癌放疗引起的口腔黏膜反应,延迟其发生时间,减轻患者痛苦。
关键词
鼻咽肿瘤
放射疗法
口腔黏膜反应
低温鲜牛奶
分类号
R472 [医药卫生—护理学]
R473.76 [医药卫生—护理学]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
HCV 3b亚型全长序列测定及基线耐药相关置换的分析
黄杰庭
许茹
廖峭
王敏
单振刚
尤庆柱
戎霞
付涌水
《临床肝胆病杂志》
CAS
北大核心
2020
1
在线阅读
下载PDF
职称材料
2
低温鲜牛奶预防鼻咽癌放疗后口腔黏膜反应的效果观察
罗先娣
林利萍
肖辉
《护理学杂志》
2012
5
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职称材料
已选择
0
条
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引用分析
参考文献
引证文献
统计分析
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