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基于网络药理学和分子对接探讨苹果多酚对铜绿假单胞菌的抑制作用
1
作者
郭世纪
何成洪
+2 位作者
刘政
郭可心
王会
《食品与发酵工业》
北大核心
2025年第11期65-74,共10页
该研究采用网络药理学和分子对接技术探究苹果多酚对铜绿假单胞菌及其疾病的抑制机制。通过文献检索搜集苹果多酚的活性成分并通过TCMSP平台、PubChem数据库、SwissTargetPrediction数据库、Swiss ADME网站获取成分靶点,通过Genecards、...
该研究采用网络药理学和分子对接技术探究苹果多酚对铜绿假单胞菌及其疾病的抑制机制。通过文献检索搜集苹果多酚的活性成分并通过TCMSP平台、PubChem数据库、SwissTargetPrediction数据库、Swiss ADME网站获取成分靶点,通过Genecards、OMIM和TTD数据库检索“Pseudomonas aeruginosa”获取相关靶点。使用“微生信”网站获取交集靶点。并使用STRING平台进行交集靶点的蛋白-蛋白相互作用分析,并在DAVID平台进行GO功能富集分析和KEGG通路富集分析,最后借助AutoDockTools软件进行分子对接,对实验进行验证。经过筛选得到8个植物活性成分和184个成分靶点,1103个抑制铜绿假单胞菌靶点,52个交集靶点。通过蛋白-蛋白相互作用分析推测包括EGFR、AKT1、BCL2、HIF1A等共51个关键靶点,通过GO和KEGG富集分析,获得387条目和93条通路与抑制铜绿假单胞菌有关,主要影响通路为EGFR酪氨酸激酶抑制剂耐药性、PI3K/AKT和VEGF信号通路。分子对接表明,度值最高的4个活性成分均可以和靶点发生结合。整体实验结果表明苹果多酚可通过多成分、多靶点、多通路实现抑制铜绿假单胞菌及其疾病的作用。该研究可为苹果多酚抑制铜绿假单胞菌及其疾病的研究提供理论基础。
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关键词
苹果多酚
铜绿假单胞菌
网络药理学
分子对接
抑菌活性
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职称材料
题名
基于网络药理学和分子对接探讨苹果多酚对铜绿假单胞菌的抑制作用
1
作者
郭世纪
何成洪
刘政
郭可心
王会
机构
锦州医科大学食品与健康学院
鞍山市台安县恩良医院儿科
出处
《食品与发酵工业》
北大核心
2025年第11期65-74,共10页
基金
辽宁省2022年省级大学生创新训练项目(S202210160021)
2023年辽宁省自然科学基金计划项目(2023-MS-309)。
文摘
该研究采用网络药理学和分子对接技术探究苹果多酚对铜绿假单胞菌及其疾病的抑制机制。通过文献检索搜集苹果多酚的活性成分并通过TCMSP平台、PubChem数据库、SwissTargetPrediction数据库、Swiss ADME网站获取成分靶点,通过Genecards、OMIM和TTD数据库检索“Pseudomonas aeruginosa”获取相关靶点。使用“微生信”网站获取交集靶点。并使用STRING平台进行交集靶点的蛋白-蛋白相互作用分析,并在DAVID平台进行GO功能富集分析和KEGG通路富集分析,最后借助AutoDockTools软件进行分子对接,对实验进行验证。经过筛选得到8个植物活性成分和184个成分靶点,1103个抑制铜绿假单胞菌靶点,52个交集靶点。通过蛋白-蛋白相互作用分析推测包括EGFR、AKT1、BCL2、HIF1A等共51个关键靶点,通过GO和KEGG富集分析,获得387条目和93条通路与抑制铜绿假单胞菌有关,主要影响通路为EGFR酪氨酸激酶抑制剂耐药性、PI3K/AKT和VEGF信号通路。分子对接表明,度值最高的4个活性成分均可以和靶点发生结合。整体实验结果表明苹果多酚可通过多成分、多靶点、多通路实现抑制铜绿假单胞菌及其疾病的作用。该研究可为苹果多酚抑制铜绿假单胞菌及其疾病的研究提供理论基础。
关键词
苹果多酚
铜绿假单胞菌
网络药理学
分子对接
抑菌活性
Keywords
apple polyphenols
Pseudomonas aeruginosa
network pharmacology
molecular docking
antibacterial activity
分类号
R285 [医药卫生—中药学]
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作者
出处
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被引量
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1
基于网络药理学和分子对接探讨苹果多酚对铜绿假单胞菌的抑制作用
郭世纪
何成洪
刘政
郭可心
王会
《食品与发酵工业》
北大核心
2025
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