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题名沙鞭PvDREB基因克隆与表达特异性分析
被引量：6
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作者
张雨
苏旭
刘玉萍
苏丹丹
郑长远
陈金元
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机构
青海师范大学生命科学学院
青海师范大学、青海省青藏高原生物多样性形成机制与综合利用重点实验室
高原科学与可持续发展研究院
青海师范大学、青海省青藏高原药用动植物资源重点实验室
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出处
《西北植物学报》
CAS
CSCD
北大核心
2023年第2期202-210,共9页
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基金
国家自然科学基金(32160297,41761009)
青海省重点研发与转化计划国际合作专项(2023-HZ-810)
2022年大学生创新创业训练计划项目(qhnucxcy2022055)。
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文摘
基于沙鞭的三代转录组数据,该研究利用PCR技术克隆DREB基因,并对其进行生物信息学分析;采用实时荧光定量PCR分析该基因的表达模式以及在20%PEG-6000模拟干旱胁迫处理下的表达特征,以探讨干旱胁迫下沙鞭DREB转录因子的功能和作用,为揭示PvDREB基因响应沙鞭的耐旱分子机制奠定基础。结果表明:(1)成功克隆获得一个沙鞭DREB基因,命名为PvDREB;PvDREB基因编码区长度831 bp、编码276个氨基酸,含有典型的AP2转录因子保守结构域;PvDREB蛋白是亲水性蛋白,不具有信号肽结构,存在跨膜结构和可能的糖基化及磷酸化位点。(2)系统进化分析显示,PvDREB基因与毛竹的DREB亲缘关系较近。(3)亚细胞定位预测表明,PvDREB蛋白定位于线粒体和细胞核中。(4)qRT-PCR显示,沙鞭根、茎和叶中PvDREB均可诱导表达但差异较大,且在茎中表达量最高,叶中次之,根中最低,具有明显的组织特异性;20%PEG-6000模拟干旱下,PvDREB基因在叶中的表达量随干旱胁迫时间增加而增加,12 h时达到最高,之后逐渐下降。研究推测,沙鞭PvDREB基因受干旱胁迫诱导表达,且该基因可能在沙鞭响应干旱胁迫的过程中起重要作用。
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关键词
沙鞭
DREB基因
基因克隆
表达特异性
生物信息学
干旱胁迫
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Keywords
Psammochloa villosa
DREB gene
gene cloning
expression characteristics
bioinformatics
drought stress
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分类号
Q785
[生物学—分子生物学]
Q786
[生物学—分子生物学]
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